MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 40924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015433	ACC	2	6	24549	24554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_015433	CGT	2	6	24586	24591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015433	ATTAT	2	10	24900	24909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015433	CGC	2	6	24979	24984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_015433	TA	3	6	24985	24990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015433	AT	3	6	25076	25081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015433	GGA	2	6	25083	25088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015433	CGTG	2	8	25143	25150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_015433	TCC	2	6	25166	25171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_015433	TCG	2	6	25207	25212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015433	CGG	2	6	25319	25324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015433	TAT	2	6	25367	25372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015433	GGT	2	6	25425	25430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015433	ATATT	2	10	25449	25458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015433	TAG	3	9	25628	25636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831868
516	NC_015433	TTA	2	6	25651	25656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831868
517	NC_015433	TTTG	2	8	25671	25678	0 %	75 %	25 %	0 %	330831868
518	NC_015433	ATA	2	6	25715	25720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831868
519	NC_015433	GTT	2	6	25729	25734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831868
520	NC_015433	CTA	2	6	25766	25771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831868
521	NC_015433	T	7	7	25774	25780	0 %	100 %	0 %	0 %	330831868
522	NC_015433	TGA	2	6	25808	25813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831868
523	NC_015433	TAT	2	6	25848	25853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831868
524	NC_015433	GCT	2	6	25870	25875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831868
525	NC_015433	AGA	2	6	25893	25898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831868
526	NC_015433	AAC	2	6	25949	25954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831868
527	NC_015433	TGG	2	6	26064	26069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831868
528	NC_015433	CGG	2	6	26105	26110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330831868
529	NC_015433	ATG	2	6	26204	26209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831868
530	NC_015433	TGA	2	6	26250	26255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831868
531	NC_015433	TGT	2	6	26274	26279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831868
532	NC_015433	CAAA	2	8	26428	26435	75 %	0 %	0 %	25 %	330831868
533	NC_015433	TTTAT	2	10	26480	26489	20 %	80 %	0 %	0 %	330831869
534	NC_015433	GGTC	2	8	26526	26533	0 %	25 %	50 %	25 %	330831869
535	NC_015433	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831869
536	NC_015433	T	6	6	26577	26582	0 %	100 %	0 %	0 %	330831869
537	NC_015433	ATT	2	6	26611	26616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831869
538	NC_015433	CTA	2	6	26676	26681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831869
539	NC_015433	TCT	2	6	26715	26720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831869
540	NC_015433	TAG	2	6	26766	26771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831869
541	NC_015433	TTA	2	6	26790	26795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831869
542	NC_015433	TAA	2	6	26854	26859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831869
543	NC_015433	ATT	2	6	26911	26916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831869
544	NC_015433	AACA	2	8	26935	26942	75 %	0 %	0 %	25 %	330831869
545	NC_015433	TAA	2	6	26956	26961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015433	T	7	7	26983	26989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015433	GA	3	6	26998	27003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015433	GAG	2	6	27017	27022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015433	GAA	2	6	27037	27042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831870
550	NC_015433	A	7	7	27041	27047	100 %	0 %	0 %	0 %	330831870
551	NC_015433	TCTA	2	8	27079	27086	25 %	50 %	0 %	25 %	330831870
552	NC_015433	ATG	2	6	27117	27122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831870
553	NC_015433	GCA	2	6	27137	27142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831870
554	NC_015433	A	6	6	27142	27147	100 %	0 %	0 %	0 %	330831870
555	NC_015433	CAA	2	6	27173	27178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831870
556	NC_015433	CAA	3	9	27188	27196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831870
557	NC_015433	AGA	2	6	27253	27258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330831870
558	NC_015433	GGC	2	6	27292	27297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330831870
559	NC_015433	ATCA	2	8	27418	27425	50 %	25 %	0 %	25 %	330831870
560	NC_015433	AATGC	2	10	27446	27455	40 %	20 %	20 %	20 %	330831870
561	NC_015433	TAA	2	6	27472	27477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831870
562	NC_015433	AAC	2	6	27489	27494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831870
563	NC_015433	TTG	2	6	27516	27521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831870
564	NC_015433	ACT	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831870
565	NC_015433	GCT	2	6	27626	27631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831870
566	NC_015433	CTG	2	6	27660	27665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831870
567	NC_015433	TTG	2	6	27683	27688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831870
568	NC_015433	CAA	2	6	27776	27781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831870
569	NC_015433	CAT	2	6	27906	27911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831870
570	NC_015433	GCA	2	6	27932	27937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831870
571	NC_015433	AAT	2	6	27938	27943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831870
572	NC_015433	GGT	2	6	28118	28123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831870
573	NC_015433	TAT	2	6	28124	28129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831870
574	NC_015433	TGT	2	6	28141	28146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831870
575	NC_015433	CAA	2	6	28164	28169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831870
576	NC_015433	GTT	2	6	28178	28183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831870
577	NC_015433	GTC	2	6	28200	28205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831870
578	NC_015433	GTG	2	6	28224	28229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831870
579	NC_015433	CAA	2	6	28242	28247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330831870
580	NC_015433	TAC	2	6	28268	28273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831870
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582	NC_015433	AT	3	6	28377	28382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015433	AGG	2	6	28383	28388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015433	A	7	7	28460	28466	100 %	0 %	0 %	0 %	330831871
585	NC_015433	TTC	2	6	28563	28568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831871
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587	NC_015433	GTA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831871
588	NC_015433	TTA	2	6	28669	28674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831871
589	NC_015433	TGG	2	6	28731	28736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831871
590	NC_015433	TTG	2	6	28769	28774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831871
591	NC_015433	TGC	2	6	28789	28794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831871
592	NC_015433	TTC	2	6	28808	28813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831871
593	NC_015433	ATTG	2	8	28846	28853	25 %	50 %	25 %	0 %	330831871
594	NC_015433	ATT	2	6	28857	28862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831871
595	NC_015433	CGT	2	6	28868	28873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330831871
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597	NC_015433	TGG	2	6	28915	28920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831871
598	NC_015433	TAT	2	6	28969	28974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831871
599	NC_015433	TGA	2	6	29016	29021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831871
600	NC_015433	ATT	2	6	29024	29029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831871
601	NC_015433	TTGA	2	8	29057	29064	25 %	50 %	25 %	0 %	330831871
602	NC_015433	TGAT	2	8	29070	29077	25 %	50 %	25 %	0 %	330831871
603	NC_015433	GTT	2	6	29213	29218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330831871
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607	NC_015433	TTTG	2	8	29335	29342	0 %	75 %	25 %	0 %	330831871
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609	NC_015433	T	6	6	29389	29394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015433	ATTT	2	8	29397	29404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015433	TAT	2	6	29413	29418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015433	TAA	2	6	29469	29474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330831872
613	NC_015433	GAT	2	6	29499	29504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831872
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616	NC_015433	TTA	2	6	29631	29636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330831872
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620	NC_015433	TGG	2	6	29849	29854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330831872
621	NC_015433	ACG	2	6	29878	29883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831872
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625	NC_015433	CAT	2	6	30354	30359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831872
626	NC_015433	CTT	2	6	30459	30464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330831872
627	NC_015433	GAAA	2	8	30479	30486	75 %	0 %	25 %	0 %	330831872
628	NC_015433	GCA	2	6	30553	30558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330831872
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630	NC_015433	TA	3	6	30645	30650	50 %	50 %	0 %	0 %	330831873
631	NC_015433	ATG	3	9	30798	30806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831873
632	NC_015433	TCA	2	6	30829	30834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330831873
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635	NC_015433	T	6	6	30952	30957	0 %	100 %	0 %	0 %	330831873
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642	NC_015433	TGA	2	6	31506	31511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330831874
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