MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 chromosome 3

Total Repeats: 907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015591	TCCAG	2	10	85	94	20 %	20 %	20 %	40 %	334318457
2	NC_015591	ACGCC	2	10	125	134	20 %	0 %	20 %	60 %	334318457
3	NC_015591	CCGCA	2	10	963	972	20 %	0 %	20 %	60 %	334318457
4	NC_015591	GCCGC	2	10	2585	2594	0 %	0 %	40 %	60 %	334318458
5	NC_015591	GAATG	2	10	4031	4040	40 %	20 %	40 %	0 %	334318459
6	NC_015591	GCAAC	2	10	4108	4117	40 %	0 %	20 %	40 %	334318459
7	NC_015591	TCTCG	2	10	5070	5079	0 %	40 %	20 %	40 %	334318461
8	NC_015591	GCTGT	2	10	5692	5701	0 %	40 %	40 %	20 %	334318461
9	NC_015591	CCACA	2	10	7743	7752	40 %	0 %	0 %	60 %	334318463
10	NC_015591	CCCGC	2	10	8065	8074	0 %	0 %	20 %	80 %	334318463
11	NC_015591	CAGAT	2	10	8870	8879	40 %	20 %	20 %	20 %	334318463
12	NC_015591	CAGAA	2	10	11295	11304	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015591	AGCCA	2	10	11444	11453	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015591	GATTG	2	10	14640	14649	20 %	40 %	40 %	0 %	334318472
15	NC_015591	CTCAG	2	10	14786	14795	20 %	20 %	20 %	40 %	334318472
16	NC_015591	CCTGC	2	10	16184	16193	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_015591	CCGCG	2	10	19614	19623	0 %	0 %	40 %	60 %	334318476
18	NC_015591	TCATC	2	10	19664	19673	20 %	40 %	0 %	40 %	334318476
19	NC_015591	CTCGG	2	10	25225	25234	0 %	20 %	40 %	40 %	334318482
20	NC_015591	GGCGG	2	10	26839	26848	0 %	0 %	80 %	20 %	334318484
21	NC_015591	GCCGC	2	10	28122	28131	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_015591	CGTCT	2	10	28450	28459	0 %	40 %	20 %	40 %	334318485
23	NC_015591	GCCCA	2	10	29553	29562	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_015591	TCGCA	2	10	29857	29866	20 %	20 %	20 %	40 %	334318487
25	NC_015591	CGACC	2	10	31374	31383	20 %	0 %	20 %	60 %	334318487
26	NC_015591	GCTTT	2	10	31941	31950	0 %	60 %	20 %	20 %	334318487
27	NC_015591	CGCCA	2	10	32741	32750	20 %	0 %	20 %	60 %	334318488
28	NC_015591	ACGGA	2	10	33429	33438	40 %	0 %	40 %	20 %	334318489
29	NC_015591	GCCCA	2	10	33470	33479	20 %	0 %	20 %	60 %	334318489
30	NC_015591	CGCGC	2	10	33845	33854	0 %	0 %	40 %	60 %	334318489
31	NC_015591	CTCCG	2	10	34108	34117	0 %	20 %	20 %	60 %	334318489
32	NC_015591	GGCGA	2	10	34249	34258	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015591	GAGAG	2	10	35627	35636	40 %	0 %	60 %	0 %	334318491
34	NC_015591	CCTGG	2	10	36926	36935	0 %	20 %	40 %	40 %	334318493
35	NC_015591	TCGTG	2	10	37604	37613	0 %	40 %	40 %	20 %	334318494
36	NC_015591	TCCTG	2	10	38632	38641	0 %	40 %	20 %	40 %	334318494
37	NC_015591	GAAGA	2	10	39554	39563	60 %	0 %	40 %	0 %	334318494
38	NC_015591	CCGCA	2	10	40106	40115	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_015591	GAAGC	2	10	40440	40449	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015591	CAAGC	2	10	42505	42514	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015591	CGATC	2	10	43074	43083	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015591	TCATT	2	10	43689	43698	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015591	TTGGG	2	10	44298	44307	0 %	40 %	60 %	0 %	334318495
44	NC_015591	AGCGG	2	10	45411	45420	20 %	0 %	60 %	20 %	334318495
45	NC_015591	TGCCG	2	10	45712	45721	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015591	CGGAT	2	10	47826	47835	20 %	20 %	40 %	20 %	334318497
47	NC_015591	CTTCT	2	10	48100	48109	0 %	60 %	0 %	40 %	334318497
48	NC_015591	GCAGC	2	10	48658	48667	20 %	0 %	40 %	40 %	334318498
49	NC_015591	GGCAT	2	10	49637	49646	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015591	GCCGC	2	10	49721	49730	0 %	0 %	40 %	60 %	334318500
51	NC_015591	GTTTG	2	10	50928	50937	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015591	CGTTC	2	10	60503	60512	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015591	ATCGC	2	10	61008	61017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015591	TCGAC	2	10	61833	61842	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015591	CCGCA	2	10	64428	64437	20 %	0 %	20 %	60 %	334318511
56	NC_015591	CGGTC	2	10	65379	65388	0 %	20 %	40 %	40 %	334318512
57	NC_015591	CGGTA	2	10	66405	66414	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015591	GTCCG	2	10	68612	68621	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015591	GCCGC	2	10	72541	72550	0 %	0 %	40 %	60 %	334318518
60	NC_015591	CCGCT	2	10	73651	73660	0 %	20 %	20 %	60 %	334318519
61	NC_015591	ATGCG	2	10	74330	74339	20 %	20 %	40 %	20 %	334318520
62	NC_015591	TGCCG	2	10	75168	75177	0 %	20 %	40 %	40 %	334318521
63	NC_015591	CCTGC	2	10	76049	76058	0 %	20 %	20 %	60 %	334318522
64	NC_015591	CTATG	2	10	76591	76600	20 %	40 %	20 %	20 %	334318522
65	NC_015591	TACGG	2	10	77610	77619	20 %	20 %	40 %	20 %	334318523
66	NC_015591	CGGCG	2	10	78554	78563	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015591	GAAGG	2	10	79313	79322	40 %	0 %	60 %	0 %	334318524
68	NC_015591	AGCGC	2	10	84283	84292	20 %	0 %	40 %	40 %	334318528
69	NC_015591	GCGAC	2	10	84909	84918	20 %	0 %	40 %	40 %	334318528
70	NC_015591	TCCGC	2	10	87219	87228	0 %	20 %	20 %	60 %	334318531
71	NC_015591	GGCGC	2	10	90441	90450	0 %	0 %	60 %	40 %	334318534
72	NC_015591	AGCCG	2	10	90501	90510	20 %	0 %	40 %	40 %	334318534
73	NC_015591	TTGCG	2	10	91395	91404	0 %	40 %	40 %	20 %	334318535
74	NC_015591	GTGAT	2	10	92827	92836	20 %	40 %	40 %	0 %	334318535
75	NC_015591	CCTTC	2	10	95796	95805	0 %	40 %	0 %	60 %	334318538
76	NC_015591	AAGTC	2	10	96311	96320	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015591	TGAAC	2	10	97487	97496	40 %	20 %	20 %	20 %	334318539
78	NC_015591	GCCAC	2	10	99127	99136	20 %	0 %	20 %	60 %	334318541
79	NC_015591	ACGCG	2	10	100232	100241	20 %	0 %	40 %	40 %	334318541
80	NC_015591	CATTC	2	10	104552	104561	20 %	40 %	0 %	40 %	334318545
81	NC_015591	TCGGT	2	10	104749	104758	0 %	40 %	40 %	20 %	334318545
82	NC_015591	GGCGC	2	10	105313	105322	0 %	0 %	60 %	40 %	334318546
83	NC_015591	ATCTC	2	10	106023	106032	20 %	40 %	0 %	40 %	334318547
84	NC_015591	GGTCG	2	10	108947	108956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015591	TCGTC	2	10	110681	110690	0 %	40 %	20 %	40 %	334318552
86	NC_015591	CTGGC	2	10	113807	113816	0 %	20 %	40 %	40 %	334318554
87	NC_015591	GCACG	2	10	116568	116577	20 %	0 %	40 %	40 %	334318557
88	NC_015591	CTCAT	2	10	118785	118794	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_015591	GCATC	2	10	119216	119225	20 %	20 %	20 %	40 %	334318560
90	NC_015591	GCTGC	2	10	120651	120660	0 %	20 %	40 %	40 %	334318562
91	NC_015591	CCGGG	2	10	120738	120747	0 %	0 %	60 %	40 %	334318562
92	NC_015591	TCCGC	2	10	122774	122783	0 %	20 %	20 %	60 %	334318563
93	NC_015591	CTATC	2	10	127256	127265	20 %	40 %	0 %	40 %	334318568
94	NC_015591	CGCGT	2	10	131309	131318	0 %	20 %	40 %	40 %	334318571
95	NC_015591	CGGGC	2	10	134306	134315	0 %	0 %	60 %	40 %	334318574
96	NC_015591	GGTTC	2	10	135942	135951	0 %	40 %	40 %	20 %	334318577
97	NC_015591	GCGAT	2	10	136242	136251	20 %	20 %	40 %	20 %	334318577
98	NC_015591	GCGCC	2	10	137437	137446	0 %	0 %	40 %	60 %	334318578
99	NC_015591	GATCT	2	10	139634	139643	20 %	40 %	20 %	20 %	334318581
100	NC_015591	GGCTC	2	10	142967	142976	0 %	20 %	40 %	40 %	334318583
101	NC_015591	TTCGC	2	10	143128	143137	0 %	40 %	20 %	40 %	334318583
102	NC_015591	TCCGT	2	10	144329	144338	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_015591	CATCT	2	10	145631	145640	20 %	40 %	0 %	40 %	334318586
104	NC_015591	ACCGG	2	10	145654	145663	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015591	GCGCG	2	10	146229	146238	0 %	0 %	60 %	40 %	334318587
106	NC_015591	GATAG	2	10	146652	146661	40 %	20 %	40 %	0 %	334318588
107	NC_015591	GCCGA	2	10	150019	150028	20 %	0 %	40 %	40 %	334318590
108	NC_015591	CGACG	2	10	153505	153514	20 %	0 %	40 %	40 %	334318591
109	NC_015591	GCACC	2	10	153742	153751	20 %	0 %	20 %	60 %	334318591
110	NC_015591	TCAAT	2	10	155339	155348	40 %	40 %	0 %	20 %	334318594
111	NC_015591	TCACG	2	10	157716	157725	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015591	TGAAG	2	10	159353	159362	40 %	20 %	40 %	0 %	334318599
113	NC_015591	ATCAG	2	10	160340	160349	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015591	GCCGA	2	10	163315	163324	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015591	ACCGT	2	10	165202	165211	20 %	20 %	20 %	40 %	334318607
116	NC_015591	CGGTG	2	10	167844	167853	0 %	20 %	60 %	20 %	334318609
117	NC_015591	CCCGG	2	10	168472	168481	0 %	0 %	40 %	60 %	334318609
118	NC_015591	AGATC	2	10	170495	170504	40 %	20 %	20 %	20 %	334318612
119	NC_015591	GCAAC	2	10	171332	171341	40 %	0 %	20 %	40 %	334318612
120	NC_015591	TCGTT	2	10	173106	173115	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015591	CTTGC	2	10	174656	174665	0 %	40 %	20 %	40 %	334318614
122	NC_015591	CCTGC	2	10	176798	176807	0 %	20 %	20 %	60 %	334318616
123	NC_015591	CGCGG	2	10	177145	177154	0 %	0 %	60 %	40 %	334318617
124	NC_015591	TGACC	2	10	177276	177285	20 %	20 %	20 %	40 %	334318617
125	NC_015591	GCGCC	2	10	177773	177782	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_015591	CAATT	2	10	177903	177912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015591	GTTGA	2	10	178376	178385	20 %	40 %	40 %	0 %	334318618
128	NC_015591	CGGGG	2	10	178485	178494	0 %	0 %	80 %	20 %	334318618
129	NC_015591	GCGTC	3	15	179203	179217	0 %	20 %	40 %	40 %	334318619
130	NC_015591	CCGTA	2	10	183506	183515	20 %	20 %	20 %	40 %	334318625
131	NC_015591	GCGCC	2	10	184001	184010	0 %	0 %	40 %	60 %	334318626
132	NC_015591	GCCGC	2	10	184045	184054	0 %	0 %	40 %	60 %	334318626
133	NC_015591	AGCGA	2	10	184422	184431	40 %	0 %	40 %	20 %	334318626
134	NC_015591	CAGGT	2	10	184550	184559	20 %	20 %	40 %	20 %	334318626
135	NC_015591	GATCG	2	10	185451	185460	20 %	20 %	40 %	20 %	334318627
136	NC_015591	ATTGT	2	10	186123	186132	20 %	60 %	20 %	0 %	334318628
137	NC_015591	TGCCC	2	10	188707	188716	0 %	20 %	20 %	60 %	334318631
138	NC_015591	CAAGT	2	10	190408	190417	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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142	NC_015591	GTCGC	2	10	193698	193707	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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258	NC_015591	CGTTA	2	10	369004	369013	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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260	NC_015591	GATAG	2	10	372288	372297	40 %	20 %	40 %	0 %	334318770
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262	NC_015591	CAATC	2	10	379123	379132	40 %	20 %	0 %	40 %	334318777
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264	NC_015591	GCATT	2	10	380616	380625	20 %	40 %	20 %	20 %	334318778
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268	NC_015591	CGCCT	2	10	383319	383328	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
269	NC_015591	CTGAT	2	10	383542	383551	20 %	40 %	20 %	20 %	334318782
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403	NC_015591	CAGCG	2	10	568952	568961	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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