MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015152	CT	3	6	26002	26007	0 %	50 %	0 %	50 %	325969873
502	NC_015152	AGT	2	6	26118	26123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969873
503	NC_015152	A	7	7	26145	26151	100 %	0 %	0 %	0 %	325969873
504	NC_015152	CTG	2	6	26188	26193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969873
505	NC_015152	GCAA	2	8	26257	26264	50 %	0 %	25 %	25 %	325969873
506	NC_015152	GAG	2	6	26289	26294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969873
507	NC_015152	GCGTT	2	10	26312	26321	0 %	40 %	40 %	20 %	325969873
508	NC_015152	AGGC	2	8	26351	26358	25 %	0 %	50 %	25 %	325969873
509	NC_015152	GCT	2	6	26455	26460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969873
510	NC_015152	GTAT	2	8	26546	26553	25 %	50 %	25 %	0 %	325969873
511	NC_015152	GCA	2	6	26724	26729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969873
512	NC_015152	TG	3	6	26779	26784	0 %	50 %	50 %	0 %	325969873
513	NC_015152	A	6	6	26833	26838	100 %	0 %	0 %	0 %	325969873
514	NC_015152	TGA	2	6	26853	26858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969873
515	NC_015152	AAGG	2	8	26872	26879	50 %	0 %	50 %	0 %	325969873
516	NC_015152	GATA	2	8	26994	27001	50 %	25 %	25 %	0 %	325969873
517	NC_015152	GCT	2	6	27006	27011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969873
518	NC_015152	TGG	2	6	27032	27037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969873
519	NC_015152	GAG	2	6	27061	27066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969873
520	NC_015152	ACTGC	2	10	27088	27097	20 %	20 %	20 %	40 %	325969873
521	NC_015152	CGT	2	6	27206	27211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969874
522	NC_015152	TGA	3	9	27359	27367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969874
523	NC_015152	CAA	2	6	27440	27445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969874
524	NC_015152	A	6	6	27486	27491	100 %	0 %	0 %	0 %	325969874
525	NC_015152	CTTCA	2	10	27525	27534	20 %	40 %	0 %	40 %	325969874
526	NC_015152	AAG	2	6	27603	27608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969874
527	NC_015152	TGCA	2	8	27631	27638	25 %	25 %	25 %	25 %	325969874
528	NC_015152	TTA	2	6	27766	27771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969874
529	NC_015152	GGC	2	6	27841	27846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969874
530	NC_015152	ATG	2	6	28089	28094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969874
531	NC_015152	CTC	2	6	28138	28143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969874
532	NC_015152	GACAA	2	10	28152	28161	60 %	0 %	20 %	20 %	325969874
533	NC_015152	CTT	2	6	28238	28243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969874
534	NC_015152	TGA	2	6	28268	28273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969874
535	NC_015152	TCA	2	6	28363	28368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969874
536	NC_015152	TCA	2	6	28396	28401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969874
537	NC_015152	GGTC	2	8	28427	28434	0 %	25 %	50 %	25 %	325969874
538	NC_015152	TGT	2	6	28454	28459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969874
539	NC_015152	GAA	2	6	28492	28497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969874
540	NC_015152	GGT	2	6	28521	28526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969874
541	NC_015152	TCA	2	6	28534	28539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969874
542	NC_015152	CGA	2	6	28559	28564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969874
543	NC_015152	GTACA	2	10	28593	28602	40 %	20 %	20 %	20 %	325969874
544	NC_015152	TCAC	2	8	28634	28641	25 %	25 %	0 %	50 %	325969874
545	NC_015152	CAT	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969874
546	NC_015152	CAG	2	6	28721	28726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969874
547	NC_015152	GCA	2	6	28731	28736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969874
548	NC_015152	CT	3	6	28771	28776	0 %	50 %	0 %	50 %	325969874
549	NC_015152	CAT	2	6	28787	28792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969874
550	NC_015152	AGG	2	6	28860	28865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015152	CAG	2	6	28909	28914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969875
552	NC_015152	GCT	2	6	28928	28933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969875
553	NC_015152	CCGC	2	8	29013	29020	0 %	0 %	25 %	75 %	325969875
554	NC_015152	T	6	6	29078	29083	0 %	100 %	0 %	0 %	325969875
555	NC_015152	AGA	2	6	29113	29118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969875
556	NC_015152	A	6	6	29260	29265	100 %	0 %	0 %	0 %	325969875
557	NC_015152	TGC	2	6	29385	29390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969875
558	NC_015152	CCTA	2	8	29396	29403	25 %	25 %	0 %	50 %	325969875
559	NC_015152	GCA	2	6	29436	29441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969875
560	NC_015152	A	6	6	29502	29507	100 %	0 %	0 %	0 %	325969875
561	NC_015152	TGA	2	6	29536	29541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969875
562	NC_015152	ATCG	2	8	29545	29552	25 %	25 %	25 %	25 %	325969875
563	NC_015152	AGC	2	6	29583	29588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969875
564	NC_015152	GGC	2	6	29638	29643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969875
565	NC_015152	AGA	2	6	29646	29651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969875
566	NC_015152	GAA	2	6	29692	29697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969875
567	NC_015152	AGAATG	2	12	29757	29768	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325969876
568	NC_015152	A	6	6	29785	29790	100 %	0 %	0 %	0 %	325969876
569	NC_015152	GA	3	6	29865	29870	50 %	0 %	50 %	0 %	325969876
570	NC_015152	CTG	2	6	29889	29894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969876
571	NC_015152	ACGA	2	8	30063	30070	50 %	0 %	25 %	25 %	325969876
572	NC_015152	GAG	2	6	30135	30140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969876
573	NC_015152	ATC	2	6	30246	30251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969876
574	NC_015152	A	6	6	30303	30308	100 %	0 %	0 %	0 %	325969876
575	NC_015152	AAG	2	6	30311	30316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969876
576	NC_015152	GCT	2	6	30321	30326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969876
577	NC_015152	CAG	2	6	30464	30469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969876
578	NC_015152	CGAAG	2	10	30472	30481	40 %	0 %	40 %	20 %	325969876
579	NC_015152	CT	3	6	30522	30527	0 %	50 %	0 %	50 %	325969877
580	NC_015152	GCT	2	6	30570	30575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969877
581	NC_015152	CCA	2	6	30586	30591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969877
582	NC_015152	ATG	2	6	30678	30683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969877
583	NC_015152	GAA	2	6	30689	30694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
584	NC_015152	AG	3	6	30712	30717	50 %	0 %	50 %	0 %	325969877
585	NC_015152	CTA	2	6	30741	30746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969877
586	NC_015152	GGC	2	6	30791	30796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969877
587	NC_015152	CAG	2	6	30800	30805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
588	NC_015152	ACC	2	6	30839	30844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969877
589	NC_015152	GAA	2	6	30941	30946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
590	NC_015152	TGC	2	6	30949	30954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969877
591	NC_015152	AG	3	6	30961	30966	50 %	0 %	50 %	0 %	325969877
592	NC_015152	CGG	2	6	30967	30972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969877
593	NC_015152	CAG	2	6	31055	31060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
594	NC_015152	GAT	2	6	31079	31084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969877
595	NC_015152	AAG	2	6	31095	31100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
596	NC_015152	CAA	2	6	31108	31113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969877
597	NC_015152	GCA	2	6	31155	31160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
598	NC_015152	TGAG	2	8	31222	31229	25 %	25 %	50 %	0 %	325969877
599	NC_015152	AAG	2	6	31317	31322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
600	NC_015152	CT	3	6	31323	31328	0 %	50 %	0 %	50 %	325969877
601	NC_015152	GCA	2	6	31360	31365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
602	NC_015152	G	6	6	31393	31398	0 %	0 %	100 %	0 %	325969877
603	NC_015152	ACG	2	6	31453	31458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969877
604	NC_015152	GAA	2	6	31460	31465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969877
605	NC_015152	CAA	3	9	31493	31501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969877
606	NC_015152	GTA	2	6	31527	31532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969877
607	NC_015152	AC	3	6	31540	31545	50 %	0 %	0 %	50 %	325969877
608	NC_015152	TTG	2	6	31661	31666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969877
609	NC_015152	GCA	2	6	31773	31778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015152	TCAA	2	8	31781	31788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_015152	AG	4	8	31899	31906	50 %	0 %	50 %	0 %	325969878
612	NC_015152	AGAT	2	8	31914	31921	50 %	25 %	25 %	0 %	325969878
613	NC_015152	CCT	2	6	31936	31941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
614	NC_015152	ATC	2	6	32045	32050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969878
615	NC_015152	AGC	2	6	32157	32162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969878
616	NC_015152	GT	3	6	32164	32169	0 %	50 %	50 %	0 %	325969878
617	NC_015152	GAA	2	6	32225	32230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969878
618	NC_015152	CTC	2	6	32294	32299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
619	NC_015152	AGCA	2	8	32333	32340	50 %	0 %	25 %	25 %	325969878
620	NC_015152	GGC	2	6	32387	32392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969878
621	NC_015152	CCA	2	6	32416	32421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969878
622	NC_015152	TCGC	2	8	32459	32466	0 %	25 %	25 %	50 %	325969878
623	NC_015152	TGG	2	6	32473	32478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969878
624	NC_015152	GAA	2	6	32510	32515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969878
625	NC_015152	TCC	2	6	32786	32791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969878
626	NC_015152	GTC	2	6	32823	32828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969878
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628	NC_015152	GTT	2	6	32906	32911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969878
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