MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Serratia plymuthica AS9 chromosome

Total Repeats: 119538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015567	GGGA	2	8	43169	43176	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015567	CCCG	2	8	43185	43192	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1003	NC_015567	CGGG	2	8	43201	43208	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_015567	GC	3	6	43279	43284	0 %	0 %	50 %	50 %	333929887
1005	NC_015567	GCA	3	9	43345	43353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1006	NC_015567	CGG	5	15	43378	43392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929887
1007	NC_015567	TCC	2	6	43395	43400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333929887
1008	NC_015567	GCG	2	6	43407	43412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929887
1009	NC_015567	CTG	2	6	43415	43420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1010	NC_015567	GGT	2	6	43421	43426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929887
1011	NC_015567	CG	3	6	43468	43473	0 %	0 %	50 %	50 %	333929887
1012	NC_015567	TCG	2	6	43479	43484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1013	NC_015567	GGC	3	9	43487	43495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929887
1014	NC_015567	TGC	2	6	43552	43557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1015	NC_015567	CCA	2	6	43567	43572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929887
1016	NC_015567	GTG	2	6	43575	43580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929887
1017	NC_015567	GCC	2	6	43632	43637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929887
1018	NC_015567	CCA	2	6	43675	43680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929887
1019	NC_015567	GC	4	8	43707	43714	0 %	0 %	50 %	50 %	333929887
1020	NC_015567	CGG	2	6	43723	43728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929887
1021	NC_015567	GGT	2	6	43775	43780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929887
1022	NC_015567	TCG	2	6	43793	43798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1023	NC_015567	CTG	2	6	43803	43808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1024	NC_015567	GCC	2	6	43850	43855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929887
1025	NC_015567	GTTG	2	8	43888	43895	0 %	50 %	50 %	0 %	333929887
1026	NC_015567	GTG	2	6	43898	43903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929887
1027	NC_015567	GGC	2	6	43952	43957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929887
1028	NC_015567	TCT	2	6	43962	43967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929887
1029	NC_015567	CCG	3	9	43969	43977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929887
1030	NC_015567	TGT	2	6	43980	43985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333929887
1031	NC_015567	CCG	2	6	44026	44031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929887
1032	NC_015567	CGC	2	6	44099	44104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929887
1033	NC_015567	CAA	2	6	44114	44119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929887
1034	NC_015567	CGG	2	6	44136	44141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929887
1035	NC_015567	CGCCAG	2	12	44186	44197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333929887
1036	NC_015567	TGC	2	6	44200	44205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1037	NC_015567	GTG	2	6	44274	44279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929887
1038	NC_015567	GCTG	2	8	44389	44396	0 %	25 %	50 %	25 %	333929887
1039	NC_015567	CTG	2	6	44399	44404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1040	NC_015567	GTC	2	6	44450	44455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1041	NC_015567	GC	3	6	44458	44463	0 %	0 %	50 %	50 %	333929887
1042	NC_015567	GCA	2	6	44476	44481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1043	NC_015567	TGCTG	2	10	44522	44531	0 %	40 %	40 %	20 %	333929887
1044	NC_015567	CG	3	6	44532	44537	0 %	0 %	50 %	50 %	333929887
1045	NC_015567	TCA	2	6	44538	44543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929887
1046	NC_015567	CGC	2	6	44546	44551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929887
1047	NC_015567	GCG	2	6	44557	44562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929887
1048	NC_015567	CGT	2	6	44602	44607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1049	NC_015567	TGC	3	9	44769	44777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1050	NC_015567	ACC	2	6	44796	44801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929887
1051	NC_015567	TTC	2	6	44895	44900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929887
1052	NC_015567	GC	3	6	44932	44937	0 %	0 %	50 %	50 %	333929887
1053	NC_015567	TGAT	2	8	44952	44959	25 %	50 %	25 %	0 %	333929887
1054	NC_015567	GAT	2	6	45008	45013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929887
1055	NC_015567	GAT	2	6	45041	45046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929887
1056	NC_015567	CAG	2	6	45053	45058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929887
1057	NC_015567	GAAC	2	8	45106	45113	50 %	0 %	25 %	25 %	333929887
1058	NC_015567	GCC	2	6	45135	45140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929887
1059	NC_015567	ATT	2	6	45143	45148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015567	A	7	7	45221	45227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015567	CAT	2	6	45245	45250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015567	CTT	2	6	45270	45275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929888
1063	NC_015567	TGC	2	6	45288	45293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929888
1064	NC_015567	GTA	2	6	45363	45368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929888
1065	NC_015567	CCAG	2	8	45491	45498	25 %	0 %	25 %	50 %	333929888
1066	NC_015567	TGC	2	6	45522	45527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929888
1067	NC_015567	GTG	2	6	45607	45612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929888
1068	NC_015567	GCC	2	6	45654	45659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929888
1069	NC_015567	GTT	2	6	45663	45668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333929888
1070	NC_015567	GTT	2	6	45774	45779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333929888
1071	NC_015567	TGG	2	6	45790	45795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929888
1072	NC_015567	CGT	2	6	45848	45853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929888
1073	NC_015567	ATC	3	9	45889	45897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_015567	GCG	2	6	45913	45918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015567	TTAA	2	8	45958	45965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015567	AATC	2	8	46013	46020	50 %	25 %	0 %	25 %	333929889
1077	NC_015567	CG	3	6	46051	46056	0 %	0 %	50 %	50 %	333929889
1078	NC_015567	TGC	2	6	46089	46094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929889
1079	NC_015567	CGC	2	6	46152	46157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929889
1080	NC_015567	CG	3	6	46234	46239	0 %	0 %	50 %	50 %	333929889
1081	NC_015567	AGC	2	6	46247	46252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929889
1082	NC_015567	GGC	2	6	46269	46274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929889
1083	NC_015567	GCC	2	6	46288	46293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929889
1084	NC_015567	CAG	2	6	46294	46299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929889
1085	NC_015567	GCG	2	6	46308	46313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929889
1086	NC_015567	GGC	2	6	46324	46329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929889
1087	NC_015567	GA	3	6	46402	46407	50 %	0 %	50 %	0 %	333929889
1088	NC_015567	GCA	2	6	46425	46430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929889
1089	NC_015567	CGGA	2	8	46438	46445	25 %	0 %	50 %	25 %	333929889
1090	NC_015567	CA	3	6	46470	46475	50 %	0 %	0 %	50 %	333929889
1091	NC_015567	CGC	2	6	46476	46481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929889
1092	NC_015567	GCG	3	9	46504	46512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929889
1093	NC_015567	GCG	2	6	46531	46536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929889
1094	NC_015567	CG	3	6	46602	46607	0 %	0 %	50 %	50 %	333929889
1095	NC_015567	CAT	2	6	46675	46680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929889
1096	NC_015567	CAC	2	6	46681	46686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929889
1097	NC_015567	GA	3	6	46689	46694	50 %	0 %	50 %	0 %	333929889
1098	NC_015567	CTT	2	6	46722	46727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929889
1099	NC_015567	GCCA	2	8	46730	46737	25 %	0 %	25 %	50 %	333929889
1100	NC_015567	CCTGGG	2	12	46776	46787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333929889
1101	NC_015567	TGC	2	6	46817	46822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929889
1102	NC_015567	AAC	2	6	46862	46867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015567	TA	3	6	46870	46875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015567	CAG	2	6	46995	47000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1105	NC_015567	ACG	2	6	47041	47046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1106	NC_015567	CGC	2	6	47049	47054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929890
1107	NC_015567	CTG	2	6	47104	47109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1108	NC_015567	AAAG	2	8	47200	47207	75 %	0 %	25 %	0 %	333929890
1109	NC_015567	GC	3	6	47252	47257	0 %	0 %	50 %	50 %	333929890
1110	NC_015567	GCC	2	6	47303	47308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929890
1111	NC_015567	TGA	2	6	47393	47398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929890
1112	NC_015567	GCTG	2	8	47456	47463	0 %	25 %	50 %	25 %	333929890
1113	NC_015567	TG	3	6	47477	47482	0 %	50 %	50 %	0 %	333929890
1114	NC_015567	ACCA	2	8	47626	47633	50 %	0 %	0 %	50 %	333929890
1115	NC_015567	GCG	2	6	47683	47688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929890
1116	NC_015567	TGC	2	6	47846	47851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1117	NC_015567	CTG	2	6	47914	47919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1118	NC_015567	ACG	2	6	47963	47968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1119	NC_015567	ACC	2	6	47992	47997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929890
1120	NC_015567	CTG	2	6	48073	48078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1121	NC_015567	GGT	2	6	48108	48113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929890
1122	NC_015567	CCGA	2	8	48133	48140	25 %	0 %	25 %	50 %	333929890
1123	NC_015567	TCA	2	6	48146	48151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929890
1124	NC_015567	CAT	2	6	48197	48202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929890
1125	NC_015567	TCGG	2	8	48232	48239	0 %	25 %	50 %	25 %	333929890
1126	NC_015567	GAT	2	6	48264	48269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929890
1127	NC_015567	GGCG	2	8	48297	48304	0 %	0 %	75 %	25 %	333929890
1128	NC_015567	GCG	3	9	48302	48310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929890
1129	NC_015567	CTG	2	6	48361	48366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1130	NC_015567	ACCT	2	8	48424	48431	25 %	25 %	0 %	50 %	333929890
1131	NC_015567	GCT	2	6	48453	48458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1132	NC_015567	ACT	2	6	48473	48478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929890
1133	NC_015567	TTC	2	6	48496	48501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333929890
1134	NC_015567	ATG	2	6	48508	48513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929890
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1136	NC_015567	GAT	2	6	48612	48617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333929890
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1140	NC_015567	GATC	2	8	48857	48864	25 %	25 %	25 %	25 %	333929890
1141	NC_015567	GCTG	2	8	48878	48885	0 %	25 %	50 %	25 %	333929890
1142	NC_015567	ACG	2	6	48929	48934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929890
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1147	NC_015567	CGA	2	6	49167	49172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929890
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1152	NC_015567	TGGGCC	2	12	49285	49296	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333929890
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1156	NC_015567	CGG	2	6	49595	49600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929890
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1158	NC_015567	GGC	2	6	49623	49628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929890
1159	NC_015567	CAC	2	6	49662	49667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929890
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1162	NC_015567	CAAGGC	2	12	49827	49838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929890
1163	NC_015567	GGT	2	6	49839	49844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929890
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1193	NC_015567	CTG	2	6	51147	51152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929892
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1198	NC_015567	CGT	2	6	51358	51363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929892
1199	NC_015567	GCT	2	6	51389	51394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929892
1200	NC_015567	GGC	2	6	51407	51412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929892
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1204	NC_015567	CAT	2	6	51522	51527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929892
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1212	NC_015567	TGCAC	2	10	51781	51790	20 %	20 %	20 %	40 %	333929893
1213	NC_015567	GCT	2	6	51823	51828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929893
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1215	NC_015567	GCT	2	6	51898	51903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929893
1216	NC_015567	GAGCTG	2	12	51989	52000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333929893
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1218	NC_015567	GCA	2	6	52164	52169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929893
1219	NC_015567	GTG	2	6	52184	52189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929893
1220	NC_015567	GTG	2	6	52253	52258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929893
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1223	NC_015567	GCG	2	6	52347	52352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929893
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1226	NC_015567	GAT	2	6	52546	52551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1227	NC_015567	GAAA	2	8	52620	52627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1228	NC_015567	GACG	2	8	52631	52638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1229	NC_015567	CGG	2	6	52664	52669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929894
1230	NC_015567	ACA	2	6	52703	52708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929894
1231	NC_015567	CGG	2	6	52853	52858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333929894
1232	NC_015567	CCA	2	6	52907	52912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929894
1233	NC_015567	GAC	2	6	52975	52980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929894
1234	NC_015567	CAT	2	6	53028	53033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929894
1235	NC_015567	ACC	2	6	53068	53073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333929894
1236	NC_015567	AGA	2	6	53076	53081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333929894
1237	NC_015567	GTG	2	6	53188	53193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929894
1238	NC_015567	TGG	2	6	53267	53272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929894
1239	NC_015567	AAC	2	6	53279	53284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333929894
1240	NC_015567	G	6	6	53303	53308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_015567	CCG	2	6	53409	53414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929895
1242	NC_015567	GTG	2	6	53433	53438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929895
1243	NC_015567	TGG	2	6	53470	53475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333929895
1244	NC_015567	CGA	2	6	53477	53482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333929895
1245	NC_015567	GGCGT	2	10	53484	53493	0 %	20 %	60 %	20 %	333929895
1246	NC_015567	CG	3	6	53503	53508	0 %	0 %	50 %	50 %	333929895
1247	NC_015567	CGC	2	6	53537	53542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929895
1248	NC_015567	CG	3	6	53565	53570	0 %	0 %	50 %	50 %	333929895
1249	NC_015567	GCC	3	9	53622	53630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929895
1250	NC_015567	GCT	2	6	53750	53755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333929895
1251	NC_015567	GCC	2	6	53760	53765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929895
1252	NC_015567	CCG	2	6	53819	53824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333929895
1253	NC_015567	CAT	2	6	53825	53830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333929895
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1255	NC_015567	CAT	2	6	53964	53969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_015567	CA	3	6	53970	53975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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