MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 254757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014623	CTCGC	2	10	84154	84163	0 %	20 %	20 %	60 %	310817336
2002	NC_014623	GAA	2	6	84306	84311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817336
2003	NC_014623	GAT	2	6	84331	84336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817336
2004	NC_014623	GGC	2	6	84349	84354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817336
2005	NC_014623	GC	3	6	84361	84366	0 %	0 %	50 %	50 %	310817336
2006	NC_014623	C	6	6	84499	84504	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2007	NC_014623	CTT	2	6	84528	84533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817337
2008	NC_014623	GAA	2	6	84562	84567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817337
2009	NC_014623	GGTG	2	8	84665	84672	0 %	25 %	75 %	0 %	310817337
2010	NC_014623	GGA	2	6	84681	84686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817337
2011	NC_014623	CCT	2	6	84795	84800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817337
2012	NC_014623	CGC	2	6	84858	84863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817337
2013	NC_014623	GCAG	2	8	84917	84924	25 %	0 %	50 %	25 %	310817337
2014	NC_014623	CGT	2	6	84963	84968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817337
2015	NC_014623	GGT	2	6	85062	85067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817337
2016	NC_014623	CTC	2	6	85099	85104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817337
2017	NC_014623	AAGA	2	8	85114	85121	75 %	0 %	25 %	0 %	310817337
2018	NC_014623	ACA	2	6	85151	85156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817337
2019	NC_014623	TCC	2	6	85178	85183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817337
2020	NC_014623	GCT	2	6	85203	85208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817337
2021	NC_014623	C	7	7	85250	85256	0 %	0 %	0 %	100 %	310817337
2022	NC_014623	GAG	2	6	85342	85347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817337
2023	NC_014623	GAT	2	6	85408	85413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817337
2024	NC_014623	AAG	2	6	85417	85422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817337
2025	NC_014623	TCC	2	6	85450	85455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817337
2026	NC_014623	TGG	2	6	85490	85495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817337
2027	NC_014623	A	6	6	85556	85561	100 %	0 %	0 %	0 %	310817337
2028	NC_014623	GCC	2	6	85567	85572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817337
2029	NC_014623	GCT	2	6	85692	85697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817337
2030	NC_014623	TCT	2	6	85754	85759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817337
2031	NC_014623	TCC	2	6	85853	85858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817337
2032	NC_014623	GAA	2	6	85875	85880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817337
2033	NC_014623	AAG	2	6	85900	85905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817337
2034	NC_014623	CCCT	2	8	85909	85916	0 %	25 %	0 %	75 %	310817337
2035	NC_014623	CT	3	6	85922	85927	0 %	50 %	0 %	50 %	310817337
2036	NC_014623	CAT	2	6	85968	85973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817337
2037	NC_014623	TTC	2	6	86011	86016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817337
2038	NC_014623	ACC	2	6	86208	86213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817338
2039	NC_014623	ACGCC	2	10	86287	86296	20 %	0 %	20 %	60 %	310817338
2040	NC_014623	TCC	2	6	86328	86333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817338
2041	NC_014623	GGAG	2	8	86509	86516	25 %	0 %	75 %	0 %	310817338
2042	NC_014623	GGC	2	6	86588	86593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817338
2043	NC_014623	GCCC	2	8	86696	86703	0 %	0 %	25 %	75 %	310817338
2044	NC_014623	GAT	2	6	86738	86743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817338
2045	NC_014623	GGC	2	6	86796	86801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817338
2046	NC_014623	CCG	2	6	86851	86856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817338
2047	NC_014623	CGA	2	6	86860	86865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817338
2048	NC_014623	TC	3	6	86890	86895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2049	NC_014623	CTT	2	6	86962	86967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817339
2050	NC_014623	GCTCGC	2	12	87026	87037	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310817339
2051	NC_014623	CCG	2	6	87058	87063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817339
2052	NC_014623	GCA	2	6	87073	87078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817339
2053	NC_014623	GTA	2	6	87104	87109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817339
2054	NC_014623	GT	3	6	87117	87122	0 %	50 %	50 %	0 %	310817339
2055	NC_014623	GGCG	2	8	87133	87140	0 %	0 %	75 %	25 %	310817339
2056	NC_014623	GCT	2	6	87172	87177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817339
2057	NC_014623	CCA	2	6	87181	87186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817339
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2059	NC_014623	GCC	2	6	87246	87251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817339
2060	NC_014623	AGCG	2	8	87300	87307	25 %	0 %	50 %	25 %	310817339
2061	NC_014623	GC	3	6	87323	87328	0 %	0 %	50 %	50 %	310817339
2062	NC_014623	CAC	2	6	87380	87385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817339
2063	NC_014623	GCA	2	6	87391	87396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817339
2064	NC_014623	CAG	2	6	87422	87427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817339
2065	NC_014623	CGGCCT	2	12	87481	87492	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310817339
2066	NC_014623	GC	3	6	87564	87569	0 %	0 %	50 %	50 %	310817339
2067	NC_014623	CCG	2	6	87598	87603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817339
2068	NC_014623	CCA	2	6	87638	87643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817339
2069	NC_014623	GGC	2	6	87659	87664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817339
2070	NC_014623	CCCAT	2	10	87697	87706	20 %	20 %	0 %	60 %	310817339
2071	NC_014623	CCT	2	6	87718	87723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817339
2072	NC_014623	CTGCCG	2	12	87728	87739	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310817339
2073	NC_014623	GCCCGC	2	12	87747	87758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817339
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2075	NC_014623	GCG	2	6	87797	87802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817339
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2077	NC_014623	GCG	2	6	88043	88048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2078	NC_014623	GCAC	2	8	88165	88172	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2079	NC_014623	AGGG	2	8	88189	88196	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2083	NC_014623	CAAAA	2	10	88405	88414	80 %	0 %	0 %	20 %	310817340
2084	NC_014623	TCAGC	2	10	88560	88569	20 %	20 %	20 %	40 %	310817340
2085	NC_014623	CG	3	6	88680	88685	0 %	0 %	50 %	50 %	310817340
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2091	NC_014623	CT	3	6	88910	88915	0 %	50 %	0 %	50 %	310817341
2092	NC_014623	CTT	2	6	88935	88940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817341
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2095	NC_014623	CTG	2	6	89148	89153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817341
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2108	NC_014623	GCC	2	6	89712	89717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817342
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2110	NC_014623	CCG	2	6	89800	89805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817342
2111	NC_014623	GCA	2	6	89888	89893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817342
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2113	NC_014623	GA	3	6	90201	90206	50 %	0 %	50 %	0 %	310817342
2114	NC_014623	GCA	2	6	90260	90265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2115	NC_014623	C	6	6	90321	90326	0 %	0 %	0 %	100 %	310817343
2116	NC_014623	GCA	2	6	90341	90346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817343
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2121	NC_014623	GACGA	2	10	90789	90798	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2122	NC_014623	CAT	3	9	90916	90924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817344
2123	NC_014623	GC	4	8	90968	90975	0 %	0 %	50 %	50 %	310817344
2124	NC_014623	GGA	2	6	91067	91072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817344
2125	NC_014623	T	6	6	91079	91084	0 %	100 %	0 %	0 %	310817344
2126	NC_014623	TCA	2	6	91103	91108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817344
2127	NC_014623	GGCTC	2	10	91120	91129	0 %	20 %	40 %	40 %	310817344
2128	NC_014623	TGAAC	2	10	91146	91155	40 %	20 %	20 %	20 %	310817344
2129	NC_014623	GC	3	6	91183	91188	0 %	0 %	50 %	50 %	310817344
2130	NC_014623	AGT	2	6	91191	91196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817344
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2132	NC_014623	GGC	2	6	91221	91226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817344
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2134	NC_014623	TGCAC	2	10	91283	91292	20 %	20 %	20 %	40 %	310817344
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2242	NC_014623	AGCG	2	8	95484	95491	25 %	0 %	50 %	25 %	310817347
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2369	NC_014623	CCCT	2	8	101466	101473	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2370	NC_014623	ACC	3	9	101642	101650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817353
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2376	NC_014623	C	6	6	101914	101919	0 %	0 %	0 %	100 %	310817353
2377	NC_014623	GGCC	2	8	101925	101932	0 %	0 %	50 %	50 %	310817353
2378	NC_014623	GCC	2	6	101941	101946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817353
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2482	NC_014623	GTGA	2	8	105443	105450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2483	NC_014623	AGGT	2	8	105451	105458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_014623	GTT	2	6	105469	105474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2500	NC_014623	C	7	7	105913	105919	0 %	0 %	0 %	100 %	310817356

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