MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 43896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_014494	TTG	2	6	1301756	1301761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068000
27003	NC_014494	AT	3	6	1301764	1301769	50 %	50 %	0 %	0 %	307068000
27004	NC_014494	ATT	2	6	1301778	1301783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068000
27005	NC_014494	AAAT	2	8	1301803	1301810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27006	NC_014494	AATCTA	2	12	1301817	1301828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27007	NC_014494	GTT	2	6	1301871	1301876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27008	NC_014494	TCT	2	6	1301880	1301885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068001
27009	NC_014494	ATTCA	2	10	1301911	1301920	40 %	40 %	0 %	20 %	307068001
27010	NC_014494	TTTC	2	8	1301978	1301985	0 %	75 %	0 %	25 %	307068001
27011	NC_014494	AAT	2	6	1301992	1301997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068001
27012	NC_014494	TTC	2	6	1302005	1302010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068001
27013	NC_014494	ATAA	2	8	1302048	1302055	75 %	25 %	0 %	0 %	307068002
27014	NC_014494	T	6	6	1302185	1302190	0 %	100 %	0 %	0 %	307068002
27015	NC_014494	TAA	2	6	1302244	1302249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068002
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27017	NC_014494	TCA	2	6	1302288	1302293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068002
27018	NC_014494	AATT	2	8	1302298	1302305	50 %	50 %	0 %	0 %	307068002
27019	NC_014494	AAG	2	6	1302362	1302367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068002
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27021	NC_014494	TTC	2	6	1302384	1302389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068002
27022	NC_014494	TAGA	2	8	1302403	1302410	50 %	25 %	25 %	0 %	307068002
27023	NC_014494	ATCA	2	8	1302412	1302419	50 %	25 %	0 %	25 %	307068002
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27025	NC_014494	TCA	2	6	1302510	1302515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068003
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27039	NC_014494	TTA	2	6	1303225	1303230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27040	NC_014494	TAT	2	6	1303352	1303357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068006
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27119	NC_014494	T	6	6	1306792	1306797	0 %	100 %	0 %	0 %	307068009
27120	NC_014494	GAA	2	6	1306956	1306961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068009
27121	NC_014494	A	6	6	1307001	1307006	100 %	0 %	0 %	0 %	307068009
27122	NC_014494	CGAC	2	8	1307016	1307023	25 %	0 %	25 %	50 %	307068009
27123	NC_014494	CAT	2	6	1307039	1307044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068009
27124	NC_014494	GAA	2	6	1307121	1307126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068009
27125	NC_014494	CTGA	2	8	1307137	1307144	25 %	25 %	25 %	25 %	307068009
27126	NC_014494	AGT	2	6	1307155	1307160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068009
27127	NC_014494	CTG	2	6	1307225	1307230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068009
27128	NC_014494	TTC	2	6	1307240	1307245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068009
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27169	NC_014494	CT	3	6	1309632	1309637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27223	NC_014494	TAGG	2	8	1312266	1312273	25 %	25 %	50 %	0 %	307068013
27224	NC_014494	GCA	2	6	1312292	1312297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068013
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27227	NC_014494	AGCTAC	2	12	1312357	1312368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307068013
27228	NC_014494	TCT	2	6	1312370	1312375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068013
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27231	NC_014494	CAT	2	6	1312539	1312544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068013
27232	NC_014494	CTT	2	6	1312557	1312562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068013
27233	NC_014494	CCA	2	6	1312563	1312568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068013
27234	NC_014494	ACT	2	6	1312601	1312606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068013
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27355	NC_014494	TAA	2	6	1318099	1318104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068018
27356	NC_014494	TCCG	2	8	1318149	1318156	0 %	25 %	25 %	50 %	307068018
27357	NC_014494	GAG	2	6	1318173	1318178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307068018
27358	NC_014494	TCT	2	6	1318194	1318199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068018
27359	NC_014494	T	6	6	1318301	1318306	0 %	100 %	0 %	0 %	307068018
27360	NC_014494	GCA	2	6	1318328	1318333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068018
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27365	NC_014494	AAC	2	6	1318436	1318441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068018
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27374	NC_014494	TCT	2	6	1318701	1318706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068018
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27383	NC_014494	T	6	6	1319054	1319059	0 %	100 %	0 %	0 %	307068019
27384	NC_014494	GA	3	6	1319075	1319080	50 %	0 %	50 %	0 %	307068019
27385	NC_014494	T	6	6	1319192	1319197	0 %	100 %	0 %	0 %	307068019
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27395	NC_014494	TATCG	2	10	1319612	1319621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27396	NC_014494	A	6	6	1319667	1319672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27397	NC_014494	AAC	2	6	1319747	1319752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27398	NC_014494	TAGGTA	2	12	1319771	1319782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27400	NC_014494	TAT	2	6	1319874	1319879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27452	NC_014494	A	6	6	1322346	1322351	100 %	0 %	0 %	0 %	307068022
27453	NC_014494	TAA	2	6	1322456	1322461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068022
27454	NC_014494	ATC	2	6	1322490	1322495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068023
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27458	NC_014494	CCTTGA	2	12	1322732	1322743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307068023
27459	NC_014494	CTC	2	6	1322745	1322750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307068023
27460	NC_014494	CTTGGG	2	12	1322774	1322785	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	307068023
27461	NC_014494	AAT	2	6	1322799	1322804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068023
27462	NC_014494	TCA	2	6	1322812	1322817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068023
27463	NC_014494	AGA	2	6	1322865	1322870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068023
27464	NC_014494	CAA	2	6	1322873	1322878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068023
27465	NC_014494	AAT	2	6	1322952	1322957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068023
27466	NC_014494	GCA	2	6	1322990	1322995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068023
27467	NC_014494	ACC	2	6	1323067	1323072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068023
27468	NC_014494	CTGTC	2	10	1323075	1323084	0 %	40 %	20 %	40 %	307068023
27469	NC_014494	ACC	2	6	1323135	1323140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068023
27470	NC_014494	TTG	2	6	1323144	1323149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068023
27471	NC_014494	ATA	2	6	1323190	1323195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068023
27472	NC_014494	TGACT	2	10	1323237	1323246	20 %	40 %	20 %	20 %	307068023
27473	NC_014494	T	7	7	1323356	1323362	0 %	100 %	0 %	0 %	307068023
27474	NC_014494	ATC	2	6	1323405	1323410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068023
27475	NC_014494	GCG	2	6	1323503	1323508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307068023
27476	NC_014494	AGCC	2	8	1323515	1323522	25 %	0 %	25 %	50 %	307068023
27477	NC_014494	TAA	2	6	1323542	1323547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068023
27478	NC_014494	TAC	2	6	1323710	1323715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068023
27479	NC_014494	TGTT	2	8	1323731	1323738	0 %	75 %	25 %	0 %	307068023
27480	NC_014494	TTCTT	2	10	1323833	1323842	0 %	80 %	0 %	20 %	307068024
27481	NC_014494	T	6	6	1323876	1323881	0 %	100 %	0 %	0 %	307068024
27482	NC_014494	TTG	3	9	1323907	1323915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068024
27483	NC_014494	CTGT	2	8	1324008	1324015	0 %	50 %	25 %	25 %	307068025
27484	NC_014494	TTGC	2	8	1324064	1324071	0 %	50 %	25 %	25 %	307068025
27485	NC_014494	CTG	2	6	1324080	1324085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068025
27486	NC_014494	GCT	2	6	1324100	1324105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068025
27487	NC_014494	TTC	2	6	1324181	1324186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27488	NC_014494	GAC	2	6	1324199	1324204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068026
27489	NC_014494	T	6	6	1324218	1324223	0 %	100 %	0 %	0 %	307068026
27490	NC_014494	TCT	2	6	1324371	1324376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068026
27491	NC_014494	TCA	2	6	1324377	1324382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068026
27492	NC_014494	CAC	3	9	1324417	1324425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068026
27493	NC_014494	GTT	2	6	1324450	1324455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068026
27494	NC_014494	A	6	6	1324469	1324474	100 %	0 %	0 %	0 %	307068026
27495	NC_014494	ACC	2	6	1324637	1324642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068026
27496	NC_014494	ATA	2	6	1324859	1324864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068026
27497	NC_014494	AGC	2	6	1324895	1324900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068026
27498	NC_014494	ATGGG	2	10	1324923	1324932	20 %	20 %	60 %	0 %	307068026
27499	NC_014494	GCCA	2	8	1324955	1324962	25 %	0 %	25 %	50 %	307068026
27500	NC_014494	CCG	2	6	1324972	1324977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307068026

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