MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_014251	CT	3	6	263385	263390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_014251	CTTTT	2	10	263428	263437	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5504	NC_014251	TAT	2	6	263447	263452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_014251	G	7	7	263479	263485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_014251	CGA	2	6	263587	263592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_014251	C	6	6	263596	263601	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5508	NC_014251	T	6	6	263602	263607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_014251	GTA	2	6	263629	263634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_014251	A	6	6	263644	263649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_014251	GTT	2	6	263688	263693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_014251	AATA	2	8	263696	263703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_014251	T	6	6	263813	263818	0 %	100 %	0 %	0 %	298501789
5514	NC_014251	T	7	7	263898	263904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_014251	GTA	2	6	263953	263958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_014251	TAG	2	6	263974	263979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_014251	A	6	6	264165	264170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_014251	T	7	7	264199	264205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_014251	TAT	3	9	264219	264227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_014251	ATTT	2	8	264248	264255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_014251	AG	3	6	264256	264261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_014251	T	7	7	264362	264368	0 %	100 %	0 %	0 %	298501790
5523	NC_014251	T	6	6	264375	264380	0 %	100 %	0 %	0 %	298501790
5524	NC_014251	GTTTT	2	10	264474	264483	0 %	80 %	20 %	0 %	298501790
5525	NC_014251	AT	3	6	264532	264537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_014251	A	6	6	264559	264564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_014251	T	6	6	264582	264587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_014251	TAG	2	6	264601	264606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_014251	TAC	2	6	264658	264663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_014251	A	7	7	264677	264683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_014251	T	6	6	264694	264699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_014251	GTT	2	6	264721	264726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_014251	A	6	6	264730	264735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_014251	A	6	6	264748	264753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5540	NC_014251	TTG	2	6	265155	265160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_014251	CAA	2	6	265165	265170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_014251	TAT	2	6	265207	265212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501792
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5551	NC_014251	GAA	2	6	265881	265886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_014251	T	7	7	265892	265898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_014251	A	6	6	265949	265954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_014251	A	6	6	265973	265978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_014251	CAAA	2	8	265979	265986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_014251	ATA	2	6	266008	266013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_014251	TGA	2	6	266030	266035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_014251	TAT	2	6	266087	266092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_014251	TTGC	2	8	266173	266180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_014251	CTG	2	6	266181	266186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5564	NC_014251	CAAAGC	2	12	266335	266346	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298501793
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5566	NC_014251	TGG	2	6	266424	266429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501793
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5598	NC_014251	ACTT	2	8	268357	268364	25 %	50 %	0 %	25 %	298501794
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5607	NC_014251	A	7	7	268638	268644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_014251	AAAT	2	8	268673	268680	75 %	25 %	0 %	0 %	298501795
5609	NC_014251	AAACA	2	10	268728	268737	80 %	0 %	0 %	20 %	298501795
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5613	NC_014251	A	6	6	268845	268850	100 %	0 %	0 %	0 %	298501795
5614	NC_014251	ATGA	2	8	268877	268884	50 %	25 %	25 %	0 %	298501795
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5619	NC_014251	ATTGGA	2	12	269075	269086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501795
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5629	NC_014251	GAT	2	6	269495	269500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501796
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5631	NC_014251	A	6	6	269535	269540	100 %	0 %	0 %	0 %	298501796
5632	NC_014251	T	6	6	269566	269571	0 %	100 %	0 %	0 %	298501796
5633	NC_014251	GCA	2	6	269612	269617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501796
5634	NC_014251	GATT	2	8	269622	269629	25 %	50 %	25 %	0 %	298501796
5635	NC_014251	GAA	2	6	269681	269686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501796
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5646	NC_014251	T	7	7	270302	270308	0 %	100 %	0 %	0 %	298501796
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5651	NC_014251	ATT	2	6	270446	270451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501796
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5667	NC_014251	A	6	6	271349	271354	100 %	0 %	0 %	0 %	298501796
5668	NC_014251	TGT	2	6	271435	271440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501796
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5678	NC_014251	GTCG	2	8	271991	271998	0 %	25 %	50 %	25 %	298501796
5679	NC_014251	TGCTTA	2	12	272011	272022	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298501796
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5681	NC_014251	TTA	2	6	272216	272221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501796
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5684	NC_014251	GTA	2	6	272444	272449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501796
5685	NC_014251	TTGGT	2	10	272466	272475	0 %	60 %	40 %	0 %	298501796
5686	NC_014251	GAAA	2	8	272513	272520	75 %	0 %	25 %	0 %	298501796
5687	NC_014251	ATA	2	6	272523	272528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501796
5688	NC_014251	CAATT	2	10	272535	272544	40 %	40 %	0 %	20 %	298501796
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5690	NC_014251	AAGA	2	8	272669	272676	75 %	0 %	25 %	0 %	298501796
5691	NC_014251	CTG	2	6	272696	272701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501796
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5696	NC_014251	TAA	2	6	272808	272813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5700	NC_014251	GCA	2	6	273029	273034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501797
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5736	NC_014251	CAGC	2	8	274230	274237	25 %	0 %	25 %	50 %	298501800
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5738	NC_014251	A	6	6	274272	274277	100 %	0 %	0 %	0 %	298501800
5739	NC_014251	A	6	6	274379	274384	100 %	0 %	0 %	0 %	298501800
5740	NC_014251	ATA	2	6	274389	274394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501800
5741	NC_014251	GAT	2	6	274529	274534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501800
5742	NC_014251	TCT	2	6	274559	274564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501800
5743	NC_014251	TTCT	2	8	274752	274759	0 %	75 %	0 %	25 %	298501800
5744	NC_014251	T	6	6	274842	274847	0 %	100 %	0 %	0 %	298501801
5745	NC_014251	AAG	2	6	274861	274866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501801
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5747	NC_014251	ATTGA	2	10	274969	274978	40 %	40 %	20 %	0 %	298501801
5748	NC_014251	GAA	2	6	275023	275028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501801
5749	NC_014251	GCT	2	6	275047	275052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501801
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6000	NC_014251	GATA	2	8	287148	287155	50 %	25 %	25 %	0 %	298501810

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