MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 6038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015436	CTGG	2	8	145	152	0 %	25 %	50 %	25 %	330835984
2	NC_015436	TTCC	2	8	258	265	0 %	50 %	0 %	50 %	330835984
3	NC_015436	GCAA	2	8	488	495	50 %	0 %	25 %	25 %	330835984
4	NC_015436	TCCT	2	8	984	991	0 %	50 %	0 %	50 %	330835984
5	NC_015436	CATG	2	8	1420	1427	25 %	25 %	25 %	25 %	330835984
6	NC_015436	ACTA	2	8	1521	1528	50 %	25 %	0 %	25 %	330835984
7	NC_015436	CTTG	2	8	1899	1906	0 %	50 %	25 %	25 %	330835985
8	NC_015436	TCTT	2	8	2307	2314	0 %	75 %	0 %	25 %	330835985
9	NC_015436	CATT	2	8	2915	2922	25 %	50 %	0 %	25 %	330835986
10	NC_015436	GAAG	2	8	3389	3396	50 %	0 %	50 %	0 %	330835986
11	NC_015436	CAGG	2	8	3756	3763	25 %	0 %	50 %	25 %	330835986
12	NC_015436	CTTG	2	8	3815	3822	0 %	50 %	25 %	25 %	330835986
13	NC_015436	TTTC	2	8	3849	3856	0 %	75 %	0 %	25 %	330835986
14	NC_015436	TTCC	2	8	3891	3898	0 %	50 %	0 %	50 %	330835986
15	NC_015436	ATAA	2	8	4271	4278	75 %	25 %	0 %	0 %	330835987
16	NC_015436	ATTT	2	8	4423	4430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015436	GAAA	2	8	4662	4669	75 %	0 %	25 %	0 %	330835989
18	NC_015436	CAAA	2	8	4886	4893	75 %	0 %	0 %	25 %	330835989
19	NC_015436	GACG	2	8	5527	5534	25 %	0 %	50 %	25 %	330835990
20	NC_015436	CCCT	2	8	5537	5544	0 %	25 %	0 %	75 %	330835990
21	NC_015436	TTTG	2	8	5595	5602	0 %	75 %	25 %	0 %	330835990
22	NC_015436	GATG	2	8	6273	6280	25 %	25 %	50 %	0 %	330835990
23	NC_015436	TGAA	2	8	6317	6324	50 %	25 %	25 %	0 %	330835990
24	NC_015436	GGAT	2	8	6466	6473	25 %	25 %	50 %	0 %	330835990
25	NC_015436	GAAG	2	8	6919	6926	50 %	0 %	50 %	0 %	330835991
26	NC_015436	TCCC	2	8	7618	7625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_015436	CGGA	2	8	7686	7693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015436	TACA	2	8	7747	7754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015436	GTAC	2	8	7822	7829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015436	ATTG	2	8	8118	8125	25 %	50 %	25 %	0 %	330835992
31	NC_015436	CTTG	2	8	8174	8181	0 %	50 %	25 %	25 %	330835992
32	NC_015436	TATG	2	8	8628	8635	25 %	50 %	25 %	0 %	330835992
33	NC_015436	ATGG	2	8	8737	8744	25 %	25 %	50 %	0 %	330835992
34	NC_015436	GAAG	2	8	9062	9069	50 %	0 %	50 %	0 %	330835993
35	NC_015436	CAAT	2	8	9292	9299	50 %	25 %	0 %	25 %	330835993
36	NC_015436	TTTG	2	8	9620	9627	0 %	75 %	25 %	0 %	330835994
37	NC_015436	TTCC	2	8	10008	10015	0 %	50 %	0 %	50 %	330835994
38	NC_015436	TTCC	2	8	10169	10176	0 %	50 %	0 %	50 %	330835994
39	NC_015436	ATGG	2	8	10437	10444	25 %	25 %	50 %	0 %	330835995
40	NC_015436	AATT	2	8	10522	10529	50 %	50 %	0 %	0 %	330835995
41	NC_015436	AGAC	2	8	10611	10618	50 %	0 %	25 %	25 %	330835995
42	NC_015436	CAGA	2	8	10652	10659	50 %	0 %	25 %	25 %	330835995
43	NC_015436	AATC	2	8	10930	10937	50 %	25 %	0 %	25 %	330835995
44	NC_015436	ATTC	2	8	11073	11080	25 %	50 %	0 %	25 %	330835995
45	NC_015436	ACGG	2	8	11112	11119	25 %	0 %	50 %	25 %	330835995
46	NC_015436	CATA	2	8	11331	11338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015436	GAAG	2	8	11433	11440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015436	TGAT	2	8	11458	11465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015436	TGGA	2	8	11506	11513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015436	GCAT	2	8	11519	11526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015436	TCAA	2	8	11633	11640	50 %	25 %	0 %	25 %	330835996
52	NC_015436	CATT	2	8	11746	11753	25 %	50 %	0 %	25 %	330835996
53	NC_015436	GCCG	2	8	12824	12831	0 %	0 %	50 %	50 %	330835996
54	NC_015436	TCCT	2	8	13012	13019	0 %	50 %	0 %	50 %	330835996
55	NC_015436	TTGC	2	8	13050	13057	0 %	50 %	25 %	25 %	330835996
56	NC_015436	TTAT	2	8	13282	13289	25 %	75 %	0 %	0 %	330835996
57	NC_015436	ATTT	2	8	13516	13523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015436	GAAA	2	8	13654	13661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015436	AAGG	3	12	14235	14246	50 %	0 %	50 %	0 %	330835997
60	NC_015436	AATG	2	8	14855	14862	50 %	25 %	25 %	0 %	330835998
61	NC_015436	TGGA	2	8	15049	15056	25 %	25 %	50 %	0 %	330835998
62	NC_015436	GATT	3	12	15193	15204	25 %	50 %	25 %	0 %	330835998
63	NC_015436	ACCA	2	8	15543	15550	50 %	0 %	0 %	50 %	330835998
64	NC_015436	GGTC	2	8	15572	15579	0 %	25 %	50 %	25 %	330835998
65	NC_015436	AAGA	2	8	15966	15973	75 %	0 %	25 %	0 %	330835998
66	NC_015436	ATTG	2	8	16169	16176	25 %	50 %	25 %	0 %	330835998
67	NC_015436	TACA	2	8	16925	16932	50 %	25 %	0 %	25 %	330835999
68	NC_015436	TTTC	2	8	17617	17624	0 %	75 %	0 %	25 %	330836000
69	NC_015436	ACCA	2	8	18268	18275	50 %	0 %	0 %	50 %	330836000
70	NC_015436	GGAA	2	8	18341	18348	50 %	0 %	50 %	0 %	330836000
71	NC_015436	CAGT	2	8	19601	19608	25 %	25 %	25 %	25 %	330836001
72	NC_015436	ACAG	2	8	19636	19643	50 %	0 %	25 %	25 %	330836001
73	NC_015436	TTGA	2	8	19952	19959	25 %	50 %	25 %	0 %	330836001
74	NC_015436	CGGG	2	8	20105	20112	0 %	0 %	75 %	25 %	330836001
75	NC_015436	GCAA	2	8	20200	20207	50 %	0 %	25 %	25 %	330836001
76	NC_015436	GAAA	2	8	20365	20372	75 %	0 %	25 %	0 %	330836001
77	NC_015436	GGTT	2	8	20558	20565	0 %	50 %	50 %	0 %	330836002
78	NC_015436	TGGA	2	8	20963	20970	25 %	25 %	50 %	0 %	330836003
79	NC_015436	GTTC	2	8	21444	21451	0 %	50 %	25 %	25 %	330836003
80	NC_015436	TTTG	2	8	22476	22483	0 %	75 %	25 %	0 %	330836004
81	NC_015436	AAAG	2	8	22633	22640	75 %	0 %	25 %	0 %	330836004
82	NC_015436	CGGA	2	8	22834	22841	25 %	0 %	50 %	25 %	330836004
83	NC_015436	ATAC	2	8	22953	22960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015436	GGAT	2	8	23749	23756	25 %	25 %	50 %	0 %	330836005
85	NC_015436	CAAA	2	8	24566	24573	75 %	0 %	0 %	25 %	330836006
86	NC_015436	TTTC	2	8	25577	25584	0 %	75 %	0 %	25 %	330836007
87	NC_015436	TGCC	2	8	25767	25774	0 %	25 %	25 %	50 %	330836007
88	NC_015436	GTTC	2	8	25895	25902	0 %	50 %	25 %	25 %	330836007
89	NC_015436	AATC	2	8	25996	26003	50 %	25 %	0 %	25 %	330836007
90	NC_015436	CCAT	2	8	26854	26861	25 %	25 %	0 %	50 %	330836008
91	NC_015436	TGCC	2	8	27566	27573	0 %	25 %	25 %	50 %	330836008
92	NC_015436	CCCG	2	8	28102	28109	0 %	0 %	25 %	75 %	330836009
93	NC_015436	TCAG	2	8	28753	28760	25 %	25 %	25 %	25 %	330836009
94	NC_015436	AGGC	2	8	29051	29058	25 %	0 %	50 %	25 %	330836010
95	NC_015436	CCGT	3	12	29259	29270	0 %	25 %	25 %	50 %	330836010
96	NC_015436	CCTT	2	8	29273	29280	0 %	50 %	0 %	50 %	330836010
97	NC_015436	TTGG	2	8	30410	30417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015436	AATT	2	8	30488	30495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015436	TCCC	2	8	30760	30767	0 %	25 %	0 %	75 %	330836012
100	NC_015436	CCTG	2	8	30821	30828	0 %	25 %	25 %	50 %	330836012
101	NC_015436	CGGA	2	8	30925	30932	25 %	0 %	50 %	25 %	330836012
102	NC_015436	TTCC	2	8	31282	31289	0 %	50 %	0 %	50 %	330836012
103	NC_015436	GACG	2	8	31372	31379	25 %	0 %	50 %	25 %	330836012
104	NC_015436	GGAC	2	8	31452	31459	25 %	0 %	50 %	25 %	330836012
105	NC_015436	GGTC	2	8	31515	31522	0 %	25 %	50 %	25 %	330836012
106	NC_015436	GTAC	2	8	31796	31803	25 %	25 %	25 %	25 %	330836012
107	NC_015436	ACAA	2	8	31875	31882	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015436	TAAA	2	8	31935	31942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015436	GGAT	2	8	32534	32541	25 %	25 %	50 %	0 %	330836013
110	NC_015436	ATCA	2	8	32642	32649	50 %	25 %	0 %	25 %	330836013
111	NC_015436	ACTG	2	8	32878	32885	25 %	25 %	25 %	25 %	330836013
112	NC_015436	GGAG	2	8	33400	33407	25 %	0 %	75 %	0 %	330836013
113	NC_015436	GAAA	2	8	34062	34069	75 %	0 %	25 %	0 %	330836014
114	NC_015436	ACGG	2	8	34478	34485	25 %	0 %	50 %	25 %	330836015
115	NC_015436	TCAA	2	8	34720	34727	50 %	25 %	0 %	25 %	330836015
116	NC_015436	TCGG	2	8	34786	34793	0 %	25 %	50 %	25 %	330836015
117	NC_015436	AGAA	2	8	35044	35051	75 %	0 %	25 %	0 %	330836015
118	NC_015436	CCAG	2	8	35087	35094	25 %	0 %	25 %	50 %	330836015
119	NC_015436	GGAT	2	8	35425	35432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015436	ATGG	2	8	35444	35451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015436	GGAG	2	8	36156	36163	25 %	0 %	75 %	0 %	330836016
122	NC_015436	CATT	2	8	36648	36655	25 %	50 %	0 %	25 %	330836017
123	NC_015436	GTTT	2	8	37307	37314	0 %	75 %	25 %	0 %	330836018
124	NC_015436	CCGG	2	8	38517	38524	0 %	0 %	50 %	50 %	330836020
125	NC_015436	GGAA	2	8	39328	39335	50 %	0 %	50 %	0 %	330836020
126	NC_015436	CGGA	2	8	39339	39346	25 %	0 %	50 %	25 %	330836020
127	NC_015436	TGCA	2	8	40842	40849	25 %	25 %	25 %	25 %	330836022
128	NC_015436	CCTG	2	8	40852	40859	0 %	25 %	25 %	50 %	330836022
129	NC_015436	CCAG	2	8	41021	41028	25 %	0 %	25 %	50 %	330836022
130	NC_015436	TGGA	2	8	41830	41837	25 %	25 %	50 %	0 %	330836022
131	NC_015436	CCAT	2	8	42505	42512	25 %	25 %	0 %	50 %	330836024
132	NC_015436	ACCG	2	8	42518	42525	25 %	0 %	25 %	50 %	330836024
133	NC_015436	TTGC	2	8	42823	42830	0 %	50 %	25 %	25 %	330836024
134	NC_015436	CATG	2	8	43048	43055	25 %	25 %	25 %	25 %	330836024
135	NC_015436	GAAA	2	8	43437	43444	75 %	0 %	25 %	0 %	330836025
136	NC_015436	GCAG	2	8	43619	43626	25 %	0 %	50 %	25 %	330836025
137	NC_015436	CTGA	2	8	44177	44184	25 %	25 %	25 %	25 %	330836025
138	NC_015436	TTGC	2	8	44552	44559	0 %	50 %	25 %	25 %	330836026
139	NC_015436	GATT	2	8	44803	44810	25 %	50 %	25 %	0 %	330836026
140	NC_015436	CGAC	2	8	45207	45214	25 %	0 %	25 %	50 %	330836026
141	NC_015436	TCCT	2	8	46026	46033	0 %	50 %	0 %	50 %	330836027
142	NC_015436	CGCT	2	8	46067	46074	0 %	25 %	25 %	50 %	330836027
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167	NC_015436	TCGG	2	8	53426	53433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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254	NC_015436	CTTT	2	8	91759	91766	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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261	NC_015436	TTTC	2	8	94797	94804	0 %	75 %	0 %	25 %	330836064
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