MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 6291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014494	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014494	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	307066637
3	NC_014494	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	307066637
4	NC_014494	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	307066637
5	NC_014494	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	307066637
6	NC_014494	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	307066637
7	NC_014494	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	307066637
8	NC_014494	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014494	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	307066638
10	NC_014494	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	307066638
11	NC_014494	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	307066638
12	NC_014494	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	307066638
13	NC_014494	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014494	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	307066640
15	NC_014494	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	307066640
16	NC_014494	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	307066640
17	NC_014494	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	307066640
18	NC_014494	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	307066640
19	NC_014494	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	307066641
20	NC_014494	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	307066641
21	NC_014494	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	307066641
22	NC_014494	TATC	2	8	5157	5164	25 %	50 %	0 %	25 %	307066642
23	NC_014494	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	307066642
24	NC_014494	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	307066642
25	NC_014494	TTTA	2	8	7633	7640	25 %	75 %	0 %	0 %	307066642
26	NC_014494	GTCG	2	8	7694	7701	0 %	25 %	50 %	25 %	307066642
27	NC_014494	ATCA	2	8	7747	7754	50 %	25 %	0 %	25 %	307066642
28	NC_014494	GAAA	2	8	8216	8223	75 %	0 %	25 %	0 %	307066642
29	NC_014494	AAGA	2	8	8372	8379	75 %	0 %	25 %	0 %	307066642
30	NC_014494	GAAA	2	8	9355	9362	75 %	0 %	25 %	0 %	307066646
31	NC_014494	TATT	2	8	9391	9398	25 %	75 %	0 %	0 %	307066646
32	NC_014494	TAAA	2	8	9522	9529	75 %	25 %	0 %	0 %	307066646
33	NC_014494	ATCA	2	8	9597	9604	50 %	25 %	0 %	25 %	307066646
34	NC_014494	GAAG	2	8	9740	9747	50 %	0 %	50 %	0 %	307066646
35	NC_014494	TTCT	2	8	9859	9866	0 %	75 %	0 %	25 %	307066646
36	NC_014494	ATCA	2	8	9908	9915	50 %	25 %	0 %	25 %	307066646
37	NC_014494	CAGC	2	8	9933	9940	25 %	0 %	25 %	50 %	307066646
38	NC_014494	TTCT	2	8	10455	10462	0 %	75 %	0 %	25 %	307066646
39	NC_014494	CTAT	2	8	10947	10954	25 %	50 %	0 %	25 %	307066647
40	NC_014494	CTTA	2	8	11102	11109	25 %	50 %	0 %	25 %	307066647
41	NC_014494	ATTT	2	8	11501	11508	25 %	75 %	0 %	0 %	307066647
42	NC_014494	TTTA	2	8	11640	11647	25 %	75 %	0 %	0 %	307066647
43	NC_014494	AGAA	2	8	12353	12360	75 %	0 %	25 %	0 %	307066648
44	NC_014494	TTAA	2	8	12391	12398	50 %	50 %	0 %	0 %	307066649
45	NC_014494	ACCA	2	8	12548	12555	50 %	0 %	0 %	50 %	307066649
46	NC_014494	TGCT	2	8	13073	13080	0 %	50 %	25 %	25 %	307066649
47	NC_014494	GATG	2	8	13317	13324	25 %	25 %	50 %	0 %	307066649
48	NC_014494	TTGG	2	8	13426	13433	0 %	50 %	50 %	0 %	307066649
49	NC_014494	TGAA	2	8	13568	13575	50 %	25 %	25 %	0 %	307066649
50	NC_014494	AAGA	2	8	13666	13673	75 %	0 %	25 %	0 %	307066649
51	NC_014494	TCTA	2	8	13842	13849	25 %	50 %	0 %	25 %	307066649
52	NC_014494	TGGC	2	8	13871	13878	0 %	25 %	50 %	25 %	307066649
53	NC_014494	AACA	2	8	14075	14082	75 %	0 %	0 %	25 %	307066649
54	NC_014494	GTTC	2	8	14104	14111	0 %	50 %	25 %	25 %	307066649
55	NC_014494	ATGA	2	8	14311	14318	50 %	25 %	25 %	0 %	307066649
56	NC_014494	TATG	2	8	14705	14712	25 %	50 %	25 %	0 %	307066650
57	NC_014494	GGTG	2	8	14714	14721	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014494	TGAG	3	12	14736	14747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014494	AAAC	2	8	14802	14809	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014494	TGAG	2	8	15331	15338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014494	GCTT	2	8	15429	15436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014494	CCTG	2	8	15477	15484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014494	GTGA	2	8	15757	15764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014494	AGCG	2	8	15928	15935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014494	AGCC	2	8	16809	16816	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014494	GTAA	2	8	17231	17238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014494	GCGA	2	8	17387	17394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014494	ATTC	2	8	18253	18260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014494	CTAA	2	8	18607	18614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014494	GTCT	2	8	18632	18639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014494	TAGG	2	8	19263	19270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014494	CTTT	2	8	20463	20470	0 %	75 %	0 %	25 %	307066651
73	NC_014494	ATGT	2	8	21898	21905	25 %	50 %	25 %	0 %	307066654
74	NC_014494	GATA	2	8	22539	22546	50 %	25 %	25 %	0 %	307066654
75	NC_014494	CAAG	2	8	22703	22710	50 %	0 %	25 %	25 %	307066654
76	NC_014494	GGTT	2	8	22858	22865	0 %	50 %	50 %	0 %	307066654
77	NC_014494	CTTT	2	8	22915	22922	0 %	75 %	0 %	25 %	307066654
78	NC_014494	CTAT	2	8	23042	23049	25 %	50 %	0 %	25 %	307066654
79	NC_014494	TTGG	2	8	23146	23153	0 %	50 %	50 %	0 %	307066654
80	NC_014494	AACA	2	8	23192	23199	75 %	0 %	0 %	25 %	307066654
81	NC_014494	TTCA	2	8	23663	23670	25 %	50 %	0 %	25 %	307066655
82	NC_014494	GAAA	2	8	25160	25167	75 %	0 %	25 %	0 %	307066656
83	NC_014494	TGTT	2	8	25463	25470	0 %	75 %	25 %	0 %	307066656
84	NC_014494	CTTT	2	8	25560	25567	0 %	75 %	0 %	25 %	307066656
85	NC_014494	GAAC	2	8	26873	26880	50 %	0 %	25 %	25 %	307066659
86	NC_014494	GAAC	2	8	27068	27075	50 %	0 %	25 %	25 %	307066660
87	NC_014494	AGAA	2	8	27077	27084	75 %	0 %	25 %	0 %	307066660
88	NC_014494	TACA	2	8	27826	27833	50 %	25 %	0 %	25 %	307066661
89	NC_014494	CAAG	2	8	28124	28131	50 %	0 %	25 %	25 %	307066662
90	NC_014494	GCTT	2	8	28378	28385	0 %	50 %	25 %	25 %	307066662
91	NC_014494	GATT	2	8	28452	28459	25 %	50 %	25 %	0 %	307066662
92	NC_014494	GATG	2	8	28722	28729	25 %	25 %	50 %	0 %	307066663
93	NC_014494	TTGA	2	8	29303	29310	25 %	50 %	25 %	0 %	307066665
94	NC_014494	AGGC	2	8	29512	29519	25 %	0 %	50 %	25 %	307066665
95	NC_014494	CCGT	2	8	29786	29793	0 %	25 %	25 %	50 %	307066666
96	NC_014494	ATAA	2	8	30069	30076	75 %	25 %	0 %	0 %	307066666
97	NC_014494	AAAG	2	8	30281	30288	75 %	0 %	25 %	0 %	307066666
98	NC_014494	ACCA	2	8	30474	30481	50 %	0 %	0 %	50 %	307066667
99	NC_014494	TGAA	2	8	30719	30726	50 %	25 %	25 %	0 %	307066668
100	NC_014494	AGCT	2	8	30851	30858	25 %	25 %	25 %	25 %	307066668
101	NC_014494	ACAA	2	8	31291	31298	75 %	0 %	0 %	25 %	307066668
102	NC_014494	ACGA	2	8	32648	32655	50 %	0 %	25 %	25 %	307066674
103	NC_014494	AAGA	2	8	32679	32686	75 %	0 %	25 %	0 %	307066674
104	NC_014494	TAAA	2	8	32940	32947	75 %	25 %	0 %	0 %	307066674
105	NC_014494	AGCA	2	8	32977	32984	50 %	0 %	25 %	25 %	307066674
106	NC_014494	AAAG	2	8	33019	33026	75 %	0 %	25 %	0 %	307066674
107	NC_014494	GAAA	2	8	33430	33437	75 %	0 %	25 %	0 %	307066675
108	NC_014494	AAAG	2	8	33605	33612	75 %	0 %	25 %	0 %	307066675
109	NC_014494	ATTG	2	8	33786	33793	25 %	50 %	25 %	0 %	307066676
110	NC_014494	CTAT	2	8	34332	34339	25 %	50 %	0 %	25 %	307066677
111	NC_014494	GAAT	2	8	34509	34516	50 %	25 %	25 %	0 %	307066677
112	NC_014494	AAAT	2	8	34989	34996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014494	ATTT	2	8	35558	35565	25 %	75 %	0 %	0 %	307066679
114	NC_014494	TCAT	2	8	36505	36512	25 %	50 %	0 %	25 %	307066681
115	NC_014494	CGAA	2	8	36679	36686	50 %	0 %	25 %	25 %	307066681
116	NC_014494	TCAA	2	8	36774	36781	50 %	25 %	0 %	25 %	307066681
117	NC_014494	GGTT	2	8	37239	37246	0 %	50 %	50 %	0 %	307066681
118	NC_014494	GTTT	2	8	37264	37271	0 %	75 %	25 %	0 %	307066681
119	NC_014494	CGTG	2	8	37358	37365	0 %	25 %	50 %	25 %	307066681
120	NC_014494	TGAG	2	8	37537	37544	25 %	25 %	50 %	0 %	307066681
121	NC_014494	TTAA	2	8	37605	37612	50 %	50 %	0 %	0 %	307066681
122	NC_014494	AGAT	2	8	37762	37769	50 %	25 %	25 %	0 %	307066681
123	NC_014494	TGAT	2	8	38331	38338	25 %	50 %	25 %	0 %	307066682
124	NC_014494	AATT	2	8	38427	38434	50 %	50 %	0 %	0 %	307066682
125	NC_014494	TTCA	2	8	38881	38888	25 %	50 %	0 %	25 %	307066682
126	NC_014494	TGGA	2	8	39464	39471	25 %	25 %	50 %	0 %	307066683
127	NC_014494	GCCA	2	8	39515	39522	25 %	0 %	25 %	50 %	307066683
128	NC_014494	GAAG	2	8	39989	39996	50 %	0 %	50 %	0 %	307066684
129	NC_014494	ATTG	2	8	40081	40088	25 %	50 %	25 %	0 %	307066684
130	NC_014494	AAAG	2	8	40216	40223	75 %	0 %	25 %	0 %	307066684
131	NC_014494	TGGA	2	8	40712	40719	25 %	25 %	50 %	0 %	307066684
132	NC_014494	AAAG	2	8	41067	41074	75 %	0 %	25 %	0 %	307066685
133	NC_014494	ATCA	2	8	41278	41285	50 %	25 %	0 %	25 %	307066686
134	NC_014494	TTAC	3	12	41862	41873	25 %	50 %	0 %	25 %	307066687
135	NC_014494	AAGG	2	8	42243	42250	50 %	0 %	50 %	0 %	307066688
136	NC_014494	CGTC	2	8	42443	42450	0 %	25 %	25 %	50 %	307066689
137	NC_014494	TGAT	2	8	42511	42518	25 %	50 %	25 %	0 %	307066689
138	NC_014494	ATTG	2	8	42869	42876	25 %	50 %	25 %	0 %	307066689
139	NC_014494	CTTT	2	8	43002	43009	0 %	75 %	0 %	25 %	307066690
140	NC_014494	TGAT	2	8	43307	43314	25 %	50 %	25 %	0 %	307066690
141	NC_014494	GGAT	2	8	43441	43448	25 %	25 %	50 %	0 %	307066691
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143	NC_014494	GAAT	2	8	46076	46083	50 %	25 %	25 %	0 %	307066692
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