MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014251	TCT	2	6	145994	145999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501652
3002	NC_014251	A	6	6	146017	146022	100 %	0 %	0 %	0 %	298501652
3003	NC_014251	TTG	2	6	146059	146064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501652
3004	NC_014251	CTT	2	6	146083	146088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501652
3005	NC_014251	TGA	2	6	146091	146096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501652
3006	NC_014251	ATG	2	6	146129	146134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501652
3007	NC_014251	AAC	2	6	146183	146188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501652
3008	NC_014251	GCT	2	6	146191	146196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501652
3009	NC_014251	A	6	6	146333	146338	100 %	0 %	0 %	0 %	298501652
3010	NC_014251	CAA	2	6	146474	146479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501652
3011	NC_014251	ACC	2	6	146561	146566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501652
3012	NC_014251	GAA	2	6	146605	146610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501652
3013	NC_014251	TTCT	2	8	146642	146649	0 %	75 %	0 %	25 %	298501652
3014	NC_014251	TC	3	6	146672	146677	0 %	50 %	0 %	50 %	298501652
3015	NC_014251	AAC	2	6	146770	146775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501652
3016	NC_014251	TTAC	2	8	146873	146880	25 %	50 %	0 %	25 %	298501652
3017	NC_014251	CTT	2	6	146929	146934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501652
3018	NC_014251	GGT	2	6	146977	146982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501652
3019	NC_014251	AGC	2	6	146994	146999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501652
3020	NC_014251	ACG	2	6	147017	147022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501652
3021	NC_014251	GTT	2	6	147058	147063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501652
3022	NC_014251	GAA	2	6	147097	147102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501652
3023	NC_014251	GTG	2	6	147152	147157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501652
3024	NC_014251	GAA	2	6	147190	147195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501652
3025	NC_014251	A	6	6	147233	147238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_014251	ATA	2	6	147251	147256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014251	CTT	2	6	147288	147293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501653
3028	NC_014251	A	6	6	147364	147369	100 %	0 %	0 %	0 %	298501653
3029	NC_014251	A	6	6	147422	147427	100 %	0 %	0 %	0 %	298501653
3030	NC_014251	TACTCG	2	12	147432	147443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298501653
3031	NC_014251	A	6	6	147520	147525	100 %	0 %	0 %	0 %	298501653
3032	NC_014251	GAA	2	6	147607	147612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501653
3033	NC_014251	ACT	2	6	147686	147691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501653
3034	NC_014251	AAC	2	6	147757	147762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501653
3035	NC_014251	TCT	2	6	147815	147820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501653
3036	NC_014251	AAAG	2	8	147877	147884	75 %	0 %	25 %	0 %	298501653
3037	NC_014251	TCA	2	6	147899	147904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501653
3038	NC_014251	TGA	2	6	147915	147920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501653
3039	NC_014251	GAA	2	6	147973	147978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501653
3040	NC_014251	CTT	2	6	148003	148008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501653
3041	NC_014251	A	6	6	148039	148044	100 %	0 %	0 %	0 %	298501653
3042	NC_014251	AGA	2	6	148140	148145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501653
3043	NC_014251	GCA	2	6	148172	148177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501653
3044	NC_014251	ATA	2	6	148282	148287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_014251	TAT	2	6	148360	148365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_014251	GTA	2	6	148458	148463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501654
3047	NC_014251	GGA	2	6	148470	148475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501654
3048	NC_014251	TTCT	2	8	148483	148490	0 %	75 %	0 %	25 %	298501654
3049	NC_014251	CAA	2	6	148512	148517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501654
3050	NC_014251	GAT	2	6	148569	148574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501654
3051	NC_014251	TCAC	2	8	148582	148589	25 %	25 %	0 %	50 %	298501654
3052	NC_014251	CT	3	6	148732	148737	0 %	50 %	0 %	50 %	298501654
3053	NC_014251	A	7	7	148753	148759	100 %	0 %	0 %	0 %	298501654
3054	NC_014251	TGT	2	6	148769	148774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501654
3055	NC_014251	AGA	3	9	148847	148855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501654
3056	NC_014251	A	6	6	148873	148878	100 %	0 %	0 %	0 %	298501654
3057	NC_014251	TGGC	2	8	148910	148917	0 %	25 %	50 %	25 %	298501654
3058	NC_014251	AAT	2	6	148983	148988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501654
3059	NC_014251	GTC	2	6	148995	149000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501654
3060	NC_014251	GGT	2	6	149010	149015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501654
3061	NC_014251	CGT	2	6	149027	149032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501654
3062	NC_014251	ACA	2	6	149167	149172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501654
3063	NC_014251	GAA	2	6	149217	149222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501654
3064	NC_014251	AGC	2	6	149273	149278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501654
3065	NC_014251	GTC	2	6	149296	149301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501654
3066	NC_014251	TTA	2	6	149317	149322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501654
3067	NC_014251	TTGA	2	8	149346	149353	25 %	50 %	25 %	0 %	298501654
3068	NC_014251	ATT	2	6	149370	149375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501654
3069	NC_014251	GTT	2	6	149388	149393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_014251	TAA	2	6	149398	149403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014251	ATT	2	6	149443	149448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_014251	T	6	6	149484	149489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_014251	TTTA	2	8	149540	149547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_014251	AGT	2	6	149552	149557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_014251	T	6	6	149561	149566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014251	AGG	2	6	149584	149589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_014251	A	6	6	149613	149618	100 %	0 %	0 %	0 %	298501655
3078	NC_014251	TAT	2	6	149647	149652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501655
3079	NC_014251	TAT	2	6	149666	149671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501655
3080	NC_014251	CTT	2	6	149849	149854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501655
3081	NC_014251	G	6	6	149868	149873	0 %	0 %	100 %	0 %	298501655
3082	NC_014251	CAA	2	6	149888	149893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501655
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3085	NC_014251	TTTG	2	8	149978	149985	0 %	75 %	25 %	0 %	298501655
3086	NC_014251	GGT	2	6	149991	149996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501655
3087	NC_014251	TATGG	2	10	150003	150012	20 %	40 %	40 %	0 %	298501655
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3089	NC_014251	ATG	2	6	150054	150059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501655
3090	NC_014251	ATT	2	6	150093	150098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501655
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3092	NC_014251	GTTT	2	8	150245	150252	0 %	75 %	25 %	0 %	298501655
3093	NC_014251	AGA	2	6	150314	150319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501655
3094	NC_014251	AGA	2	6	150338	150343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501655
3095	NC_014251	AGC	2	6	150369	150374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501655
3096	NC_014251	TCT	2	6	150391	150396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501655
3097	NC_014251	TGA	2	6	150467	150472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501655
3098	NC_014251	TTAT	2	8	150601	150608	25 %	75 %	0 %	0 %	298501655
3099	NC_014251	AGA	2	6	150617	150622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501655
3100	NC_014251	CTTC	2	8	150634	150641	0 %	50 %	0 %	50 %	298501655
3101	NC_014251	TGC	2	6	150650	150655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501655
3102	NC_014251	ACG	2	6	150715	150720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501655
3103	NC_014251	AAG	2	6	150754	150759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501655
3104	NC_014251	TCT	2	6	150805	150810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501655
3105	NC_014251	GTCC	2	8	150900	150907	0 %	25 %	25 %	50 %	298501655
3106	NC_014251	TGG	2	6	151020	151025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501655
3107	NC_014251	TAT	2	6	151052	151057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501655
3108	NC_014251	CTT	2	6	151074	151079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501655
3109	NC_014251	CCTT	2	8	151090	151097	0 %	50 %	0 %	50 %	298501655
3110	NC_014251	AGTG	2	8	151113	151120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014251	A	6	6	151264	151269	100 %	0 %	0 %	0 %	298501656
3112	NC_014251	TTA	2	6	151322	151327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501656
3113	NC_014251	TGT	2	6	151385	151390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501656
3114	NC_014251	TGA	2	6	151400	151405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501656
3115	NC_014251	GTG	2	6	151465	151470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501656
3116	NC_014251	GAT	2	6	151476	151481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501656
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3118	NC_014251	CT	3	6	151501	151506	0 %	50 %	0 %	50 %	298501656
3119	NC_014251	GAA	2	6	151620	151625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501656
3120	NC_014251	GGATC	2	10	151713	151722	20 %	20 %	40 %	20 %	298501656
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3122	NC_014251	AAG	2	6	151816	151821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501656
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3124	NC_014251	ATCA	2	8	152070	152077	50 %	25 %	0 %	25 %	298501656
3125	NC_014251	GAA	2	6	152130	152135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501656
3126	NC_014251	TAG	2	6	152137	152142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501656
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3129	NC_014251	AATG	2	8	152385	152392	50 %	25 %	25 %	0 %	298501656
3130	NC_014251	AGA	2	6	152402	152407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501656
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3132	NC_014251	TAT	2	6	152553	152558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501657
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3134	NC_014251	CTT	2	6	152939	152944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501658
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3136	NC_014251	T	6	6	153047	153052	0 %	100 %	0 %	0 %	298501658
3137	NC_014251	AT	3	6	153058	153063	50 %	50 %	0 %	0 %	298501658
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3145	NC_014251	AAT	2	6	153510	153515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_014251	T	6	6	153539	153544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_014251	TAA	2	6	153553	153558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3224	NC_014251	TAC	2	6	157920	157925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3244	NC_014251	TGA	2	6	158526	158531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501664
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3248	NC_014251	TTA	2	6	158698	158703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501664
3249	NC_014251	AGC	2	6	158718	158723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501664
3250	NC_014251	ACT	2	6	158773	158778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501664
3251	NC_014251	TCT	2	6	158782	158787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501664
3252	NC_014251	CACTC	2	10	158865	158874	20 %	20 %	0 %	60 %	298501664
3253	NC_014251	ATT	2	6	158946	158951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501664
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3270	NC_014251	TAT	2	6	159674	159679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501664
3271	NC_014251	TAT	2	6	159731	159736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501664
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3280	NC_014251	TCA	2	6	160196	160201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501664
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3283	NC_014251	CAT	2	6	160379	160384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501664
3284	NC_014251	TCAT	2	8	160459	160466	25 %	50 %	0 %	25 %	298501664
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3286	NC_014251	AC	3	6	160610	160615	50 %	0 %	0 %	50 %	298501664
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3291	NC_014251	TTG	2	6	160775	160780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501664
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3300	NC_014251	AT	3	6	161142	161147	50 %	50 %	0 %	0 %	298501665
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3303	NC_014251	TCC	2	6	161235	161240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501665
3304	NC_014251	ATG	2	6	161313	161318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501665
3305	NC_014251	TAA	2	6	161328	161333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501665
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3308	NC_014251	ATT	2	6	161415	161420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501665
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3315	NC_014251	TAC	2	6	161750	161755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501665
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3318	NC_014251	CAATGC	2	12	161834	161845	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298501665
3319	NC_014251	GAT	2	6	161887	161892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501665
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3321	NC_014251	ATTT	2	8	161930	161937	25 %	75 %	0 %	0 %	298501665
3322	NC_014251	TCA	2	6	161960	161965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501665
3323	NC_014251	AAAT	2	8	161982	161989	75 %	25 %	0 %	0 %	298501665
3324	NC_014251	AAAGA	2	10	161997	162006	80 %	0 %	20 %	0 %	298501665
3325	NC_014251	CTT	2	6	162011	162016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501665
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3330	NC_014251	TATTAA	2	12	162314	162325	50 %	50 %	0 %	0 %	298501665
3331	NC_014251	TCA	2	6	162358	162363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501665
3332	NC_014251	AGT	2	6	162455	162460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501665
3333	NC_014251	AAG	2	6	162483	162488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501665
3334	NC_014251	T	7	7	162564	162570	0 %	100 %	0 %	0 %	298501665
3335	NC_014251	TAC	2	6	162602	162607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501665
3336	NC_014251	GAAGA	2	10	162620	162629	60 %	0 %	40 %	0 %	298501665
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3339	NC_014251	ACTT	2	8	162720	162727	25 %	50 %	0 %	25 %	298501665
3340	NC_014251	TAC	2	6	162753	162758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501665
3341	NC_014251	CAG	2	6	162785	162790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501665
3342	NC_014251	TGA	2	6	162891	162896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501665
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3344	NC_014251	ACA	2	6	162982	162987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501665
3345	NC_014251	CT	3	6	163014	163019	0 %	50 %	0 %	50 %	298501665
3346	NC_014251	TTC	2	6	163134	163139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501665
3347	NC_014251	T	7	7	163178	163184	0 %	100 %	0 %	0 %	298501665
3348	NC_014251	ATT	2	6	163206	163211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501665
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3350	NC_014251	CT	3	6	163372	163377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3351	NC_014251	ACC	2	6	163404	163409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3352	NC_014251	CTA	2	6	163420	163425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501666
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3354	NC_014251	TAAT	2	8	163506	163513	50 %	50 %	0 %	0 %	298501666
3355	NC_014251	TAA	2	6	163522	163527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501666
3356	NC_014251	AATT	2	8	163555	163562	50 %	50 %	0 %	0 %	298501666
3357	NC_014251	ACCA	2	8	163627	163634	50 %	0 %	0 %	50 %	298501666
3358	NC_014251	ACC	2	6	163648	163653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501666
3359	NC_014251	TAT	2	6	163713	163718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501666
3360	NC_014251	TAA	2	6	163785	163790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501666
3361	NC_014251	CCG	2	6	163829	163834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501666
3362	NC_014251	CCAG	2	8	163907	163914	25 %	0 %	25 %	50 %	298501666
3363	NC_014251	CTT	2	6	163968	163973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501666
3364	NC_014251	TTC	2	6	163975	163980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501666
3365	NC_014251	TGA	2	6	164021	164026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501666
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3367	NC_014251	GAA	2	6	164103	164108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501666
3368	NC_014251	TA	3	6	164112	164117	50 %	50 %	0 %	0 %	298501666
3369	NC_014251	TC	3	6	164137	164142	0 %	50 %	0 %	50 %	298501666
3370	NC_014251	GAA	2	6	164153	164158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501666
3371	NC_014251	CATA	2	8	164160	164167	50 %	25 %	0 %	25 %	298501666
3372	NC_014251	T	6	6	164185	164190	0 %	100 %	0 %	0 %	298501666
3373	NC_014251	TAT	2	6	164211	164216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501666
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3385	NC_014251	AAT	2	6	164576	164581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501667
3386	NC_014251	AAT	2	6	164600	164605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501667
3387	NC_014251	CAT	2	6	164618	164623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501667
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3393	NC_014251	ATAA	2	8	164917	164924	75 %	25 %	0 %	0 %	298501667
3394	NC_014251	AAT	2	6	164949	164954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501667
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3474	NC_014251	AAT	2	6	168590	168595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3475	NC_014251	AAT	2	6	168624	168629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3476	NC_014251	TCC	2	6	168636	168641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3477	NC_014251	AGG	2	6	168676	168681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3479	NC_014251	A	7	7	168735	168741	100 %	0 %	0 %	0 %	298501673
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3482	NC_014251	TCA	2	6	168887	168892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501673
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3484	NC_014251	TATC	2	8	168971	168978	25 %	50 %	0 %	25 %	298501673
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3490	NC_014251	A	6	6	169268	169273	100 %	0 %	0 %	0 %	298501673
3491	NC_014251	ATT	2	6	169278	169283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501673
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3493	NC_014251	T	6	6	169341	169346	0 %	100 %	0 %	0 %	298501673
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3496	NC_014251	TGA	2	6	169512	169517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3498	NC_014251	TGA	2	6	169557	169562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_014251	AGTC	2	8	169563	169570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3500	NC_014251	AT	3	6	169573	169578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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