MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014251	TTC	3	9	120876	120884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501630
2502	NC_014251	CCA	2	6	120961	120966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501630
2503	NC_014251	CAA	3	9	120992	121000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501630
2504	NC_014251	ACC	2	6	121011	121016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501630
2505	NC_014251	CGTC	3	12	121024	121035	0 %	25 %	25 %	50 %	298501630
2506	NC_014251	CAA	2	6	121067	121072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501630
2507	NC_014251	GAA	2	6	121078	121083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501630
2508	NC_014251	ACC	2	6	121110	121115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501630
2509	NC_014251	CAA	2	6	121124	121129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501630
2510	NC_014251	AAC	2	6	121134	121139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501630
2511	NC_014251	TCT	3	9	121189	121197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501630
2512	NC_014251	GAC	2	6	121226	121231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501630
2513	NC_014251	GAT	2	6	121290	121295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501630
2514	NC_014251	CAA	2	6	121437	121442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501630
2515	NC_014251	ACC	2	6	121464	121469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501630
2516	NC_014251	ACC	2	6	121623	121628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501630
2517	NC_014251	AAC	2	6	121713	121718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501630
2518	NC_014251	CTG	2	6	121727	121732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501630
2519	NC_014251	TCT	2	6	121741	121746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501630
2520	NC_014251	ACC	2	6	121842	121847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501630
2521	NC_014251	ACC	2	6	121851	121856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501630
2522	NC_014251	GGCA	2	8	121865	121872	25 %	0 %	50 %	25 %	298501630
2523	NC_014251	TGTCA	2	10	121902	121911	20 %	40 %	20 %	20 %	298501630
2524	NC_014251	CCA	2	6	121993	121998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501630
2525	NC_014251	TAGCAA	2	12	122027	122038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298501630
2526	NC_014251	CGA	2	6	122078	122083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501630
2527	NC_014251	GCC	2	6	122110	122115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501630
2528	NC_014251	GAT	2	6	122130	122135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501630
2529	NC_014251	AG	3	6	122149	122154	50 %	0 %	50 %	0 %	298501630
2530	NC_014251	CTT	2	6	122243	122248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501630
2531	NC_014251	TCCC	2	8	122443	122450	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2532	NC_014251	TAT	2	6	122465	122470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_014251	ACA	2	6	122555	122560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_014251	TGA	2	6	122581	122586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_014251	T	7	7	122610	122616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_014251	GTAAT	2	10	122624	122633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_014251	ATCT	2	8	122669	122676	25 %	50 %	0 %	25 %	298501631
2538	NC_014251	AAG	2	6	122737	122742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501631
2539	NC_014251	TCTT	2	8	122770	122777	0 %	75 %	0 %	25 %	298501631
2540	NC_014251	CAT	2	6	122808	122813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501631
2541	NC_014251	AAT	2	6	122819	122824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501631
2542	NC_014251	TAAA	2	8	122931	122938	75 %	25 %	0 %	0 %	298501631
2543	NC_014251	TCT	2	6	123071	123076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501631
2544	NC_014251	AT	3	6	123119	123124	50 %	50 %	0 %	0 %	298501631
2545	NC_014251	ATC	2	6	123175	123180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501631
2546	NC_014251	TTC	2	6	123229	123234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501631
2547	NC_014251	CATT	2	8	123255	123262	25 %	50 %	0 %	25 %	298501631
2548	NC_014251	AAAT	2	8	123324	123331	75 %	25 %	0 %	0 %	298501631
2549	NC_014251	GAA	2	6	123353	123358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501631
2550	NC_014251	CTG	2	6	123408	123413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501631
2551	NC_014251	ACT	2	6	123521	123526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501631
2552	NC_014251	AGA	2	6	123532	123537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501631
2553	NC_014251	TA	3	6	123567	123572	50 %	50 %	0 %	0 %	298501631
2554	NC_014251	TCA	2	6	123597	123602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501631
2555	NC_014251	TCC	2	6	123610	123615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501632
2556	NC_014251	GAT	3	9	123680	123688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501632
2557	NC_014251	ATTTC	2	10	123692	123701	20 %	60 %	0 %	20 %	298501632
2558	NC_014251	TGA	2	6	123756	123761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501632
2559	NC_014251	ATT	2	6	123762	123767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501632
2560	NC_014251	T	6	6	123909	123914	0 %	100 %	0 %	0 %	298501632
2561	NC_014251	ATC	2	6	123918	123923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501632
2562	NC_014251	TGA	2	6	123952	123957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501632
2563	NC_014251	CAA	2	6	124010	124015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501632
2564	NC_014251	TCC	2	6	124233	124238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501632
2565	NC_014251	ATA	2	6	124250	124255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501632
2566	NC_014251	AAT	2	6	124259	124264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501632
2567	NC_014251	TGC	2	6	124275	124280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501632
2568	NC_014251	ATT	2	6	124303	124308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501632
2569	NC_014251	AGAC	2	8	124341	124348	50 %	0 %	25 %	25 %	298501632
2570	NC_014251	TCC	2	6	124350	124355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501632
2571	NC_014251	GAT	2	6	124373	124378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501632
2572	NC_014251	TCT	2	6	124432	124437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501632
2573	NC_014251	ATC	2	6	124453	124458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501632
2574	NC_014251	TCC	2	6	124465	124470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501633
2575	NC_014251	TAA	2	6	124487	124492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501633
2576	NC_014251	AAT	2	6	124578	124583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501633
2577	NC_014251	TCC	2	6	124635	124640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501633
2578	NC_014251	GAA	2	6	124664	124669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501633
2579	NC_014251	ACC	2	6	124719	124724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501633
2580	NC_014251	AGA	2	6	124760	124765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501633
2581	NC_014251	AAC	2	6	124791	124796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501633
2582	NC_014251	TACT	2	8	124823	124830	25 %	50 %	0 %	25 %	298501633
2583	NC_014251	ACC	2	6	124833	124838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501633
2584	NC_014251	CTG	2	6	125009	125014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501633
2585	NC_014251	ACT	2	6	125061	125066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501633
2586	NC_014251	TA	3	6	125079	125084	50 %	50 %	0 %	0 %	298501633
2587	NC_014251	AAT	2	6	125109	125114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501633
2588	NC_014251	A	6	6	125161	125166	100 %	0 %	0 %	0 %	298501633
2589	NC_014251	TTGATT	2	12	125198	125209	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298501633
2590	NC_014251	AT	3	6	125305	125310	50 %	50 %	0 %	0 %	298501633
2591	NC_014251	ATA	3	9	125338	125346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501633
2592	NC_014251	TCC	2	6	125358	125363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501633
2593	NC_014251	AT	3	6	125428	125433	50 %	50 %	0 %	0 %	298501633
2594	NC_014251	GTG	2	6	125439	125444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501633
2595	NC_014251	AT	3	6	125458	125463	50 %	50 %	0 %	0 %	298501633
2596	NC_014251	TGT	2	6	125541	125546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501633
2597	NC_014251	AGCTAC	2	12	125550	125561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298501633
2598	NC_014251	ATT	2	6	125571	125576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501633
2599	NC_014251	CAC	2	6	125654	125659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501633
2600	NC_014251	CAA	2	6	125678	125683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501633
2601	NC_014251	TAA	2	6	125702	125707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501633
2602	NC_014251	TCT	3	9	125720	125728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501633
2603	NC_014251	GAA	2	6	125729	125734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501633
2604	NC_014251	CTA	2	6	125759	125764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501633
2605	NC_014251	TCA	2	6	125801	125806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501633
2606	NC_014251	CCT	2	6	125816	125821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501634
2607	NC_014251	TTC	2	6	125835	125840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501634
2608	NC_014251	TAAT	2	8	125852	125859	50 %	50 %	0 %	0 %	298501634
2609	NC_014251	AAT	2	6	125880	125885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501634
2610	NC_014251	CAA	2	6	125942	125947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501634
2611	NC_014251	TCC	2	6	126112	126117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501635
2612	NC_014251	TCA	2	6	126139	126144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501635
2613	NC_014251	T	6	6	126148	126153	0 %	100 %	0 %	0 %	298501635
2614	NC_014251	TTG	2	6	126194	126199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501635
2615	NC_014251	CAA	2	6	126255	126260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501635
2616	NC_014251	AATA	2	8	126286	126293	75 %	25 %	0 %	0 %	298501635
2617	NC_014251	TTC	2	6	126300	126305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501635
2618	NC_014251	TTCA	2	8	126330	126337	25 %	50 %	0 %	25 %	298501635
2619	NC_014251	TCCCT	2	10	126372	126381	0 %	40 %	0 %	60 %	298501635
2620	NC_014251	TAA	2	6	126386	126391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501635
2621	NC_014251	TTATC	2	10	126443	126452	20 %	60 %	0 %	20 %	298501635
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2623	NC_014251	CCT	2	6	126488	126493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501635
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2999	NC_014251	ACAT	2	8	145912	145919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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