MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 254757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014623	GGA	2	6	144966	144971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817386
3502	NC_014623	TCG	2	6	144976	144981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817386
3503	NC_014623	GGT	2	6	144991	144996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817386
3504	NC_014623	GGA	2	6	145085	145090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014623	CTGG	2	8	145111	145118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_014623	AG	3	6	145142	145147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_014623	GGC	2	6	145176	145181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_014623	ACTTCC	2	12	145264	145275	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310817387
3509	NC_014623	CAC	2	6	145380	145385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817387
3510	NC_014623	TGG	2	6	145411	145416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817387
3511	NC_014623	ACGA	2	8	145423	145430	50 %	0 %	25 %	25 %	310817387
3512	NC_014623	CTG	2	6	145455	145460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817387
3513	NC_014623	CAC	2	6	145476	145481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817387
3514	NC_014623	CGG	2	6	145559	145564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_014623	GCC	2	6	145622	145627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_014623	AGC	2	6	145628	145633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_014623	GAT	2	6	145737	145742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014623	GCAG	2	8	145766	145773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_014623	AGA	2	6	145821	145826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817388
3520	NC_014623	GGC	2	6	145874	145879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817388
3521	NC_014623	CAGC	2	8	145942	145949	25 %	0 %	25 %	50 %	310817388
3522	NC_014623	CAC	2	6	145951	145956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817388
3523	NC_014623	CGGC	2	8	145972	145979	0 %	0 %	50 %	50 %	310817388
3524	NC_014623	CG	3	6	146016	146021	0 %	0 %	50 %	50 %	310817388
3525	NC_014623	CGA	2	6	146040	146045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817388
3526	NC_014623	GCC	2	6	146050	146055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817388
3527	NC_014623	GAG	2	6	146069	146074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817388
3528	NC_014623	GAA	2	6	146083	146088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817388
3529	NC_014623	CTT	2	6	146143	146148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817388
3530	NC_014623	GGGGGC	2	12	146161	146172	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	310817388
3531	NC_014623	CGG	2	6	146233	146238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817388
3532	NC_014623	GCG	2	6	146241	146246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817388
3533	NC_014623	CCGGGC	2	12	146254	146265	0 %	0 %	50 %	50 %	310817388
3534	NC_014623	CTG	2	6	146272	146277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817388
3535	NC_014623	GCG	2	6	146278	146283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817388
3536	NC_014623	GGCG	2	8	146286	146293	0 %	0 %	75 %	25 %	310817388
3537	NC_014623	CG	3	6	146337	146342	0 %	0 %	50 %	50 %	310817388
3538	NC_014623	CTG	2	6	146356	146361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817388
3539	NC_014623	CCT	2	6	146388	146393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817388
3540	NC_014623	CGG	2	6	146426	146431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817388
3541	NC_014623	GTG	2	6	146588	146593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817388
3542	NC_014623	GGC	2	6	146602	146607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817388
3543	NC_014623	CCG	2	6	146622	146627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817388
3544	NC_014623	CTCGGC	2	12	146650	146661	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310817388
3545	NC_014623	GC	4	8	146660	146667	0 %	0 %	50 %	50 %	310817388
3546	NC_014623	CGG	2	6	146713	146718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817388
3547	NC_014623	TCA	2	6	146721	146726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817388
3548	NC_014623	CCCT	2	8	146783	146790	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3549	NC_014623	GCC	2	6	146802	146807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_014623	GCG	2	6	146834	146839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_014623	CGT	2	6	146935	146940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817389
3552	NC_014623	G	6	6	146974	146979	0 %	0 %	100 %	0 %	310817389
3553	NC_014623	GAG	2	6	146993	146998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817389
3554	NC_014623	GGTC	2	8	147022	147029	0 %	25 %	50 %	25 %	310817389
3555	NC_014623	TCC	2	6	147030	147035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817389
3556	NC_014623	CGC	2	6	147058	147063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817389
3557	NC_014623	CTC	2	6	147119	147124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817389
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3559	NC_014623	GC	3	6	147231	147236	0 %	0 %	50 %	50 %	310817389
3560	NC_014623	GC	3	6	147248	147253	0 %	0 %	50 %	50 %	310817389
3561	NC_014623	CCT	2	6	147268	147273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817389
3562	NC_014623	GCC	2	6	147317	147322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817389
3563	NC_014623	GAT	2	6	147359	147364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817389
3564	NC_014623	GCC	2	6	147390	147395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817389
3565	NC_014623	TGT	2	6	147397	147402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817389
3566	NC_014623	CCAG	2	8	147442	147449	25 %	0 %	25 %	50 %	310817389
3567	NC_014623	GC	4	8	147483	147490	0 %	0 %	50 %	50 %	310817389
3568	NC_014623	GAA	2	6	147500	147505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817389
3569	NC_014623	GCA	2	6	147547	147552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817389
3570	NC_014623	GCC	3	9	147602	147610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817389
3571	NC_014623	GTC	2	6	147665	147670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817389
3572	NC_014623	GGT	2	6	147695	147700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817389
3573	NC_014623	CAC	2	6	147737	147742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817389
3574	NC_014623	GCGCTG	2	12	147770	147781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310817389
3575	NC_014623	CCCACG	2	12	147795	147806	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310817389
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3578	NC_014623	CGT	2	6	147878	147883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817389
3579	NC_014623	GCA	2	6	147931	147936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817389
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3581	NC_014623	AGG	2	6	148027	148032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817389
3582	NC_014623	GAC	2	6	148040	148045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817389
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3585	NC_014623	GCA	2	6	148153	148158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817389
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3587	NC_014623	GCTT	2	8	148275	148282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_014623	TCT	2	6	148401	148406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_014623	AGC	2	6	148408	148413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_014623	GT	3	6	148445	148450	0 %	50 %	50 %	0 %	310817390
3591	NC_014623	GGC	2	6	148470	148475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817390
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3595	NC_014623	AGA	2	6	148646	148651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817390
3596	NC_014623	GCG	2	6	148669	148674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_014623	TCT	2	6	148721	148726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817391
3598	NC_014623	TCC	2	6	148790	148795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817391
3599	NC_014623	GCG	2	6	148812	148817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817391
3600	NC_014623	CG	4	8	148820	148827	0 %	0 %	50 %	50 %	310817391
3601	NC_014623	GTG	2	6	148871	148876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817391
3602	NC_014623	GCC	2	6	148884	148889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817391
3603	NC_014623	G	6	6	148915	148920	0 %	0 %	100 %	0 %	310817391
3604	NC_014623	GCG	2	6	149007	149012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817391
3605	NC_014623	CGG	2	6	149016	149021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817391
3606	NC_014623	CAT	2	6	149053	149058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817391
3607	NC_014623	GCG	2	6	149142	149147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817391
3608	NC_014623	GCG	2	6	149163	149168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817391
3609	NC_014623	GCG	2	6	149190	149195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817391
3610	NC_014623	GCTGG	2	10	149213	149222	0 %	20 %	60 %	20 %	310817391
3611	NC_014623	G	6	6	149244	149249	0 %	0 %	100 %	0 %	310817391
3612	NC_014623	AGGG	2	8	149285	149292	25 %	0 %	75 %	0 %	310817391
3613	NC_014623	G	7	7	149295	149301	0 %	0 %	100 %	0 %	310817391
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3619	NC_014623	GCG	2	6	149521	149526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817391
3620	NC_014623	CTTC	2	8	149643	149650	0 %	50 %	0 %	50 %	310817391
3621	NC_014623	GCC	3	9	149680	149688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_014623	CCG	2	6	149750	149755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_014623	GCC	2	6	149764	149769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_014623	G	6	6	149771	149776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3868	NC_014623	GAG	2	6	159728	159733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817398
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3870	NC_014623	GCT	2	6	159781	159786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817398
3871	NC_014623	TCG	2	6	159795	159800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817398
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3899	NC_014623	CGG	2	6	160513	160518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3981	NC_014623	CA	3	6	163743	163748	50 %	0 %	0 %	50 %	310817404
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3992	NC_014623	AGG	2	6	164496	164501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817405
3993	NC_014623	CGA	2	6	164562	164567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817405
3994	NC_014623	C	6	6	164619	164624	0 %	0 %	0 %	100 %	310817405
3995	NC_014623	GGTTGT	2	12	164629	164640	0 %	50 %	50 %	0 %	310817405
3996	NC_014623	GCCA	2	8	164689	164696	25 %	0 %	25 %	50 %	310817405
3997	NC_014623	ACCAA	2	10	164732	164741	60 %	0 %	0 %	40 %	310817405
3998	NC_014623	TTC	2	6	164744	164749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817405
3999	NC_014623	ATG	2	6	164753	164758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817405
4000	NC_014623	C	6	6	164759	164764	0 %	0 %	0 %	100 %	310817405

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