MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 8021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014623	CCCGG	2	10	1736	1745	0 %	0 %	40 %	60 %	310817280
2	NC_014623	GCAAG	2	10	1916	1925	40 %	0 %	40 %	20 %	310817280
3	NC_014623	ACGCC	2	10	2635	2644	20 %	0 %	20 %	60 %	310817281
4	NC_014623	GCCAC	2	10	4082	4091	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_014623	CGCGG	2	10	4235	4244	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014623	TCACC	2	10	5599	5608	20 %	20 %	0 %	60 %	310817285
7	NC_014623	GCGGG	2	10	7120	7129	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014623	GGGCC	2	10	7409	7418	0 %	0 %	60 %	40 %	310817287
9	NC_014623	GGGGA	2	10	8002	8011	20 %	0 %	80 %	0 %	310817287
10	NC_014623	GCCCC	2	10	8278	8287	0 %	0 %	20 %	80 %	310817288
11	NC_014623	CGCGC	2	10	8428	8437	0 %	0 %	40 %	60 %	310817288
12	NC_014623	CCGTT	2	10	8529	8538	0 %	40 %	20 %	40 %	310817288
13	NC_014623	GCGGA	2	10	10056	10065	20 %	0 %	60 %	20 %	310817289
14	NC_014623	CACGA	2	10	10392	10401	40 %	0 %	20 %	40 %	310817289
15	NC_014623	CGCTG	2	10	12641	12650	0 %	20 %	40 %	40 %	310817291
16	NC_014623	GCCCT	2	10	14928	14937	0 %	20 %	20 %	60 %	310817294
17	NC_014623	AAGCA	2	10	17926	17935	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014623	CCGCG	2	10	18763	18772	0 %	0 %	40 %	60 %	310817295
19	NC_014623	CGGCT	2	10	19221	19230	0 %	20 %	40 %	40 %	310817296
20	NC_014623	CGGCG	2	10	19283	19292	0 %	0 %	60 %	40 %	310817296
21	NC_014623	GCTGG	2	10	20300	20309	0 %	20 %	60 %	20 %	310817297
22	NC_014623	TGGGC	2	10	21460	21469	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014623	AGCTG	2	10	21692	21701	20 %	20 %	40 %	20 %	310817298
24	NC_014623	CCACG	2	10	23621	23630	20 %	0 %	20 %	60 %	310817299
25	NC_014623	TCGCG	2	10	23640	23649	0 %	20 %	40 %	40 %	310817299
26	NC_014623	TCCGA	2	10	24265	24274	20 %	20 %	20 %	40 %	310817300
27	NC_014623	CCACC	2	10	25596	25605	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
28	NC_014623	GTCGA	2	10	26419	26428	20 %	20 %	40 %	20 %	310817301
29	NC_014623	ACGCC	2	10	27693	27702	20 %	0 %	20 %	60 %	310817302
30	NC_014623	CGCGT	2	10	28406	28415	0 %	20 %	40 %	40 %	310817302
31	NC_014623	TCCTC	2	10	29402	29411	0 %	40 %	0 %	60 %	310817302
32	NC_014623	CCGAT	2	10	30537	30546	20 %	20 %	20 %	40 %	310817302
33	NC_014623	CCCGT	2	10	30629	30638	0 %	20 %	20 %	60 %	310817302
34	NC_014623	TCCGC	2	10	31909	31918	0 %	20 %	20 %	60 %	310817303
35	NC_014623	CGCGC	2	10	32767	32776	0 %	0 %	40 %	60 %	310817303
36	NC_014623	AGCCC	2	10	32872	32881	20 %	0 %	20 %	60 %	310817303
37	NC_014623	GCCAC	2	10	32986	32995	20 %	0 %	20 %	60 %	310817303
38	NC_014623	GCGTC	2	10	33211	33220	0 %	20 %	40 %	40 %	310817303
39	NC_014623	GAAGA	2	10	33527	33536	60 %	0 %	40 %	0 %	310817303
40	NC_014623	ACGCC	2	10	34654	34663	20 %	0 %	20 %	60 %	310817303
41	NC_014623	GAGCT	2	10	34821	34830	20 %	20 %	40 %	20 %	310817303
42	NC_014623	CGGCG	2	10	35391	35400	0 %	0 %	60 %	40 %	310817303
43	NC_014623	CCCGC	2	10	36343	36352	0 %	0 %	20 %	80 %	310817303
44	NC_014623	AGGGC	2	10	37446	37455	20 %	0 %	60 %	20 %	310817303
45	NC_014623	GCGGG	2	10	37473	37482	0 %	0 %	80 %	20 %	310817303
46	NC_014623	GCGTG	2	10	38065	38074	0 %	20 %	60 %	20 %	310817303
47	NC_014623	GCGCC	2	10	41785	41794	0 %	0 %	40 %	60 %	310817306
48	NC_014623	GCGAG	2	10	42264	42273	20 %	0 %	60 %	20 %	310817306
49	NC_014623	TGCCG	2	10	46593	46602	0 %	20 %	40 %	40 %	310817306
50	NC_014623	CGCCC	2	10	49512	49521	0 %	0 %	20 %	80 %	310817308
51	NC_014623	GGCCC	2	10	51004	51013	0 %	0 %	40 %	60 %	310817309
52	NC_014623	CCCAC	2	10	52001	52010	20 %	0 %	0 %	80 %	310817310
53	NC_014623	AGGGC	2	10	54017	54026	20 %	0 %	60 %	20 %	310817312
54	NC_014623	TCCAA	2	10	54375	54384	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014623	AGGCC	2	10	54423	54432	20 %	0 %	40 %	40 %	310817313
56	NC_014623	CCAGC	2	10	57013	57022	20 %	0 %	20 %	60 %	310817313
57	NC_014623	CACCG	2	10	60288	60297	20 %	0 %	20 %	60 %	310817315
58	NC_014623	TCGGC	2	10	62216	62225	0 %	20 %	40 %	40 %	310817318
59	NC_014623	CCAGG	2	10	63641	63650	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014623	CACGC	2	10	65683	65692	20 %	0 %	20 %	60 %	310817322
61	NC_014623	ATCCG	2	10	65720	65729	20 %	20 %	20 %	40 %	310817322
62	NC_014623	AGCGC	2	10	66319	66328	20 %	0 %	40 %	40 %	310817323
63	NC_014623	GTCCC	2	10	66917	66926	0 %	20 %	20 %	60 %	310817323
64	NC_014623	GGGGT	2	10	68091	68100	0 %	20 %	80 %	0 %	310817323
65	NC_014623	GCCGG	2	10	68498	68507	0 %	0 %	60 %	40 %	310817324
66	NC_014623	GCCTG	2	10	68837	68846	0 %	20 %	40 %	40 %	310817324
67	NC_014623	CGAAC	2	10	70179	70188	40 %	0 %	20 %	40 %	310817325
68	NC_014623	CAGCC	2	10	70373	70382	20 %	0 %	20 %	60 %	310817325
69	NC_014623	CCCAG	2	10	71527	71536	20 %	0 %	20 %	60 %	310817326
70	NC_014623	AGCAG	2	10	71823	71832	40 %	0 %	40 %	20 %	310817326
71	NC_014623	TCGGC	2	10	72447	72456	0 %	20 %	40 %	40 %	310817327
72	NC_014623	GAACG	2	10	74483	74492	40 %	0 %	40 %	20 %	310817328
73	NC_014623	GCCCA	2	10	74876	74885	20 %	0 %	20 %	60 %	310817328
74	NC_014623	CACGC	2	10	74897	74906	20 %	0 %	20 %	60 %	310817328
75	NC_014623	TCGTG	2	10	75597	75606	0 %	40 %	40 %	20 %	310817329
76	NC_014623	CAGCC	2	10	76084	76093	20 %	0 %	20 %	60 %	310817329
77	NC_014623	TCCTC	2	10	80226	80235	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_014623	CCCCG	2	10	81296	81305	0 %	0 %	20 %	80 %	310817332
79	NC_014623	GGACC	2	10	81500	81509	20 %	0 %	40 %	40 %	310817332
80	NC_014623	CCGGG	2	10	81807	81816	0 %	0 %	60 %	40 %	310817332
81	NC_014623	CCGTC	2	10	82288	82297	0 %	20 %	20 %	60 %	310817334
82	NC_014623	CCCGG	2	10	82730	82739	0 %	0 %	40 %	60 %	310817334
83	NC_014623	GCCGG	2	10	83072	83081	0 %	0 %	60 %	40 %	310817334
84	NC_014623	CTCGC	2	10	84154	84163	0 %	20 %	20 %	60 %	310817336
85	NC_014623	ACGCC	2	10	86287	86296	20 %	0 %	20 %	60 %	310817338
86	NC_014623	CCCAT	2	10	87697	87706	20 %	20 %	0 %	60 %	310817339
87	NC_014623	CAAAA	2	10	88405	88414	80 %	0 %	0 %	20 %	310817340
88	NC_014623	TCAGC	2	10	88560	88569	20 %	20 %	20 %	40 %	310817340
89	NC_014623	CCAAT	2	10	89085	89094	40 %	20 %	0 %	40 %	310817341
90	NC_014623	GACGA	2	10	90789	90798	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014623	GGCTC	2	10	91120	91129	0 %	20 %	40 %	40 %	310817344
92	NC_014623	TGAAC	2	10	91146	91155	40 %	20 %	20 %	20 %	310817344
93	NC_014623	TGCAC	2	10	91283	91292	20 %	20 %	20 %	40 %	310817344
94	NC_014623	GCCGC	2	10	93064	93073	0 %	0 %	40 %	60 %	310817345
95	NC_014623	GTCCG	2	10	93611	93620	0 %	20 %	40 %	40 %	310817345
96	NC_014623	GCGTG	2	10	94302	94311	0 %	20 %	60 %	20 %	310817346
97	NC_014623	CGCGT	2	10	95235	95244	0 %	20 %	40 %	40 %	310817347
98	NC_014623	TCCGG	2	10	101710	101719	0 %	20 %	40 %	40 %	310817353
99	NC_014623	ACATC	2	10	103134	103143	40 %	20 %	0 %	40 %	310817353
100	NC_014623	GGAAA	2	10	103931	103940	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014623	TTGCC	2	10	104135	104144	0 %	40 %	20 %	40 %	310817355
102	NC_014623	TGGGC	2	10	104379	104388	0 %	20 %	60 %	20 %	310817355
103	NC_014623	CACCC	2	10	105906	105915	20 %	0 %	0 %	80 %	310817356
104	NC_014623	GAGCG	2	10	112232	112241	20 %	0 %	60 %	20 %	310817359
105	NC_014623	AAGCG	2	10	112588	112597	40 %	0 %	40 %	20 %	310817360
106	NC_014623	GCCAT	2	10	114948	114957	20 %	20 %	20 %	40 %	310817362
107	NC_014623	GAAGT	2	10	115276	115285	40 %	20 %	40 %	0 %	310817362
108	NC_014623	TGGGG	2	10	115662	115671	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014623	CCGGA	2	10	116885	116894	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014623	CGGCC	2	10	119820	119829	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_014623	CACCC	2	10	120962	120971	20 %	0 %	0 %	80 %	310817368
112	NC_014623	TCTCC	2	10	122748	122757	0 %	40 %	0 %	60 %	310817369
113	NC_014623	GCCCA	2	10	123383	123392	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_014623	CTTGC	2	10	123559	123568	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014623	GGGGC	2	10	123606	123615	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014623	GGTGG	2	10	124293	124302	0 %	20 %	80 %	0 %	310817370
117	NC_014623	GGCAC	2	10	124750	124759	20 %	0 %	40 %	40 %	310817370
118	NC_014623	TCCGC	2	10	125221	125230	0 %	20 %	20 %	60 %	310817371
119	NC_014623	CCGTG	2	10	126937	126946	0 %	20 %	40 %	40 %	310817374
120	NC_014623	GCGCA	2	10	127599	127608	20 %	0 %	40 %	40 %	310817374
121	NC_014623	CCAGC	2	10	130234	130243	20 %	0 %	20 %	60 %	310817375
122	NC_014623	GGGTG	2	10	131927	131936	0 %	20 %	80 %	0 %	310817376
123	NC_014623	GCGCC	2	10	133882	133891	0 %	0 %	40 %	60 %	310817379
124	NC_014623	GCCCG	2	10	134076	134085	0 %	0 %	40 %	60 %	310817380
125	NC_014623	ACGGC	2	10	137205	137214	20 %	0 %	40 %	40 %	310817382
126	NC_014623	CGGTG	2	10	139340	139349	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014623	GCCCG	2	10	140680	140689	0 %	0 %	40 %	60 %	310817384
128	NC_014623	ATGGC	2	10	141387	141396	20 %	20 %	40 %	20 %	310817384
129	NC_014623	GGCCC	2	10	144086	144095	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_014623	GCTGG	2	10	149213	149222	0 %	20 %	60 %	20 %	310817391
131	NC_014623	GGCCG	2	10	152414	152423	0 %	0 %	60 %	40 %	310817394
132	NC_014623	TGGGC	2	10	152615	152624	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014623	CGGGC	2	10	153034	153043	0 %	0 %	60 %	40 %	310817395
134	NC_014623	GCAAG	2	10	153243	153252	40 %	0 %	40 %	20 %	310817395
135	NC_014623	CCGCG	2	10	155786	155795	0 %	0 %	40 %	60 %	310817396
136	NC_014623	GCTCG	2	10	157200	157209	0 %	20 %	40 %	40 %	310817396
137	NC_014623	CGATG	2	10	158709	158718	20 %	20 %	40 %	20 %	310817397
138	NC_014623	GCCGC	2	10	160025	160034	0 %	0 %	40 %	60 %	310817398
139	NC_014623	CCGGG	3	15	160186	160200	0 %	0 %	60 %	40 %	310817398
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141	NC_014623	GTCCT	2	10	162122	162131	0 %	40 %	20 %	40 %	310817401
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144	NC_014623	GCTGG	2	10	165101	165110	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014623	ACGGC	2	10	165462	165471	20 %	0 %	40 %	40 %	310817406
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147	NC_014623	GACGC	2	10	167762	167771	20 %	0 %	40 %	40 %	310817408
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150	NC_014623	CGGGA	2	10	168366	168375	20 %	0 %	60 %	20 %	310817408
151	NC_014623	GGAAT	2	10	170958	170967	40 %	20 %	40 %	0 %	310817412
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196	NC_014623	CTGTC	2	10	214554	214563	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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199	NC_014623	GCTCG	2	10	217764	217773	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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249	NC_014623	CTCGG	2	10	288205	288214	0 %	20 %	40 %	40 %	310817504
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251	NC_014623	GCGTG	2	10	293107	293116	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
252	NC_014623	GCCCC	2	10	293983	293992	0 %	0 %	20 %	80 %	310817510
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256	NC_014623	GAGGG	2	10	296656	296665	20 %	0 %	80 %	0 %	310817512
257	NC_014623	GCCCA	2	10	297392	297401	20 %	0 %	20 %	60 %	310817513
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259	NC_014623	GCTCA	2	10	298561	298570	20 %	20 %	20 %	40 %	310817515
260	NC_014623	CTGGC	2	10	299548	299557	0 %	20 %	40 %	40 %	310817515
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263	NC_014623	GCCGG	2	10	302987	302996	0 %	0 %	60 %	40 %	310817517
264	NC_014623	CGGAG	2	10	303672	303681	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
265	NC_014623	ACGTC	2	10	304244	304253	20 %	20 %	20 %	40 %	310817519
266	NC_014623	AGGGC	2	10	304280	304289	20 %	0 %	60 %	20 %	310817519
267	NC_014623	CGGCG	2	10	307424	307433	0 %	0 %	60 %	40 %	310817520
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269	NC_014623	GGGAT	2	10	308721	308730	20 %	20 %	60 %	0 %	310817521
270	NC_014623	GACGG	2	10	309473	309482	20 %	0 %	60 %	20 %	310817521
271	NC_014623	GACGG	2	10	309923	309932	20 %	0 %	60 %	20 %	310817521
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283	NC_014623	CCCAA	2	10	326144	326153	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
284	NC_014623	CGGCG	2	10	326848	326857	0 %	0 %	60 %	40 %	310817532
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402	NC_014623	ATTGA	2	10	472676	472685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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