MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfurimonas autotrophica DSM 16294 chromosome

Total Repeats: 1640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014506	AAACA	2	10	390	399	80 %	0 %	0 %	20 %	307719922
2	NC_014506	AAATA	2	10	1394	1403	80 %	20 %	0 %	0 %	307719922
3	NC_014506	ATTTT	2	10	1418	1427	20 %	80 %	0 %	0 %	307719922
4	NC_014506	TTTTA	2	10	2614	2623	20 %	80 %	0 %	0 %	307719923
5	NC_014506	ATTGC	2	10	4573	4582	20 %	40 %	20 %	20 %	307719924
6	NC_014506	TATTT	2	10	5248	5257	20 %	80 %	0 %	0 %	307719925
7	NC_014506	TTTGA	2	10	5950	5959	20 %	60 %	20 %	0 %	307719925
8	NC_014506	ATATT	2	10	6682	6691	40 %	60 %	0 %	0 %	307719926
9	NC_014506	TCTTT	2	10	7150	7159	0 %	80 %	0 %	20 %	307719927
10	NC_014506	TTGTC	2	10	7902	7911	0 %	60 %	20 %	20 %	307719927
11	NC_014506	ATGGC	2	10	8765	8774	20 %	20 %	40 %	20 %	307719928
12	NC_014506	AAAAG	2	10	9517	9526	80 %	0 %	20 %	0 %	307719928
13	NC_014506	TGAAA	2	10	9528	9537	60 %	20 %	20 %	0 %	307719928
14	NC_014506	CACTA	2	10	10798	10807	40 %	20 %	0 %	40 %	307719929
15	NC_014506	CTTAT	2	10	11074	11083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014506	GACCT	2	10	11846	11855	20 %	20 %	20 %	40 %	307719930
17	NC_014506	ATGTT	2	10	12721	12730	20 %	60 %	20 %	0 %	307719931
18	NC_014506	GAAGT	2	10	14696	14705	40 %	20 %	40 %	0 %	307719935
19	NC_014506	CAAAA	2	10	15970	15979	80 %	0 %	0 %	20 %	307719936
20	NC_014506	TCAAA	2	10	16031	16040	60 %	20 %	0 %	20 %	307719936
21	NC_014506	GATAT	2	10	16787	16796	40 %	40 %	20 %	0 %	307719937
22	NC_014506	ATCAC	2	10	17754	17763	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014506	TGAAA	2	10	17782	17791	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014506	TTTAT	2	10	17966	17975	20 %	80 %	0 %	0 %	307719939
25	NC_014506	TGTTT	2	10	18196	18205	0 %	80 %	20 %	0 %	307719939
26	NC_014506	CAAAA	2	10	18222	18231	80 %	0 %	0 %	20 %	307719939
27	NC_014506	TAAAA	2	10	18316	18325	80 %	20 %	0 %	0 %	307719939
28	NC_014506	TTTTA	2	10	18845	18854	20 %	80 %	0 %	0 %	307719939
29	NC_014506	ATCAA	2	10	18886	18895	60 %	20 %	0 %	20 %	307719939
30	NC_014506	TAAAC	2	10	19282	19291	60 %	20 %	0 %	20 %	307719939
31	NC_014506	CAAAT	2	10	20228	20237	60 %	20 %	0 %	20 %	307719941
32	NC_014506	GATAA	2	10	22242	22251	60 %	20 %	20 %	0 %	307719943
33	NC_014506	CAGAG	2	10	24315	24324	40 %	0 %	40 %	20 %	307719945
34	NC_014506	AAATA	2	10	26474	26483	80 %	20 %	0 %	0 %	307719946
35	NC_014506	TTAGA	2	10	26818	26827	40 %	40 %	20 %	0 %	307719947
36	NC_014506	TAAAA	2	10	26915	26924	80 %	20 %	0 %	0 %	307719947
37	NC_014506	TTTAA	2	10	27258	27267	40 %	60 %	0 %	0 %	307719948
38	NC_014506	TTTGT	2	10	28237	28246	0 %	80 %	20 %	0 %	307719950
39	NC_014506	AAATA	2	10	31332	31341	80 %	20 %	0 %	0 %	307719954
40	NC_014506	AAAAT	2	10	31712	31721	80 %	20 %	0 %	0 %	307719954
41	NC_014506	ATTTT	2	10	32238	32247	20 %	80 %	0 %	0 %	307719955
42	NC_014506	ACAGA	2	10	33876	33885	60 %	0 %	20 %	20 %	307719956
43	NC_014506	ACAGC	2	10	34721	34730	40 %	0 %	20 %	40 %	307719956
44	NC_014506	ACTTT	2	10	41862	41871	20 %	60 %	0 %	20 %	307719963
45	NC_014506	TTAAA	2	10	41976	41985	60 %	40 %	0 %	0 %	307719963
46	NC_014506	TCAAA	2	10	45182	45191	60 %	20 %	0 %	20 %	307719965
47	NC_014506	TAAAA	2	10	46308	46317	80 %	20 %	0 %	0 %	307719965
48	NC_014506	ATTTA	2	10	46921	46930	40 %	60 %	0 %	0 %	307719966
49	NC_014506	GCTTG	2	10	48966	48975	0 %	40 %	40 %	20 %	307719968
50	NC_014506	AGAGG	2	10	49431	49440	40 %	0 %	60 %	0 %	307719968
51	NC_014506	AAAAG	2	10	50722	50731	80 %	0 %	20 %	0 %	307719969
52	NC_014506	TTTAT	2	10	51461	51470	20 %	80 %	0 %	0 %	307719970
53	NC_014506	ATACA	2	10	55027	55036	60 %	20 %	0 %	20 %	307719973
54	NC_014506	AAAGA	2	10	55217	55226	80 %	0 %	20 %	0 %	307719973
55	NC_014506	TGATT	2	10	55243	55252	20 %	60 %	20 %	0 %	307719973
56	NC_014506	CTTTT	2	10	57724	57733	0 %	80 %	0 %	20 %	307719975
57	NC_014506	AAAAT	2	10	59266	59275	80 %	20 %	0 %	0 %	307719976
58	NC_014506	AAAAT	2	10	60665	60674	80 %	20 %	0 %	0 %	307719977
59	NC_014506	ATTTG	2	10	61532	61541	20 %	60 %	20 %	0 %	307719979
60	NC_014506	GTGTA	2	10	61684	61693	20 %	40 %	40 %	0 %	307719979
61	NC_014506	TAAAA	2	10	63083	63092	80 %	20 %	0 %	0 %	307719980
62	NC_014506	AAATC	2	10	64978	64987	60 %	20 %	0 %	20 %	307719980
63	NC_014506	ATTTT	3	15	65131	65145	20 %	80 %	0 %	0 %	307719981
64	NC_014506	ACTAA	2	10	65916	65925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014506	TCAAC	2	10	66742	66751	40 %	20 %	0 %	40 %	307719983
66	NC_014506	AGTGA	2	10	68041	68050	40 %	20 %	40 %	0 %	307719984
67	NC_014506	TTTGG	2	10	69048	69057	0 %	60 %	40 %	0 %	307719986
68	NC_014506	TAAGT	2	10	69323	69332	40 %	40 %	20 %	0 %	307719986
69	NC_014506	TTGAT	2	10	70394	70403	20 %	60 %	20 %	0 %	307719988
70	NC_014506	TTTAC	2	10	72555	72564	20 %	60 %	0 %	20 %	307719989
71	NC_014506	ACTCA	2	10	73031	73040	40 %	20 %	0 %	40 %	307719989
72	NC_014506	GTTTT	2	10	73538	73547	0 %	80 %	20 %	0 %	307719989
73	NC_014506	TTTGT	2	10	79846	79855	0 %	80 %	20 %	0 %	307719993
74	NC_014506	TATTT	2	10	81903	81912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014506	TTGTT	2	10	85615	85624	0 %	80 %	20 %	0 %	307719998
76	NC_014506	GTTTT	2	10	86056	86065	0 %	80 %	20 %	0 %	307719998
77	NC_014506	AATGT	2	10	86717	86726	40 %	40 %	20 %	0 %	307719999
78	NC_014506	GTTTT	2	10	88052	88061	0 %	80 %	20 %	0 %	307720000
79	NC_014506	ATCAA	2	10	88258	88267	60 %	20 %	0 %	20 %	307720000
80	NC_014506	TTTAA	2	10	88364	88373	40 %	60 %	0 %	0 %	307720001
81	NC_014506	ATACG	2	10	88589	88598	40 %	20 %	20 %	20 %	307720001
82	NC_014506	ACAGT	2	10	90775	90784	40 %	20 %	20 %	20 %	307720005
83	NC_014506	TTCGC	2	10	93228	93237	0 %	40 %	20 %	40 %	307720007
84	NC_014506	AAACT	2	10	95147	95156	60 %	20 %	0 %	20 %	307720010
85	NC_014506	CTTTG	2	10	96167	96176	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014506	CCGCT	2	10	97144	97153	0 %	20 %	20 %	60 %	307720012
87	NC_014506	ATGCC	2	10	98417	98426	20 %	20 %	20 %	40 %	307720014
88	NC_014506	GGGAG	2	10	100923	100932	20 %	0 %	80 %	0 %	307720016
89	NC_014506	AAAGC	2	10	101945	101954	60 %	0 %	20 %	20 %	307720017
90	NC_014506	ACAAA	2	10	102085	102094	80 %	0 %	0 %	20 %	307720017
91	NC_014506	TGTAT	2	10	102394	102403	20 %	60 %	20 %	0 %	307720017
92	NC_014506	TCATT	2	10	108249	108258	20 %	60 %	0 %	20 %	307720025
93	NC_014506	GCATT	2	10	108995	109004	20 %	40 %	20 %	20 %	307720026
94	NC_014506	TTTAT	2	10	109332	109341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014506	ATTAA	2	10	109369	109378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014506	GAAGA	2	10	111031	111040	60 %	0 %	40 %	0 %	307720028
97	NC_014506	CAAAC	2	10	112153	112162	60 %	0 %	0 %	40 %	307720029
98	NC_014506	AGAAA	2	10	114644	114653	80 %	0 %	20 %	0 %	307720033
99	NC_014506	AGAGC	2	10	114772	114781	40 %	0 %	40 %	20 %	307720033
100	NC_014506	AACAG	2	10	114949	114958	60 %	0 %	20 %	20 %	307720033
101	NC_014506	AAAAG	2	10	115650	115659	80 %	0 %	20 %	0 %	307720034
102	NC_014506	CGTAG	2	10	120241	120250	20 %	20 %	40 %	20 %	307720038
103	NC_014506	GATAG	2	10	121252	121261	40 %	20 %	40 %	0 %	307720038
104	NC_014506	AAAGA	2	10	121640	121649	80 %	0 %	20 %	0 %	307720038
105	NC_014506	GATTG	2	10	121847	121856	20 %	40 %	40 %	0 %	307720039
106	NC_014506	AAAAC	2	10	121913	121922	80 %	0 %	0 %	20 %	307720039
107	NC_014506	TGTTT	2	10	129310	129319	0 %	80 %	20 %	0 %	307720047
108	NC_014506	TCACT	2	10	130508	130517	20 %	40 %	0 %	40 %	307720049
109	NC_014506	TAAAA	2	10	130742	130751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014506	GTTTT	2	10	131302	131311	0 %	80 %	20 %	0 %	307720051
111	NC_014506	TTTAT	2	10	135223	135232	20 %	80 %	0 %	0 %	307720053
112	NC_014506	TTGTA	2	10	135503	135512	20 %	60 %	20 %	0 %	307720053
113	NC_014506	TCATG	2	10	137917	137926	20 %	40 %	20 %	20 %	307720056
114	NC_014506	TAGTC	2	10	138678	138687	20 %	40 %	20 %	20 %	307720056
115	NC_014506	TGAGT	2	10	140206	140215	20 %	40 %	40 %	0 %	307720058
116	NC_014506	ATTTC	2	10	140771	140780	20 %	60 %	0 %	20 %	307720059
117	NC_014506	TTGAT	2	10	142368	142377	20 %	60 %	20 %	0 %	307720061
118	NC_014506	TTTGA	2	10	146386	146395	20 %	60 %	20 %	0 %	307720065
119	NC_014506	CAATA	2	10	151350	151359	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014506	CTAGA	2	10	152320	152329	40 %	20 %	20 %	20 %	307720074
121	NC_014506	AAATT	2	10	153588	153597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014506	TAAGT	2	10	153606	153615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014506	GAAAA	2	10	155329	155338	80 %	0 %	20 %	0 %	307720077
124	NC_014506	AATAC	2	10	156195	156204	60 %	20 %	0 %	20 %	307720077
125	NC_014506	TTTAA	2	10	159968	159977	40 %	60 %	0 %	0 %	307720083
126	NC_014506	GGATG	2	10	163145	163154	20 %	20 %	60 %	0 %	307720089
127	NC_014506	GATAT	2	10	163875	163884	40 %	40 %	20 %	0 %	307720089
128	NC_014506	TACAA	2	10	166948	166957	60 %	20 %	0 %	20 %	307720092
129	NC_014506	GCAGT	2	10	168117	168126	20 %	20 %	40 %	20 %	307720092
130	NC_014506	ATAGA	2	10	169290	169299	60 %	20 %	20 %	0 %	307720093
131	NC_014506	ATGAG	2	10	170067	170076	40 %	20 %	40 %	0 %	307720093
132	NC_014506	CTTAT	2	10	170569	170578	20 %	60 %	0 %	20 %	307720093
133	NC_014506	TATTT	2	10	172196	172205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014506	ATTGT	2	10	174062	174071	20 %	60 %	20 %	0 %	307720098
135	NC_014506	AAATA	2	10	174177	174186	80 %	20 %	0 %	0 %	307720098
136	NC_014506	ATTAG	2	10	174359	174368	40 %	40 %	20 %	0 %	307720098
137	NC_014506	AGATA	2	10	174780	174789	60 %	20 %	20 %	0 %	307720099
138	NC_014506	ATATC	2	10	174985	174994	40 %	40 %	0 %	20 %	307720099
139	NC_014506	ATTGT	2	10	177913	177922	20 %	60 %	20 %	0 %	307720103
140	NC_014506	TATTT	2	10	178922	178931	20 %	80 %	0 %	0 %	307720105
141	NC_014506	TTGCA	2	10	180123	180132	20 %	40 %	20 %	20 %	307720107
142	NC_014506	ATTTT	2	10	181516	181525	20 %	80 %	0 %	0 %	307720107
143	NC_014506	GTTTG	2	10	181618	181627	0 %	60 %	40 %	0 %	307720107
144	NC_014506	TTATC	2	10	185909	185918	20 %	60 %	0 %	20 %	307720109
145	NC_014506	ATTTT	2	10	187107	187116	20 %	80 %	0 %	0 %	307720111
146	NC_014506	CTTCT	2	10	187838	187847	0 %	60 %	0 %	40 %	307720112
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148	NC_014506	AATTT	2	10	188693	188702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014506	ATGCC	2	10	193434	193443	20 %	20 %	20 %	40 %	307720117
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151	NC_014506	TATTT	2	10	200048	200057	20 %	80 %	0 %	0 %	307720124
152	NC_014506	AGAGA	2	10	200319	200328	60 %	0 %	40 %	0 %	307720124
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156	NC_014506	ACTTA	2	10	207843	207852	40 %	40 %	0 %	20 %	307720132
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169	NC_014506	ATTTT	2	10	223490	223499	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_014506	CAAGT	2	10	254273	254282	40 %	20 %	20 %	20 %	307720197
197	NC_014506	GTGGA	2	10	256751	256760	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014506	AATAT	2	10	259246	259255	60 %	40 %	0 %	0 %	307720202
199	NC_014506	CAAAT	2	10	260999	261008	60 %	20 %	0 %	20 %	307720204
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214	NC_014506	GAAGT	2	10	279611	279620	40 %	20 %	40 %	0 %	307720224
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221	NC_014506	TAATC	2	10	285721	285730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_014506	GATTC	2	10	335276	335285	20 %	40 %	20 %	20 %	307720279
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267	NC_014506	TCATG	2	10	336402	336411	20 %	40 %	20 %	20 %	307720282
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