MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015433	TGA	2	6	172636	172641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832026
3502	NC_015433	CGT	2	6	172666	172671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832026
3503	NC_015433	CTT	2	6	172691	172696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832026
3504	NC_015433	GGT	2	6	172820	172825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832026
3505	NC_015433	TCA	2	6	172881	172886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832026
3506	NC_015433	ACGG	2	8	172892	172899	25 %	0 %	50 %	25 %	330832026
3507	NC_015433	ACC	2	6	172902	172907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330832026
3508	NC_015433	CGGT	2	8	172980	172987	0 %	25 %	50 %	25 %	330832026
3509	NC_015433	TCC	2	6	173010	173015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832026
3510	NC_015433	GAAA	2	8	173041	173048	75 %	0 %	25 %	0 %	330832026
3511	NC_015433	ATG	2	6	173052	173057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832026
3512	NC_015433	AAAG	2	8	173089	173096	75 %	0 %	25 %	0 %	330832026
3513	NC_015433	GCCA	2	8	173114	173121	25 %	0 %	25 %	50 %	330832026
3514	NC_015433	TCT	2	6	173127	173132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832026
3515	NC_015433	GTT	2	6	173141	173146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330832026
3516	NC_015433	CCG	2	6	173163	173168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330832026
3517	NC_015433	T	7	7	173202	173208	0 %	100 %	0 %	0 %	330832026
3518	NC_015433	AAG	2	6	173210	173215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832026
3519	NC_015433	GAA	2	6	173241	173246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832026
3520	NC_015433	GGC	2	6	173249	173254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832026
3521	NC_015433	CAT	2	6	173255	173260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330832026
3522	NC_015433	CAG	2	6	173263	173268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_015433	TAA	2	6	173281	173286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_015433	AGT	2	6	173336	173341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_015433	TGTA	2	8	173450	173457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_015433	AAC	2	6	173503	173508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_015433	GAAA	2	8	173523	173530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_015433	GTAG	2	8	173531	173538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015433	AG	3	6	173558	173563	50 %	0 %	50 %	0 %	330832027
3530	NC_015433	T	6	6	173581	173586	0 %	100 %	0 %	0 %	330832027
3531	NC_015433	CTC	2	6	173593	173598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330832027
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3533	NC_015433	AACA	2	8	173712	173719	75 %	0 %	0 %	25 %	330832027
3534	NC_015433	GATTTG	2	12	173747	173758	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	330832027
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3542	NC_015433	AATC	2	8	174547	174554	50 %	25 %	0 %	25 %	330832027
3543	NC_015433	GAA	2	6	174578	174583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330832027
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3545	NC_015433	GGA	2	6	174670	174675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330832027
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3550	NC_015433	CAAG	2	8	174907	174914	50 %	0 %	25 %	25 %	330832027
3551	NC_015433	TAGA	2	8	174937	174944	50 %	25 %	25 %	0 %	330832027
3552	NC_015433	CATTG	2	10	174968	174977	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3553	NC_015433	ATT	2	6	175003	175008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_015433	A	6	6	175123	175128	100 %	0 %	0 %	0 %	330832028
3555	NC_015433	CAGT	2	8	175129	175136	25 %	25 %	25 %	25 %	330832028
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3560	NC_015433	TGA	2	6	175310	175315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832028
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3563	NC_015433	AAC	2	6	175426	175431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330832028
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3597	NC_015433	TTTA	2	8	176593	176600	25 %	75 %	0 %	0 %	330832029
3598	NC_015433	AGGG	2	8	176649	176656	25 %	0 %	75 %	0 %	330832029
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3609	NC_015433	A	6	6	177341	177346	100 %	0 %	0 %	0 %	330832029
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3743	NC_015433	GAGAG	2	10	183390	183399	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3993	NC_015433	TTC	2	6	196021	196026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832045
3994	NC_015433	GATT	2	8	196036	196043	25 %	50 %	25 %	0 %	330832045
3995	NC_015433	TCG	2	6	196046	196051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330832045
3996	NC_015433	TTC	2	6	196084	196089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330832045
3997	NC_015433	AGT	2	6	196095	196100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832045
3998	NC_015433	GAT	2	6	196135	196140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330832045
3999	NC_015433	GTG	2	6	196177	196182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330832045
4000	NC_015433	CGG	2	6	196196	196201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330832045

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