MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 43896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014494	AGA	2	6	23070	23075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066654
502	NC_014494	TCG	2	6	23130	23135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066654
503	NC_014494	TTGG	2	8	23146	23153	0 %	50 %	50 %	0 %	307066654
504	NC_014494	AACA	2	8	23192	23199	75 %	0 %	0 %	25 %	307066654
505	NC_014494	AAG	2	6	23278	23283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014494	CCT	2	6	23285	23290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_014494	TTG	2	6	23294	23299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014494	CTTTT	2	10	23316	23325	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
509	NC_014494	ATA	2	6	23328	23333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014494	T	6	6	23365	23370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014494	AAT	2	6	23405	23410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014494	TGG	2	6	23454	23459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014494	T	7	7	23463	23469	0 %	100 %	0 %	0 %	307066655
514	NC_014494	TGT	2	6	23495	23500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066655
515	NC_014494	AAT	2	6	23600	23605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066655
516	NC_014494	GAA	2	6	23618	23623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066655
517	NC_014494	CAT	2	6	23630	23635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066655
518	NC_014494	TTCA	2	8	23663	23670	25 %	50 %	0 %	25 %	307066655
519	NC_014494	TGA	2	6	23704	23709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066655
520	NC_014494	ACC	2	6	23711	23716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307066655
521	NC_014494	TA	3	6	23732	23737	50 %	50 %	0 %	0 %	307066655
522	NC_014494	ATA	2	6	23801	23806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066655
523	NC_014494	ATC	2	6	23825	23830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066655
524	NC_014494	CCT	2	6	23868	23873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307066655
525	NC_014494	TCT	2	6	24036	24041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066655
526	NC_014494	GCA	2	6	24090	24095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066655
527	NC_014494	CAT	2	6	24163	24168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066655
528	NC_014494	GTA	2	6	24332	24337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066655
529	NC_014494	TTCTTG	2	12	24428	24439	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307066655
530	NC_014494	TTG	2	6	24443	24448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066655
531	NC_014494	ACTTTT	2	12	24497	24508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307066655
532	NC_014494	T	6	6	24505	24510	0 %	100 %	0 %	0 %	307066655
533	NC_014494	T	7	7	24514	24520	0 %	100 %	0 %	0 %	307066655
534	NC_014494	GAA	2	6	24527	24532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066655
535	NC_014494	A	6	6	24531	24536	100 %	0 %	0 %	0 %	307066655
536	NC_014494	TAT	2	6	24604	24609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066655
537	NC_014494	TAT	2	6	24730	24735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014494	T	7	7	24782	24788	0 %	100 %	0 %	0 %	307066656
539	NC_014494	T	6	6	24790	24795	0 %	100 %	0 %	0 %	307066656
540	NC_014494	TAAGT	2	10	24827	24836	40 %	40 %	20 %	0 %	307066656
541	NC_014494	CT	3	6	24855	24860	0 %	50 %	0 %	50 %	307066656
542	NC_014494	TCC	2	6	24889	24894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307066656
543	NC_014494	CAT	2	6	24912	24917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066656
544	NC_014494	ATT	2	6	24991	24996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066656
545	NC_014494	TTA	2	6	25127	25132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066656
546	NC_014494	AAT	2	6	25143	25148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066656
547	NC_014494	GAAA	2	8	25160	25167	75 %	0 %	25 %	0 %	307066656
548	NC_014494	CTT	3	9	25185	25193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066656
549	NC_014494	GAT	2	6	25194	25199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066656
550	NC_014494	TAA	2	6	25213	25218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066656
551	NC_014494	ATC	2	6	25222	25227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066656
552	NC_014494	TCT	2	6	25272	25277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066656
553	NC_014494	TC	3	6	25281	25286	0 %	50 %	0 %	50 %	307066656
554	NC_014494	AAT	2	6	25306	25311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066656
555	NC_014494	TAA	2	6	25329	25334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066656
556	NC_014494	AAG	3	9	25337	25345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066656
557	NC_014494	CTT	2	6	25404	25409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066656
558	NC_014494	GT	3	6	25424	25429	0 %	50 %	50 %	0 %	307066656
559	NC_014494	TGTT	2	8	25463	25470	0 %	75 %	25 %	0 %	307066656
560	NC_014494	ACT	2	6	25475	25480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066656
561	NC_014494	T	6	6	25484	25489	0 %	100 %	0 %	0 %	307066656
562	NC_014494	GAT	2	6	25499	25504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066656
563	NC_014494	CTTT	2	8	25560	25567	0 %	75 %	0 %	25 %	307066656
564	NC_014494	CCCAT	2	10	25578	25587	20 %	20 %	0 %	60 %	307066656
565	NC_014494	T	6	6	25618	25623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014494	TAG	2	6	25644	25649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014494	TCT	2	6	25766	25771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066657
568	NC_014494	CAT	2	6	25893	25898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066657
569	NC_014494	AAG	2	6	25974	25979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066657
570	NC_014494	A	6	6	26007	26012	100 %	0 %	0 %	0 %	307066657
571	NC_014494	TAT	2	6	26115	26120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066657
572	NC_014494	CTT	2	6	26235	26240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066657
573	NC_014494	CTT	2	6	26244	26249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066657
574	NC_014494	TCT	2	6	26258	26263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066657
575	NC_014494	TTA	2	6	26276	26281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066657
576	NC_014494	AGT	2	6	26356	26361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066657
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578	NC_014494	TAT	2	6	26457	26462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066657
579	NC_014494	TA	3	6	26484	26489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014494	TA	3	6	26491	26496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014494	A	6	6	26512	26517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014494	A	7	7	26524	26530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014494	A	7	7	26532	26538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014494	A	6	6	26553	26558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014494	A	7	7	26618	26624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014494	A	6	6	26678	26683	100 %	0 %	0 %	0 %	307066658
587	NC_014494	CTA	2	6	26791	26796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066658
588	NC_014494	GT	3	6	26803	26808	0 %	50 %	50 %	0 %	307066658
589	NC_014494	TGA	2	6	26813	26818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066658
590	NC_014494	ATT	2	6	26820	26825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066658
591	NC_014494	T	7	7	26824	26830	0 %	100 %	0 %	0 %	307066658
592	NC_014494	ACA	2	6	26833	26838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066658
593	NC_014494	GAAC	2	8	26873	26880	50 %	0 %	25 %	25 %	307066659
594	NC_014494	TAC	2	6	26934	26939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066659
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596	NC_014494	A	7	7	26979	26985	100 %	0 %	0 %	0 %	307066659
597	NC_014494	GAT	2	6	26991	26996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066659
598	NC_014494	A	7	7	27014	27020	100 %	0 %	0 %	0 %	307066659
599	NC_014494	T	6	6	27033	27038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014494	GAAC	2	8	27068	27075	50 %	0 %	25 %	25 %	307066660
601	NC_014494	AGAA	2	8	27077	27084	75 %	0 %	25 %	0 %	307066660
602	NC_014494	AT	3	6	27116	27121	50 %	50 %	0 %	0 %	307066660
603	NC_014494	ATGCT	2	10	27148	27157	20 %	40 %	20 %	20 %	307066660
604	NC_014494	AAG	2	6	27166	27171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066660
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606	NC_014494	T	6	6	27265	27270	0 %	100 %	0 %	0 %	307066661
607	NC_014494	TA	3	6	27295	27300	50 %	50 %	0 %	0 %	307066661
608	NC_014494	TAT	2	6	27333	27338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066661
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611	NC_014494	GA	3	6	27525	27530	50 %	0 %	50 %	0 %	307066661
612	NC_014494	AT	3	6	27588	27593	50 %	50 %	0 %	0 %	307066661
613	NC_014494	TCA	2	6	27647	27652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066661
614	NC_014494	AAT	2	6	27657	27662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066661
615	NC_014494	TTG	2	6	27670	27675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066661
616	NC_014494	GTT	2	6	27725	27730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066661
617	NC_014494	TACA	2	8	27826	27833	50 %	25 %	0 %	25 %	307066661
618	NC_014494	ATT	2	6	27836	27841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014494	TTTTTA	2	12	27851	27862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014494	TGA	2	6	27939	27944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066662
621	NC_014494	TGA	2	6	28023	28028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066662
622	NC_014494	ATC	3	9	28084	28092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066662
623	NC_014494	CT	3	6	28110	28115	0 %	50 %	0 %	50 %	307066662
624	NC_014494	CAAG	2	8	28124	28131	50 %	0 %	25 %	25 %	307066662
625	NC_014494	GGT	2	6	28198	28203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066662
626	NC_014494	AGA	2	6	28256	28261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066662
627	NC_014494	GAA	2	6	28353	28358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066662
628	NC_014494	TCGTG	2	10	28368	28377	0 %	40 %	40 %	20 %	307066662
629	NC_014494	GCTT	2	8	28378	28385	0 %	50 %	25 %	25 %	307066662
630	NC_014494	GGT	2	6	28387	28392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066662
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632	NC_014494	TAC	2	6	28493	28498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066662
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