MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 43896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014494	T	6	6	190245	190250	0 %	100 %	0 %	0 %	307066841
4003	NC_014494	CTT	2	6	190344	190349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066841
4004	NC_014494	A	7	7	190462	190468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_014494	AGAT	2	8	190479	190486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014494	GGA	2	6	190543	190548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014494	A	7	7	190558	190564	100 %	0 %	0 %	0 %	307066842
4008	NC_014494	TGC	2	6	190584	190589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066842
4009	NC_014494	TTG	2	6	190598	190603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066842
4010	NC_014494	AAGA	2	8	190639	190646	75 %	0 %	25 %	0 %	307066842
4011	NC_014494	AGC	2	6	190653	190658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066842
4012	NC_014494	AAGA	2	8	190663	190670	75 %	0 %	25 %	0 %	307066842
4013	NC_014494	ATC	2	6	190672	190677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066842
4014	NC_014494	GAA	2	6	190714	190719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066842
4015	NC_014494	ATG	2	6	190784	190789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066842
4016	NC_014494	CAA	2	6	190860	190865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066842
4017	NC_014494	GAA	2	6	190944	190949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066842
4018	NC_014494	TC	3	6	190969	190974	0 %	50 %	0 %	50 %	307066842
4019	NC_014494	GAT	2	6	190975	190980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066842
4020	NC_014494	AC	3	6	191052	191057	50 %	0 %	0 %	50 %	307066842
4021	NC_014494	CAA	2	6	191098	191103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066842
4022	NC_014494	CAA	2	6	191224	191229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066842
4023	NC_014494	CTT	2	6	191245	191250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066842
4024	NC_014494	TTC	2	6	191341	191346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066842
4025	NC_014494	CAG	2	6	191363	191368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066842
4026	NC_014494	AAT	2	6	191381	191386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066842
4027	NC_014494	ATC	2	6	191395	191400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_014494	TA	3	6	191453	191458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_014494	TAA	2	6	191469	191474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_014494	CAAA	2	8	191488	191495	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_014494	TAT	2	6	191515	191520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_014494	A	6	6	191548	191553	100 %	0 %	0 %	0 %	307066843
4033	NC_014494	TAG	2	6	191564	191569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066843
4034	NC_014494	AGAAA	2	10	191616	191625	80 %	0 %	20 %	0 %	307066843
4035	NC_014494	CAA	2	6	191636	191641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066843
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4038	NC_014494	ACT	2	6	191753	191758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066843
4039	NC_014494	CAAA	2	8	191765	191772	75 %	0 %	0 %	25 %	307066843
4040	NC_014494	CTG	2	6	191777	191782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066843
4041	NC_014494	CTT	2	6	191820	191825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066843
4042	NC_014494	AAC	2	6	191827	191832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066843
4043	NC_014494	TC	3	6	191882	191887	0 %	50 %	0 %	50 %	307066843
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4049	NC_014494	TTG	2	6	192260	192265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066843
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4051	NC_014494	CA	3	6	192328	192333	50 %	0 %	0 %	50 %	307066843
4052	NC_014494	A	6	6	192343	192348	100 %	0 %	0 %	0 %	307066843
4053	NC_014494	GAA	2	6	192355	192360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066843
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4055	NC_014494	TAA	2	6	192391	192396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066843
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4057	NC_014494	AGA	2	6	192458	192463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_014494	AG	3	6	192484	192489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014494	ATT	2	6	192554	192559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066844
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4061	NC_014494	TGA	2	6	192678	192683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066844
4062	NC_014494	TGA	2	6	192855	192860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066844
4063	NC_014494	AT	3	6	192903	192908	50 %	50 %	0 %	0 %	307066844
4064	NC_014494	GCA	2	6	192909	192914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066844
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4080	NC_014494	GA	3	6	193592	193597	50 %	0 %	50 %	0 %	307066844
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4096	NC_014494	TTG	2	6	194426	194431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066845
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4106	NC_014494	CTT	2	6	195047	195052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066846
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4110	NC_014494	CTTT	2	8	195249	195256	0 %	75 %	0 %	25 %	307066846
4111	NC_014494	CTT	2	6	195269	195274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066846
4112	NC_014494	GGC	2	6	195326	195331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307066846
4113	NC_014494	AGCG	2	8	195335	195342	25 %	0 %	50 %	25 %	307066846
4114	NC_014494	GAC	2	6	195407	195412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066846
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4119	NC_014494	A	6	6	195613	195618	100 %	0 %	0 %	0 %	307066846
4120	NC_014494	T	6	6	195662	195667	0 %	100 %	0 %	0 %	307066847
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4122	NC_014494	AT	3	6	195771	195776	50 %	50 %	0 %	0 %	307066847
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4124	NC_014494	TGT	2	6	195851	195856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066847
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4239	NC_014494	TTGA	2	8	202566	202573	25 %	50 %	25 %	0 %	307066853
4240	NC_014494	AAT	2	6	202624	202629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_014494	A	6	6	202654	202659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_014494	A	6	6	202686	202691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_014494	TGAT	2	8	202803	202810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_014494	ATTTC	2	10	202824	202833	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4245	NC_014494	GCA	2	6	202847	202852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4246	NC_014494	TTTC	2	8	202874	202881	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4247	NC_014494	TTA	2	6	202892	202897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_014494	TTGA	2	8	202927	202934	25 %	50 %	25 %	0 %	307066854
4249	NC_014494	T	6	6	202945	202950	0 %	100 %	0 %	0 %	307066854
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4374	NC_014494	CCCTG	2	10	210075	210084	0 %	20 %	20 %	60 %	307066861
4375	NC_014494	GAT	2	6	210105	210110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066861
4376	NC_014494	CTC	2	6	210191	210196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4377	NC_014494	AG	3	6	210234	210239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4378	NC_014494	TCAGG	2	10	210358	210367	20 %	20 %	40 %	20 %	307066862
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4402	NC_014494	TGT	2	6	211670	211675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066864
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4411	NC_014494	CTA	2	6	212015	212020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066864
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4413	NC_014494	TGA	2	6	212190	212195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4414	NC_014494	A	6	6	212218	212223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4434	NC_014494	A	6	6	213480	213485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4470	NC_014494	TAT	2	6	215214	215219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4471	NC_014494	T	7	7	215256	215262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4472	NC_014494	AAT	2	6	215278	215283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4473	NC_014494	AGAA	2	8	215289	215296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4477	NC_014494	CT	3	6	215435	215440	0 %	50 %	0 %	50 %	307066868
4478	NC_014494	AG	3	6	215466	215471	50 %	0 %	50 %	0 %	307066868
4479	NC_014494	CTCG	2	8	215585	215592	0 %	25 %	25 %	50 %	307066868
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4483	NC_014494	TGTTCG	2	12	215826	215837	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307066868
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4495	NC_014494	CGT	2	6	216445	216450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066868
4496	NC_014494	ATGA	2	8	216499	216506	50 %	25 %	25 %	0 %	307066868
4497	NC_014494	TGTC	2	8	216554	216561	0 %	50 %	25 %	25 %	307066868
4498	NC_014494	GGC	2	6	216568	216573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307066868
4499	NC_014494	ACTTGG	2	12	216623	216634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066868
4500	NC_014494	CAT	2	6	216666	216671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066868

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