MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 42628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014251	ACG	2	6	216332	216337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501726
4502	NC_014251	GCT	2	6	216426	216431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501726
4503	NC_014251	TCCT	2	8	216445	216452	0 %	50 %	0 %	50 %	298501726
4504	NC_014251	AAC	2	6	216494	216499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501726
4505	NC_014251	GCT	2	6	216516	216521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501726
4506	NC_014251	TTG	2	6	216547	216552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501726
4507	NC_014251	TGG	2	6	216566	216571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501726
4508	NC_014251	ATG	2	6	216739	216744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501726
4509	NC_014251	TCGT	2	8	216748	216755	0 %	50 %	25 %	25 %	298501726
4510	NC_014251	TGG	2	6	216794	216799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501726
4511	NC_014251	AAG	2	6	216802	216807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501726
4512	NC_014251	A	6	6	216864	216869	100 %	0 %	0 %	0 %	298501726
4513	NC_014251	A	6	6	216882	216887	100 %	0 %	0 %	0 %	298501726
4514	NC_014251	TC	3	6	216923	216928	0 %	50 %	0 %	50 %	298501726
4515	NC_014251	AGA	2	6	217119	217124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_014251	GATA	2	8	217128	217135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_014251	ATG	2	6	217189	217194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501727
4518	NC_014251	A	6	6	217232	217237	100 %	0 %	0 %	0 %	298501727
4519	NC_014251	CT	3	6	217265	217270	0 %	50 %	0 %	50 %	298501727
4520	NC_014251	AAG	2	6	217281	217286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501727
4521	NC_014251	TC	4	8	217321	217328	0 %	50 %	0 %	50 %	298501727
4522	NC_014251	TCT	3	9	217427	217435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501727
4523	NC_014251	GATG	2	8	217470	217477	25 %	25 %	50 %	0 %	298501727
4524	NC_014251	ATA	2	6	217487	217492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501727
4525	NC_014251	GAT	2	6	217557	217562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_014251	TCC	2	6	217646	217651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501728
4527	NC_014251	AC	3	6	217654	217659	50 %	0 %	0 %	50 %	298501728
4528	NC_014251	AGG	2	6	217783	217788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501728
4529	NC_014251	AAAG	2	8	217851	217858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_014251	TGA	2	6	217888	217893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_014251	TA	3	6	218101	218106	50 %	50 %	0 %	0 %	298501729
4532	NC_014251	CCA	2	6	218160	218165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501729
4533	NC_014251	ATC	2	6	218301	218306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501729
4534	NC_014251	TCC	2	6	218322	218327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_014251	ATT	2	6	218332	218337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014251	T	6	6	218336	218341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_014251	GATA	2	8	218371	218378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_014251	TTA	2	6	218438	218443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_014251	ATT	2	6	218461	218466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014251	A	6	6	218522	218527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_014251	TAT	2	6	218549	218554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501730
4542	NC_014251	GCT	2	6	218567	218572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501730
4543	NC_014251	ATG	2	6	218708	218713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501730
4544	NC_014251	AAG	2	6	218725	218730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501730
4545	NC_014251	AAT	2	6	218788	218793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501730
4546	NC_014251	T	6	6	218805	218810	0 %	100 %	0 %	0 %	298501730
4547	NC_014251	TCAGCT	2	12	218846	218857	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298501730
4548	NC_014251	CAT	2	6	218868	218873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501730
4549	NC_014251	TTA	2	6	218921	218926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501730
4550	NC_014251	AAGA	2	8	219015	219022	75 %	0 %	25 %	0 %	298501730
4551	NC_014251	CAA	2	6	219087	219092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501730
4552	NC_014251	T	6	6	219153	219158	0 %	100 %	0 %	0 %	298501730
4553	NC_014251	CAAT	2	8	219159	219166	50 %	25 %	0 %	25 %	298501730
4554	NC_014251	TC	3	6	219189	219194	0 %	50 %	0 %	50 %	298501730
4555	NC_014251	CTT	2	6	219264	219269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501730
4556	NC_014251	GTA	2	6	219308	219313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501730
4557	NC_014251	T	6	6	219338	219343	0 %	100 %	0 %	0 %	298501730
4558	NC_014251	CTG	2	6	219378	219383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501730
4559	NC_014251	GCA	2	6	219422	219427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501730
4560	NC_014251	T	6	6	219520	219525	0 %	100 %	0 %	0 %	298501730
4561	NC_014251	T	6	6	219610	219615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014251	CCT	2	6	219645	219650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_014251	TTC	2	6	219706	219711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408767009
4564	NC_014251	ATA	2	6	219788	219793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408767009
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4567	NC_014251	T	6	6	219919	219924	0 %	100 %	0 %	0 %	408767009
4568	NC_014251	CTT	2	6	219927	219932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408767009
4569	NC_014251	ACATC	2	10	219969	219978	40 %	20 %	0 %	40 %	408767009
4570	NC_014251	GTT	2	6	220032	220037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408767009
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4576	NC_014251	CAAC	2	8	220162	220169	50 %	0 %	0 %	50 %	408767009
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4581	NC_014251	GCT	2	6	220268	220273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408767009
4582	NC_014251	TTG	2	6	220318	220323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408767009
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4584	NC_014251	AAG	2	6	220423	220428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408767009
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4587	NC_014251	TCA	2	6	220530	220535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_014251	TAT	2	6	220544	220549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_014251	AT	3	6	220689	220694	50 %	50 %	0 %	0 %	298501732
4590	NC_014251	GTT	3	9	220713	220721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501732
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4594	NC_014251	CTG	4	12	220894	220905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501732
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4598	NC_014251	GCT	2	6	221145	221150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501732
4599	NC_014251	GCT	3	9	221184	221192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501732
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4601	NC_014251	CAG	2	6	221257	221262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501732
4602	NC_014251	CAT	2	6	221299	221304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501732
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4604	NC_014251	CAT	2	6	221344	221349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501732
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4606	NC_014251	TGT	2	6	221394	221399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501732
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4608	NC_014251	GCA	2	6	221439	221444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501732
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4610	NC_014251	CTT	2	6	221704	221709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501732
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4612	NC_014251	TAT	2	6	221737	221742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501732
4613	NC_014251	AGC	2	6	221747	221752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501732
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4618	NC_014251	CTT	2	6	221870	221875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_014251	A	7	7	221898	221904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_014251	TAA	2	6	221909	221914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014251	ATA	2	6	221954	221959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501733
4622	NC_014251	AAAT	2	8	221968	221975	75 %	25 %	0 %	0 %	298501733
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4624	NC_014251	ATC	2	6	222006	222011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501733
4625	NC_014251	TAGC	2	8	222121	222128	25 %	25 %	25 %	25 %	298501733
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4629	NC_014251	CAT	2	6	222235	222240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501733
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4657	NC_014251	A	6	6	223774	223779	100 %	0 %	0 %	0 %	298501735
4658	NC_014251	TTG	2	6	223790	223795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501735
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4660	NC_014251	AATA	2	8	223949	223956	75 %	25 %	0 %	0 %	298501735
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4683	NC_014251	CTT	2	6	225148	225153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501737
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4689	NC_014251	CCAAA	2	10	225436	225445	60 %	0 %	0 %	40 %	298501737
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4695	NC_014251	CGT	2	6	225611	225616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501737
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4719	NC_014251	CTT	2	6	226823	226828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501739
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4722	NC_014251	AAGA	2	8	226965	226972	75 %	0 %	25 %	0 %	298501739
4723	NC_014251	TGAT	2	8	227082	227089	25 %	50 %	25 %	0 %	298501739
4724	NC_014251	T	8	8	227119	227126	0 %	100 %	0 %	0 %	298501739
4725	NC_014251	CTT	2	6	227143	227148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4726	NC_014251	TAT	2	6	227158	227163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4727	NC_014251	TAC	2	6	227171	227176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
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4730	NC_014251	CAT	2	6	227307	227312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
4731	NC_014251	AG	3	6	227333	227338	50 %	0 %	50 %	0 %	298501740
4732	NC_014251	TC	3	6	227367	227372	0 %	50 %	0 %	50 %	298501740
4733	NC_014251	ATA	2	6	227378	227383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501740
4734	NC_014251	TGA	2	6	227444	227449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501740
4735	NC_014251	CCAA	2	8	227581	227588	50 %	0 %	0 %	50 %	298501740
4736	NC_014251	CAT	2	6	227590	227595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
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4739	NC_014251	ATG	2	6	227620	227625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501740
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4742	NC_014251	CTC	2	6	227911	227916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501740
4743	NC_014251	ATC	2	6	227995	228000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
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4745	NC_014251	TCA	2	6	228083	228088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501740
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4747	NC_014251	A	6	6	228126	228131	100 %	0 %	0 %	0 %	298501740
4748	NC_014251	GTTT	2	8	228136	228143	0 %	75 %	25 %	0 %	298501740
4749	NC_014251	TCT	2	6	228212	228217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501740
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4751	NC_014251	AAT	2	6	228224	228229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501740
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4867	NC_014251	CAT	2	6	233388	233393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501745
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4996	NC_014251	TGAT	2	8	239254	239261	25 %	50 %	25 %	0 %	298501749
4997	NC_014251	GCT	2	6	239264	239269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501749
4998	NC_014251	GTT	2	6	239294	239299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501749
4999	NC_014251	T	6	6	239298	239303	0 %	100 %	0 %	0 %	298501749
5000	NC_014251	CTT	2	6	239359	239364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501749

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