MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 64538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014484	CCA	2	6	38324	38329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717753
1002	NC_014484	GGA	2	6	38366	38371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717753
1003	NC_014484	ATG	2	6	38395	38400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717753
1004	NC_014484	TGG	2	6	38408	38413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717753
1005	NC_014484	GAG	2	6	38418	38423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717753
1006	NC_014484	TTC	2	6	38433	38438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717753
1007	NC_014484	GAGGG	2	10	38457	38466	20 %	0 %	80 %	0 %	307717753
1008	NC_014484	TGA	2	6	38537	38542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717753
1009	NC_014484	CCT	2	6	38585	38590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717753
1010	NC_014484	GGAG	2	8	38591	38598	25 %	0 %	75 %	0 %	307717753
1011	NC_014484	TCT	2	6	38648	38653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717753
1012	NC_014484	G	7	7	38726	38732	0 %	0 %	100 %	0 %	307717753
1013	NC_014484	GAGCTC	2	12	38760	38771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307717753
1014	NC_014484	TCT	2	6	38797	38802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717753
1015	NC_014484	TTGAGG	2	12	38863	38874	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307717753
1016	NC_014484	TCC	2	6	38926	38931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717753
1017	NC_014484	GCG	2	6	38987	38992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717753
1018	NC_014484	TCC	2	6	39031	39036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717753
1019	NC_014484	GAG	2	6	39042	39047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717753
1020	NC_014484	CTC	2	6	39051	39056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717753
1021	NC_014484	GAT	2	6	39084	39089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717753
1022	NC_014484	TCC	2	6	39115	39120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717753
1023	NC_014484	AGG	2	6	39146	39151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717753
1024	NC_014484	GA	3	6	39161	39166	50 %	0 %	50 %	0 %	307717753
1025	NC_014484	GAT	2	6	39198	39203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717753
1026	NC_014484	TCC	2	6	39215	39220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717753
1027	NC_014484	GTG	2	6	39238	39243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717753
1028	NC_014484	TC	3	6	39261	39266	0 %	50 %	0 %	50 %	307717753
1029	NC_014484	TCTCC	2	10	39323	39332	0 %	40 %	0 %	60 %	307717753
1030	NC_014484	TGTCC	2	10	39338	39347	0 %	40 %	20 %	40 %	307717753
1031	NC_014484	CGG	2	6	39362	39367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717753
1032	NC_014484	GA	3	6	39368	39373	50 %	0 %	50 %	0 %	307717753
1033	NC_014484	CTT	2	6	39392	39397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717753
1034	NC_014484	AGG	2	6	39407	39412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717753
1035	NC_014484	CTC	2	6	39445	39450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717753
1036	NC_014484	TCT	2	6	39452	39457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717753
1037	NC_014484	TCT	2	6	39473	39478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717753
1038	NC_014484	GCC	2	6	39505	39510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717753
1039	NC_014484	TCT	2	6	39529	39534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717753
1040	NC_014484	G	7	7	39571	39577	0 %	0 %	100 %	0 %	307717753
1041	NC_014484	G	7	7	39615	39621	0 %	0 %	100 %	0 %	307717753
1042	NC_014484	GTT	2	6	39749	39754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307717753
1043	NC_014484	GTT	2	6	39779	39784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307717753
1044	NC_014484	CTT	2	6	39791	39796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717753
1045	NC_014484	TG	3	6	39913	39918	0 %	50 %	50 %	0 %	307717753
1046	NC_014484	GGA	2	6	39952	39957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717754
1047	NC_014484	TCCT	2	8	40005	40012	0 %	50 %	0 %	50 %	307717754
1048	NC_014484	CTG	2	6	40031	40036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717754
1049	NC_014484	CCA	2	6	40051	40056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717754
1050	NC_014484	GGA	2	6	40084	40089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717754
1051	NC_014484	TTC	2	6	40091	40096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717754
1052	NC_014484	GAG	2	6	40178	40183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717754
1053	NC_014484	GGA	2	6	40207	40212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717754
1054	NC_014484	GCGAT	2	10	40221	40230	20 %	20 %	40 %	20 %	307717754
1055	NC_014484	GAG	2	6	40284	40289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717754
1056	NC_014484	GAT	2	6	40319	40324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717754
1057	NC_014484	TCGATG	2	12	40335	40346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307717754
1058	NC_014484	GTGG	2	8	40429	40436	0 %	25 %	75 %	0 %	307717754
1059	NC_014484	GAG	2	6	40440	40445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717754
1060	NC_014484	TGA	2	6	40489	40494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717754
1061	NC_014484	CT	3	6	40579	40584	0 %	50 %	0 %	50 %	307717754
1062	NC_014484	GA	3	6	40590	40595	50 %	0 %	50 %	0 %	307717754
1063	NC_014484	GGGGTG	2	12	40653	40664	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	307717754
1064	NC_014484	GAT	2	6	40670	40675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717754
1065	NC_014484	GTT	2	6	40679	40684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307717754
1066	NC_014484	GAA	2	6	40694	40699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717754
1067	NC_014484	TG	3	6	40714	40719	0 %	50 %	50 %	0 %	307717754
1068	NC_014484	GAT	2	6	40736	40741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717754
1069	NC_014484	GAG	2	6	40775	40780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717754
1070	NC_014484	CTT	3	9	40781	40789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717754
1071	NC_014484	CGG	2	6	40795	40800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717754
1072	NC_014484	TGGG	2	8	40860	40867	0 %	25 %	75 %	0 %	307717754
1073	NC_014484	GTG	2	6	40899	40904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717754
1074	NC_014484	TCC	2	6	40961	40966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717754
1075	NC_014484	CCA	2	6	40978	40983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717754
1076	NC_014484	ACC	2	6	40986	40991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717754
1077	NC_014484	GGGCGA	2	12	41005	41016	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	307717754
1078	NC_014484	TCG	2	6	41026	41031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717754
1079	NC_014484	GA	3	6	41036	41041	50 %	0 %	50 %	0 %	307717754
1080	NC_014484	CCT	2	6	41052	41057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717754
1081	NC_014484	G	6	6	41106	41111	0 %	0 %	100 %	0 %	307717755
1082	NC_014484	GAG	2	6	41146	41151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717755
1083	NC_014484	GTG	2	6	41183	41188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717755
1084	NC_014484	GAT	2	6	41191	41196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717755
1085	NC_014484	GAG	2	6	41224	41229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717755
1086	NC_014484	GTC	2	6	41289	41294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717755
1087	NC_014484	GAG	3	9	41344	41352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717755
1088	NC_014484	GGCC	2	8	41353	41360	0 %	0 %	50 %	50 %	307717755
1089	NC_014484	AGG	2	6	41372	41377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717755
1090	NC_014484	GGA	2	6	41415	41420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717755
1091	NC_014484	AGAA	2	8	41468	41475	75 %	0 %	25 %	0 %	307717755
1092	NC_014484	CAT	2	6	41485	41490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717755
1093	NC_014484	GGT	2	6	41511	41516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014484	CA	3	6	41579	41584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_014484	GGT	2	6	41594	41599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014484	GAT	2	6	41600	41605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717756
1097	NC_014484	A	6	6	41607	41612	100 %	0 %	0 %	0 %	307717756
1098	NC_014484	TGG	2	6	41637	41642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717756
1099	NC_014484	TCC	3	9	41650	41658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717756
1100	NC_014484	CTC	2	6	41727	41732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717756
1101	NC_014484	TC	4	8	41731	41738	0 %	50 %	0 %	50 %	307717756
1102	NC_014484	GAT	2	6	41838	41843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717756
1103	NC_014484	GGA	2	6	41864	41869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717756
1104	NC_014484	ACC	2	6	41892	41897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717756
1105	NC_014484	G	7	7	41949	41955	0 %	0 %	100 %	0 %	307717756
1106	NC_014484	ATGTGG	2	12	41965	41976	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307717756
1107	NC_014484	CG	3	6	42006	42011	0 %	0 %	50 %	50 %	307717756
1108	NC_014484	CTGG	2	8	42018	42025	0 %	25 %	50 %	25 %	307717756
1109	NC_014484	CGA	2	6	42074	42079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717756
1110	NC_014484	ACCATC	2	12	42120	42131	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307717756
1111	NC_014484	G	7	7	42136	42142	0 %	0 %	100 %	0 %	307717756
1112	NC_014484	ATC	2	6	42177	42182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717756
1113	NC_014484	TTCC	2	8	42207	42214	0 %	50 %	0 %	50 %	307717756
1114	NC_014484	ATC	2	6	42240	42245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717756
1115	NC_014484	CA	3	6	42256	42261	50 %	0 %	0 %	50 %	307717756
1116	NC_014484	GAG	2	6	42276	42281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717756
1117	NC_014484	CTC	2	6	42318	42323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717756
1118	NC_014484	CTC	2	6	42351	42356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717756
1119	NC_014484	CTT	3	9	42380	42388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717756
1120	NC_014484	GAG	2	6	42411	42416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717756
1121	NC_014484	GGAC	2	8	42417	42424	25 %	0 %	50 %	25 %	307717756
1122	NC_014484	TAT	2	6	42444	42449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307717756
1123	NC_014484	TGG	2	6	42466	42471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717756
1124	NC_014484	TGG	2	6	42487	42492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717756
1125	NC_014484	CGG	2	6	42517	42522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717756
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1127	NC_014484	GA	3	6	42574	42579	50 %	0 %	50 %	0 %	307717756
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1248	NC_014484	CATA	2	8	46623	46630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1249	NC_014484	TAT	2	6	46637	46642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_014484	CAT	2	6	46696	46701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717762
1251	NC_014484	CGA	2	6	46711	46716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717762
1252	NC_014484	TA	3	6	46796	46801	50 %	50 %	0 %	0 %	307717762
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