MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 27545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014494	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014494	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014494	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014494	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014494	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014494	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066637
7	NC_014494	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066637
8	NC_014494	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066637
9	NC_014494	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066637
10	NC_014494	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066637
11	NC_014494	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066637
12	NC_014494	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066637
13	NC_014494	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066637
14	NC_014494	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066637
15	NC_014494	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066637
16	NC_014494	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066637
17	NC_014494	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066637
18	NC_014494	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066637
19	NC_014494	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066637
20	NC_014494	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014494	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014494	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066638
23	NC_014494	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066638
24	NC_014494	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066638
25	NC_014494	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066638
26	NC_014494	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066638
27	NC_014494	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066638
28	NC_014494	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066638
29	NC_014494	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066638
30	NC_014494	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066638
31	NC_014494	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066638
32	NC_014494	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066638
33	NC_014494	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066638
34	NC_014494	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066638
35	NC_014494	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066638
36	NC_014494	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014494	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066639
38	NC_014494	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066639
39	NC_014494	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066639
40	NC_014494	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066639
41	NC_014494	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066640
42	NC_014494	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066640
43	NC_014494	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066640
44	NC_014494	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066640
45	NC_014494	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066640
46	NC_014494	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
47	NC_014494	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066640
48	NC_014494	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066640
49	NC_014494	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
50	NC_014494	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066640
51	NC_014494	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
52	NC_014494	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066640
53	NC_014494	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066640
54	NC_014494	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
55	NC_014494	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
56	NC_014494	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014494	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066641
58	NC_014494	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066641
59	NC_014494	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066641
60	NC_014494	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066641
61	NC_014494	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066641
62	NC_014494	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066641
63	NC_014494	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066641
64	NC_014494	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066641
65	NC_014494	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066641
66	NC_014494	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
67	NC_014494	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066642
68	NC_014494	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
69	NC_014494	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
70	NC_014494	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066642
71	NC_014494	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066642
72	NC_014494	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
73	NC_014494	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066642
74	NC_014494	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
75	NC_014494	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
76	NC_014494	TCA	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066642
77	NC_014494	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
78	NC_014494	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
79	NC_014494	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
80	NC_014494	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
81	NC_014494	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
82	NC_014494	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066642
83	NC_014494	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066642
84	NC_014494	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066642
85	NC_014494	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066642
86	NC_014494	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066642
87	NC_014494	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
88	NC_014494	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
89	NC_014494	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
90	NC_014494	GAT	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
91	NC_014494	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
92	NC_014494	CGA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066642
93	NC_014494	TGT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066642
94	NC_014494	TGA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
95	NC_014494	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
96	NC_014494	GAA	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
97	NC_014494	CCG	2	6	7322	7327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307066642
98	NC_014494	ACA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066642
99	NC_014494	GAC	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066642
100	NC_014494	TAT	2	6	7594	7599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
101	NC_014494	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
102	NC_014494	GTA	2	6	8147	8152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
103	NC_014494	ATA	2	6	8226	8231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066642
104	NC_014494	ATT	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
105	NC_014494	TTA	2	6	8420	8425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
106	NC_014494	GAA	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
107	NC_014494	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014494	AAT	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014494	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014494	CGT	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066643
111	NC_014494	TGC	2	6	8682	8687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066643
112	NC_014494	GCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066643
113	NC_014494	AGA	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066643
114	NC_014494	AAT	2	6	8802	8807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066644
115	NC_014494	CGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066644
116	NC_014494	TGA	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066644
117	NC_014494	TAT	2	6	8905	8910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066644
118	NC_014494	TGA	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066644
119	NC_014494	TGC	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066644
120	NC_014494	TAT	2	6	9090	9095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066644
121	NC_014494	TTA	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066645
122	NC_014494	GAA	2	6	9208	9213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066645
123	NC_014494	ATT	2	6	9231	9236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066645
124	NC_014494	ATT	2	6	9281	9286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066646
125	NC_014494	TTG	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066646
126	NC_014494	GTC	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066646
127	NC_014494	TTA	2	6	9364	9369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066646
128	NC_014494	TAG	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066646
129	NC_014494	ATC	2	6	9558	9563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066646
130	NC_014494	CAA	2	6	9615	9620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066646
131	NC_014494	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066646
132	NC_014494	ATC	2	6	9688	9693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066646
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260	NC_014494	AGT	2	6	20194	20199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_014494	GTA	2	6	20261	20266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_014494	ATG	2	6	20284	20289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_014494	TAA	3	9	20355	20363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_014494	GAA	2	6	20426	20431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066651
265	NC_014494	TGA	2	6	20521	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066651
266	NC_014494	ATT	2	6	20528	20533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066651
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268	NC_014494	TTA	2	6	20711	20716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066651
269	NC_014494	TTG	2	6	20776	20781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014494	GAT	2	6	20829	20834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014494	TGA	2	6	21042	21047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066652
272	NC_014494	TGA	2	6	21100	21105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066652
273	NC_014494	TGA	2	6	21117	21122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066652
274	NC_014494	TTC	2	6	21123	21128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066652
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276	NC_014494	ATA	2	6	21239	21244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_014494	TTG	2	6	21375	21380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014494	GAA	2	6	21521	21526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066653
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280	NC_014494	TTG	2	6	21703	21708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066653
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282	NC_014494	TCT	2	6	21828	21833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_014494	TAA	2	6	21858	21863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_014494	CGT	2	6	22891	22896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066654
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328	NC_014494	TAT	2	6	24730	24735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_014494	TAT	2	6	28656	28661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066663
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383	NC_014494	ATT	2	6	28912	28917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
384	NC_014494	TAT	2	6	28924	28929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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