MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 63687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63502	NC_015152	TTC	2	6	3307397	3307402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972860
63503	NC_015152	CGA	2	6	3307458	3307463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972860
63504	NC_015152	CCTT	2	8	3307496	3307503	0 %	50 %	0 %	50 %	325972860
63505	NC_015152	AAGA	2	8	3307519	3307526	75 %	0 %	25 %	0 %	325972860
63506	NC_015152	TTGC	2	8	3307540	3307547	0 %	50 %	25 %	25 %	325972860
63507	NC_015152	CCAA	2	8	3307553	3307560	50 %	0 %	0 %	50 %	325972860
63508	NC_015152	ACC	2	6	3307646	3307651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972860
63509	NC_015152	CAT	2	6	3307653	3307658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972860
63510	NC_015152	AGA	2	6	3307666	3307671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972860
63511	NC_015152	GA	3	6	3307670	3307675	50 %	0 %	50 %	0 %	325972860
63512	NC_015152	AT	3	6	3307710	3307715	50 %	50 %	0 %	0 %	325972860
63513	NC_015152	AG	3	6	3307723	3307728	50 %	0 %	50 %	0 %	325972860
63514	NC_015152	CTC	2	6	3307774	3307779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972860
63515	NC_015152	ATAC	2	8	3307785	3307792	50 %	25 %	0 %	25 %	325972860
63516	NC_015152	CCGA	2	8	3307805	3307812	25 %	0 %	25 %	50 %	325972860
63517	NC_015152	ATC	2	6	3307832	3307837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972860
63518	NC_015152	AG	3	6	3307947	3307952	50 %	0 %	50 %	0 %	325972860
63519	NC_015152	ACC	2	6	3307961	3307966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972860
63520	NC_015152	CGAG	2	8	3307971	3307978	25 %	0 %	50 %	25 %	325972860
63521	NC_015152	TGA	2	6	3307998	3308003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972860
63522	NC_015152	CTT	2	6	3308037	3308042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972860
63523	NC_015152	AT	3	6	3308165	3308170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63524	NC_015152	GGA	2	6	3308214	3308219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972861
63525	NC_015152	G	7	7	3308258	3308264	0 %	0 %	100 %	0 %	325972861
63526	NC_015152	GCT	2	6	3308278	3308283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972861
63527	NC_015152	TCA	2	6	3308299	3308304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972861
63528	NC_015152	CAAG	2	8	3308392	3308399	50 %	0 %	25 %	25 %	325972861
63529	NC_015152	CTT	2	6	3308444	3308449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972861
63530	NC_015152	TTC	2	6	3308463	3308468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972861
63531	NC_015152	GGA	2	6	3308486	3308491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972861
63532	NC_015152	TTC	2	6	3308517	3308522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972861
63533	NC_015152	AGCTT	2	10	3308535	3308544	20 %	40 %	20 %	20 %	325972861
63534	NC_015152	TTC	2	6	3308568	3308573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972861
63535	NC_015152	CACGA	2	10	3308711	3308720	40 %	0 %	20 %	40 %	325972861
63536	NC_015152	TGA	2	6	3308767	3308772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972861
63537	NC_015152	GA	3	6	3308840	3308845	50 %	0 %	50 %	0 %	325972861
63538	NC_015152	GTC	2	6	3308846	3308851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972861
63539	NC_015152	TCA	2	6	3308856	3308861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972861
63540	NC_015152	CAA	2	6	3309050	3309055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972861
63541	NC_015152	GCA	2	6	3309079	3309084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972861
63542	NC_015152	TTGG	2	8	3309156	3309163	0 %	50 %	50 %	0 %	325972862
63543	NC_015152	TTC	2	6	3309192	3309197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972862
63544	NC_015152	TGG	2	6	3309200	3309205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972862
63545	NC_015152	TGCA	2	8	3309267	3309274	25 %	25 %	25 %	25 %	325972862
63546	NC_015152	TCT	2	6	3309283	3309288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972862
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63550	NC_015152	CTG	2	6	3309488	3309493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972862
63551	NC_015152	CTG	2	6	3309516	3309521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972862
63552	NC_015152	TCG	2	6	3309524	3309529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972862
63553	NC_015152	TTG	2	6	3309563	3309568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972862
63554	NC_015152	CTT	2	6	3309599	3309604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972862
63555	NC_015152	ATATGC	2	12	3309630	3309641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325972862
63556	NC_015152	CTT	2	6	3309647	3309652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972862
63557	NC_015152	TC	3	6	3309780	3309785	0 %	50 %	0 %	50 %	325972862
63558	NC_015152	CGA	2	6	3309791	3309796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972862
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63560	NC_015152	GATTGG	2	12	3309911	3309922	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325972862
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63570	NC_015152	GAGG	2	8	3310460	3310467	25 %	0 %	75 %	0 %	325972863
63571	NC_015152	ATC	2	6	3310495	3310500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972863
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63573	NC_015152	GCT	2	6	3310536	3310541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972863
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63575	NC_015152	GGTTA	2	10	3310702	3310711	20 %	40 %	40 %	0 %	325972863
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63580	NC_015152	GGA	2	6	3310938	3310943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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63584	NC_015152	T	8	8	3311231	3311238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63585	NC_015152	TC	3	6	3311267	3311272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63586	NC_015152	TCG	2	6	3311339	3311344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63587	NC_015152	AGA	2	6	3311353	3311358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63588	NC_015152	CAT	2	6	3311400	3311405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63589	NC_015152	CA	3	6	3311418	3311423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63590	NC_015152	ACA	2	6	3311441	3311446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63591	NC_015152	ACC	2	6	3311453	3311458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63592	NC_015152	T	6	6	3311547	3311552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63593	NC_015152	TGCAA	2	10	3311570	3311579	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63594	NC_015152	TA	3	6	3311636	3311641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63595	NC_015152	T	6	6	3311673	3311678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63596	NC_015152	A	6	6	3311684	3311689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63602	NC_015152	TCA	2	6	3311871	3311876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972865
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63608	NC_015152	TCCT	2	8	3312329	3312336	0 %	50 %	0 %	50 %	325972865
63609	NC_015152	GTT	2	6	3312416	3312421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972865
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63611	NC_015152	CAC	2	6	3312437	3312442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972865
63612	NC_015152	CAT	2	6	3312458	3312463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972865
63613	NC_015152	CTTG	2	8	3312566	3312573	0 %	50 %	25 %	25 %	325972865
63614	NC_015152	TAA	2	6	3312600	3312605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972865
63615	NC_015152	CAA	2	6	3312652	3312657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972865
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