MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 1

Total Repeats: 75347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015593	AT	4	8	14	21	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015593	ATT	2	6	27	32	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015593	TCC	2	6	133	138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015593	GCC	2	6	140	145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015593	AATCG	2	10	146	155	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015593	CGG	2	6	162	167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015593	GCA	2	6	331	336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343658
8	NC_015593	GC	3	6	341	346	0 %	0 %	50 %	50 %	334343658
9	NC_015593	CTG	2	6	470	475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343658
10	NC_015593	TGGCG	2	10	534	543	0 %	20 %	60 %	20 %	334343658
11	NC_015593	CTG	2	6	575	580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343658
12	NC_015593	CG	3	6	603	608	0 %	0 %	50 %	50 %	334343658
13	NC_015593	GGA	2	6	628	633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334343658
14	NC_015593	CGA	2	6	643	648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343658
15	NC_015593	C	6	6	668	673	0 %	0 %	0 %	100 %	334343658
16	NC_015593	ATC	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334343658
17	NC_015593	CGG	2	6	744	749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343658
18	NC_015593	TTCA	2	8	794	801	25 %	50 %	0 %	25 %	334343658
19	NC_015593	GGC	2	6	803	808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343658
20	NC_015593	ATG	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343658
21	NC_015593	GC	3	6	931	936	0 %	0 %	50 %	50 %	334343658
22	NC_015593	ATG	2	6	947	952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343658
23	NC_015593	GCGG	2	8	967	974	0 %	0 %	75 %	25 %	334343658
24	NC_015593	GCT	3	9	979	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343658
25	NC_015593	CGA	2	6	991	996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343658
26	NC_015593	AGG	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334343658
27	NC_015593	GC	4	8	1071	1078	0 %	0 %	50 %	50 %	334343658
28	NC_015593	CCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343658
29	NC_015593	GGCG	2	8	1147	1154	0 %	0 %	75 %	25 %	334343658
30	NC_015593	CCGG	2	8	1175	1182	0 %	0 %	50 %	50 %	334343658
31	NC_015593	GC	3	6	1216	1221	0 %	0 %	50 %	50 %	334343658
32	NC_015593	CCG	2	6	1235	1240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343658
33	NC_015593	GGT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334343658
34	NC_015593	CAA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334343658
35	NC_015593	CCGG	2	8	1341	1348	0 %	0 %	50 %	50 %	334343658
36	NC_015593	GC	3	6	1393	1398	0 %	0 %	50 %	50 %	334343658
37	NC_015593	CGCC	2	8	1402	1409	0 %	0 %	25 %	75 %	334343658
38	NC_015593	CGA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343658
39	NC_015593	CGG	2	6	1464	1469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343658
40	NC_015593	GC	4	8	1490	1497	0 %	0 %	50 %	50 %	334343658
41	NC_015593	AAG	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334343658
42	NC_015593	CGC	2	6	1545	1550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343658
43	NC_015593	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343658
44	NC_015593	GGC	2	6	1703	1708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015593	GAC	2	6	1790	1795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343659
46	NC_015593	CCG	2	6	1803	1808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343659
47	NC_015593	CGG	3	9	1838	1846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343659
48	NC_015593	GTG	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334343659
49	NC_015593	CCG	2	6	1888	1893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343659
50	NC_015593	GGGCG	2	10	1982	1991	0 %	0 %	80 %	20 %	334343659
51	NC_015593	GCC	2	6	2015	2020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343659
52	NC_015593	CCAG	2	8	2038	2045	25 %	0 %	25 %	50 %	334343659
53	NC_015593	ATG	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343659
54	NC_015593	GC	3	6	2068	2073	0 %	0 %	50 %	50 %	334343659
55	NC_015593	TTC	2	6	2115	2120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334343659
56	NC_015593	TGG	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334343659
57	NC_015593	GTG	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334343659
58	NC_015593	TGA	2	6	2272	2277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343659
59	NC_015593	CGC	2	6	2319	2324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343659
60	NC_015593	TCC	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015593	GGA	2	6	2387	2392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015593	GCC	2	6	2417	2422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015593	A	6	6	2433	2438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015593	CCG	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015593	CTT	2	6	2508	2513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334343660
66	NC_015593	GGC	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343660
67	NC_015593	GGC	2	6	2648	2653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343660
68	NC_015593	CGG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343660
69	NC_015593	GCT	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343660
70	NC_015593	GCC	2	6	2727	2732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343660
71	NC_015593	CCAGCC	2	12	2793	2804	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	334343660
72	NC_015593	AGA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334343660
73	NC_015593	GC	3	6	2825	2830	0 %	0 %	50 %	50 %	334343660
74	NC_015593	ACC	2	6	2982	2987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334343660
75	NC_015593	CGA	2	6	3008	3013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343660
76	NC_015593	GCT	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343660
77	NC_015593	GGC	2	6	3375	3380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343661
78	NC_015593	GC	3	6	3379	3384	0 %	0 %	50 %	50 %	334343661
79	NC_015593	TCGGC	2	10	3389	3398	0 %	20 %	40 %	40 %	334343661
80	NC_015593	CGC	2	6	3399	3404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343661
81	NC_015593	CCA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334343661
82	NC_015593	CGG	2	6	3572	3577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343661
83	NC_015593	ATT	2	6	3612	3617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334343661
84	NC_015593	CCG	2	6	3644	3649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343661
85	NC_015593	CTT	2	6	3681	3686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334343661
86	NC_015593	ATG	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343661
87	NC_015593	CGT	2	6	3704	3709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343661
88	NC_015593	TCG	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343661
89	NC_015593	ATG	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343661
90	NC_015593	ATG	2	6	3811	3816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343661
91	NC_015593	TGC	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343661
92	NC_015593	GCC	2	6	3949	3954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343661
93	NC_015593	AGCC	2	8	4039	4046	25 %	0 %	25 %	50 %	334343661
94	NC_015593	GC	3	6	4050	4055	0 %	0 %	50 %	50 %	334343661
95	NC_015593	CAG	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343661
96	NC_015593	GATC	2	8	4130	4137	25 %	25 %	25 %	25 %	334343661
97	NC_015593	CCA	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334343661
98	NC_015593	GCG	2	6	4153	4158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343661
99	NC_015593	GCT	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343661
100	NC_015593	GAA	3	9	4230	4238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334343661
101	NC_015593	GCG	2	6	4419	4424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343662
102	NC_015593	CCG	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343662
103	NC_015593	AGC	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343662
104	NC_015593	GCGCC	2	10	4583	4592	0 %	0 %	40 %	60 %	334343662
105	NC_015593	GCC	2	6	4603	4608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343662
106	NC_015593	GCC	2	6	4628	4633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343662
107	NC_015593	CGG	2	6	4646	4651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343662
108	NC_015593	GGA	2	6	4704	4709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334343662
109	NC_015593	GGC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343662
110	NC_015593	GCCC	2	8	4746	4753	0 %	0 %	25 %	75 %	334343662
111	NC_015593	AGC	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343662
112	NC_015593	GAT	2	6	4785	4790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343662
113	NC_015593	TGA	3	9	4793	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343662
114	NC_015593	ATA	2	6	4848	4853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334343662
115	NC_015593	AGG	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334343662
116	NC_015593	TCC	2	6	4936	4941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334343662
117	NC_015593	TGA	2	6	4994	4999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334343662
118	NC_015593	GGCA	2	8	5010	5017	25 %	0 %	50 %	25 %	334343662
119	NC_015593	TG	3	6	5053	5058	0 %	50 %	50 %	0 %	334343662
120	NC_015593	GCA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343662
121	NC_015593	GCCGAT	2	12	5127	5138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334343662
122	NC_015593	ATA	2	6	5172	5177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334343662
123	NC_015593	AGC	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343662
124	NC_015593	CAG	2	6	5232	5237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343662
125	NC_015593	GCCC	2	8	5253	5260	0 %	0 %	25 %	75 %	334343662
126	NC_015593	CCG	4	12	5261	5272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343662
127	NC_015593	GCA	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343662
128	NC_015593	CGCC	2	8	5339	5346	0 %	0 %	25 %	75 %	334343662
129	NC_015593	CGG	2	6	5347	5352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343662
130	NC_015593	GC	3	6	5381	5386	0 %	0 %	50 %	50 %	334343662
131	NC_015593	CG	3	6	5416	5421	0 %	0 %	50 %	50 %	334343662
132	NC_015593	TCG	2	6	5431	5436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334343662
133	NC_015593	ACAGCC	2	12	5447	5458	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	334343662
134	NC_015593	CGGCG	2	10	5487	5496	0 %	0 %	60 %	40 %	334343662
135	NC_015593	GCC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343662
136	NC_015593	GCC	2	6	5671	5676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343662
137	NC_015593	CAG	2	6	5682	5687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343662
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146	NC_015593	GCT	2	6	6066	6071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_015593	CCGG	2	8	6156	6163	0 %	0 %	50 %	50 %	334343663
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269	NC_015593	GC	3	6	11005	11010	0 %	0 %	50 %	50 %	334343667
270	NC_015593	CGC	2	6	11065	11070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343667
271	NC_015593	CTGAA	2	10	11076	11085	40 %	20 %	20 %	20 %	334343667
272	NC_015593	CGC	2	6	11123	11128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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380	NC_015593	ACC	2	6	15433	15438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
381	NC_015593	GCG	2	6	15446	15451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
382	NC_015593	GGA	2	6	15476	15481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
383	NC_015593	CCG	3	9	15545	15553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334343674
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398	NC_015593	AGC	2	6	16000	16005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334343674
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498	NC_015593	GCG	2	6	19424	19429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334343676
499	NC_015593	GATC	2	8	19431	19438	25 %	25 %	25 %	25 %	334343676
500	NC_015593	CCGC	2	8	19515	19522	0 %	0 %	25 %	75 %	334343677

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