MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015436	TGA	2	6	271539	271544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836215
5502	NC_015436	GGT	2	6	271594	271599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836215
5503	NC_015436	AG	3	6	271719	271724	50 %	0 %	50 %	0 %	330836215
5504	NC_015436	TCGC	2	8	271751	271758	0 %	25 %	25 %	50 %	330836215
5505	NC_015436	T	6	6	271789	271794	0 %	100 %	0 %	0 %	330836215
5506	NC_015436	CGC	2	6	271921	271926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836215
5507	NC_015436	GCG	2	6	271936	271941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836215
5508	NC_015436	TTG	3	9	271961	271969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836215
5509	NC_015436	GAT	2	6	271984	271989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836215
5510	NC_015436	CAG	2	6	272017	272022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836215
5511	NC_015436	CGA	2	6	272064	272069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836215
5512	NC_015436	TTC	2	6	272107	272112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836215
5513	NC_015436	GAT	2	6	272113	272118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836215
5514	NC_015436	GAA	2	6	272152	272157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836215
5515	NC_015436	GGA	2	6	272172	272177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836215
5516	NC_015436	TGGT	2	8	272276	272283	0 %	50 %	50 %	0 %	330836215
5517	NC_015436	TGC	2	6	272314	272319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836215
5518	NC_015436	ATG	2	6	272430	272435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836215
5519	NC_015436	TGC	2	6	272495	272500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836215
5520	NC_015436	GGC	2	6	272635	272640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836215
5521	NC_015436	TCC	2	6	272782	272787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836215
5522	NC_015436	GA	3	6	272953	272958	50 %	0 %	50 %	0 %	330836215
5523	NC_015436	GCAG	2	8	272968	272975	25 %	0 %	50 %	25 %	330836215
5524	NC_015436	GCC	2	6	272989	272994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836215
5525	NC_015436	GAGG	2	8	273049	273056	25 %	0 %	75 %	0 %	330836215
5526	NC_015436	TGA	2	6	273093	273098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836215
5527	NC_015436	TGT	2	6	273099	273104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836215
5528	NC_015436	TGCG	2	8	273164	273171	0 %	25 %	50 %	25 %	330836215
5529	NC_015436	TGG	2	6	273197	273202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836215
5530	NC_015436	TGGTA	2	10	273255	273264	20 %	40 %	40 %	0 %	330836215
5531	NC_015436	GT	3	6	273339	273344	0 %	50 %	50 %	0 %	330836215
5532	NC_015436	ATG	2	6	273356	273361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836215
5533	NC_015436	GTC	2	6	273391	273396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836216
5534	NC_015436	AAATT	2	10	273477	273486	60 %	40 %	0 %	0 %	330836216
5535	NC_015436	AAATT	2	10	273488	273497	60 %	40 %	0 %	0 %	330836216
5536	NC_015436	TGAT	2	8	273516	273523	25 %	50 %	25 %	0 %	330836216
5537	NC_015436	TCC	2	6	273596	273601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836217
5538	NC_015436	T	6	6	273606	273611	0 %	100 %	0 %	0 %	330836217
5539	NC_015436	TCATT	2	10	273616	273625	20 %	60 %	0 %	20 %	330836217
5540	NC_015436	A	6	6	273706	273711	100 %	0 %	0 %	0 %	330836217
5541	NC_015436	A	6	6	273715	273720	100 %	0 %	0 %	0 %	330836217
5542	NC_015436	TG	4	8	273774	273781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_015436	TCT	2	6	273790	273795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836218
5544	NC_015436	CAG	2	6	273932	273937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5545	NC_015436	CCA	2	6	273955	273960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836218
5546	NC_015436	C	6	6	273981	273986	0 %	0 %	0 %	100 %	330836218
5547	NC_015436	AGC	2	6	274011	274016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5548	NC_015436	GAT	2	6	274148	274153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836218
5549	NC_015436	CGT	2	6	274159	274164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5550	NC_015436	GCCC	2	8	274209	274216	0 %	0 %	25 %	75 %	330836218
5551	NC_015436	G	6	6	274223	274228	0 %	0 %	100 %	0 %	330836218
5552	NC_015436	CTC	2	6	274235	274240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836218
5553	NC_015436	CCT	2	6	274285	274290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836218
5554	NC_015436	AGC	2	6	274299	274304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5555	NC_015436	CTT	2	6	274373	274378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836218
5556	NC_015436	GTT	2	6	274400	274405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836218
5557	NC_015436	C	6	6	274421	274426	0 %	0 %	0 %	100 %	330836218
5558	NC_015436	CGC	2	6	274430	274435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836218
5559	NC_015436	CTG	2	6	274436	274441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5560	NC_015436	CTG	2	6	274481	274486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5561	NC_015436	GAA	2	6	274499	274504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836218
5562	NC_015436	CAC	2	6	274505	274510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836218
5563	NC_015436	GGC	2	6	274585	274590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836218
5564	NC_015436	CGG	2	6	274612	274617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836218
5565	NC_015436	CCT	2	6	274633	274638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836218
5566	NC_015436	CGA	2	6	274682	274687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5567	NC_015436	TGA	2	6	274690	274695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836218
5568	NC_015436	GCA	2	6	274711	274716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5569	NC_015436	TCA	2	6	274741	274746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836218
5570	NC_015436	CTG	2	6	274781	274786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5571	NC_015436	GGT	2	6	274811	274816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836218
5572	NC_015436	C	6	6	274912	274917	0 %	0 %	0 %	100 %	330836218
5573	NC_015436	CGT	2	6	274966	274971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5574	NC_015436	CAG	2	6	274976	274981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5575	NC_015436	CCCG	2	8	274990	274997	0 %	0 %	25 %	75 %	330836218
5576	NC_015436	CCA	2	6	275008	275013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836218
5577	NC_015436	GAA	2	6	275054	275059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836218
5578	NC_015436	CGT	2	6	275077	275082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5579	NC_015436	GC	3	6	275117	275122	0 %	0 %	50 %	50 %	330836218
5580	NC_015436	AC	3	6	275165	275170	50 %	0 %	0 %	50 %	330836218
5581	NC_015436	CAG	2	6	275171	275176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5582	NC_015436	TGT	2	6	275188	275193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836218
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5584	NC_015436	GTT	2	6	275225	275230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836218
5585	NC_015436	CAG	2	6	275267	275272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5586	NC_015436	GTCC	2	8	275327	275334	0 %	25 %	25 %	50 %	330836218
5587	NC_015436	GTC	2	6	275447	275452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836218
5588	NC_015436	TGA	2	6	275581	275586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836218
5589	NC_015436	GAG	2	6	275605	275610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_015436	ATCAT	2	10	275612	275621	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5591	NC_015436	CA	3	6	275634	275639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5592	NC_015436	TGA	2	6	275649	275654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015436	A	8	8	275673	275680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_015436	CTT	2	6	275681	275686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_015436	AAG	2	6	275701	275706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_015436	CCT	2	6	275714	275719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_015436	TTC	2	6	275767	275772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_015436	ATT	2	6	275779	275784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_015436	GTT	2	6	275951	275956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_015436	CGG	2	6	276068	276073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836219
5601	NC_015436	GC	3	6	276106	276111	0 %	0 %	50 %	50 %	330836219
5602	NC_015436	TAGAA	2	10	276237	276246	60 %	20 %	20 %	0 %	330836219
5603	NC_015436	GGTA	2	8	276325	276332	25 %	25 %	50 %	0 %	330836219
5604	NC_015436	GGC	2	6	276334	276339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836219
5605	NC_015436	CAT	2	6	276405	276410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836219
5606	NC_015436	TGGAA	2	10	276458	276467	40 %	20 %	40 %	0 %	330836219
5607	NC_015436	AGC	2	6	276538	276543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836219
5608	NC_015436	CGAA	2	8	276575	276582	50 %	0 %	25 %	25 %	330836219
5609	NC_015436	GA	3	6	276632	276637	50 %	0 %	50 %	0 %	330836219
5610	NC_015436	GCTGA	2	10	276721	276730	20 %	20 %	40 %	20 %	330836219
5611	NC_015436	CAA	2	6	276771	276776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836219
5612	NC_015436	ACA	2	6	276809	276814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836219
5613	NC_015436	ACC	2	6	276851	276856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836219
5614	NC_015436	CTG	2	6	276859	276864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836219
5615	NC_015436	GAA	2	6	276880	276885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836219
5616	NC_015436	CAA	2	6	277036	277041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_015436	AGC	2	6	277064	277069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_015436	TGC	2	6	277160	277165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_015436	T	6	6	277236	277241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_015436	AGAAA	2	10	277262	277271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_015436	TTTA	2	8	277305	277312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_015436	TGG	2	6	277352	277357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_015436	GTTA	2	8	277373	277380	25 %	50 %	25 %	0 %	330836220
5624	NC_015436	A	6	6	277432	277437	100 %	0 %	0 %	0 %	330836220
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5745	NC_015436	GCG	2	6	284436	284441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5746	NC_015436	GCC	2	6	284453	284458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5748	NC_015436	GCAA	2	8	284474	284481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5871	NC_015436	CGC	2	6	290213	290218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836234
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5921	NC_015436	CAA	2	6	292531	292536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5997	NC_015436	A	6	6	296118	296123	100 %	0 %	0 %	0 %	330836238
5998	NC_015436	AAGG	2	8	296142	296149	50 %	0 %	50 %	0 %	330836238
5999	NC_015436	CATG	2	8	296305	296312	25 %	25 %	25 %	25 %	330836238
6000	NC_015436	TCAG	2	8	296320	296327	25 %	25 %	25 %	25 %	330836238

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