MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015436	A	6	6	222766	222771	100 %	0 %	0 %	0 %	330836177
4502	NC_015436	GAA	2	6	222787	222792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836178
4503	NC_015436	A	8	8	222795	222802	100 %	0 %	0 %	0 %	330836178
4504	NC_015436	GAA	2	6	222828	222833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836178
4505	NC_015436	AGA	2	6	222840	222845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836178
4506	NC_015436	A	6	6	222849	222854	100 %	0 %	0 %	0 %	330836178
4507	NC_015436	TCACA	2	10	223038	223047	40 %	20 %	0 %	40 %	330836178
4508	NC_015436	AAAGG	2	10	223062	223071	60 %	0 %	40 %	0 %	330836178
4509	NC_015436	GC	3	6	223105	223110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_015436	C	6	6	223139	223144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4511	NC_015436	AGG	2	6	223198	223203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015436	AAC	2	6	223217	223222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_015436	A	6	6	223271	223276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015436	GCC	3	9	223324	223332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836179
4515	NC_015436	CCA	2	6	223346	223351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836179
4516	NC_015436	GCA	2	6	223394	223399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836179
4517	NC_015436	TTC	2	6	223624	223629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836179
4518	NC_015436	CAT	2	6	223715	223720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836179
4519	NC_015436	TGA	2	6	223754	223759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836179
4520	NC_015436	CAT	2	6	223901	223906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836179
4521	NC_015436	GTC	2	6	223924	223929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836179
4522	NC_015436	CT	3	6	223931	223936	0 %	50 %	0 %	50 %	330836179
4523	NC_015436	GAG	2	6	224019	224024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836179
4524	NC_015436	CTTT	2	8	224033	224040	0 %	75 %	0 %	25 %	330836179
4525	NC_015436	TCA	2	6	224095	224100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836179
4526	NC_015436	ACG	2	6	224127	224132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836179
4527	NC_015436	TTC	2	6	224136	224141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836179
4528	NC_015436	AGT	2	6	224153	224158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836179
4529	NC_015436	AGT	3	9	224165	224173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836179
4530	NC_015436	AGG	2	6	224282	224287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836179
4531	NC_015436	TTA	2	6	224297	224302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836179
4532	NC_015436	GGA	2	6	224408	224413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836179
4533	NC_015436	ATG	2	6	224497	224502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836179
4534	NC_015436	CCGT	2	8	224523	224530	0 %	25 %	25 %	50 %	330836179
4535	NC_015436	AAG	2	6	224531	224536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836179
4536	NC_015436	AGG	2	6	224539	224544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836179
4537	NC_015436	TTCA	2	8	224571	224578	25 %	50 %	0 %	25 %	330836179
4538	NC_015436	GAT	2	6	224652	224657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015436	T	6	6	224673	224678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015436	GAAA	2	8	224688	224695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015436	A	6	6	224705	224710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015436	CTT	2	6	224721	224726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836180
4543	NC_015436	AGCG	2	8	224784	224791	25 %	0 %	50 %	25 %	330836180
4544	NC_015436	ATG	3	9	224818	224826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836180
4545	NC_015436	TCA	2	6	224843	224848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836180
4546	NC_015436	GGCT	2	8	224874	224881	0 %	25 %	50 %	25 %	330836180
4547	NC_015436	CAT	2	6	225059	225064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836180
4548	NC_015436	CAATGA	2	12	225131	225142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330836180
4549	NC_015436	GGGA	2	8	225183	225190	25 %	0 %	75 %	0 %	330836180
4550	NC_015436	TTC	2	6	225270	225275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836180
4551	NC_015436	CAAGG	2	10	225351	225360	40 %	0 %	40 %	20 %	330836180
4552	NC_015436	GAAT	2	8	225467	225474	50 %	25 %	25 %	0 %	330836180
4553	NC_015436	CAT	2	6	225477	225482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836180
4554	NC_015436	CCT	2	6	225488	225493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_015436	GACT	2	8	225499	225506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_015436	CTT	2	6	225525	225530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_015436	GC	3	6	225538	225543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_015436	GACG	2	8	225578	225585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_015436	TGG	2	6	225626	225631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_015436	AGG	2	6	225679	225684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_015436	TAT	2	6	225696	225701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836181
4562	NC_015436	TTG	2	6	225719	225724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836181
4563	NC_015436	GTG	2	6	225730	225735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836181
4564	NC_015436	GAA	2	6	225787	225792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836181
4565	NC_015436	AAC	2	6	225821	225826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836181
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4567	NC_015436	CGG	2	6	225896	225901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836181
4568	NC_015436	CAT	2	6	226110	226115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836181
4569	NC_015436	TCT	2	6	226268	226273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836182
4570	NC_015436	GT	3	6	226287	226292	0 %	50 %	50 %	0 %	330836182
4571	NC_015436	GTTG	2	8	226310	226317	0 %	50 %	50 %	0 %	330836182
4572	NC_015436	GATG	2	8	226364	226371	25 %	25 %	50 %	0 %	330836182
4573	NC_015436	A	6	6	226513	226518	100 %	0 %	0 %	0 %	330836182
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4576	NC_015436	GAT	2	6	226803	226808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836182
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4578	NC_015436	CG	3	6	226827	226832	0 %	0 %	50 %	50 %	330836182
4579	NC_015436	GTC	2	6	226907	226912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836182
4580	NC_015436	CGG	2	6	226916	226921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836182
4581	NC_015436	TAG	2	6	226942	226947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836182
4582	NC_015436	TGA	2	6	227000	227005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836182
4583	NC_015436	TCG	2	6	227014	227019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836182
4584	NC_015436	CCG	2	6	227034	227039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836182
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4587	NC_015436	CTTTT	2	10	227112	227121	0 %	80 %	0 %	20 %	330836182
4588	NC_015436	A	6	6	227152	227157	100 %	0 %	0 %	0 %	330836182
4589	NC_015436	A	6	6	227168	227173	100 %	0 %	0 %	0 %	330836182
4590	NC_015436	GAA	2	6	227192	227197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836182
4591	NC_015436	GAA	2	6	227222	227227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836182
4592	NC_015436	GTT	2	6	227228	227233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836182
4593	NC_015436	CTTT	2	8	227239	227246	0 %	75 %	0 %	25 %	330836182
4594	NC_015436	GGAAG	2	10	227285	227294	40 %	0 %	60 %	0 %	330836182
4595	NC_015436	CCGT	2	8	227314	227321	0 %	25 %	25 %	50 %	330836182
4596	NC_015436	GAA	2	6	227360	227365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836182
4597	NC_015436	CGG	2	6	227438	227443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836182
4598	NC_015436	CTG	2	6	227502	227507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836182
4599	NC_015436	TCA	2	6	227515	227520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836182
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4601	NC_015436	CCAG	2	8	227656	227663	25 %	0 %	25 %	50 %	330836182
4602	NC_015436	TA	3	6	227670	227675	50 %	50 %	0 %	0 %	330836182
4603	NC_015436	GTG	2	6	227691	227696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836182
4604	NC_015436	ATC	2	6	227709	227714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836182
4605	NC_015436	TCA	2	6	227836	227841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836182
4606	NC_015436	ATG	2	6	227842	227847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836182
4607	NC_015436	CATC	2	8	227923	227930	25 %	25 %	0 %	50 %	330836182
4608	NC_015436	ATG	2	6	227974	227979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836182
4609	NC_015436	TCC	2	6	228045	228050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836182
4610	NC_015436	CGG	2	6	228083	228088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836182
4611	NC_015436	TGG	2	6	228098	228103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836182
4612	NC_015436	CGG	2	6	228116	228121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836182
4613	NC_015436	GGA	2	6	228129	228134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836182
4614	NC_015436	TGG	2	6	228162	228167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836183
4615	NC_015436	TGG	2	6	228198	228203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836183
4616	NC_015436	ATC	2	6	228265	228270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836184
4617	NC_015436	TAT	2	6	228397	228402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836184
4618	NC_015436	AT	3	6	228450	228455	50 %	50 %	0 %	0 %	330836184
4619	NC_015436	GAA	2	6	228487	228492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836184
4620	NC_015436	CTA	2	6	228756	228761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836184
4621	NC_015436	TGG	2	6	228782	228787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836184
4622	NC_015436	G	6	6	228866	228871	0 %	0 %	100 %	0 %	330836184
4623	NC_015436	ACA	2	6	228884	228889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836184
4624	NC_015436	TTC	2	6	228994	228999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836184
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4630	NC_015436	TGG	2	6	229397	229402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_015436	TGTT	2	8	229419	229426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4747	NC_015436	GAA	2	6	234782	234787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836190
4748	NC_015436	TCC	2	6	234828	234833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836190
4749	NC_015436	CAT	2	6	234898	234903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836190
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4751	NC_015436	TTCC	2	8	234988	234995	0 %	50 %	0 %	50 %	330836190
4752	NC_015436	TTA	2	6	235033	235038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836190
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4777	NC_015436	TCA	2	6	236075	236080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4778	NC_015436	GTTG	2	8	236103	236110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4779	NC_015436	CTGG	2	8	236131	236138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4780	NC_015436	CTG	2	6	236219	236224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4781	NC_015436	GCTG	2	8	236271	236278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4782	NC_015436	TGT	2	6	236301	236306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4783	NC_015436	GCTT	2	8	236319	236326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4784	NC_015436	CTTT	2	8	236408	236415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4785	NC_015436	TTC	2	6	236492	236497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4786	NC_015436	ATC	2	6	236539	236544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4787	NC_015436	TTC	2	6	236588	236593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4788	NC_015436	CGG	2	6	236598	236603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4789	NC_015436	CGG	2	6	236711	236716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4790	NC_015436	CAG	2	6	236831	236836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4793	NC_015436	GGA	2	6	236912	236917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4794	NC_015436	AG	3	6	236970	236975	50 %	0 %	50 %	0 %	330836191
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4838	NC_015436	AGACGA	2	12	239077	239088	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4839	NC_015436	AGTC	2	8	239091	239098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4840	NC_015436	TGA	2	6	239158	239163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4841	NC_015436	CGC	2	6	239209	239214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4842	NC_015436	T	6	6	239367	239372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4843	NC_015436	GAG	2	6	239383	239388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4844	NC_015436	AAT	2	6	239404	239409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836194
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4849	NC_015436	CATT	2	8	239640	239647	25 %	50 %	0 %	25 %	330836194
4850	NC_015436	GTC	2	6	239654	239659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836194
4851	NC_015436	TGA	2	6	239665	239670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836194
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4854	NC_015436	CCA	2	6	239799	239804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330836194
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4856	NC_015436	GGTCT	2	10	240026	240035	0 %	40 %	40 %	20 %	330836194
4857	NC_015436	CAGGGT	2	12	240055	240066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330836194
4858	NC_015436	TAT	2	6	240224	240229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836194
4859	NC_015436	ACA	3	9	240267	240275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330836194
4860	NC_015436	GAT	2	6	240389	240394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836194
4861	NC_015436	GATG	2	8	240421	240428	25 %	25 %	50 %	0 %	330836194
4862	NC_015436	GAA	2	6	240518	240523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836194
4863	NC_015436	AGAA	2	8	240582	240589	75 %	0 %	25 %	0 %	330836194
4864	NC_015436	AGG	2	6	240613	240618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836194
4865	NC_015436	GGAC	2	8	240745	240752	25 %	0 %	50 %	25 %	330836194
4866	NC_015436	TTC	2	6	240806	240811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836194
4867	NC_015436	T	6	6	240895	240900	0 %	100 %	0 %	0 %	330836194
4868	NC_015436	AAGG	2	8	240935	240942	50 %	0 %	50 %	0 %	330836194
4869	NC_015436	ATG	2	6	241095	241100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836194
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4871	NC_015436	GGA	2	6	241193	241198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330836195
4872	NC_015436	TGGGA	2	10	241243	241252	20 %	20 %	60 %	0 %	330836195
4873	NC_015436	GGCT	2	8	241308	241315	0 %	25 %	50 %	25 %	330836195
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4933	NC_015436	CAA	2	6	244418	244423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4942	NC_015436	GA	3	6	244738	244743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4943	NC_015436	AGAGA	3	15	244739	244753	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4944	NC_015436	GA	4	8	244750	244757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4945	NC_015436	ATG	2	6	244796	244801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4956	NC_015436	G	7	7	245233	245239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4984	NC_015436	GAG	2	6	246457	246462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4989	NC_015436	TCTCTT	2	12	246618	246629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4993	NC_015436	T	7	7	246768	246774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4995	NC_015436	GAA	2	6	246797	246802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4997	NC_015436	GGA	2	6	246831	246836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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