MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 1722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014498	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	307126152
2	NC_014498	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	307126152
3	NC_014498	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	307126152
4	NC_014498	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	307126153
5	NC_014498	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	307126154
6	NC_014498	GTCCA	2	10	3477	3486	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014498	TAGTT	2	10	6220	6229	20 %	60 %	20 %	0 %	307126158
8	NC_014498	CTATG	2	10	8953	8962	20 %	40 %	20 %	20 %	307126160
9	NC_014498	AAATC	2	10	9064	9073	60 %	20 %	0 %	20 %	307126160
10	NC_014498	AAGAA	2	10	10779	10788	80 %	0 %	20 %	0 %	307126166
11	NC_014498	TTCGT	2	10	11502	11511	0 %	60 %	20 %	20 %	307126168
12	NC_014498	TACCG	2	10	11991	12000	20 %	20 %	20 %	40 %	307126170
13	NC_014498	TTGTT	2	10	12055	12064	0 %	80 %	20 %	0 %	307126170
14	NC_014498	TTATT	2	10	12629	12638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014498	ATTTT	2	10	14590	14599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014498	AATTA	2	10	14643	14652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014498	ATCCA	2	10	14918	14927	40 %	20 %	0 %	40 %	307126175
18	NC_014498	CAAGA	2	10	14949	14958	60 %	0 %	20 %	20 %	307126175
19	NC_014498	CCCAT	2	10	15446	15455	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_014498	CTTTT	2	10	15913	15922	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014498	CTGAA	2	10	15988	15997	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014498	TGAAA	2	10	18923	18932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014498	AAACA	2	10	20184	20193	80 %	0 %	0 %	20 %	307126179
24	NC_014498	TCAAT	2	10	21811	21820	40 %	40 %	0 %	20 %	307126180
25	NC_014498	TTTTC	2	10	21851	21860	0 %	80 %	0 %	20 %	307126180
26	NC_014498	TAAAT	2	10	22369	22378	60 %	40 %	0 %	0 %	307126180
27	NC_014498	ACTCT	2	10	22450	22459	20 %	40 %	0 %	40 %	307126180
28	NC_014498	AAACG	2	10	23693	23702	60 %	0 %	20 %	20 %	307126180
29	NC_014498	TTGGT	2	10	23922	23931	0 %	60 %	40 %	0 %	307126180
30	NC_014498	CAATT	2	10	23991	24000	40 %	40 %	0 %	20 %	307126180
31	NC_014498	AGGAA	2	10	25007	25016	60 %	0 %	40 %	0 %	307126183
32	NC_014498	ATTGA	2	10	26425	26434	40 %	40 %	20 %	0 %	307126185
33	NC_014498	ATTCT	2	10	28558	28567	20 %	60 %	0 %	20 %	307126187
34	NC_014498	ATGCT	2	10	29786	29795	20 %	40 %	20 %	20 %	307126187
35	NC_014498	TCGTG	2	10	32174	32183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014498	GTTAA	2	10	32895	32904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014498	GGGAG	2	10	33413	33422	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014498	AGGGA	2	10	35624	35633	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014498	ATGGT	2	10	38201	38210	20 %	40 %	40 %	0 %	307126195
40	NC_014498	CTTTT	2	10	39369	39378	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014498	TAAGT	2	10	40881	40890	40 %	40 %	20 %	0 %	307126197
42	NC_014498	CCCAT	2	10	41632	41641	20 %	20 %	0 %	60 %	307126197
43	NC_014498	TCCCA	2	10	42306	42315	20 %	20 %	0 %	60 %	307126198
44	NC_014498	CATTT	2	10	42598	42607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014498	TCGTG	2	10	43387	43396	0 %	40 %	40 %	20 %	307126200
46	NC_014498	TAGAT	2	10	45069	45078	40 %	40 %	20 %	0 %	307126204
47	NC_014498	CTTAT	2	10	45577	45586	20 %	60 %	0 %	20 %	307126206
48	NC_014498	GAAGA	2	10	48036	48045	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014498	AAAGA	2	10	50339	50348	80 %	0 %	20 %	0 %	307126217
50	NC_014498	TAAAT	2	10	51900	51909	60 %	40 %	0 %	0 %	307126221
51	NC_014498	AAGGA	2	10	51955	51964	60 %	0 %	40 %	0 %	307126221
52	NC_014498	ATGGT	2	10	52150	52159	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014498	GAAAA	2	10	52225	52234	80 %	0 %	20 %	0 %	307126222
54	NC_014498	TCAGC	2	10	52396	52405	20 %	20 %	20 %	40 %	307126222
55	NC_014498	TCAAG	2	10	53053	53062	40 %	20 %	20 %	20 %	307126224
56	NC_014498	AGAAA	2	10	53141	53150	80 %	0 %	20 %	0 %	307126224
57	NC_014498	GCAAT	2	10	53940	53949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014498	TATGC	2	10	54274	54283	20 %	40 %	20 %	20 %	307126225
59	NC_014498	TGACT	2	10	55395	55404	20 %	40 %	20 %	20 %	307126225
60	NC_014498	GCTAG	2	10	55709	55718	20 %	20 %	40 %	20 %	307126226
61	NC_014498	GCAAG	2	10	55761	55770	40 %	0 %	40 %	20 %	307126226
62	NC_014498	TGAAT	2	10	56002	56011	40 %	40 %	20 %	0 %	307126226
63	NC_014498	AGTCT	2	10	57356	57365	20 %	40 %	20 %	20 %	307126228
64	NC_014498	GGAAA	2	10	58255	58264	60 %	0 %	40 %	0 %	307126229
65	NC_014498	GGAAT	2	10	58469	58478	40 %	20 %	40 %	0 %	307126229
66	NC_014498	AAACA	2	10	59261	59270	80 %	0 %	0 %	20 %	307126230
67	NC_014498	GTTCT	2	10	59651	59660	0 %	60 %	20 %	20 %	307126231
68	NC_014498	TGGAG	2	10	59697	59706	20 %	20 %	60 %	0 %	307126231
69	NC_014498	AGCGG	2	10	60567	60576	20 %	0 %	60 %	20 %	307126232
70	NC_014498	ATCCA	2	10	61145	61154	40 %	20 %	0 %	40 %	307126234
71	NC_014498	AAAGC	2	10	62216	62225	60 %	0 %	20 %	20 %	307126237
72	NC_014498	GTCTT	2	10	62251	62260	0 %	60 %	20 %	20 %	307126237
73	NC_014498	GGTTT	2	10	64396	64405	0 %	60 %	40 %	0 %	307126240
74	NC_014498	AATGT	2	10	65736	65745	40 %	40 %	20 %	0 %	307126240
75	NC_014498	CCGTT	2	10	66099	66108	0 %	40 %	20 %	40 %	307126241
76	NC_014498	GGTTC	2	10	66390	66399	0 %	40 %	40 %	20 %	307126241
77	NC_014498	TCCAG	2	10	67395	67404	20 %	20 %	20 %	40 %	307126242
78	NC_014498	ATTCA	2	10	71196	71205	40 %	40 %	0 %	20 %	307126242
79	NC_014498	CTCAA	2	10	72952	72961	40 %	20 %	0 %	40 %	307126242
80	NC_014498	TTTTG	2	10	77534	77543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014498	ATTAT	2	10	77675	77684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014498	TTTTA	2	10	77812	77821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014498	TATTT	2	10	81526	81535	20 %	80 %	0 %	0 %	307126255
84	NC_014498	TTATT	2	10	81536	81545	20 %	80 %	0 %	0 %	307126255
85	NC_014498	AGCAG	2	10	85515	85524	40 %	0 %	40 %	20 %	307126259
86	NC_014498	CAGAT	2	10	95013	95022	40 %	20 %	20 %	20 %	307126271
87	NC_014498	TTTAC	2	10	95715	95724	20 %	60 %	0 %	20 %	307126271
88	NC_014498	AGAGG	2	10	96577	96586	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014498	GTGAC	2	10	99346	99355	20 %	20 %	40 %	20 %	307126274
90	NC_014498	GTGAT	2	10	100336	100345	20 %	40 %	40 %	0 %	307126274
91	NC_014498	TGGCT	2	10	103156	103165	0 %	40 %	40 %	20 %	307126275
92	NC_014498	AAATG	2	10	103762	103771	60 %	20 %	20 %	0 %	307126275
93	NC_014498	AGCTA	2	10	104656	104665	40 %	20 %	20 %	20 %	307126276
94	NC_014498	CCTTG	2	10	107546	107555	0 %	40 %	20 %	40 %	307126279
95	NC_014498	TCAAA	2	10	107740	107749	60 %	20 %	0 %	20 %	307126279
96	NC_014498	AGTGG	2	10	110107	110116	20 %	20 %	60 %	0 %	307126282
97	NC_014498	GGGTG	2	10	110145	110154	0 %	20 %	80 %	0 %	307126282
98	NC_014498	CTATT	2	10	111112	111121	20 %	60 %	0 %	20 %	307126283
99	NC_014498	GAAGC	2	10	111302	111311	40 %	0 %	40 %	20 %	307126283
100	NC_014498	GCTTG	2	10	111757	111766	0 %	40 %	40 %	20 %	307126285
101	NC_014498	GCTTT	2	10	113186	113195	0 %	60 %	20 %	20 %	307126286
102	NC_014498	TCTGG	2	10	113792	113801	0 %	40 %	40 %	20 %	307126286
103	NC_014498	AGCAT	2	10	114746	114755	40 %	20 %	20 %	20 %	307126286
104	NC_014498	TACCA	2	10	115444	115453	40 %	20 %	0 %	40 %	307126286
105	NC_014498	TTCCT	2	10	116461	116470	0 %	60 %	0 %	40 %	307126286
106	NC_014498	TTATT	2	10	117042	117051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014498	TTGGT	2	10	120416	120425	0 %	60 %	40 %	0 %	307126289
108	NC_014498	CTTCA	2	10	121471	121480	20 %	40 %	0 %	40 %	307126290
109	NC_014498	AATCA	2	10	121583	121592	60 %	20 %	0 %	20 %	307126291
110	NC_014498	ATTCA	2	10	122959	122968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014498	AGCTC	2	10	123803	123812	20 %	20 %	20 %	40 %	307126293
112	NC_014498	GCTCC	2	10	128072	128081	0 %	20 %	20 %	60 %	307126300
113	NC_014498	GCTGT	2	10	128390	128399	0 %	40 %	40 %	20 %	307126300
114	NC_014498	TATCA	2	10	128714	128723	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014498	TCTAT	2	10	129593	129602	20 %	60 %	0 %	20 %	307126302
116	NC_014498	AGAAA	2	10	130518	130527	80 %	0 %	20 %	0 %	307126302
117	NC_014498	GAAAG	2	10	130570	130579	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014498	GCGGT	2	10	131811	131820	0 %	20 %	60 %	20 %	307126305
119	NC_014498	TGACT	2	10	133565	133574	20 %	40 %	20 %	20 %	307126307
120	NC_014498	AGGGC	2	10	136544	136553	20 %	0 %	60 %	20 %	307126309
121	NC_014498	ATAAA	2	10	138756	138765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014498	TAACC	2	10	138854	138863	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014498	ATTCT	2	10	139029	139038	20 %	60 %	0 %	20 %	307126313
124	NC_014498	TTACT	2	10	142846	142855	20 %	60 %	0 %	20 %	307126316
125	NC_014498	CAACC	2	10	143556	143565	40 %	0 %	0 %	60 %	307126316
126	NC_014498	TGCTT	2	10	144374	144383	0 %	60 %	20 %	20 %	307126317
127	NC_014498	TGGCT	2	10	144557	144566	0 %	40 %	40 %	20 %	307126317
128	NC_014498	AGATA	2	10	148524	148533	60 %	20 %	20 %	0 %	307126322
129	NC_014498	GTTTG	2	10	148691	148700	0 %	60 %	40 %	0 %	307126322
130	NC_014498	TATTT	2	10	150640	150649	20 %	80 %	0 %	0 %	307126324
131	NC_014498	AAAGC	2	10	153505	153514	60 %	0 %	20 %	20 %	307126327
132	NC_014498	GGCTT	2	10	154929	154938	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014498	CACAA	2	10	155268	155277	60 %	0 %	0 %	40 %	307126329
134	NC_014498	GGAAT	2	10	156769	156778	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014498	AGGAT	2	10	157334	157343	40 %	20 %	40 %	0 %	307126331
136	NC_014498	CTTTG	2	10	158643	158652	0 %	60 %	20 %	20 %	307126331
137	NC_014498	TCCTC	2	10	158769	158778	0 %	40 %	0 %	60 %	307126331
138	NC_014498	TCTTT	2	10	161513	161522	0 %	80 %	0 %	20 %	307126335
139	NC_014498	AAACT	2	10	165919	165928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014498	AAATT	2	10	166925	166934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_014498	CTGGT	2	10	498237	498246	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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