MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 56417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014925	AAT	2	6	136322	136327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014925	ATT	2	6	136330	136335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014925	TAA	2	6	136348	136353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014925	TAA	2	6	136362	136367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014925	TTA	2	6	136388	136393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014925	GAA	2	6	136394	136399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014925	TGGC	2	8	136475	136482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_014925	AGTC	2	8	136499	136506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_014925	AAC	2	6	136536	136541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_014925	ATT	2	6	136556	136561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_014925	GAA	2	6	136601	136606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_014925	ATG	2	6	136641	136646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014925	AAC	2	6	136666	136671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_014925	A	6	6	136690	136695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_014925	AGAAA	2	10	136700	136709	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_014925	AAG	2	6	136730	136735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891419
3017	NC_014925	ATG	2	6	136824	136829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891419
3018	NC_014925	AAT	2	6	136907	136912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891419
3019	NC_014925	AGC	2	6	137121	137126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891419
3020	NC_014925	TTA	2	6	137148	137153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891419
3021	NC_014925	AGA	2	6	137179	137184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891419
3022	NC_014925	TTA	2	6	137185	137190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891419
3023	NC_014925	AAG	2	6	137204	137209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891419
3024	NC_014925	ACATT	2	10	137210	137219	40 %	40 %	0 %	20 %	319891419
3025	NC_014925	AGAGA	2	10	137235	137244	60 %	0 %	40 %	0 %	319891419
3026	NC_014925	GT	3	6	137290	137295	0 %	50 %	50 %	0 %	319891419
3027	NC_014925	TTTA	2	8	137356	137363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014925	ATT	2	6	137379	137384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_014925	ATAA	2	8	137396	137403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014925	AGAT	2	8	137448	137455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_014925	TTCG	2	8	137598	137605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_014925	A	6	6	137614	137619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014925	T	8	8	137651	137658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014925	AAAT	2	8	137726	137733	75 %	25 %	0 %	0 %	319891420
3035	NC_014925	T	6	6	137760	137765	0 %	100 %	0 %	0 %	319891420
3036	NC_014925	GGT	2	6	137775	137780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891420
3037	NC_014925	TCA	2	6	137851	137856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891420
3038	NC_014925	CTT	2	6	137893	137898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891420
3039	NC_014925	ATC	2	6	137936	137941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891420
3040	NC_014925	TGT	2	6	137954	137959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891420
3041	NC_014925	T	6	6	137980	137985	0 %	100 %	0 %	0 %	319891420
3042	NC_014925	CTT	2	6	138148	138153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891420
3043	NC_014925	T	7	7	138346	138352	0 %	100 %	0 %	0 %	319891420
3044	NC_014925	ATC	2	6	138386	138391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891420
3045	NC_014925	TAA	2	6	138410	138415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891420
3046	NC_014925	GT	3	6	138432	138437	0 %	50 %	50 %	0 %	319891420
3047	NC_014925	TTAA	2	8	138489	138496	50 %	50 %	0 %	0 %	319891420
3048	NC_014925	GTT	2	6	138575	138580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891420
3049	NC_014925	GC	4	8	138660	138667	0 %	0 %	50 %	50 %	319891420
3050	NC_014925	GTATCG	2	12	138669	138680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319891420
3051	NC_014925	GCC	2	6	138722	138727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319891420
3052	NC_014925	TGA	2	6	138775	138780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891420
3053	NC_014925	GAT	2	6	138800	138805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891420
3054	NC_014925	T	6	6	138850	138855	0 %	100 %	0 %	0 %	319891420
3055	NC_014925	CTG	2	6	138862	138867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891420
3056	NC_014925	TCG	2	6	138888	138893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891420
3057	NC_014925	GTT	2	6	138975	138980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891420
3058	NC_014925	ATA	2	6	139050	139055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891420
3059	NC_014925	TTC	2	6	139100	139105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891420
3060	NC_014925	GACA	2	8	139186	139193	50 %	0 %	25 %	25 %	319891420
3061	NC_014925	ATTA	2	8	139259	139266	50 %	50 %	0 %	0 %	319891420
3062	NC_014925	CTT	2	6	139378	139383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891420
3063	NC_014925	CAAA	2	8	139414	139421	75 %	0 %	0 %	25 %	319891420
3064	NC_014925	TTCA	2	8	139517	139524	25 %	50 %	0 %	25 %	319891420
3065	NC_014925	CA	3	6	139564	139569	50 %	0 %	0 %	50 %	319891420
3066	NC_014925	ATT	2	6	139580	139585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891420
3067	NC_014925	CGA	2	6	139609	139614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891420
3068	NC_014925	CGGA	2	8	139644	139651	25 %	0 %	50 %	25 %	319891420
3069	NC_014925	ACCG	2	8	139673	139680	25 %	0 %	25 %	50 %	319891420
3070	NC_014925	T	6	6	139705	139710	0 %	100 %	0 %	0 %	319891420
3071	NC_014925	TGA	2	6	139714	139719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891420
3072	NC_014925	T	6	6	139923	139928	0 %	100 %	0 %	0 %	319891420
3073	NC_014925	GTT	2	6	139931	139936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891420
3074	NC_014925	ATGAAT	2	12	139949	139960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319891420
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3076	NC_014925	CCT	2	6	140109	140114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319891421
3077	NC_014925	CTT	2	6	140131	140136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891421
3078	NC_014925	AAT	2	6	140142	140147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891421
3079	NC_014925	A	6	6	140194	140199	100 %	0 %	0 %	0 %	319891421
3080	NC_014925	CAAT	2	8	140218	140225	50 %	25 %	0 %	25 %	319891421
3081	NC_014925	TGAA	2	8	140282	140289	50 %	25 %	25 %	0 %	319891421
3082	NC_014925	TAATCG	2	12	140347	140358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319891421
3083	NC_014925	CTG	2	6	140371	140376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891421
3084	NC_014925	TTC	2	6	140462	140467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891421
3085	NC_014925	TAA	2	6	140525	140530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891421
3086	NC_014925	AAT	2	6	140612	140617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891421
3087	NC_014925	A	6	6	140620	140625	100 %	0 %	0 %	0 %	319891421
3088	NC_014925	GC	3	6	140647	140652	0 %	0 %	50 %	50 %	319891421
3089	NC_014925	CCT	2	6	140801	140806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319891422
3090	NC_014925	T	6	6	140939	140944	0 %	100 %	0 %	0 %	319891422
3091	NC_014925	AAT	2	6	140987	140992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891422
3092	NC_014925	CACC	2	8	141046	141053	25 %	0 %	0 %	75 %	319891422
3093	NC_014925	TG	3	6	141066	141071	0 %	50 %	50 %	0 %	319891422
3094	NC_014925	CATC	2	8	141120	141127	25 %	25 %	0 %	50 %	319891422
3095	NC_014925	GT	3	6	141223	141228	0 %	50 %	50 %	0 %	319891422
3096	NC_014925	ACCA	2	8	141312	141319	50 %	0 %	0 %	50 %	319891422
3097	NC_014925	TCG	2	6	141342	141347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891422
3098	NC_014925	TAA	2	6	141370	141375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891422
3099	NC_014925	TAA	2	6	141438	141443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891422
3100	NC_014925	GGAT	2	8	141453	141460	25 %	25 %	50 %	0 %	319891422
3101	NC_014925	TGA	2	6	141510	141515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891422
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3103	NC_014925	AAT	2	6	141547	141552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891422
3104	NC_014925	AT	3	6	141551	141556	50 %	50 %	0 %	0 %	319891422
3105	NC_014925	T	6	6	141569	141574	0 %	100 %	0 %	0 %	319891422
3106	NC_014925	TTC	2	6	141616	141621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891422
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3108	NC_014925	TGT	2	6	141728	141733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891422
3109	NC_014925	TGA	2	6	141755	141760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891422
3110	NC_014925	GAT	2	6	141844	141849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891422
3111	NC_014925	CAC	2	6	141853	141858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891422
3112	NC_014925	T	7	7	141876	141882	0 %	100 %	0 %	0 %	319891422
3113	NC_014925	GTT	2	6	141927	141932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891423
3114	NC_014925	ATG	2	6	141944	141949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891423
3115	NC_014925	TCA	2	6	141962	141967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891423
3116	NC_014925	T	7	7	142011	142017	0 %	100 %	0 %	0 %	319891423
3117	NC_014925	TTG	2	6	142051	142056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891423
3118	NC_014925	TA	3	6	142065	142070	50 %	50 %	0 %	0 %	319891423
3119	NC_014925	ACGT	2	8	142076	142083	25 %	25 %	25 %	25 %	319891423
3120	NC_014925	ACGG	2	8	142150	142157	25 %	0 %	50 %	25 %	319891423
3121	NC_014925	CAAG	2	8	142209	142216	50 %	0 %	25 %	25 %	319891423
3122	NC_014925	GTT	2	6	142224	142229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891423
3123	NC_014925	TG	3	6	142236	142241	0 %	50 %	50 %	0 %	319891423
3124	NC_014925	TCA	2	6	142263	142268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891423
3125	NC_014925	ACGT	2	8	142295	142302	25 %	25 %	25 %	25 %	319891423
3126	NC_014925	TTC	2	6	142303	142308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891423
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3135	NC_014925	TAGA	2	8	142826	142833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_014925	TA	3	6	142846	142851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_014925	TA	3	6	142874	142879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_014925	ATT	2	6	142921	142926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891424
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3233	NC_014925	TGAA	2	8	148261	148268	50 %	25 %	25 %	0 %	319891425
3234	NC_014925	A	6	6	148299	148304	100 %	0 %	0 %	0 %	319891425
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3237	NC_014925	GAT	2	6	148617	148622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891425
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3239	NC_014925	ACG	2	6	148790	148795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891425
3240	NC_014925	TTG	2	6	148807	148812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891425
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3242	NC_014925	TA	3	6	148880	148885	50 %	50 %	0 %	0 %	319891425
3243	NC_014925	TTG	2	6	148901	148906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_014925	TAA	2	6	148924	148929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_014925	TATGT	2	10	148932	148941	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_014925	GGA	2	6	148953	148958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_014925	TCC	2	6	149036	149041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3248	NC_014925	T	7	7	149110	149116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_014925	CGA	2	6	149142	149147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_014925	TTG	2	6	149223	149228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_014925	A	6	6	149280	149285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_014925	TGTA	2	8	149305	149312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3287	NC_014925	A	6	6	150859	150864	100 %	0 %	0 %	0 %	319891427
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