MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015433	GAA	2	6	49053	49058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831889
1002	NC_015433	ATGGA	2	10	49071	49080	40 %	20 %	40 %	0 %	330831889
1003	NC_015433	ATA	2	6	49090	49095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831889
1004	NC_015433	TA	3	6	49112	49117	50 %	50 %	0 %	0 %	330831889
1005	NC_015433	TA	3	6	49119	49124	50 %	50 %	0 %	0 %	330831889
1006	NC_015433	GA	3	6	49199	49204	50 %	0 %	50 %	0 %	330831889
1007	NC_015433	A	7	7	49225	49231	100 %	0 %	0 %	0 %	330831889
1008	NC_015433	ATAG	2	8	49235	49242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015433	ACA	2	6	49256	49261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831890
1010	NC_015433	AC	3	6	49274	49279	50 %	0 %	0 %	50 %	330831890
1011	NC_015433	TTGG	2	8	49326	49333	0 %	50 %	50 %	0 %	330831890
1012	NC_015433	TGA	2	6	49350	49355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831890
1013	NC_015433	AGA	2	6	49386	49391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831890
1014	NC_015433	TGG	2	6	49469	49474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831890
1015	NC_015433	CGAC	2	8	49541	49548	25 %	0 %	25 %	50 %	330831890
1016	NC_015433	GTG	2	6	49549	49554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831890
1017	NC_015433	CAT	2	6	49593	49598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831890
1018	NC_015433	CGT	2	6	49600	49605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831890
1019	NC_015433	ATG	2	6	49666	49671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831890
1020	NC_015433	GGC	2	6	49770	49775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330831890
1021	NC_015433	TCC	2	6	49830	49835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330831890
1022	NC_015433	AAC	2	6	50000	50005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831890
1023	NC_015433	GTG	2	6	50107	50112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831890
1024	NC_015433	CT	3	6	50147	50152	0 %	50 %	0 %	50 %	330831890
1025	NC_015433	AGCGG	2	10	50181	50190	20 %	0 %	60 %	20 %	330831890
1026	NC_015433	TCA	2	6	50216	50221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831890
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1028	NC_015433	TTGA	2	8	50341	50348	25 %	50 %	25 %	0 %	330831890
1029	NC_015433	GAA	2	6	50476	50481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831890
1030	NC_015433	ACT	2	6	50504	50509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831890
1031	NC_015433	TGA	2	6	50523	50528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831890
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1033	NC_015433	T	7	7	50585	50591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015433	AATA	2	8	50603	50610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015433	GTAA	2	8	50652	50659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015433	AAAT	2	8	50660	50667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015433	T	6	6	50670	50675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015433	A	7	7	50728	50734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015433	TTA	2	6	50757	50762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015433	A	6	6	50841	50846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015433	T	6	6	50847	50852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015433	A	6	6	50854	50859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015433	TAAG	2	8	50877	50884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015433	AC	3	6	50913	50918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_015433	AAAT	2	8	50926	50933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015433	GAA	2	6	50983	50988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015433	GAT	2	6	50990	50995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015433	TGG	2	6	51024	51029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015433	A	6	6	51030	51035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015433	GTTT	2	8	51039	51046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015433	GAT	2	6	51064	51069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831891
1052	NC_015433	ACA	2	6	51117	51122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831891
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1055	NC_015433	ATT	2	6	51200	51205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831891
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1058	NC_015433	TTC	2	6	51317	51322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831891
1059	NC_015433	TGT	2	6	51348	51353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831891
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1062	NC_015433	TGA	2	6	51520	51525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831891
1063	NC_015433	CAA	2	6	51546	51551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831891
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1070	NC_015433	CA	3	6	51917	51922	50 %	0 %	0 %	50 %	330831892
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1079	NC_015433	GAT	3	9	52358	52366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831892
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1082	NC_015433	CATT	2	8	52663	52670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_015433	TCGGTG	2	12	52672	52683	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1084	NC_015433	ATT	2	6	52689	52694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831893
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1086	NC_015433	TAT	2	6	52735	52740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831893
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1092	NC_015433	AATA	2	8	52893	52900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015433	ATCT	2	8	52920	52927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_015433	AATATG	2	12	52948	52959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	330831894
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1099	NC_015433	TTAGT	2	10	53258	53267	20 %	60 %	20 %	0 %	330831894
1100	NC_015433	CTT	2	6	53328	53333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831894
1101	NC_015433	AGT	2	6	53349	53354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831894
1102	NC_015433	GAT	2	6	53359	53364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831894
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1105	NC_015433	CAA	2	6	53402	53407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831894
1106	NC_015433	TCAA	2	8	53410	53417	50 %	25 %	0 %	25 %	330831894
1107	NC_015433	T	6	6	53489	53494	0 %	100 %	0 %	0 %	330831894
1108	NC_015433	ACA	2	6	53506	53511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831894
1109	NC_015433	AGC	2	6	53604	53609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831894
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1111	NC_015433	TA	3	6	53621	53626	50 %	50 %	0 %	0 %	330831894
1112	NC_015433	TTG	2	6	53627	53632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831894
1113	NC_015433	ATT	2	6	53734	53739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831895
1114	NC_015433	TCT	2	6	53757	53762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831895
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1118	NC_015433	TAT	2	6	54003	54008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831895
1119	NC_015433	GAA	2	6	54019	54024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831895
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1121	NC_015433	GCTA	2	8	54078	54085	25 %	25 %	25 %	25 %	330831895
1122	NC_015433	TC	3	6	54097	54102	0 %	50 %	0 %	50 %	330831895
1123	NC_015433	TTG	2	6	54136	54141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831895
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1125	NC_015433	GGA	2	6	54220	54225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330831895
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