MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC BAA-2069 plasmid pSGG1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015219	AACC	2	8	459	466	50 %	0 %	0 %	50 %	325926839
2	NC_015219	ACAA	2	8	1490	1497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015219	GCTA	2	8	2384	2391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015219	TATT	2	8	2882	2889	25 %	75 %	0 %	0 %	325926840
5	NC_015219	AAAT	2	8	3295	3302	75 %	25 %	0 %	0 %	325926840
6	NC_015219	TAAA	2	8	5266	5273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015219	TAGT	2	8	5532	5539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015219	TCTT	2	8	6037	6044	0 %	75 %	0 %	25 %	325926842
9	NC_015219	TTGA	2	8	7098	7105	25 %	50 %	25 %	0 %	325926843
10	NC_015219	TTTA	2	8	7315	7322	25 %	75 %	0 %	0 %	325926844
11	NC_015219	TCAC	2	8	7519	7526	25 %	25 %	0 %	50 %	325926844
12	NC_015219	TTCT	2	8	7527	7534	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015219	TAAA	2	8	7582	7589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015219	TACA	2	8	7776	7783	50 %	25 %	0 %	25 %	325926845
15	NC_015219	ACAG	2	8	7832	7839	50 %	0 %	25 %	25 %	325926845
16	NC_015219	TAAA	2	8	8134	8141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015219	GATG	2	8	9054	9061	25 %	25 %	50 %	0 %	325926846
18	NC_015219	TCTA	2	8	9161	9168	25 %	50 %	0 %	25 %	325926846
19	NC_015219	TCCA	2	8	9252	9259	25 %	25 %	0 %	50 %	325926846
20	NC_015219	GACA	2	8	9276	9283	50 %	0 %	25 %	25 %	325926846
21	NC_015219	TTAT	2	8	9617	9624	25 %	75 %	0 %	0 %	325926846
22	NC_015219	AATC	2	8	9772	9779	50 %	25 %	0 %	25 %	325926846
23	NC_015219	ATGG	2	8	9833	9840	25 %	25 %	50 %	0 %	325926846
24	NC_015219	CCAG	2	8	10194	10201	25 %	0 %	25 %	50 %	325926846
25	NC_015219	ATTT	2	8	10212	10219	25 %	75 %	0 %	0 %	325926846
26	NC_015219	AGGA	2	8	10396	10403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015219	AAGA	2	8	10448	10455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015219	GGGT	2	8	10610	10617	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015219	CAGG	2	8	10974	10981	25 %	0 %	50 %	25 %	325926847
30	NC_015219	CCAA	2	8	11398	11405	50 %	0 %	0 %	50 %	325926848
31	NC_015219	AATT	2	8	11754	11761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015219	AATG	2	8	11771	11778	50 %	25 %	25 %	0 %	325926849
33	NC_015219	AAAG	2	8	12355	12362	75 %	0 %	25 %	0 %	325926849
34	NC_015219	TTTC	2	8	12782	12789	0 %	75 %	0 %	25 %	325926849
35	NC_015219	CTTT	2	8	12811	12818	0 %	75 %	0 %	25 %	325926849
36	NC_015219	AGTT	2	8	13716	13723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015219	TATT	2	8	14048	14055	25 %	75 %	0 %	0 %	325926852
38	NC_015219	CGAA	2	8	14175	14182	50 %	0 %	25 %	25 %	325926852
39	NC_015219	AAAT	2	8	14307	14314	75 %	25 %	0 %	0 %	325926852
40	NC_015219	TGTC	2	8	14410	14417	0 %	50 %	25 %	25 %	325926852
41	NC_015219	TCAT	2	8	14578	14585	25 %	50 %	0 %	25 %	325926852
42	NC_015219	ATTT	3	12	14642	14653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015219	CTTT	2	8	15405	15412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015219	ATTT	2	8	15472	15479	25 %	75 %	0 %	0 %	325926853
45	NC_015219	TTGC	2	8	15920	15927	0 %	50 %	25 %	25 %	325926853
46	NC_015219	GGTC	2	8	15934	15941	0 %	25 %	50 %	25 %	325926853
47	NC_015219	TTTG	2	8	16646	16653	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015219	AAAT	2	8	16910	16917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015219	TTCT	2	8	17075	17082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015219	ATCT	2	8	17178	17185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015219	TTAA	2	8	17347	17354	50 %	50 %	0 %	0 %	325926855
52	NC_015219	ATAA	2	8	18187	18194	75 %	25 %	0 %	0 %	325926856
53	NC_015219	TGTT	2	8	18252	18259	0 %	75 %	25 %	0 %	325926856
54	NC_015219	ATTT	2	8	18538	18545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015219	GCTT	2	8	18762	18769	0 %	50 %	25 %	25 %	325926857
56	NC_015219	CAGT	2	8	19363	19370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015219	ATTT	2	8	20367	20374	25 %	75 %	0 %	0 %	325926858

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.