MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 254757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014623	GCCC	2	8	41994	42001	0 %	0 %	25 %	75 %	310817306
1002	NC_014623	CG	3	6	42046	42051	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1003	NC_014623	GCT	2	6	42052	42057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1004	NC_014623	GCG	2	6	42074	42079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1005	NC_014623	TTC	2	6	42131	42136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817306
1006	NC_014623	CTG	2	6	42157	42162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1007	NC_014623	AGC	2	6	42191	42196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1008	NC_014623	TGA	2	6	42207	42212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817306
1009	NC_014623	TTC	2	6	42224	42229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817306
1010	NC_014623	GC	3	6	42255	42260	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1011	NC_014623	GCGAG	2	10	42264	42273	20 %	0 %	60 %	20 %	310817306
1012	NC_014623	GCT	2	6	42312	42317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1013	NC_014623	CTC	2	6	42334	42339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1014	NC_014623	CG	3	6	42346	42351	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1015	NC_014623	CG	3	6	42401	42406	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1016	NC_014623	GGC	2	6	42421	42426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1017	NC_014623	AGC	2	6	42446	42451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1018	NC_014623	CCA	2	6	42480	42485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817306
1019	NC_014623	GCT	2	6	42516	42521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1020	NC_014623	TCA	2	6	42528	42533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817306
1021	NC_014623	CG	3	6	42600	42605	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1022	NC_014623	GCA	2	6	42615	42620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1023	NC_014623	TGG	2	6	42657	42662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817306
1024	NC_014623	ACC	2	6	42743	42748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817306
1025	NC_014623	AGC	2	6	42767	42772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1026	NC_014623	AGC	2	6	42827	42832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1027	NC_014623	GGA	2	6	42837	42842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817306
1028	NC_014623	GCCG	2	8	42901	42908	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1029	NC_014623	CGG	2	6	42927	42932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1030	NC_014623	CG	4	8	42984	42991	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1031	NC_014623	TGG	2	6	43010	43015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817306
1032	NC_014623	TCC	2	6	43019	43024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1033	NC_014623	GC	3	6	43033	43038	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1034	NC_014623	CGC	2	6	43072	43077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1035	NC_014623	GCC	3	9	43121	43129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1036	NC_014623	AGC	2	6	43199	43204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1037	NC_014623	CTG	2	6	43213	43218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1038	NC_014623	TGT	2	6	43263	43268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817306
1039	NC_014623	GCC	2	6	43325	43330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1040	NC_014623	CCA	2	6	43428	43433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817306
1041	NC_014623	CATC	2	8	43437	43444	25 %	25 %	0 %	50 %	310817306
1042	NC_014623	AAG	2	6	43445	43450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817306
1043	NC_014623	ATG	2	6	43466	43471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817306
1044	NC_014623	CCA	2	6	43509	43514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817306
1045	NC_014623	TGG	2	6	43601	43606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817306
1046	NC_014623	GCG	2	6	43633	43638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1047	NC_014623	GC	3	6	43663	43668	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1048	NC_014623	TGC	2	6	43670	43675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1049	NC_014623	TCC	2	6	43685	43690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1050	NC_014623	TGT	2	6	43749	43754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817306
1051	NC_014623	CAG	2	6	43783	43788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1052	NC_014623	CAC	2	6	43814	43819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817306
1053	NC_014623	GGC	2	6	43831	43836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1054	NC_014623	GCTC	2	8	43860	43867	0 %	25 %	25 %	50 %	310817306
1055	NC_014623	GCC	2	6	43870	43875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1056	NC_014623	AGG	2	6	43971	43976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817306
1057	NC_014623	CG	5	10	44004	44013	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1058	NC_014623	TGG	2	6	44051	44056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817306
1059	NC_014623	GC	3	6	44098	44103	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1060	NC_014623	GTCG	2	8	44116	44123	0 %	25 %	50 %	25 %	310817306
1061	NC_014623	GCT	2	6	44143	44148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1062	NC_014623	CG	3	6	44156	44161	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1063	NC_014623	CCT	2	6	44214	44219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1064	NC_014623	TCC	2	6	44222	44227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1065	NC_014623	ATC	2	6	44312	44317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817306
1066	NC_014623	GGT	2	6	44319	44324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817306
1067	NC_014623	CG	3	6	44353	44358	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1068	NC_014623	CGA	2	6	44403	44408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1069	NC_014623	CAGCGC	2	12	44437	44448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310817306
1070	NC_014623	CAG	2	6	44557	44562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1071	NC_014623	CTC	2	6	44578	44583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1072	NC_014623	CTC	2	6	44608	44613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1073	NC_014623	CCG	2	6	44649	44654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1074	NC_014623	AGC	3	9	44681	44689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1075	NC_014623	GGT	2	6	44703	44708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817306
1076	NC_014623	GGC	2	6	44743	44748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1077	NC_014623	GCC	2	6	44795	44800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1078	NC_014623	GCT	2	6	44815	44820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1079	NC_014623	GCA	2	6	44853	44858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1080	NC_014623	AGCGCG	2	12	44885	44896	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310817306
1081	NC_014623	TCC	2	6	44900	44905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1082	NC_014623	GCC	2	6	44924	44929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1083	NC_014623	TTG	2	6	44948	44953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817306
1084	NC_014623	GAA	2	6	45148	45153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817306
1085	NC_014623	TCT	2	6	45168	45173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817306
1086	NC_014623	CCT	2	6	45201	45206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1087	NC_014623	GCT	2	6	45237	45242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1088	NC_014623	GCC	2	6	45287	45292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1089	NC_014623	GCA	2	6	45318	45323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1090	NC_014623	CAG	2	6	45370	45375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1091	NC_014623	CGA	2	6	45396	45401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1092	NC_014623	GGA	3	9	45408	45416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817306
1093	NC_014623	GGC	2	6	45424	45429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1094	NC_014623	GCA	2	6	45484	45489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1095	NC_014623	GCT	2	6	45498	45503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1096	NC_014623	AGC	2	6	45542	45547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
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1098	NC_014623	GAT	2	6	45571	45576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817306
1099	NC_014623	CAC	2	6	45604	45609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817306
1100	NC_014623	GCC	2	6	45629	45634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1101	NC_014623	GCC	2	6	45645	45650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1102	NC_014623	CTC	2	6	45664	45669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1103	NC_014623	AGC	2	6	45680	45685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1104	NC_014623	CGC	2	6	45718	45723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1105	NC_014623	GTA	2	6	45763	45768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817306
1106	NC_014623	CGAG	2	8	45807	45814	25 %	0 %	50 %	25 %	310817306
1107	NC_014623	AGC	2	6	45848	45853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1108	NC_014623	TCG	2	6	45890	45895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1109	NC_014623	GGA	2	6	45972	45977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817306
1110	NC_014623	TTC	2	6	46070	46075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817306
1111	NC_014623	CAG	2	6	46078	46083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1112	NC_014623	TCA	2	6	46086	46091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817306
1113	NC_014623	GCA	2	6	46125	46130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1114	NC_014623	CAT	2	6	46177	46182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817306
1115	NC_014623	AGC	2	6	46214	46219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1116	NC_014623	GCT	2	6	46323	46328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1117	NC_014623	GAT	2	6	46447	46452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817306
1118	NC_014623	GCG	2	6	46453	46458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1119	NC_014623	CAC	2	6	46474	46479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817306
1120	NC_014623	TGCCG	2	10	46593	46602	0 %	20 %	40 %	40 %	310817306
1121	NC_014623	CTC	2	6	46681	46686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1122	NC_014623	TCC	2	6	46700	46705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
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1124	NC_014623	CG	5	10	46744	46753	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
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1251	NC_014623	CGCGGG	2	12	51654	51665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817310
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1253	NC_014623	G	6	6	51708	51713	0 %	0 %	100 %	0 %	310817310
1254	NC_014623	GCT	2	6	51840	51845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817310
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1280	NC_014623	CGC	2	6	52740	52745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817310
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1283	NC_014623	GCC	2	6	52844	52849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817310
1284	NC_014623	TCG	2	6	53011	53016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817311
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1290	NC_014623	C	8	8	53289	53296	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1291	NC_014623	AGG	2	6	53311	53316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1355	NC_014623	GGC	2	6	55525	55530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817313
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1361	NC_014623	GC	3	6	55721	55726	0 %	0 %	50 %	50 %	310817313
1362	NC_014623	CCG	2	6	55788	55793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817313
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1364	NC_014623	GCC	2	6	55874	55879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817313
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1372	NC_014623	GCT	2	6	56059	56064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817313
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1376	NC_014623	CAC	2	6	56242	56247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817313
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1378	NC_014623	CGA	2	6	56307	56312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817313
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1486	NC_014623	A	6	6	60640	60645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1487	NC_014623	GC	3	6	60772	60777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1488	NC_014623	CACG	2	8	60923	60930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1489	NC_014623	AGAC	2	8	60945	60952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1490	NC_014623	GAGC	2	8	61022	61029	25 %	0 %	50 %	25 %	310817316
1491	NC_014623	AAG	2	6	61148	61153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817316
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1495	NC_014623	AGA	2	6	61333	61338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1496	NC_014623	ATG	2	6	61488	61493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817317
1497	NC_014623	CGT	2	6	61542	61547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817317
1498	NC_014623	GCC	2	6	61636	61641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1499	NC_014623	ATG	2	6	61664	61669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_014623	C	6	6	61765	61770	0 %	0 %	0 %	100 %	310817318

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