MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014251	ATG	2	6	287171	287176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501810
6002	NC_014251	TCA	2	6	287263	287268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501810
6003	NC_014251	TGG	2	6	287280	287285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501810
6004	NC_014251	CAAG	2	8	287312	287319	50 %	0 %	25 %	25 %	298501810
6005	NC_014251	GTT	2	6	287388	287393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501810
6006	NC_014251	TGA	2	6	287394	287399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501810
6007	NC_014251	ACA	2	6	287440	287445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501810
6008	NC_014251	GTC	2	6	287450	287455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501810
6009	NC_014251	CGT	2	6	287458	287463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501810
6010	NC_014251	GGTT	2	8	287467	287474	0 %	50 %	50 %	0 %	298501810
6011	NC_014251	CGT	2	6	287500	287505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501810
6012	NC_014251	CTTT	2	8	287524	287531	0 %	75 %	0 %	25 %	298501810
6013	NC_014251	TG	3	6	287575	287580	0 %	50 %	50 %	0 %	298501810
6014	NC_014251	ACT	2	6	287609	287614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501810
6015	NC_014251	CTAT	2	8	287651	287658	25 %	50 %	0 %	25 %	298501810
6016	NC_014251	AGA	2	6	287679	287684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501810
6017	NC_014251	TCG	2	6	287739	287744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501810
6018	NC_014251	TTGG	2	8	287755	287762	0 %	50 %	50 %	0 %	298501810
6019	NC_014251	AACA	2	8	287801	287808	75 %	0 %	0 %	25 %	298501810
6020	NC_014251	AAG	2	6	287887	287892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014251	CCT	2	6	287894	287899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_014251	TTG	2	6	287903	287908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_014251	CTTTT	2	10	287925	287934	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6024	NC_014251	ATA	2	6	287937	287942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_014251	CTT	2	6	287973	287978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_014251	ATA	3	9	287998	288006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_014251	TAT	2	6	288039	288044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501811
6028	NC_014251	GAA	2	6	288051	288056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501811
6029	NC_014251	AAG	2	6	288058	288063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501811
6030	NC_014251	GAGG	2	8	288071	288078	25 %	0 %	75 %	0 %	298501811
6031	NC_014251	GA	3	6	288083	288088	50 %	0 %	50 %	0 %	298501811
6032	NC_014251	TG	3	6	288129	288134	0 %	50 %	50 %	0 %	298501811
6033	NC_014251	AGCG	2	8	288190	288197	25 %	0 %	50 %	25 %	298501811
6034	NC_014251	ATGC	2	8	288201	288208	25 %	25 %	25 %	25 %	298501811
6035	NC_014251	GCT	2	6	288372	288377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501811
6036	NC_014251	ATC	2	6	288415	288420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501811
6037	NC_014251	T	7	7	288476	288482	0 %	100 %	0 %	0 %	298501811
6038	NC_014251	A	6	6	288495	288500	100 %	0 %	0 %	0 %	298501811
6039	NC_014251	ATA	2	6	288534	288539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_014251	GGA	2	6	288577	288582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014251	CAG	2	6	288586	288591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_014251	TG	3	6	288609	288614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014251	T	7	7	288618	288624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_014251	AATA	2	8	288638	288645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_014251	AAT	2	6	288652	288657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014251	ATA	2	6	288670	288675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_014251	GTT	2	6	288801	288806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501812
6048	NC_014251	GA	3	6	288814	288819	50 %	0 %	50 %	0 %	298501812
6049	NC_014251	TTC	2	6	288887	288892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501812
6050	NC_014251	AAG	2	6	288903	288908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501812
6051	NC_014251	TTAA	2	8	288918	288925	50 %	50 %	0 %	0 %	298501812
6052	NC_014251	ATT	2	6	288949	288954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501812
6053	NC_014251	GAA	2	6	288995	289000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501812
6054	NC_014251	GTT	2	6	289017	289022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501812
6055	NC_014251	TGG	2	6	289106	289111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501812
6056	NC_014251	TA	3	6	289195	289200	50 %	50 %	0 %	0 %	298501813
6057	NC_014251	GCA	2	6	289242	289247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501813
6058	NC_014251	AAT	2	6	289290	289295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501813
6059	NC_014251	TCT	2	6	289300	289305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501813
6060	NC_014251	TTA	2	6	289378	289383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501813
6061	NC_014251	AGA	2	6	289432	289437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501813
6062	NC_014251	ATGT	2	8	289524	289531	25 %	50 %	25 %	0 %	298501813
6063	NC_014251	GTT	2	6	289561	289566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501813
6064	NC_014251	GATT	2	8	289608	289615	25 %	50 %	25 %	0 %	298501813
6065	NC_014251	A	6	6	289673	289678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_014251	TCT	2	6	289754	289759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_014251	AGGTTG	2	12	289770	289781	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298501814
6068	NC_014251	GT	3	6	289800	289805	0 %	50 %	50 %	0 %	298501814
6069	NC_014251	GGA	2	6	289885	289890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501814
6070	NC_014251	GAG	2	6	290033	290038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501814
6071	NC_014251	CAG	2	6	290045	290050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501814
6072	NC_014251	CCAG	2	8	290149	290156	25 %	0 %	25 %	50 %	298501814
6073	NC_014251	ATT	2	6	290165	290170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501814
6074	NC_014251	TCCA	2	8	290174	290181	25 %	25 %	0 %	50 %	298501814
6075	NC_014251	CAT	2	6	290185	290190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501814
6076	NC_014251	AAG	2	6	290310	290315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501814
6077	NC_014251	TGG	2	6	290349	290354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501814
6078	NC_014251	CAC	2	6	290384	290389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501814
6079	NC_014251	GGC	2	6	290465	290470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298501814
6080	NC_014251	AGA	2	6	290506	290511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501814
6081	NC_014251	TCC	2	6	290534	290539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501814
6082	NC_014251	TAC	2	6	290626	290631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501814
6083	NC_014251	CTG	2	6	290727	290732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501814
6084	NC_014251	GTG	2	6	290733	290738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501814
6085	NC_014251	GA	3	6	290853	290858	50 %	0 %	50 %	0 %	298501814
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6088	NC_014251	TTCG	2	8	291303	291310	0 %	50 %	25 %	25 %	298501815
6089	NC_014251	CAA	2	6	291326	291331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501815
6090	NC_014251	AG	3	6	291341	291346	50 %	0 %	50 %	0 %	298501815
6091	NC_014251	CTT	2	6	291451	291456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501815
6092	NC_014251	AGA	2	6	291472	291477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501815
6093	NC_014251	AGAA	2	8	291607	291614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_014251	GAA	2	6	291622	291627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501816
6095	NC_014251	TATTT	2	10	291634	291643	20 %	80 %	0 %	0 %	298501816
6096	NC_014251	TTTTA	2	10	291646	291655	20 %	80 %	0 %	0 %	298501816
6097	NC_014251	CTA	2	6	291688	291693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501816
6098	NC_014251	ACGG	2	8	291695	291702	25 %	0 %	50 %	25 %	298501816
6099	NC_014251	CT	3	6	291753	291758	0 %	50 %	0 %	50 %	298501816
6100	NC_014251	A	6	6	291800	291805	100 %	0 %	0 %	0 %	298501816
6101	NC_014251	AAG	2	6	291818	291823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501816
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6103	NC_014251	AGA	2	6	291973	291978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501816
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6105	NC_014251	TTGTTT	2	12	291999	292010	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298501816
6106	NC_014251	ATC	2	6	292160	292165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501816
6107	NC_014251	GTA	2	6	292205	292210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501816
6108	NC_014251	CTT	2	6	292300	292305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501816
6109	NC_014251	CT	3	6	292374	292379	0 %	50 %	0 %	50 %	298501816
6110	NC_014251	TTG	2	6	292404	292409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501816
6111	NC_014251	TGA	2	6	292425	292430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501816
6112	NC_014251	ATG	2	6	292452	292457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_014251	CTT	2	6	292479	292484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_014251	TTGA	2	8	292491	292498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_014251	AT	3	6	292561	292566	50 %	50 %	0 %	0 %	298501817
6116	NC_014251	GGA	2	6	292570	292575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501817
6117	NC_014251	TCT	2	6	292613	292618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501817
6118	NC_014251	GA	3	6	292698	292703	50 %	0 %	50 %	0 %	298501817
6119	NC_014251	GAA	2	6	292718	292723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501817
6120	NC_014251	TGT	2	6	292843	292848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501817
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6123	NC_014251	ATT	2	6	293043	293048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501817
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6125	NC_014251	TGGT	2	8	293064	293071	0 %	50 %	50 %	0 %	298501817
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6377	NC_014251	A	7	7	304937	304943	100 %	0 %	0 %	0 %	298501833
6378	NC_014251	CT	3	6	304951	304956	0 %	50 %	0 %	50 %	298501833
6379	NC_014251	AGC	2	6	304976	304981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501833
6380	NC_014251	TTA	2	6	305046	305051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501833
6381	NC_014251	CAGAT	2	10	305081	305090	40 %	20 %	20 %	20 %	298501833
6382	NC_014251	ATT	2	6	305107	305112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501833
6383	NC_014251	TCC	2	6	305138	305143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501833
6384	NC_014251	CTTG	2	8	305175	305182	0 %	50 %	25 %	25 %	298501833
6385	NC_014251	CTT	2	6	305253	305258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501833
6386	NC_014251	ATC	2	6	305311	305316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501833
6387	NC_014251	ATT	2	6	305371	305376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501833
6388	NC_014251	TCT	3	9	305518	305526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501833
6389	NC_014251	A	6	6	305591	305596	100 %	0 %	0 %	0 %	298501833
6390	NC_014251	GAA	2	6	305622	305627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501833
6391	NC_014251	AG	3	6	305649	305654	50 %	0 %	50 %	0 %	298501833
6392	NC_014251	ATGG	2	8	305731	305738	25 %	25 %	50 %	0 %	298501833
6393	NC_014251	TTTAC	2	10	305783	305792	20 %	60 %	0 %	20 %	298501833
6394	NC_014251	ATC	2	6	305809	305814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501833
6395	NC_014251	TAG	2	6	305876	305881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501833
6396	NC_014251	GAG	2	6	305893	305898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501833
6397	NC_014251	TGA	2	6	305924	305929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501833
6398	NC_014251	GAC	2	6	306057	306062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501833
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6400	NC_014251	GTG	2	6	306119	306124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501833
6401	NC_014251	TCAATC	2	12	306125	306136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501833
6402	NC_014251	A	6	6	306145	306150	100 %	0 %	0 %	0 %	298501833
6403	NC_014251	TCT	2	6	306219	306224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501833
6404	NC_014251	AGG	2	6	306236	306241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501833
6405	NC_014251	GAC	2	6	306243	306248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501833
6406	NC_014251	CAGA	2	8	306322	306329	50 %	0 %	25 %	25 %	298501833
6407	NC_014251	GGT	2	6	306358	306363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501833
6408	NC_014251	CT	3	6	306392	306397	0 %	50 %	0 %	50 %	298501833
6409	NC_014251	GAA	2	6	306577	306582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501833
6410	NC_014251	TTGC	2	8	306598	306605	0 %	50 %	25 %	25 %	298501833
6411	NC_014251	AGAGG	2	10	306645	306654	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6412	NC_014251	TCG	2	6	306693	306698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501834
6413	NC_014251	AGT	2	6	306715	306720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501834
6414	NC_014251	CAA	2	6	306852	306857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501834
6415	NC_014251	GAA	2	6	306880	306885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501834
6416	NC_014251	AAG	2	6	306898	306903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501834
6417	NC_014251	AAG	2	6	306926	306931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501834
6418	NC_014251	CAGT	2	8	306963	306970	25 %	25 %	25 %	25 %	298501834
6419	NC_014251	A	7	7	306989	306995	100 %	0 %	0 %	0 %	298501834
6420	NC_014251	AAG	2	6	307025	307030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501834
6421	NC_014251	AGG	2	6	307049	307054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501834
6422	NC_014251	GCAG	2	8	307099	307106	25 %	0 %	50 %	25 %	298501834
6423	NC_014251	CAA	2	6	307126	307131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501834
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6432	NC_014251	CTA	2	6	307838	307843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501834
6433	NC_014251	GAT	2	6	307941	307946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501834
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6435	NC_014251	AAT	2	6	308025	308030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6436	NC_014251	TTC	2	6	308050	308055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6437	NC_014251	T	6	6	308062	308067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6438	NC_014251	CTA	2	6	308090	308095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6439	NC_014251	T	6	6	308118	308123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6440	NC_014251	T	6	6	308126	308131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6441	NC_014251	TTA	2	6	308238	308243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501835
6442	NC_014251	AAG	2	6	308285	308290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501835
6443	NC_014251	AAT	2	6	308318	308323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501835
6444	NC_014251	AAC	2	6	308403	308408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501835
6445	NC_014251	ATT	2	6	308426	308431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501835
6446	NC_014251	CTG	2	6	308460	308465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501835
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6450	NC_014251	ATG	2	6	308568	308573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501835
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6453	NC_014251	CGT	2	6	308636	308641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501835
6454	NC_014251	ATTG	2	8	308686	308693	25 %	50 %	25 %	0 %	298501835
6455	NC_014251	AAC	2	6	308880	308885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501835
6456	NC_014251	A	7	7	308960	308966	100 %	0 %	0 %	0 %	298501836
6457	NC_014251	AG	3	6	308988	308993	50 %	0 %	50 %	0 %	298501836
6458	NC_014251	AG	3	6	309001	309006	50 %	0 %	50 %	0 %	298501836
6459	NC_014251	ATG	2	6	309062	309067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501836
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6461	NC_014251	TTG	2	6	309253	309258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501836
6462	NC_014251	GTGAC	2	10	309269	309278	20 %	20 %	40 %	20 %	298501836
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6464	NC_014251	CAG	2	6	309464	309469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501836
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6468	NC_014251	GAT	2	6	309805	309810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501836
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6485	NC_014251	CGT	2	6	310738	310743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501836
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6489	NC_014251	TGC	2	6	311085	311090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501836
6490	NC_014251	TGG	2	6	311120	311125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501836
6491	NC_014251	CTG	2	6	311126	311131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501836
6492	NC_014251	CAAG	2	8	311187	311194	50 %	0 %	25 %	25 %	298501836
6493	NC_014251	GCC	2	6	311218	311223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501836
6494	NC_014251	GCTTG	2	10	311253	311262	0 %	40 %	40 %	20 %	298501836
6495	NC_014251	GGT	2	6	311272	311277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501836
6496	NC_014251	GAA	2	6	311302	311307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501836
6497	NC_014251	GAC	2	6	311343	311348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501836
6498	NC_014251	CT	3	6	311368	311373	0 %	50 %	0 %	50 %	298501836
6499	NC_014251	CTA	2	6	311403	311408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501836
6500	NC_014251	CT	3	6	311425	311430	0 %	50 %	0 %	50 %	298501836

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