MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015152	TTG	2	6	53691	53696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969893
1002	NC_015152	CAT	2	6	53742	53747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969893
1003	NC_015152	T	6	6	53770	53775	0 %	100 %	0 %	0 %	325969893
1004	NC_015152	TTGGAG	2	12	53779	53790	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325969893
1005	NC_015152	TCG	2	6	53848	53853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969893
1006	NC_015152	ATG	2	6	53893	53898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969893
1007	NC_015152	CAG	2	6	53940	53945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969893
1008	NC_015152	CCAA	2	8	53950	53957	50 %	0 %	0 %	50 %	325969893
1009	NC_015152	GCT	2	6	53991	53996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969893
1010	NC_015152	AG	3	6	54000	54005	50 %	0 %	50 %	0 %	325969893
1011	NC_015152	GAA	2	6	54086	54091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969893
1012	NC_015152	TTC	2	6	54093	54098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969893
1013	NC_015152	TGAG	2	8	54113	54120	25 %	25 %	50 %	0 %	325969893
1014	NC_015152	ACC	2	6	54127	54132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969893
1015	NC_015152	T	7	7	54134	54140	0 %	100 %	0 %	0 %	325969893
1016	NC_015152	GAC	2	6	54167	54172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969894
1017	NC_015152	CCA	2	6	54183	54188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969894
1018	NC_015152	CATAC	2	10	54242	54251	40 %	20 %	0 %	40 %	325969894
1019	NC_015152	GAT	2	6	54290	54295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969894
1020	NC_015152	ATG	2	6	54309	54314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969894
1021	NC_015152	GGT	2	6	54479	54484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969894
1022	NC_015152	GCCTGA	2	12	54514	54525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325969894
1023	NC_015152	GATG	2	8	54544	54551	25 %	25 %	50 %	0 %	325969894
1024	NC_015152	TTC	2	6	54590	54595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969894
1025	NC_015152	CAGCTC	2	12	54611	54622	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325969894
1026	NC_015152	ACC	2	6	54648	54653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969894
1027	NC_015152	TTG	2	6	54703	54708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969894
1028	NC_015152	GAT	2	6	54745	54750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969894
1029	NC_015152	TCC	2	6	54900	54905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969894
1030	NC_015152	CTG	2	6	55070	55075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969894
1031	NC_015152	CCTT	2	8	55119	55126	0 %	50 %	0 %	50 %	325969894
1032	NC_015152	T	8	8	55151	55158	0 %	100 %	0 %	0 %	325969894
1033	NC_015152	TA	3	6	55216	55221	50 %	50 %	0 %	0 %	325969895
1034	NC_015152	AGT	2	6	55234	55239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969895
1035	NC_015152	GAT	2	6	55291	55296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969895
1036	NC_015152	AGA	2	6	55428	55433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969895
1037	NC_015152	AGC	2	6	55448	55453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969895
1038	NC_015152	TTCT	2	8	55556	55563	0 %	75 %	0 %	25 %	325969895
1039	NC_015152	GAGCA	2	10	55610	55619	40 %	0 %	40 %	20 %	325969895
1040	NC_015152	CAT	2	6	55651	55656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969895
1041	NC_015152	T	6	6	55697	55702	0 %	100 %	0 %	0 %	325969895
1042	NC_015152	AT	3	6	55745	55750	50 %	50 %	0 %	0 %	325969895
1043	NC_015152	AGG	2	6	55751	55756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969895
1044	NC_015152	ATG	2	6	55879	55884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969896
1045	NC_015152	CGA	2	6	55973	55978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969896
1046	NC_015152	GTG	2	6	56004	56009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969896
1047	NC_015152	ACA	2	6	56011	56016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969896
1048	NC_015152	TCA	2	6	56029	56034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969896
1049	NC_015152	GCA	2	6	56044	56049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969896
1050	NC_015152	GGT	2	6	56120	56125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969896
1051	NC_015152	ATC	2	6	56139	56144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969896
1052	NC_015152	CGA	2	6	56165	56170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969896
1053	NC_015152	TTC	2	6	56228	56233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969896
1054	NC_015152	GGAA	2	8	56258	56265	50 %	0 %	50 %	0 %	325969896
1055	NC_015152	GGT	2	6	56345	56350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969896
1056	NC_015152	GTT	2	6	56369	56374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969896
1057	NC_015152	GTT	2	6	56489	56494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969896
1058	NC_015152	ATT	2	6	56538	56543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969896
1059	NC_015152	ACC	2	6	56634	56639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969896
1060	NC_015152	AGG	2	6	56668	56673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969896
1061	NC_015152	AAG	2	6	56703	56708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969896
1062	NC_015152	GTGAAA	2	12	56757	56768	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325969896
1063	NC_015152	CAA	2	6	56912	56917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969896
1064	NC_015152	AAAG	2	8	56972	56979	75 %	0 %	25 %	0 %	325969896
1065	NC_015152	ACC	2	6	57016	57021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969896
1066	NC_015152	GAT	2	6	57062	57067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969896
1067	NC_015152	ATG	2	6	57216	57221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969896
1068	NC_015152	TCA	2	6	57271	57276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969896
1069	NC_015152	TGA	2	6	57322	57327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969896
1070	NC_015152	CTT	2	6	57332	57337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969896
1071	NC_015152	GCAG	2	8	57363	57370	25 %	0 %	50 %	25 %	325969896
1072	NC_015152	CAA	2	6	57407	57412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969896
1073	NC_015152	GAC	2	6	57450	57455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969896
1074	NC_015152	ATGA	2	8	57579	57586	50 %	25 %	25 %	0 %	325969896
1075	NC_015152	TCA	2	6	57643	57648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969896
1076	NC_015152	TCA	2	6	57720	57725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969897
1077	NC_015152	TGG	2	6	57834	57839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969897
1078	NC_015152	ACC	2	6	57855	57860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969897
1079	NC_015152	TCC	2	6	57872	57877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969897
1080	NC_015152	CT	3	6	57946	57951	0 %	50 %	0 %	50 %	325969897
1081	NC_015152	GCG	2	6	57965	57970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969897
1082	NC_015152	GCTT	2	8	57993	58000	0 %	50 %	25 %	25 %	325969897
1083	NC_015152	AAG	2	6	58010	58015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969897
1084	NC_015152	ATG	2	6	58056	58061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969897
1085	NC_015152	GAA	2	6	58062	58067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969897
1086	NC_015152	GTA	2	6	58079	58084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969897
1087	NC_015152	CGT	2	6	58102	58107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969897
1088	NC_015152	GGTA	2	8	58135	58142	25 %	25 %	50 %	0 %	325969897
1089	NC_015152	TTC	2	6	58155	58160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969897
1090	NC_015152	GGC	2	6	58192	58197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969897
1091	NC_015152	TTG	2	6	58251	58256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969897
1092	NC_015152	TAC	2	6	58312	58317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969897
1093	NC_015152	ATT	3	9	58331	58339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969897
1094	NC_015152	TTCG	2	8	58377	58384	0 %	50 %	25 %	25 %	325969897
1095	NC_015152	GGA	2	6	58387	58392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969897
1096	NC_015152	AAG	2	6	58400	58405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969897
1097	NC_015152	GC	3	6	58472	58477	0 %	0 %	50 %	50 %	325969897
1098	NC_015152	CAT	2	6	58579	58584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969897
1099	NC_015152	TGG	2	6	58623	58628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969897
1100	NC_015152	CTG	2	6	58667	58672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969897
1101	NC_015152	AGA	3	9	58740	58748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969897
1102	NC_015152	AGA	2	6	58753	58758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969897
1103	NC_015152	GAG	2	6	58796	58801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969897
1104	NC_015152	GAA	2	6	58885	58890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969897
1105	NC_015152	GAA	2	6	59362	59367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969897
1106	NC_015152	GTAC	2	8	59415	59422	25 %	25 %	25 %	25 %	325969897
1107	NC_015152	GAG	2	6	59477	59482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969897
1108	NC_015152	GAA	2	6	59509	59514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969897
1109	NC_015152	GTG	2	6	59585	59590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969897
1110	NC_015152	GAT	2	6	59621	59626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969897
1111	NC_015152	AGG	2	6	59634	59639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969897
1112	NC_015152	ATG	2	6	59641	59646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969897
1113	NC_015152	AGGAT	2	10	59654	59663	40 %	20 %	40 %	0 %	325969898
1114	NC_015152	ATC	3	9	59686	59694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969898
1115	NC_015152	GCG	2	6	59705	59710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969898
1116	NC_015152	ACA	2	6	59783	59788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969898
1117	NC_015152	CCA	2	6	59834	59839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969898
1118	NC_015152	TTG	2	6	59846	59851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969898
1119	NC_015152	GAA	2	6	59913	59918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969898
1120	NC_015152	TCG	2	6	59933	59938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969898
1121	NC_015152	CCAA	2	8	59948	59955	50 %	0 %	0 %	50 %	325969898
1122	NC_015152	CAA	2	6	60000	60005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969898
1123	NC_015152	GAA	2	6	60027	60032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969898
1124	NC_015152	CAT	2	6	60121	60126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969898
1125	NC_015152	TGC	2	6	60144	60149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969898
1126	NC_015152	GGC	2	6	60186	60191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969898
1127	NC_015152	TGG	2	6	60207	60212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969898
1128	NC_015152	GAA	2	6	60255	60260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969898
1129	NC_015152	GAT	2	6	60292	60297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969898
1130	NC_015152	ATG	2	6	60365	60370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015152	TCA	2	6	60379	60384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_015152	ATCC	2	8	60410	60417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_015152	TTC	2	6	60467	60472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015152	ATG	2	6	60479	60484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015152	ATG	2	6	60486	60491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015152	AT	3	6	60540	60545	50 %	50 %	0 %	0 %	325969899
1137	NC_015152	TGC	2	6	60551	60556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969899
1138	NC_015152	TGA	2	6	60610	60615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969899
1139	NC_015152	GAC	2	6	60624	60629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969899
1140	NC_015152	ATC	2	6	60645	60650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969899
1141	NC_015152	TTC	2	6	60746	60751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969899
1142	NC_015152	CGA	2	6	60809	60814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969899
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1144	NC_015152	CTA	2	6	60874	60879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969899
1145	NC_015152	CCA	2	6	60889	60894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969899
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1147	NC_015152	CTG	2	6	61164	61169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969899
1148	NC_015152	TCG	2	6	61222	61227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969900
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1150	NC_015152	CGC	2	6	61405	61410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969900
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1152	NC_015152	CCA	2	6	61518	61523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969900
1153	NC_015152	ATCG	2	8	61546	61553	25 %	25 %	25 %	25 %	325969900
1154	NC_015152	AGGA	2	8	61586	61593	50 %	0 %	50 %	0 %	325969900
1155	NC_015152	CGGAGA	2	12	61615	61626	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325969900
1156	NC_015152	GAT	2	6	61639	61644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969900
1157	NC_015152	GCA	2	6	61661	61666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969900
1158	NC_015152	CCA	2	6	61669	61674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969900
1159	NC_015152	ACA	3	9	61704	61712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969900
1160	NC_015152	GCG	2	6	61722	61727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969900
1161	NC_015152	GA	3	6	61923	61928	50 %	0 %	50 %	0 %	325969900
1162	NC_015152	GAA	2	6	61955	61960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969900
1163	NC_015152	GAG	2	6	61989	61994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969900
1164	NC_015152	CTT	2	6	62041	62046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969901
1165	NC_015152	GGT	2	6	62100	62105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969901
1166	NC_015152	CAG	2	6	62125	62130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969901
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1169	NC_015152	TA	3	6	62218	62223	50 %	50 %	0 %	0 %	325969901
1170	NC_015152	CTGCC	2	10	62412	62421	0 %	20 %	20 %	60 %	325969901
1171	NC_015152	TGA	2	6	62562	62567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969901
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1180	NC_015152	A	7	7	63001	63007	100 %	0 %	0 %	0 %	325969902
1181	NC_015152	GTT	2	6	63028	63033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969902
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1183	NC_015152	GCA	2	6	63055	63060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969902
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1186	NC_015152	CAC	2	6	63283	63288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969902
1187	NC_015152	GTT	2	6	63330	63335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969902
1188	NC_015152	ACC	2	6	63365	63370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969902
1189	NC_015152	GGCA	2	8	63522	63529	25 %	0 %	50 %	25 %	325969902
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1192	NC_015152	GGCA	2	8	63767	63774	25 %	0 %	50 %	25 %	325969902
1193	NC_015152	AAG	2	6	63790	63795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969902
1194	NC_015152	GCA	2	6	63846	63851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969902
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1199	NC_015152	TAAG	2	8	64014	64021	50 %	25 %	25 %	0 %	325969902
1200	NC_015152	TGG	3	9	64032	64040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1201	NC_015152	GAAA	2	8	64044	64051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1202	NC_015152	TCCA	2	8	64056	64063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1203	NC_015152	AAC	2	6	64100	64105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969903
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1215	NC_015152	TGA	2	6	64664	64669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969904
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1220	NC_015152	ATCGAG	2	12	64927	64938	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325969904
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1230	NC_015152	TCA	2	6	65243	65248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969904
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1232	NC_015152	CCGA	2	8	65281	65288	25 %	0 %	25 %	50 %	325969904
1233	NC_015152	TGC	2	6	65292	65297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969904
1234	NC_015152	TCG	2	6	65411	65416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969904
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1237	NC_015152	CAT	2	6	65574	65579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969904
1238	NC_015152	CCT	2	6	65602	65607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969904
1239	NC_015152	TGG	2	6	65609	65614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969904
1240	NC_015152	TGA	2	6	65663	65668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969904
1241	NC_015152	CCG	2	6	65683	65688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969904
1242	NC_015152	TA	3	6	65702	65707	50 %	50 %	0 %	0 %	325969904
1243	NC_015152	TGT	2	6	65777	65782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969904
1244	NC_015152	CAA	2	6	65916	65921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969905
1245	NC_015152	AGCA	2	8	65933	65940	50 %	0 %	25 %	25 %	325969905
1246	NC_015152	GAT	2	6	66016	66021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969905
1247	NC_015152	CGAT	2	8	66041	66048	25 %	25 %	25 %	25 %	325969905
1248	NC_015152	GAA	2	6	66066	66071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969905
1249	NC_015152	ATG	2	6	66103	66108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969905
1250	NC_015152	A	7	7	66145	66151	100 %	0 %	0 %	0 %	325969905
1251	NC_015152	GTG	2	6	66152	66157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969905
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1264	NC_015152	CAGT	2	8	66701	66708	25 %	25 %	25 %	25 %	325969905
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1269	NC_015152	ATCG	2	8	66972	66979	25 %	25 %	25 %	25 %	325969906
1270	NC_015152	ACA	2	6	67003	67008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969906
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1284	NC_015152	GCGA	2	8	67689	67696	25 %	0 %	50 %	25 %	325969907
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