MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015436	GCA	2	6	296396	296401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836238
6002	NC_015436	TAT	2	6	296430	296435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836238
6003	NC_015436	A	6	6	296668	296673	100 %	0 %	0 %	0 %	330836238
6004	NC_015436	TGC	2	6	296688	296693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_015436	ATC	2	6	296696	296701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_015436	GT	3	6	296776	296781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015436	CCA	2	6	296818	296823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_015436	AGC	2	6	296848	296853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836239
6009	NC_015436	CGC	2	6	296862	296867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836239
6010	NC_015436	TATCG	2	10	296922	296931	20 %	40 %	20 %	20 %	330836239
6011	NC_015436	GCC	2	6	296939	296944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836239
6012	NC_015436	CAT	2	6	297057	297062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836239
6013	NC_015436	GATG	2	8	297075	297082	25 %	25 %	50 %	0 %	330836239
6014	NC_015436	GAA	2	6	297097	297102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836239
6015	NC_015436	TCC	2	6	297130	297135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836239
6016	NC_015436	CGC	2	6	297150	297155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836239
6017	NC_015436	CGC	2	6	297224	297229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836239
6018	NC_015436	TC	3	6	297279	297284	0 %	50 %	0 %	50 %	330836239
6019	NC_015436	TTC	2	6	297294	297299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836239
6020	NC_015436	GCG	2	6	297406	297411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836239
6021	NC_015436	CGC	2	6	297456	297461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836239
6022	NC_015436	TCA	2	6	297491	297496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836239
6023	NC_015436	GGC	2	6	297528	297533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836239
6024	NC_015436	GAG	2	6	297556	297561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836239
6025	NC_015436	GAA	2	6	297603	297608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836239
6026	NC_015436	GAC	2	6	297665	297670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836239
6027	NC_015436	GAA	2	6	297690	297695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836239
6028	NC_015436	AGC	2	6	297737	297742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836239
6029	NC_015436	CTG	2	6	297760	297765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836239
6030	NC_015436	TGC	2	6	297770	297775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836239
6031	NC_015436	TGG	2	6	297875	297880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836239
6032	NC_015436	CAT	2	6	297960	297965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836239
6033	NC_015436	TGA	2	6	298005	298010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836239
6034	NC_015436	CTGT	2	8	298022	298029	0 %	50 %	25 %	25 %	330836239
6035	NC_015436	TTC	2	6	298168	298173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_015436	TCT	2	6	298419	298424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836240
6037	NC_015436	CAG	2	6	298493	298498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836240
6038	NC_015436	GTCA	2	8	298511	298518	25 %	25 %	25 %	25 %	330836240
6039	NC_015436	GGA	2	6	298596	298601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836240
6040	NC_015436	CGA	2	6	298618	298623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836240
6041	NC_015436	CTG	2	6	298667	298672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836240
6042	NC_015436	ACA	2	6	298692	298697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836240
6043	NC_015436	TGT	2	6	298765	298770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836240
6044	NC_015436	TCG	2	6	298833	298838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836240
6045	NC_015436	CCG	2	6	298899	298904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836240
6046	NC_015436	AAG	2	6	298928	298933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836240
6047	NC_015436	TTC	2	6	298934	298939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836240
6048	NC_015436	GCC	2	6	298956	298961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836240
6049	NC_015436	TGT	2	6	299023	299028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836240
6050	NC_015436	ATC	2	6	299117	299122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836240
6051	NC_015436	ACG	2	6	299211	299216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836240
6052	NC_015436	TGA	2	6	299230	299235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836240
6053	NC_015436	CGC	2	6	299263	299268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836240
6054	NC_015436	CAT	2	6	299269	299274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836240
6055	NC_015436	AT	3	6	299273	299278	50 %	50 %	0 %	0 %	330836240
6056	NC_015436	CCT	2	6	299316	299321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_015436	CTTAT	2	10	299322	299331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6058	NC_015436	TCAAA	2	10	299366	299375	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6059	NC_015436	ACC	2	6	299435	299440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_015436	ACA	2	6	299459	299464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_015436	CAT	2	6	299567	299572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836241
6062	NC_015436	CAC	2	6	299573	299578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836241
6063	NC_015436	ATG	2	6	299602	299607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836241
6064	NC_015436	CTG	2	6	299655	299660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836241
6065	NC_015436	AC	3	6	299682	299687	50 %	0 %	0 %	50 %	330836241
6066	NC_015436	GAA	2	6	299727	299732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836241
6067	NC_015436	CCA	2	6	299821	299826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836241
6068	NC_015436	TTG	2	6	299827	299832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836241
6069	NC_015436	TGG	2	6	299863	299868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836241
6070	NC_015436	GCC	2	6	299913	299918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836241
6071	NC_015436	CCG	2	6	299941	299946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836241
6072	NC_015436	ACTC	2	8	299954	299961	25 %	25 %	0 %	50 %	330836241
6073	NC_015436	GAT	2	6	300003	300008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836241
6074	NC_015436	AACAA	2	10	300018	300027	80 %	0 %	0 %	20 %	330836241
6075	NC_015436	ATG	2	6	300097	300102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015436	GA	3	6	300106	300111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_015436	AGG	2	6	300113	300118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_015436	TC	3	6	300262	300267	0 %	50 %	0 %	50 %	330836242
6079	NC_015436	CAAT	2	8	300306	300313	50 %	25 %	0 %	25 %	330836242
6080	NC_015436	CCG	2	6	300321	300326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836242
6081	NC_015436	ACT	2	6	300338	300343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836242
6082	NC_015436	GGC	2	6	300452	300457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836242
6083	NC_015436	AGT	2	6	300469	300474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836242
6084	NC_015436	CAA	2	6	300532	300537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836242
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6086	NC_015436	GCC	2	6	300545	300550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836242
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6088	NC_015436	CCG	2	6	300714	300719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836242
6089	NC_015436	GAC	2	6	300809	300814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836242
6090	NC_015436	GGC	2	6	300856	300861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836242
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6092	NC_015436	CAT	2	6	300967	300972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836242
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6094	NC_015436	CGC	2	6	301174	301179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836242
6095	NC_015436	CA	3	6	301225	301230	50 %	0 %	0 %	50 %	330836242
6096	NC_015436	TGCC	2	8	301242	301249	0 %	25 %	25 %	50 %	330836242
6097	NC_015436	CAAT	2	8	301257	301264	50 %	25 %	0 %	25 %	330836242
6098	NC_015436	CTG	2	6	301272	301277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836242
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6101	NC_015436	GC	3	6	301371	301376	0 %	0 %	50 %	50 %	330836242
6102	NC_015436	C	6	6	301413	301418	0 %	0 %	0 %	100 %	330836242
6103	NC_015436	GGA	2	6	301496	301501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836242
6104	NC_015436	TC	4	8	301601	301608	0 %	50 %	0 %	50 %	330836242
6105	NC_015436	TGA	2	6	301609	301614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836242
6106	NC_015436	GCCGGT	2	12	301676	301687	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330836242
6107	NC_015436	CGGA	2	8	301770	301777	25 %	0 %	50 %	25 %	330836242
6108	NC_015436	AAT	2	6	301833	301838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_015436	A	6	6	301839	301844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_015436	CAT	2	6	301870	301875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_015436	GT	4	8	301910	301917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_015436	GTT	2	6	301982	301987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015436	GAG	2	6	302008	302013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_015436	T	8	8	302023	302030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015436	ATGT	2	8	302112	302119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_015436	ATT	2	6	302153	302158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015436	GAT	2	6	302167	302172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015436	ATC	2	6	302288	302293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_015436	GAA	2	6	302320	302325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_015436	TATG	2	8	302385	302392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_015436	TAT	2	6	302439	302444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_015436	CA	3	6	302445	302450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_015436	TTA	2	6	302486	302491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015436	TGA	2	6	302511	302516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6126	NC_015436	TAAA	2	8	302558	302565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6128	NC_015436	ACA	2	6	302682	302687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6130	NC_015436	TGA	2	6	302766	302771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6371	NC_015436	TC	3	6	314968	314973	0 %	50 %	0 %	50 %	330836251
6372	NC_015436	TGA	2	6	315038	315043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836251
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6375	NC_015436	TGA	2	6	315182	315187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836251
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6379	NC_015436	CGG	2	6	315335	315340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836251
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6383	NC_015436	CTG	2	6	315491	315496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836251
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6385	NC_015436	CCT	2	6	315550	315555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836251
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6415	NC_015436	CGATG	2	10	317296	317305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6475	NC_015436	TTCAG	2	10	320182	320191	20 %	40 %	20 %	20 %	330836256
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6479	NC_015436	TCC	2	6	320445	320450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6480	NC_015436	CA	3	6	320505	320510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6490	NC_015436	AGGGA	2	10	320847	320856	40 %	0 %	60 %	0 %	330836257
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6492	NC_015436	TCG	3	9	320904	320912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836257
6493	NC_015436	CCGGC	2	10	320950	320959	0 %	0 %	40 %	60 %	330836257
6494	NC_015436	GGA	2	6	320966	320971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836257
6495	NC_015436	TGA	2	6	320998	321003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836257
6496	NC_015436	TCA	3	9	321144	321152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836257
6497	NC_015436	CG	3	6	321158	321163	0 %	0 %	50 %	50 %	330836257
6498	NC_015436	CATT	2	8	321292	321299	25 %	50 %	0 %	25 %	330836257
6499	NC_015436	ATG	2	6	321344	321349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836258
6500	NC_015436	TTGTTC	2	12	321478	321489	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330836258

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