MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 plasmid pSPHCH01

Total Repeats: 370

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015595	TC	4	8	164	171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015595	CG	3	6	1104	1109	0 %	0 %	50 %	50 %	334346524
3	NC_015595	GC	3	6	1282	1287	0 %	0 %	50 %	50 %	334346524
4	NC_015595	TC	3	6	1466	1471	0 %	50 %	0 %	50 %	334346524
5	NC_015595	CG	3	6	2002	2007	0 %	0 %	50 %	50 %	334346526
6	NC_015595	GC	3	6	2022	2027	0 %	0 %	50 %	50 %	334346526
7	NC_015595	GC	3	6	2500	2505	0 %	0 %	50 %	50 %	334346526
8	NC_015595	CG	3	6	2741	2746	0 %	0 %	50 %	50 %	334346527
9	NC_015595	CG	3	6	3866	3871	0 %	0 %	50 %	50 %	334346528
10	NC_015595	GC	4	8	3908	3915	0 %	0 %	50 %	50 %	334346528
11	NC_015595	GC	3	6	4284	4289	0 %	0 %	50 %	50 %	334346528
12	NC_015595	TC	3	6	4403	4408	0 %	50 %	0 %	50 %	334346528
13	NC_015595	CG	3	6	4900	4905	0 %	0 %	50 %	50 %	334346528
14	NC_015595	GC	3	6	5204	5209	0 %	0 %	50 %	50 %	334346528
15	NC_015595	GC	3	6	5382	5387	0 %	0 %	50 %	50 %	334346529
16	NC_015595	GC	3	6	5691	5696	0 %	0 %	50 %	50 %	334346530
17	NC_015595	CA	3	6	5848	5853	50 %	0 %	0 %	50 %	334346530
18	NC_015595	GC	3	6	6282	6287	0 %	0 %	50 %	50 %	334346531
19	NC_015595	CG	3	6	7066	7071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015595	GC	3	6	7221	7226	0 %	0 %	50 %	50 %	334346533
21	NC_015595	GC	3	6	7504	7509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015595	GC	3	6	7852	7857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015595	GC	3	6	7902	7907	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
24	NC_015595	CT	3	6	7924	7929	0 %	50 %	0 %	50 %	334346535
25	NC_015595	GC	4	8	8035	8042	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
26	NC_015595	CG	3	6	8159	8164	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
27	NC_015595	GC	4	8	8236	8243	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
28	NC_015595	GC	4	8	8426	8433	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
29	NC_015595	CG	3	6	8529	8534	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
30	NC_015595	GC	4	8	8634	8641	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
31	NC_015595	CG	3	6	8646	8651	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
32	NC_015595	CG	4	8	8682	8689	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
33	NC_015595	TC	3	6	8925	8930	0 %	50 %	0 %	50 %	334346535
34	NC_015595	CG	4	8	9096	9103	0 %	0 %	50 %	50 %	334346535
35	NC_015595	GC	3	6	9604	9609	0 %	0 %	50 %	50 %	334346536
36	NC_015595	CG	3	6	9701	9706	0 %	0 %	50 %	50 %	334346536
37	NC_015595	GC	4	8	9918	9925	0 %	0 %	50 %	50 %	334346536
38	NC_015595	CG	4	8	10535	10542	0 %	0 %	50 %	50 %	334346536
39	NC_015595	GC	3	6	10946	10951	0 %	0 %	50 %	50 %	334346537
40	NC_015595	GC	3	6	11010	11015	0 %	0 %	50 %	50 %	334346537
41	NC_015595	TC	3	6	11086	11091	0 %	50 %	0 %	50 %	334346537
42	NC_015595	AT	3	6	11314	11319	50 %	50 %	0 %	0 %	334346537
43	NC_015595	CG	3	6	12948	12953	0 %	0 %	50 %	50 %	334346537
44	NC_015595	GC	3	6	13228	13233	0 %	0 %	50 %	50 %	334346537
45	NC_015595	GC	3	6	13542	13547	0 %	0 %	50 %	50 %	334346537
46	NC_015595	GC	3	6	14984	14989	0 %	0 %	50 %	50 %	334346539
47	NC_015595	TG	3	6	15266	15271	0 %	50 %	50 %	0 %	334346539
48	NC_015595	GC	3	6	15549	15554	0 %	0 %	50 %	50 %	334346539
49	NC_015595	CG	3	6	15567	15572	0 %	0 %	50 %	50 %	334346539
50	NC_015595	GA	3	6	15642	15647	50 %	0 %	50 %	0 %	334346539
51	NC_015595	GA	3	6	15900	15905	50 %	0 %	50 %	0 %	334346540
52	NC_015595	AG	3	6	16384	16389	50 %	0 %	50 %	0 %	334346541
53	NC_015595	CG	4	8	16515	16522	0 %	0 %	50 %	50 %	334346541
54	NC_015595	GC	3	6	16636	16641	0 %	0 %	50 %	50 %	334346541
55	NC_015595	GC	3	6	17187	17192	0 %	0 %	50 %	50 %	334346542
56	NC_015595	CG	4	8	17340	17347	0 %	0 %	50 %	50 %	334346542
57	NC_015595	CG	3	6	18537	18542	0 %	0 %	50 %	50 %	334346542
58	NC_015595	CG	3	6	18622	18627	0 %	0 %	50 %	50 %	334346542
59	NC_015595	GC	3	6	18830	18835	0 %	0 %	50 %	50 %	334346542
60	NC_015595	CG	3	6	18951	18956	0 %	0 %	50 %	50 %	334346542
61	NC_015595	GC	3	6	19695	19700	0 %	0 %	50 %	50 %	334346542
62	NC_015595	CG	3	6	20411	20416	0 %	0 %	50 %	50 %	334346543
63	NC_015595	CG	3	6	20642	20647	0 %	0 %	50 %	50 %	334346543
64	NC_015595	GC	3	6	21534	21539	0 %	0 %	50 %	50 %	334346544
65	NC_015595	GC	3	6	21960	21965	0 %	0 %	50 %	50 %	334346544
66	NC_015595	CG	3	6	21994	21999	0 %	0 %	50 %	50 %	334346544
67	NC_015595	GC	3	6	22167	22172	0 %	0 %	50 %	50 %	334346544
68	NC_015595	GC	3	6	22746	22751	0 %	0 %	50 %	50 %	334346544
69	NC_015595	GC	3	6	23098	23103	0 %	0 %	50 %	50 %	334346544
70	NC_015595	GC	4	8	23425	23432	0 %	0 %	50 %	50 %	334346545
71	NC_015595	GC	3	6	23876	23881	0 %	0 %	50 %	50 %	334346545
72	NC_015595	GC	3	6	24193	24198	0 %	0 %	50 %	50 %	334346546
73	NC_015595	GC	4	8	24805	24812	0 %	0 %	50 %	50 %	334346547
74	NC_015595	GC	3	6	25028	25033	0 %	0 %	50 %	50 %	334346547
75	NC_015595	GA	4	8	27755	27762	50 %	0 %	50 %	0 %	334346550
76	NC_015595	GC	3	6	28077	28082	0 %	0 %	50 %	50 %	334346550
77	NC_015595	GC	3	6	29149	29154	0 %	0 %	50 %	50 %	334346550
78	NC_015595	GC	3	6	29843	29848	0 %	0 %	50 %	50 %	334346551
79	NC_015595	CT	3	6	30004	30009	0 %	50 %	0 %	50 %	334346551
80	NC_015595	CG	4	8	30028	30035	0 %	0 %	50 %	50 %	334346551
81	NC_015595	GC	3	6	30537	30542	0 %	0 %	50 %	50 %	334346552
82	NC_015595	CG	3	6	30656	30661	0 %	0 %	50 %	50 %	334346552
83	NC_015595	GC	4	8	30953	30960	0 %	0 %	50 %	50 %	334346552
84	NC_015595	CG	3	6	31193	31198	0 %	0 %	50 %	50 %	334346552
85	NC_015595	CG	3	6	31204	31209	0 %	0 %	50 %	50 %	334346552
86	NC_015595	GC	3	6	31800	31805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015595	GC	3	6	31939	31944	0 %	0 %	50 %	50 %	334346553
88	NC_015595	GC	3	6	31947	31952	0 %	0 %	50 %	50 %	334346553
89	NC_015595	GC	3	6	33164	33169	0 %	0 %	50 %	50 %	334346554
90	NC_015595	GC	3	6	33236	33241	0 %	0 %	50 %	50 %	334346554
91	NC_015595	CG	3	6	33478	33483	0 %	0 %	50 %	50 %	334346554
92	NC_015595	GC	5	10	33626	33635	0 %	0 %	50 %	50 %	334346554
93	NC_015595	GC	3	6	33795	33800	0 %	0 %	50 %	50 %	334346554
94	NC_015595	CG	3	6	34348	34353	0 %	0 %	50 %	50 %	334346555
95	NC_015595	GC	3	6	34472	34477	0 %	0 %	50 %	50 %	334346555
96	NC_015595	GC	5	10	34740	34749	0 %	0 %	50 %	50 %	334346555
97	NC_015595	GA	3	6	35155	35160	50 %	0 %	50 %	0 %	334346556
98	NC_015595	GC	3	6	35221	35226	0 %	0 %	50 %	50 %	334346556
99	NC_015595	GC	3	6	36857	36862	0 %	0 %	50 %	50 %	334346558
100	NC_015595	CG	3	6	36995	37000	0 %	0 %	50 %	50 %	334346558
101	NC_015595	CG	3	6	37048	37053	0 %	0 %	50 %	50 %	334346558
102	NC_015595	GC	3	6	38000	38005	0 %	0 %	50 %	50 %	334346558
103	NC_015595	GC	4	8	38414	38421	0 %	0 %	50 %	50 %	334346558
104	NC_015595	CG	3	6	38823	38828	0 %	0 %	50 %	50 %	334346558
105	NC_015595	GC	4	8	39487	39494	0 %	0 %	50 %	50 %	334346559
106	NC_015595	CG	3	6	39718	39723	0 %	0 %	50 %	50 %	334346560
107	NC_015595	GC	3	6	39963	39968	0 %	0 %	50 %	50 %	334346560
108	NC_015595	GC	3	6	40346	40351	0 %	0 %	50 %	50 %	334346560
109	NC_015595	CG	3	6	40642	40647	0 %	0 %	50 %	50 %	334346560
110	NC_015595	GC	3	6	40694	40699	0 %	0 %	50 %	50 %	334346560
111	NC_015595	AT	3	6	40932	40937	50 %	50 %	0 %	0 %	334346560
112	NC_015595	CG	3	6	41112	41117	0 %	0 %	50 %	50 %	334346561
113	NC_015595	GC	4	8	41159	41166	0 %	0 %	50 %	50 %	334346561
114	NC_015595	CG	3	6	41177	41182	0 %	0 %	50 %	50 %	334346561
115	NC_015595	CG	3	6	41268	41273	0 %	0 %	50 %	50 %	334346561
116	NC_015595	GC	3	6	41355	41360	0 %	0 %	50 %	50 %	334346561
117	NC_015595	CG	5	10	41388	41397	0 %	0 %	50 %	50 %	334346561
118	NC_015595	GC	4	8	41492	41499	0 %	0 %	50 %	50 %	334346561
119	NC_015595	GC	3	6	41569	41574	0 %	0 %	50 %	50 %	334346561
120	NC_015595	CG	3	6	41631	41636	0 %	0 %	50 %	50 %	334346561
121	NC_015595	GC	3	6	41893	41898	0 %	0 %	50 %	50 %	334346562
122	NC_015595	GC	3	6	42335	42340	0 %	0 %	50 %	50 %	334346562
123	NC_015595	GC	3	6	42365	42370	0 %	0 %	50 %	50 %	334346562
124	NC_015595	CG	3	6	42396	42401	0 %	0 %	50 %	50 %	334346562
125	NC_015595	CG	3	6	42633	42638	0 %	0 %	50 %	50 %	334346562
126	NC_015595	GC	3	6	42676	42681	0 %	0 %	50 %	50 %	334346562
127	NC_015595	GC	3	6	42801	42806	0 %	0 %	50 %	50 %	334346562
128	NC_015595	CG	3	6	42995	43000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015595	AT	3	6	43457	43462	50 %	50 %	0 %	0 %	334346563
130	NC_015595	CG	3	6	44837	44842	0 %	0 %	50 %	50 %	334346566
131	NC_015595	AC	3	6	44914	44919	50 %	0 %	0 %	50 %	334346566
132	NC_015595	AG	3	6	44944	44949	50 %	0 %	50 %	0 %	334346566
133	NC_015595	GC	4	8	45115	45122	0 %	0 %	50 %	50 %	334346566
134	NC_015595	CG	5	10	45130	45139	0 %	0 %	50 %	50 %	334346566
135	NC_015595	CG	3	6	45160	45165	0 %	0 %	50 %	50 %	334346566
136	NC_015595	GC	3	6	45255	45260	0 %	0 %	50 %	50 %	334346566
137	NC_015595	GC	4	8	45284	45291	0 %	0 %	50 %	50 %	334346566
138	NC_015595	GC	3	6	45452	45457	0 %	0 %	50 %	50 %	334346566
139	NC_015595	CG	3	6	46114	46119	0 %	0 %	50 %	50 %	334346567
140	NC_015595	GC	3	6	46246	46251	0 %	0 %	50 %	50 %	334346567
141	NC_015595	CG	3	6	46784	46789	0 %	0 %	50 %	50 %	334346567
142	NC_015595	AG	3	6	46887	46892	50 %	0 %	50 %	0 %	334346567
143	NC_015595	GC	3	6	47181	47186	0 %	0 %	50 %	50 %	334346568
144	NC_015595	TG	3	6	47342	47347	0 %	50 %	50 %	0 %	334346568
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.