MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014251	CTT	2	6	47958	47963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501557
1002	NC_014251	T	6	6	48105	48110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014251	TGC	2	6	48177	48182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501558
1004	NC_014251	AGT	2	6	48222	48227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501558
1005	NC_014251	CAC	2	6	48237	48242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501558
1006	NC_014251	CAT	2	6	48249	48254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501558
1007	NC_014251	TTTCT	2	10	48294	48303	0 %	80 %	0 %	20 %	298501558
1008	NC_014251	AG	3	6	48311	48316	50 %	0 %	50 %	0 %	298501558
1009	NC_014251	T	7	7	48384	48390	0 %	100 %	0 %	0 %	298501558
1010	NC_014251	ACT	2	6	48420	48425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501558
1011	NC_014251	TTC	2	6	48542	48547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501558
1012	NC_014251	TCT	2	6	48598	48603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501558
1013	NC_014251	CTC	2	6	48765	48770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_014251	T	6	6	48790	48795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014251	T	7	7	48934	48940	0 %	100 %	0 %	0 %	298501559
1016	NC_014251	GCA	2	6	48966	48971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501559
1017	NC_014251	AAAT	2	8	49020	49027	75 %	25 %	0 %	0 %	298501559
1018	NC_014251	TTC	2	6	49109	49114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501559
1019	NC_014251	A	6	6	49174	49179	100 %	0 %	0 %	0 %	298501559
1020	NC_014251	GTT	2	6	49206	49211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501559
1021	NC_014251	TAA	2	6	49222	49227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501559
1022	NC_014251	ATTT	2	8	49277	49284	25 %	75 %	0 %	0 %	298501560
1023	NC_014251	GTTCT	2	10	49298	49307	0 %	60 %	20 %	20 %	298501560
1024	NC_014251	CAC	2	6	49371	49376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501560
1025	NC_014251	CCA	2	6	49448	49453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501560
1026	NC_014251	AGC	2	6	49491	49496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501560
1027	NC_014251	T	6	6	49598	49603	0 %	100 %	0 %	0 %	298501560
1028	NC_014251	CT	3	6	49679	49684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_014251	TAAT	2	8	49710	49717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014251	GAT	2	6	49768	49773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501561
1031	NC_014251	A	6	6	49919	49924	100 %	0 %	0 %	0 %	298501561
1032	NC_014251	ATG	2	6	49973	49978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014251	CATT	2	8	49998	50005	25 %	50 %	0 %	25 %	298501562
1034	NC_014251	ACGTGA	2	12	50009	50020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298501562
1035	NC_014251	GTT	2	6	50112	50117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501562
1036	NC_014251	GAT	2	6	50122	50127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501562
1037	NC_014251	TCT	2	6	50297	50302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501562
1038	NC_014251	GTT	2	6	50393	50398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501562
1039	NC_014251	ATT	2	6	50402	50407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501562
1040	NC_014251	TCT	2	6	50414	50419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501562
1041	NC_014251	CTG	3	9	50436	50444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501562
1042	NC_014251	TGA	2	6	50455	50460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501562
1043	NC_014251	CTT	2	6	50466	50471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501562
1044	NC_014251	TTG	2	6	50484	50489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501562
1045	NC_014251	CTG	2	6	50502	50507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501562
1046	NC_014251	GCTT	2	8	50521	50528	0 %	50 %	25 %	25 %	298501562
1047	NC_014251	GAG	2	6	50562	50567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501562
1048	NC_014251	CTT	2	6	50568	50573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501562
1049	NC_014251	ACTGC	2	10	50579	50588	20 %	20 %	20 %	40 %	298501562
1050	NC_014251	CTC	2	6	50605	50610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501562
1051	NC_014251	CTT	2	6	50640	50645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501562
1052	NC_014251	CTT	2	6	50688	50693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501562
1053	NC_014251	ATC	2	6	50743	50748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501562
1054	NC_014251	CTG	2	6	50775	50780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501562
1055	NC_014251	CTT	2	6	50793	50798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501562
1056	NC_014251	CTT	2	6	50841	50846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501562
1057	NC_014251	TTGTT	2	10	50994	51003	0 %	80 %	20 %	0 %	298501562
1058	NC_014251	CTT	2	6	51060	51065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501562
1059	NC_014251	TAA	2	6	51115	51120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501562
1060	NC_014251	TTCTT	2	10	51123	51132	0 %	80 %	0 %	20 %	298501562
1061	NC_014251	A	6	6	51179	51184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014251	A	7	7	51190	51196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014251	TA	3	6	51436	51441	50 %	50 %	0 %	0 %	298501563
1064	NC_014251	TAT	2	6	51447	51452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501563
1065	NC_014251	GTT	2	6	51586	51591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501563
1066	NC_014251	TA	4	8	51603	51610	50 %	50 %	0 %	0 %	298501563
1067	NC_014251	CTG	2	6	51613	51618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501563
1068	NC_014251	TTC	2	6	51683	51688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501563
1069	NC_014251	GCAC	2	8	51704	51711	25 %	0 %	25 %	50 %	298501563
1070	NC_014251	TCT	2	6	51743	51748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501563
1071	NC_014251	CT	3	6	51793	51798	0 %	50 %	0 %	50 %	298501563
1072	NC_014251	T	6	6	51912	51917	0 %	100 %	0 %	0 %	298501563
1073	NC_014251	AG	3	6	51993	51998	50 %	0 %	50 %	0 %	298501564
1074	NC_014251	CCAA	2	8	52024	52031	50 %	0 %	0 %	50 %	298501564
1075	NC_014251	CAG	2	6	52042	52047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501564
1076	NC_014251	GTC	2	6	52154	52159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501564
1077	NC_014251	AGT	2	6	52172	52177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501564
1078	NC_014251	AT	3	6	52258	52263	50 %	50 %	0 %	0 %	298501564
1079	NC_014251	GTTT	2	8	52307	52314	0 %	75 %	25 %	0 %	298501564
1080	NC_014251	ATC	2	6	52339	52344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501564
1081	NC_014251	AGGC	2	8	52395	52402	25 %	0 %	50 %	25 %	298501564
1082	NC_014251	TCA	2	6	52503	52508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501564
1083	NC_014251	GCT	2	6	52523	52528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501564
1084	NC_014251	ACCA	2	8	52615	52622	50 %	0 %	0 %	50 %	298501564
1085	NC_014251	A	6	6	52692	52697	100 %	0 %	0 %	0 %	298501564
1086	NC_014251	A	6	6	52718	52723	100 %	0 %	0 %	0 %	298501564
1087	NC_014251	AG	3	6	52731	52736	50 %	0 %	50 %	0 %	298501564
1088	NC_014251	AGAT	2	8	52819	52826	50 %	25 %	25 %	0 %	298501564
1089	NC_014251	CCA	2	6	52832	52837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501564
1090	NC_014251	ATC	2	6	52874	52879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501564
1091	NC_014251	AGC	2	6	53014	53019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501564
1092	NC_014251	ATA	2	6	53054	53059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501564
1093	NC_014251	CCA	2	6	53121	53126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501564
1094	NC_014251	GCAAT	2	10	53166	53175	40 %	20 %	20 %	20 %	298501564
1095	NC_014251	TC	3	6	53206	53211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_014251	TGA	2	6	53216	53221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014251	GCT	2	6	53291	53296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1098	NC_014251	CAG	2	6	53304	53309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1099	NC_014251	TGT	2	6	53317	53322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501565
1100	NC_014251	CTG	2	6	53358	53363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1101	NC_014251	ACT	2	6	53453	53458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501565
1102	NC_014251	T	6	6	53527	53532	0 %	100 %	0 %	0 %	298501565
1103	NC_014251	CTG	2	6	53538	53543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1104	NC_014251	CTG	2	6	53604	53609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1105	NC_014251	TTC	2	6	53614	53619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501565
1106	NC_014251	ATT	2	6	53731	53736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501565
1107	NC_014251	GTT	2	6	53801	53806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501565
1108	NC_014251	GAA	2	6	53845	53850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501565
1109	NC_014251	TTG	2	6	53864	53869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501565
1110	NC_014251	TTTG	2	8	53910	53917	0 %	75 %	25 %	0 %	298501565
1111	NC_014251	ATA	2	6	54028	54033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501565
1112	NC_014251	GAC	2	6	54051	54056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1113	NC_014251	TGA	2	6	54076	54081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501565
1114	NC_014251	TTG	2	6	54092	54097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501565
1115	NC_014251	CGT	2	6	54123	54128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1116	NC_014251	TTTG	2	8	54146	54153	0 %	75 %	25 %	0 %	298501565
1117	NC_014251	AGC	2	6	54301	54306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1118	NC_014251	AGC	2	6	54370	54375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1119	NC_014251	GTC	2	6	54377	54382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501565
1120	NC_014251	TTG	2	6	54518	54523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501565
1121	NC_014251	AGT	2	6	54528	54533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501565
1122	NC_014251	CTC	2	6	54538	54543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501565
1123	NC_014251	AAG	2	6	54597	54602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501565
1124	NC_014251	AAAC	2	8	54655	54662	75 %	0 %	0 %	25 %	298501565
1125	NC_014251	CCGT	2	8	54665	54672	0 %	25 %	25 %	50 %	298501565
1126	NC_014251	TTG	2	6	54713	54718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501565
1127	NC_014251	TTGA	2	8	54729	54736	25 %	50 %	25 %	0 %	298501565
1128	NC_014251	CT	3	6	54753	54758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1265	NC_014251	CAGG	2	8	61986	61993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1266	NC_014251	AAGC	2	8	62034	62041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1267	NC_014251	TCC	2	6	62042	62047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1268	NC_014251	CGC	2	6	62077	62082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1269	NC_014251	T	6	6	62163	62168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_014251	TAC	2	6	62179	62184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501567
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1273	NC_014251	T	6	6	62307	62312	0 %	100 %	0 %	0 %	298501567
1274	NC_014251	T	6	6	62327	62332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_014251	T	7	7	62337	62343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_014251	CCG	2	6	62401	62406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1277	NC_014251	GTT	2	6	62447	62452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1278	NC_014251	TAT	2	6	62468	62473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1279	NC_014251	ACT	2	6	62496	62501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1280	NC_014251	T	8	8	62510	62517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1281	NC_014251	T	6	6	62519	62524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_014251	TTC	2	6	62591	62596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501568
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1308	NC_014251	GA	3	6	63836	63841	50 %	0 %	50 %	0 %	298501569
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1380	NC_014251	T	6	6	66897	66902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1381	NC_014251	CTT	2	6	66935	66940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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