MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 254757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014623	CTG	2	6	244686	244691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817467
6002	NC_014623	AGG	2	6	244712	244717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817467
6003	NC_014623	GAA	2	6	244740	244745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817467
6004	NC_014623	ACC	2	6	244796	244801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817467
6005	NC_014623	TGG	2	6	244802	244807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817467
6006	NC_014623	CGA	2	6	244830	244835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817467
6007	NC_014623	GC	3	6	244899	244904	0 %	0 %	50 %	50 %	310817467
6008	NC_014623	GCC	4	12	244933	244944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817467
6009	NC_014623	CTC	2	6	244977	244982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817467
6010	NC_014623	CCG	2	6	245008	245013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817467
6011	NC_014623	GC	3	6	245157	245162	0 %	0 %	50 %	50 %	310817467
6012	NC_014623	CCG	2	6	245184	245189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817467
6013	NC_014623	TCC	2	6	245249	245254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817467
6014	NC_014623	GTG	2	6	245298	245303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817467
6015	NC_014623	CGG	2	6	245334	245339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817467
6016	NC_014623	CGC	2	6	245362	245367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817467
6017	NC_014623	TGG	2	6	245399	245404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817467
6018	NC_014623	CAT	2	6	245415	245420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817467
6019	NC_014623	CGC	2	6	245541	245546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817467
6020	NC_014623	GGCG	2	8	245547	245554	0 %	0 %	75 %	25 %	310817467
6021	NC_014623	GACAAG	2	12	245572	245583	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310817467
6022	NC_014623	G	6	6	245646	245651	0 %	0 %	100 %	0 %	310817468
6023	NC_014623	TGG	2	6	245713	245718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817468
6024	NC_014623	GC	3	6	245722	245727	0 %	0 %	50 %	50 %	310817468
6025	NC_014623	GC	4	8	245748	245755	0 %	0 %	50 %	50 %	310817468
6026	NC_014623	CTG	2	6	245811	245816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817468
6027	NC_014623	GGA	2	6	245840	245845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817468
6028	NC_014623	CGC	2	6	245909	245914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817468
6029	NC_014623	GT	3	6	245931	245936	0 %	50 %	50 %	0 %	310817468
6030	NC_014623	GAG	2	6	245970	245975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817468
6031	NC_014623	CGT	2	6	246002	246007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817468
6032	NC_014623	GC	3	6	246054	246059	0 %	0 %	50 %	50 %	310817468
6033	NC_014623	GCG	2	6	246073	246078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817468
6034	NC_014623	GGT	2	6	246098	246103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817468
6035	NC_014623	GCTG	2	8	246121	246128	0 %	25 %	50 %	25 %	310817468
6036	NC_014623	CAA	2	6	246152	246157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817468
6037	NC_014623	GGCG	2	8	246197	246204	0 %	0 %	75 %	25 %	310817468
6038	NC_014623	GCC	2	6	246240	246245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817468
6039	NC_014623	G	6	6	246358	246363	0 %	0 %	100 %	0 %	310817468
6040	NC_014623	CGC	2	6	246383	246388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817468
6041	NC_014623	GT	3	6	246415	246420	0 %	50 %	50 %	0 %	310817468
6042	NC_014623	GGC	2	6	246445	246450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817468
6043	NC_014623	CGC	2	6	246478	246483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817468
6044	NC_014623	GCC	2	6	246550	246555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817468
6045	NC_014623	CGG	2	6	246616	246621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817468
6046	NC_014623	CGC	2	6	246662	246667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817468
6047	NC_014623	CGG	2	6	246730	246735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817468
6048	NC_014623	CG	3	6	246773	246778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_014623	GTG	2	6	246784	246789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_014623	GTG	2	6	246796	246801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_014623	GCC	2	6	246824	246829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_014623	CGC	2	6	246862	246867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_014623	AGG	2	6	246911	246916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_014623	CG	3	6	246931	246936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_014623	G	6	6	246954	246959	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_014623	TGC	2	6	246971	246976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_014623	CTCG	2	8	247032	247039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_014623	GCC	2	6	247076	247081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_014623	AGGC	2	8	247105	247112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_014623	GCC	2	6	247124	247129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_014623	AGAT	2	8	247154	247161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_014623	CGAG	2	8	247209	247216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6063	NC_014623	AGG	2	6	247247	247252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_014623	GAGC	2	8	247294	247301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6065	NC_014623	GGAG	2	8	247317	247324	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_014623	ACACGG	2	12	247419	247430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_014623	G	6	6	247452	247457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_014623	CGGG	2	8	247479	247486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_014623	GTC	2	6	247501	247506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_014623	GCA	2	6	247542	247547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_014623	CTT	2	6	247633	247638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_014623	ACAG	2	8	247658	247665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_014623	TGC	2	6	247725	247730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_014623	CCA	2	6	247824	247829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817469
6075	NC_014623	CAG	2	6	247908	247913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817469
6076	NC_014623	GT	3	6	247930	247935	0 %	50 %	50 %	0 %	310817469
6077	NC_014623	ATC	2	6	247964	247969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817469
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6079	NC_014623	G	6	6	248019	248024	0 %	0 %	100 %	0 %	310817469
6080	NC_014623	G	6	6	248080	248085	0 %	0 %	100 %	0 %	310817469
6081	NC_014623	C	7	7	248131	248137	0 %	0 %	0 %	100 %	310817469
6082	NC_014623	TCG	2	6	248139	248144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817469
6083	NC_014623	CGC	2	6	248161	248166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817469
6084	NC_014623	TGGC	2	8	248186	248193	0 %	25 %	50 %	25 %	310817469
6085	NC_014623	AGCC	2	8	248280	248287	25 %	0 %	25 %	50 %	310817469
6086	NC_014623	CTC	2	6	248288	248293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817469
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6088	NC_014623	GGCGG	2	10	248359	248368	0 %	0 %	80 %	20 %	310817469
6089	NC_014623	GGT	2	6	248402	248407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817469
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6091	NC_014623	AGCCC	2	10	248530	248539	20 %	0 %	20 %	60 %	310817469
6092	NC_014623	GCC	2	6	248564	248569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817469
6093	NC_014623	TGCG	2	8	248676	248683	0 %	25 %	50 %	25 %	310817469
6094	NC_014623	GGT	2	6	248717	248722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817469
6095	NC_014623	GGC	2	6	248746	248751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817469
6096	NC_014623	AGG	2	6	248754	248759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817469
6097	NC_014623	TC	3	6	248866	248871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_014623	GAATG	2	10	248881	248890	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_014623	G	8	8	248897	248904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_014623	G	9	9	248937	248945	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_014623	GCA	2	6	248985	248990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817470
6102	NC_014623	CGG	2	6	249006	249011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817470
6103	NC_014623	GC	3	6	249081	249086	0 %	0 %	50 %	50 %	310817470
6104	NC_014623	TGA	2	6	249147	249152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817470
6105	NC_014623	C	6	6	249156	249161	0 %	0 %	0 %	100 %	310817470
6106	NC_014623	GAT	2	6	249185	249190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817470
6107	NC_014623	ACC	2	6	249218	249223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817470
6108	NC_014623	AAGC	2	8	249262	249269	50 %	0 %	25 %	25 %	310817470
6109	NC_014623	CGG	2	6	249285	249290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817470
6110	NC_014623	GAA	2	6	249295	249300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817470
6111	NC_014623	TGG	2	6	249315	249320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817470
6112	NC_014623	ACT	2	6	249366	249371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817470
6113	NC_014623	CAC	3	9	249461	249469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817470
6114	NC_014623	AGG	2	6	249483	249488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817470
6115	NC_014623	AGC	2	6	249591	249596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817470
6116	NC_014623	GCGGAC	2	12	249680	249691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310817470
6117	NC_014623	ACA	2	6	249702	249707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817470
6118	NC_014623	GA	3	6	249718	249723	50 %	0 %	50 %	0 %	310817470
6119	NC_014623	GTC	2	6	249797	249802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817470
6120	NC_014623	CAC	2	6	249844	249849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817470
6121	NC_014623	AGG	2	6	249865	249870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817470
6122	NC_014623	CAG	2	6	249964	249969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817470
6123	NC_014623	GGA	2	6	250120	250125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817470
6124	NC_014623	CTC	2	6	250176	250181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817470
6125	NC_014623	GAC	2	6	250193	250198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817470
6126	NC_014623	A	6	6	250199	250204	100 %	0 %	0 %	0 %	310817470
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6135	NC_014623	TTC	2	6	250860	250865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6223	NC_014623	CAAGT	2	10	254987	254996	40 %	20 %	20 %	20 %	310817472
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6240	NC_014623	TGGT	2	8	255680	255687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6241	NC_014623	ATG	2	6	255734	255739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817474
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6247	NC_014623	CCT	2	6	256229	256234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817474
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6250	NC_014623	GGA	2	6	256315	256320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817474
6251	NC_014623	GGC	2	6	256336	256341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817474
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6314	NC_014623	CCTGT	2	10	259111	259120	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6351	NC_014623	GCCGTT	4	24	260739	260762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817479
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6496	NC_014623	G	6	6	266892	266897	0 %	0 %	100 %	0 %	310817486
6497	NC_014623	GCT	2	6	266924	266929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817486
6498	NC_014623	CAT	2	6	266948	266953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817486
6499	NC_014623	GAT	2	6	266958	266963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817486
6500	NC_014623	GCG	2	6	267019	267024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817486

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