MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014251	ATGG	2	8	23598	23605	25 %	25 %	50 %	0 %	298501528
502	NC_014251	TAG	2	6	23658	23663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501528
503	NC_014251	GAA	2	6	23736	23741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501528
504	NC_014251	TACC	2	8	23769	23776	25 %	25 %	0 %	50 %	298501528
505	NC_014251	TTC	2	6	23923	23928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501528
506	NC_014251	AGCCA	2	10	23938	23947	40 %	0 %	20 %	40 %	298501528
507	NC_014251	TCA	2	6	23966	23971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501528
508	NC_014251	CAAG	2	8	23995	24002	50 %	0 %	25 %	25 %	298501528
509	NC_014251	AAC	2	6	24067	24072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501528
510	NC_014251	GAT	2	6	24073	24078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501528
511	NC_014251	C	6	6	24093	24098	0 %	0 %	0 %	100 %	298501528
512	NC_014251	TTG	2	6	24161	24166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501528
513	NC_014251	TGC	2	6	24172	24177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501528
514	NC_014251	T	6	6	24346	24351	0 %	100 %	0 %	0 %	298501528
515	NC_014251	CCA	2	6	24436	24441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501528
516	NC_014251	CTT	3	9	24468	24476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501528
517	NC_014251	TTC	2	6	24481	24486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501528
518	NC_014251	CT	3	6	24532	24537	0 %	50 %	0 %	50 %	298501528
519	NC_014251	CCT	2	6	24568	24573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_014251	ACC	2	6	24606	24611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_014251	A	6	6	24624	24629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014251	TCA	2	6	24655	24660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_014251	A	6	6	24686	24691	100 %	0 %	0 %	0 %	298501529
524	NC_014251	ACT	2	6	24698	24703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501529
525	NC_014251	CTT	2	6	24732	24737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501529
526	NC_014251	TTA	2	6	24815	24820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501529
527	NC_014251	AT	3	6	24825	24830	50 %	50 %	0 %	0 %	298501529
528	NC_014251	TCT	2	6	24863	24868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501529
529	NC_014251	AGGAT	2	10	24875	24884	40 %	20 %	40 %	0 %	298501529
530	NC_014251	ATC	2	6	24916	24921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501529
531	NC_014251	TAG	2	6	24924	24929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501529
532	NC_014251	TGT	2	6	24979	24984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501529
533	NC_014251	TCA	2	6	25061	25066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501529
534	NC_014251	T	6	6	25081	25086	0 %	100 %	0 %	0 %	298501529
535	NC_014251	T	7	7	25091	25097	0 %	100 %	0 %	0 %	298501529
536	NC_014251	TCC	2	6	25123	25128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501529
537	NC_014251	ATC	2	6	25153	25158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501529
538	NC_014251	AAT	2	6	25220	25225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501529
539	NC_014251	TTTGT	2	10	25245	25254	0 %	80 %	20 %	0 %	298501529
540	NC_014251	A	6	6	25269	25274	100 %	0 %	0 %	0 %	298501529
541	NC_014251	ATC	2	6	25313	25318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501529
542	NC_014251	ATC	2	6	25333	25338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501529
543	NC_014251	TTC	2	6	25387	25392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501529
544	NC_014251	ATC	2	6	25417	25422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501529
545	NC_014251	AGGAG	2	10	25455	25464	40 %	0 %	60 %	0 %	298501529
546	NC_014251	AAC	2	6	25520	25525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501529
547	NC_014251	TTCT	2	8	25582	25589	0 %	75 %	0 %	25 %	298501529
548	NC_014251	TCTT	2	8	25603	25610	0 %	75 %	0 %	25 %	298501529
549	NC_014251	ATG	2	6	25678	25683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501529
550	NC_014251	TTC	2	6	25691	25696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501529
551	NC_014251	A	6	6	25732	25737	100 %	0 %	0 %	0 %	298501529
552	NC_014251	TCA	2	6	25766	25771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501529
553	NC_014251	CT	3	6	25778	25783	0 %	50 %	0 %	50 %	298501529
554	NC_014251	ATCTT	2	10	25787	25796	20 %	60 %	0 %	20 %	298501529
555	NC_014251	TTC	2	6	25822	25827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501529
556	NC_014251	TTA	2	6	25868	25873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501529
557	NC_014251	GGT	2	6	25890	25895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501529
558	NC_014251	AGTT	2	8	25942	25949	25 %	50 %	25 %	0 %	298501529
559	NC_014251	ATA	2	6	26052	26057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501529
560	NC_014251	ATC	2	6	26063	26068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501529
561	NC_014251	ATA	2	6	26115	26120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501529
562	NC_014251	ACA	2	6	26125	26130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501529
563	NC_014251	TC	3	6	26135	26140	0 %	50 %	0 %	50 %	298501529
564	NC_014251	ATG	2	6	26180	26185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501529
565	NC_014251	AGC	2	6	26206	26211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501529
566	NC_014251	ATA	2	6	26230	26235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501529
567	NC_014251	CTT	2	6	26243	26248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501529
568	NC_014251	A	6	6	26350	26355	100 %	0 %	0 %	0 %	298501530
569	NC_014251	AT	7	14	26400	26413	50 %	50 %	0 %	0 %	298501530
570	NC_014251	A	6	6	26428	26433	100 %	0 %	0 %	0 %	298501530
571	NC_014251	TCC	2	6	26513	26518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_014251	ATA	2	6	26541	26546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501531
573	NC_014251	GATT	2	8	26615	26622	25 %	50 %	25 %	0 %	298501531
574	NC_014251	ACA	2	6	26725	26730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501531
575	NC_014251	TTC	2	6	26772	26777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501531
576	NC_014251	AAT	2	6	26864	26869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501531
577	NC_014251	GTT	2	6	26878	26883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501531
578	NC_014251	CCTG	2	8	26905	26912	0 %	25 %	25 %	50 %	298501531
579	NC_014251	CAAC	2	8	26917	26924	50 %	0 %	0 %	50 %	298501531
580	NC_014251	TA	3	6	26975	26980	50 %	50 %	0 %	0 %	298501531
581	NC_014251	TGAT	2	8	27180	27187	25 %	50 %	25 %	0 %	298501531
582	NC_014251	TCT	2	6	27305	27310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501532
583	NC_014251	CTT	2	6	27387	27392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501532
584	NC_014251	ATG	2	6	27493	27498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501532
585	NC_014251	TGA	2	6	27621	27626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501532
586	NC_014251	ATC	2	6	27631	27636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501532
587	NC_014251	ACC	2	6	27656	27661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501532
588	NC_014251	CTT	2	6	27666	27671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501532
589	NC_014251	T	6	6	27805	27810	0 %	100 %	0 %	0 %	298501532
590	NC_014251	CGA	2	6	27866	27871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501532
591	NC_014251	TTC	2	6	27940	27945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501532
592	NC_014251	GT	3	6	28054	28059	0 %	50 %	50 %	0 %	298501532
593	NC_014251	GCT	2	6	28142	28147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501533
594	NC_014251	CTG	2	6	28149	28154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501533
595	NC_014251	ACC	2	6	28240	28245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501533
596	NC_014251	T	6	6	28279	28284	0 %	100 %	0 %	0 %	298501533
597	NC_014251	TTA	2	6	28289	28294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501533
598	NC_014251	AAG	2	6	28324	28329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501533
599	NC_014251	GCT	2	6	28469	28474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501533
600	NC_014251	TAG	2	6	28479	28484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501533
601	NC_014251	ATT	2	6	28534	28539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501533
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603	NC_014251	AAT	2	6	28585	28590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501533
604	NC_014251	AAGC	2	8	28642	28649	50 %	0 %	25 %	25 %	298501533
605	NC_014251	ATA	2	6	28667	28672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501533
606	NC_014251	GCT	2	6	28697	28702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501533
607	NC_014251	AATCC	2	10	28795	28804	40 %	20 %	0 %	40 %	298501534
608	NC_014251	TTC	2	6	28829	28834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501534
609	NC_014251	TCT	2	6	28851	28856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501534
610	NC_014251	TCT	2	6	28890	28895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501534
611	NC_014251	AAT	2	6	28910	28915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501534
612	NC_014251	TG	3	6	28934	28939	0 %	50 %	50 %	0 %	298501534
613	NC_014251	TTG	2	6	28951	28956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501534
614	NC_014251	CAA	2	6	28967	28972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501534
615	NC_014251	ACA	2	6	29001	29006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501534
616	NC_014251	CTT	2	6	29197	29202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501534
617	NC_014251	CCT	2	6	29275	29280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_014251	ATC	2	6	29384	29389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501535
619	NC_014251	TGA	2	6	29582	29587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501535
620	NC_014251	CCATT	2	10	29590	29599	20 %	40 %	0 %	40 %	298501535
621	NC_014251	GCT	2	6	29607	29612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501535
622	NC_014251	CTT	3	9	29654	29662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501536
623	NC_014251	CAAG	2	8	29726	29733	50 %	0 %	25 %	25 %	298501536
624	NC_014251	AC	3	6	29739	29744	50 %	0 %	0 %	50 %	298501536
625	NC_014251	CAA	2	6	29756	29761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501536
626	NC_014251	AT	3	6	29779	29784	50 %	50 %	0 %	0 %	298501536
627	NC_014251	CCA	2	6	29830	29835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501536
628	NC_014251	CA	3	6	29859	29864	50 %	0 %	0 %	50 %	298501536
629	NC_014251	AAAGG	2	10	29901	29910	60 %	0 %	40 %	0 %	298501536
630	NC_014251	CCG	2	6	29929	29934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501536
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755	NC_014251	TAT	2	6	35455	35460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_014251	CAT	2	6	35851	35856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501543
760	NC_014251	ATA	2	6	35861	35866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501543
761	NC_014251	TGA	2	6	35884	35889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501543
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763	NC_014251	AGCC	2	8	35941	35948	25 %	0 %	25 %	50 %	298501543
764	NC_014251	ATCA	2	8	35984	35991	50 %	25 %	0 %	25 %	298501543
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767	NC_014251	TCC	2	6	36099	36104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501543
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770	NC_014251	TCA	2	6	36202	36207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501543
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777	NC_014251	T	6	6	36454	36459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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791	NC_014251	T	6	6	37248	37253	0 %	100 %	0 %	0 %	298501545
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872	NC_014251	A	6	6	41447	41452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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874	NC_014251	TAC	2	6	41508	41513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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887	NC_014251	T	6	6	42279	42284	0 %	100 %	0 %	0 %	298501553
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