MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 2770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014251	TC	3	6	195	200	0 %	50 %	0 %	50 %	298501503
2	NC_014251	TC	3	6	685	690	0 %	50 %	0 %	50 %	298501504
3	NC_014251	CT	3	6	1069	1074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014251	GT	3	6	1361	1366	0 %	50 %	50 %	0 %	298501505
5	NC_014251	TC	3	6	1774	1779	0 %	50 %	0 %	50 %	298501506
6	NC_014251	CT	3	6	1850	1855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014251	AT	3	6	3431	3436	50 %	50 %	0 %	0 %	298501508
8	NC_014251	CA	3	6	3614	3619	50 %	0 %	0 %	50 %	298501508
9	NC_014251	TC	3	6	3718	3723	0 %	50 %	0 %	50 %	298501508
10	NC_014251	CT	3	6	4370	4375	0 %	50 %	0 %	50 %	298501509
11	NC_014251	CT	3	6	5077	5082	0 %	50 %	0 %	50 %	298501509
12	NC_014251	AG	3	6	6555	6560	50 %	0 %	50 %	0 %	298501511
13	NC_014251	CT	3	6	6912	6917	0 %	50 %	0 %	50 %	298501511
14	NC_014251	AG	3	6	8307	8312	50 %	0 %	50 %	0 %	298501513
15	NC_014251	TC	4	8	9769	9776	0 %	50 %	0 %	50 %	298501515
16	NC_014251	TG	3	6	10575	10580	0 %	50 %	50 %	0 %	298501515
17	NC_014251	TC	3	6	10755	10760	0 %	50 %	0 %	50 %	298501515
18	NC_014251	CT	3	6	11006	11011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014251	AT	3	6	11525	11530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014251	GA	4	8	12436	12443	50 %	0 %	50 %	0 %	298501517
21	NC_014251	TC	3	6	12654	12659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014251	AG	4	8	13610	13617	50 %	0 %	50 %	0 %	298501518
23	NC_014251	AG	3	6	14211	14216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014251	TA	3	6	14334	14339	50 %	50 %	0 %	0 %	298501519
25	NC_014251	CA	3	6	15069	15074	50 %	0 %	0 %	50 %	298501519
26	NC_014251	AT	3	6	15850	15855	50 %	50 %	0 %	0 %	298501521
27	NC_014251	AC	3	6	16578	16583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014251	AT	3	6	16850	16855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014251	TA	3	6	16954	16959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014251	TG	3	6	17535	17540	0 %	50 %	50 %	0 %	298501522
31	NC_014251	TG	3	6	18600	18605	0 %	50 %	50 %	0 %	298501522
32	NC_014251	CA	3	6	19245	19250	50 %	0 %	0 %	50 %	298501522
33	NC_014251	CA	3	6	23391	23396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014251	CT	3	6	24532	24537	0 %	50 %	0 %	50 %	298501528
35	NC_014251	AT	3	6	24825	24830	50 %	50 %	0 %	0 %	298501529
36	NC_014251	CT	3	6	25778	25783	0 %	50 %	0 %	50 %	298501529
37	NC_014251	TC	3	6	26135	26140	0 %	50 %	0 %	50 %	298501529
38	NC_014251	AT	7	14	26400	26413	50 %	50 %	0 %	0 %	298501530
39	NC_014251	TA	3	6	26975	26980	50 %	50 %	0 %	0 %	298501531
40	NC_014251	GT	3	6	28054	28059	0 %	50 %	50 %	0 %	298501532
41	NC_014251	TG	3	6	28934	28939	0 %	50 %	50 %	0 %	298501534
42	NC_014251	AC	3	6	29739	29744	50 %	0 %	0 %	50 %	298501536
43	NC_014251	AT	3	6	29779	29784	50 %	50 %	0 %	0 %	298501536
44	NC_014251	CA	3	6	29859	29864	50 %	0 %	0 %	50 %	298501536
45	NC_014251	TC	3	6	31611	31616	0 %	50 %	0 %	50 %	298501537
46	NC_014251	AG	3	6	33347	33352	50 %	0 %	50 %	0 %	298501539
47	NC_014251	TC	3	6	34054	34059	0 %	50 %	0 %	50 %	298501540
48	NC_014251	CT	3	6	34411	34416	0 %	50 %	0 %	50 %	298501542
49	NC_014251	GT	3	6	34643	34648	0 %	50 %	50 %	0 %	298501542
50	NC_014251	TG	3	6	34971	34976	0 %	50 %	50 %	0 %	298501542
51	NC_014251	GA	3	6	36711	36716	50 %	0 %	50 %	0 %	298501544
52	NC_014251	AC	3	6	39873	39878	50 %	0 %	0 %	50 %	298501550
53	NC_014251	TC	3	6	42729	42734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014251	TC	3	6	43447	43452	0 %	50 %	0 %	50 %	298501554
55	NC_014251	TC	3	6	44238	44243	0 %	50 %	0 %	50 %	298501555
56	NC_014251	GT	3	6	44791	44796	0 %	50 %	50 %	0 %	298501555
57	NC_014251	TG	3	6	47049	47054	0 %	50 %	50 %	0 %	298501556
58	NC_014251	AC	3	6	47154	47159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014251	CT	3	6	47548	47553	0 %	50 %	0 %	50 %	298501557
60	NC_014251	TC	3	6	47717	47722	0 %	50 %	0 %	50 %	298501557
61	NC_014251	AG	3	6	48311	48316	50 %	0 %	50 %	0 %	298501558
62	NC_014251	CT	3	6	49679	49684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014251	TA	3	6	51436	51441	50 %	50 %	0 %	0 %	298501563
64	NC_014251	TA	4	8	51603	51610	50 %	50 %	0 %	0 %	298501563
65	NC_014251	CT	3	6	51793	51798	0 %	50 %	0 %	50 %	298501563
66	NC_014251	AG	3	6	51993	51998	50 %	0 %	50 %	0 %	298501564
67	NC_014251	AT	3	6	52258	52263	50 %	50 %	0 %	0 %	298501564
68	NC_014251	AG	3	6	52731	52736	50 %	0 %	50 %	0 %	298501564
69	NC_014251	TC	3	6	53206	53211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014251	CT	3	6	54753	54758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014251	TC	3	6	54842	54847	0 %	50 %	0 %	50 %	298501566
72	NC_014251	AC	4	8	55117	55124	50 %	0 %	0 %	50 %	298501566
73	NC_014251	GT	3	6	56431	56436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014251	AT	3	6	56631	56636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014251	TC	3	6	57505	57510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014251	AT	3	6	57524	57529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014251	TC	3	6	58320	58325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014251	AG	3	6	58527	58532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014251	TC	3	6	58643	58648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014251	TC	3	6	58939	58944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014251	CA	3	6	59090	59095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014251	GA	3	6	59479	59484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014251	CT	3	6	59971	59976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014251	TC	3	6	60440	60445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014251	GT	3	6	60718	60723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014251	GT	3	6	60887	60892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014251	AG	3	6	61377	61382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014251	AT	3	6	61408	61413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014251	TC	3	6	62253	62258	0 %	50 %	0 %	50 %	298501567
90	NC_014251	GA	3	6	63575	63580	50 %	0 %	50 %	0 %	298501569
91	NC_014251	GA	3	6	63836	63841	50 %	0 %	50 %	0 %	298501569
92	NC_014251	GC	3	6	64374	64379	0 %	0 %	50 %	50 %	298501569
93	NC_014251	AG	3	6	64557	64562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014251	TG	3	6	64821	64826	0 %	50 %	50 %	0 %	298501570
95	NC_014251	TC	3	6	66573	66578	0 %	50 %	0 %	50 %	298501572
96	NC_014251	CG	3	6	68433	68438	0 %	0 %	50 %	50 %	298501573
97	NC_014251	GC	3	6	69886	69891	0 %	0 %	50 %	50 %	298501575
98	NC_014251	AG	3	6	70443	70448	50 %	0 %	50 %	0 %	298501575
99	NC_014251	TG	3	6	71258	71263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014251	CT	3	6	71505	71510	0 %	50 %	0 %	50 %	298501576
101	NC_014251	AT	3	6	71769	71774	50 %	50 %	0 %	0 %	298501576
102	NC_014251	GA	3	6	71846	71851	50 %	0 %	50 %	0 %	298501576
103	NC_014251	AG	3	6	73289	73294	50 %	0 %	50 %	0 %	298501576
104	NC_014251	TC	3	6	73883	73888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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107	NC_014251	CT	3	6	75422	75427	0 %	50 %	0 %	50 %	298501578
108	NC_014251	CT	3	6	75622	75627	0 %	50 %	0 %	50 %	298501578
109	NC_014251	TC	3	6	76650	76655	0 %	50 %	0 %	50 %	298501579
110	NC_014251	AG	3	6	78170	78175	50 %	0 %	50 %	0 %	298501581
111	NC_014251	CT	3	6	78522	78527	0 %	50 %	0 %	50 %	298501582
112	NC_014251	CT	3	6	78730	78735	0 %	50 %	0 %	50 %	298501582
113	NC_014251	TC	3	6	80081	80086	0 %	50 %	0 %	50 %	298501583
114	NC_014251	CT	4	8	81738	81745	0 %	50 %	0 %	50 %	298501585
115	NC_014251	CT	3	6	82059	82064	0 %	50 %	0 %	50 %	298501585
116	NC_014251	CT	3	6	84671	84676	0 %	50 %	0 %	50 %	298501589
117	NC_014251	TA	3	6	84760	84765	50 %	50 %	0 %	0 %	298501589
118	NC_014251	AT	3	6	84809	84814	50 %	50 %	0 %	0 %	298501589
119	NC_014251	AC	3	6	85304	85309	50 %	0 %	0 %	50 %	298501590
120	NC_014251	AG	3	6	87479	87484	50 %	0 %	50 %	0 %	298501592
121	NC_014251	AG	3	6	88238	88243	50 %	0 %	50 %	0 %	298501593
122	NC_014251	GC	3	6	89198	89203	0 %	0 %	50 %	50 %	298501594
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124	NC_014251	GA	3	6	90646	90651	50 %	0 %	50 %	0 %	298501596
125	NC_014251	GA	4	8	90968	90975	50 %	0 %	50 %	0 %	298501596
126	NC_014251	TC	3	6	92888	92893	0 %	50 %	0 %	50 %	298501597
127	NC_014251	CT	3	6	93602	93607	0 %	50 %	0 %	50 %	298501597
128	NC_014251	AG	3	6	95502	95507	50 %	0 %	50 %	0 %	298501599
129	NC_014251	AT	3	6	96154	96159	50 %	50 %	0 %	0 %	298501599
130	NC_014251	CT	3	6	96738	96743	0 %	50 %	0 %	50 %	298501599
131	NC_014251	CT	3	6	96760	96765	0 %	50 %	0 %	50 %	298501599
132	NC_014251	CT	3	6	96922	96927	0 %	50 %	0 %	50 %	298501599
133	NC_014251	AT	3	6	97154	97159	50 %	50 %	0 %	0 %	298501599
134	NC_014251	CT	3	6	97234	97239	0 %	50 %	0 %	50 %	298501599
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136	NC_014251	CT	3	6	98632	98637	0 %	50 %	0 %	50 %	298501601
137	NC_014251	GA	3	6	99615	99620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014251	GT	3	6	99677	99682	0 %	50 %	50 %	0 %	298501604
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144	NC_014251	GT	3	6	104317	104322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014251	AT	3	6	104639	104644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014251	TC	3	6	105987	105992	0 %	50 %	0 %	50 %	298501608
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