MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 254757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014623	CG	3	6	224573	224578	0 %	0 %	50 %	50 %	310817450
5502	NC_014623	G	6	6	224578	224583	0 %	0 %	100 %	0 %	310817450
5503	NC_014623	GCT	2	6	224598	224603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817450
5504	NC_014623	CGG	2	6	224604	224609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817450
5505	NC_014623	GCT	2	6	224652	224657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817450
5506	NC_014623	TCG	2	6	224711	224716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817450
5507	NC_014623	ACGA	2	8	224725	224732	50 %	0 %	25 %	25 %	310817450
5508	NC_014623	AG	3	6	224735	224740	50 %	0 %	50 %	0 %	310817450
5509	NC_014623	ATC	2	6	224782	224787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817450
5510	NC_014623	CG	3	6	224892	224897	0 %	0 %	50 %	50 %	310817450
5511	NC_014623	TTC	2	6	224950	224955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817450
5512	NC_014623	GCC	2	6	224982	224987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817450
5513	NC_014623	CGC	2	6	225037	225042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817450
5514	NC_014623	CG	5	10	225147	225156	0 %	0 %	50 %	50 %	310817450
5515	NC_014623	GTC	3	9	225170	225178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_014623	AGC	2	6	225190	225195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_014623	GGA	2	6	225388	225393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817451
5518	NC_014623	GGC	2	6	225409	225414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817451
5519	NC_014623	CCTGC	2	10	225420	225429	0 %	20 %	20 %	60 %	310817451
5520	NC_014623	TGC	2	6	225492	225497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817451
5521	NC_014623	CGGA	2	8	225501	225508	25 %	0 %	50 %	25 %	310817451
5522	NC_014623	GTCC	2	8	225547	225554	0 %	25 %	25 %	50 %	310817451
5523	NC_014623	TGG	2	6	225744	225749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817451
5524	NC_014623	TCA	2	6	225759	225764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817451
5525	NC_014623	CTA	2	6	225790	225795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817451
5526	NC_014623	AGTG	2	8	225806	225813	25 %	25 %	50 %	0 %	310817451
5527	NC_014623	TGG	2	6	225820	225825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817451
5528	NC_014623	GCC	2	6	225835	225840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817451
5529	NC_014623	GGT	2	6	225856	225861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817451
5530	NC_014623	AGC	2	6	225887	225892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817451
5531	NC_014623	TAC	2	6	226139	226144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817451
5532	NC_014623	CCG	2	6	226200	226205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817451
5533	NC_014623	CCG	2	6	226217	226222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817451
5534	NC_014623	GTC	2	6	226398	226403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817452
5535	NC_014623	AAG	2	6	226417	226422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817452
5536	NC_014623	GGC	2	6	226482	226487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817452
5537	NC_014623	AGC	2	6	226561	226566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817452
5538	NC_014623	AGG	2	6	226705	226710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817452
5539	NC_014623	GCTTC	2	10	226742	226751	0 %	40 %	20 %	40 %	310817452
5540	NC_014623	CAGCCA	2	12	226755	226766	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310817452
5541	NC_014623	TGCA	2	8	226804	226811	25 %	25 %	25 %	25 %	310817452
5542	NC_014623	ACC	2	6	226989	226994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817453
5543	NC_014623	TGG	2	6	227073	227078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817453
5544	NC_014623	GGC	2	6	227099	227104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817453
5545	NC_014623	TG	3	6	227161	227166	0 %	50 %	50 %	0 %	310817453
5546	NC_014623	CCT	2	6	227170	227175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817453
5547	NC_014623	GAT	2	6	227234	227239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817453
5548	NC_014623	GC	3	6	227240	227245	0 %	0 %	50 %	50 %	310817453
5549	NC_014623	GCA	2	6	227277	227282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_014623	GA	3	6	227378	227383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_014623	AGC	2	6	227388	227393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_014623	CTG	2	6	227458	227463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_014623	AGCA	2	8	227472	227479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_014623	AG	3	6	227551	227556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_014623	GGC	2	6	227568	227573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_014623	CGC	2	6	227591	227596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_014623	GCC	2	6	227644	227649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5558	NC_014623	CTG	2	6	227659	227664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817454
5559	NC_014623	CCGGC	2	10	227707	227716	0 %	0 %	40 %	60 %	310817454
5560	NC_014623	CG	3	6	227761	227766	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
5561	NC_014623	CGGG	2	8	227768	227775	0 %	0 %	75 %	25 %	310817454
5562	NC_014623	GAA	2	6	227784	227789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817454
5563	NC_014623	TCA	2	6	227804	227809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817454
5564	NC_014623	AGG	2	6	227819	227824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817454
5565	NC_014623	GTC	2	6	227914	227919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817454
5566	NC_014623	AGG	2	6	227954	227959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817454
5567	NC_014623	TCG	2	6	228020	228025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817454
5568	NC_014623	CGG	2	6	228038	228043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817454
5569	NC_014623	CGG	2	6	228159	228164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817454
5570	NC_014623	GCC	2	6	228169	228174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5571	NC_014623	CTA	2	6	228177	228182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817454
5572	NC_014623	GAG	2	6	228205	228210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817454
5573	NC_014623	ATC	2	6	228241	228246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817454
5574	NC_014623	GGCA	2	8	228288	228295	25 %	0 %	50 %	25 %	310817454
5575	NC_014623	GCC	2	6	228373	228378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5576	NC_014623	CG	3	6	228394	228399	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
5577	NC_014623	GC	3	6	228430	228435	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
5578	NC_014623	CCG	2	6	228479	228484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5579	NC_014623	CG	3	6	228503	228508	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
5580	NC_014623	TCGC	2	8	228680	228687	0 %	25 %	25 %	50 %	310817454
5581	NC_014623	CG	3	6	228711	228716	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
5582	NC_014623	CTCC	2	8	228717	228724	0 %	25 %	0 %	75 %	310817454
5583	NC_014623	CGC	2	6	228729	228734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5584	NC_014623	CCG	2	6	228740	228745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5585	NC_014623	GCTCG	2	10	228759	228768	0 %	20 %	40 %	40 %	310817454
5586	NC_014623	TAC	2	6	228772	228777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817454
5587	NC_014623	TGG	2	6	228809	228814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817454
5588	NC_014623	GCCC	2	8	228849	228856	0 %	0 %	25 %	75 %	310817454
5589	NC_014623	GTG	2	6	228862	228867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817454
5590	NC_014623	TGG	2	6	228869	228874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817454
5591	NC_014623	GGA	2	6	228894	228899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817454
5592	NC_014623	GCC	2	6	228913	228918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5593	NC_014623	GCG	2	6	229037	229042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817454
5594	NC_014623	CG	3	6	229101	229106	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
5595	NC_014623	ACC	2	6	229112	229117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817454
5596	NC_014623	GC	3	6	229134	229139	0 %	0 %	50 %	50 %	310817454
5597	NC_014623	GCC	2	6	229159	229164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5598	NC_014623	GCC	2	6	229270	229275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817454
5599	NC_014623	GCC	2	6	229320	229325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_014623	CGC	2	6	229364	229369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_014623	CGCAA	2	10	229378	229387	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5602	NC_014623	GCT	2	6	229423	229428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5603	NC_014623	CGA	2	6	229429	229434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817455
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5605	NC_014623	CGA	2	6	229450	229455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5606	NC_014623	TGA	2	6	229464	229469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817455
5607	NC_014623	GAA	2	6	229483	229488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817455
5608	NC_014623	CCG	2	6	229491	229496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817455
5609	NC_014623	CAG	2	6	229529	229534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5610	NC_014623	CGT	2	6	229642	229647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5611	NC_014623	CTGG	2	8	229651	229658	0 %	25 %	50 %	25 %	310817455
5612	NC_014623	CTG	2	6	229667	229672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5613	NC_014623	TGG	2	6	229674	229679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817455
5614	NC_014623	CAC	2	6	229757	229762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817455
5615	NC_014623	TCG	2	6	229803	229808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5616	NC_014623	CGG	2	6	229860	229865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817455
5617	NC_014623	ATC	2	6	229868	229873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817455
5618	NC_014623	CGT	2	6	229888	229893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5619	NC_014623	TGC	2	6	229926	229931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5620	NC_014623	TGA	2	6	229947	229952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817455
5621	NC_014623	TGG	2	6	229971	229976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817455
5622	NC_014623	CGA	2	6	229993	229998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5623	NC_014623	GC	3	6	230042	230047	0 %	0 %	50 %	50 %	310817455
5624	NC_014623	CG	3	6	230052	230057	0 %	0 %	50 %	50 %	310817455
5625	NC_014623	GGC	2	6	230144	230149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817455
5626	NC_014623	CACG	2	8	230155	230162	25 %	0 %	25 %	50 %	310817455
5627	NC_014623	GC	3	6	230203	230208	0 %	0 %	50 %	50 %	310817455
5628	NC_014623	TGC	2	6	230235	230240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5629	NC_014623	CGC	2	6	230250	230255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817455
5630	NC_014623	GGCG	2	8	230284	230291	0 %	0 %	75 %	25 %	310817455
5631	NC_014623	GTG	2	6	230306	230311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817455
5632	NC_014623	TGC	2	6	230328	230333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817455
5633	NC_014623	GCC	2	6	230371	230376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5635	NC_014623	CGA	2	6	230483	230488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817456
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5642	NC_014623	CGC	2	6	230710	230715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817456
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5644	NC_014623	CCG	2	6	230808	230813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817456
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5648	NC_014623	CCGG	2	8	231085	231092	0 %	0 %	50 %	50 %	310817456
5649	NC_014623	GCTC	2	8	231096	231103	0 %	25 %	25 %	50 %	310817456
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5653	NC_014623	GC	3	6	231194	231199	0 %	0 %	50 %	50 %	310817456
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5662	NC_014623	ACT	2	6	231729	231734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817456
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5667	NC_014623	CGGA	2	8	231854	231861	25 %	0 %	50 %	25 %	310817456
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5672	NC_014623	TCT	2	6	232001	232006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817457
5673	NC_014623	GC	3	6	232023	232028	0 %	0 %	50 %	50 %	310817457
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5681	NC_014623	CGAT	2	8	232282	232289	25 %	25 %	25 %	25 %	310817457
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5687	NC_014623	CGG	2	6	232426	232431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817457
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5701	NC_014623	ATC	2	6	232790	232795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817458
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5723	NC_014623	C	6	6	233659	233664	0 %	0 %	0 %	100 %	310817458
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5730	NC_014623	CG	3	6	234109	234114	0 %	0 %	50 %	50 %	310817458
5731	NC_014623	GA	3	6	234127	234132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5732	NC_014623	CAG	2	6	234240	234245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817459
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5741	NC_014623	CG	3	6	234582	234587	0 %	0 %	50 %	50 %	310817459
5742	NC_014623	CAC	2	6	234588	234593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817459
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5745	NC_014623	GCA	2	6	234645	234650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817459
5746	NC_014623	GAT	2	6	234657	234662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817459
5747	NC_014623	CCT	2	6	234706	234711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817459
5748	NC_014623	CTTC	2	8	234728	234735	0 %	50 %	0 %	50 %	310817459
5749	NC_014623	GGGC	2	8	234800	234807	0 %	0 %	75 %	25 %	310817459
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5784	NC_014623	CGG	2	6	236024	236029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5869	NC_014623	CG	3	6	239372	239377	0 %	0 %	50 %	50 %	310817462
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5971	NC_014623	CGG	2	6	243499	243504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817465
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5977	NC_014623	GC	3	6	243651	243656	0 %	0 %	50 %	50 %	310817466
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5981	NC_014623	CCAA	2	8	243741	243748	50 %	0 %	0 %	50 %	310817466
5982	NC_014623	AAG	2	6	243752	243757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817466
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5984	NC_014623	CTG	2	6	243842	243847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817466
5985	NC_014623	AAGGGC	2	12	243923	243934	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310817466
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5987	NC_014623	CG	3	6	243974	243979	0 %	0 %	50 %	50 %	310817466
5988	NC_014623	ACA	2	6	244002	244007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817466
5989	NC_014623	CGG	2	6	244026	244031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817466
5990	NC_014623	GTG	2	6	244070	244075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817466
5991	NC_014623	CAC	2	6	244090	244095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817466
5992	NC_014623	GAA	2	6	244135	244140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817466
5993	NC_014623	GAC	2	6	244262	244267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817466
5994	NC_014623	CGG	2	6	244330	244335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817466
5995	NC_014623	CAT	2	6	244363	244368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817466
5996	NC_014623	GCA	2	6	244374	244379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817466
5997	NC_014623	ACG	2	6	244425	244430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817466
5998	NC_014623	GC	3	6	244451	244456	0 %	0 %	50 %	50 %	310817466
5999	NC_014623	ATC	2	6	244487	244492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817466
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