MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 1520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014220	ACTCC	2	10	4385	4394	20 %	20 %	0 %	60 %	297616219
2	NC_014220	TCCTA	2	10	4888	4897	20 %	40 %	0 %	40 %	297616219
3	NC_014220	CCAAA	2	10	5093	5102	60 %	0 %	0 %	40 %	297616219
4	NC_014220	CCAGG	2	10	6024	6033	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014220	CGATG	2	10	6482	6491	20 %	20 %	40 %	20 %	297616220
6	NC_014220	TTTGA	2	10	7461	7470	20 %	60 %	20 %	0 %	297616220
7	NC_014220	AAGAA	2	10	9584	9593	80 %	0 %	20 %	0 %	297616221
8	NC_014220	TATAA	2	10	10175	10184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014220	GCCAA	2	10	10540	10549	40 %	0 %	20 %	40 %	297616223
10	NC_014220	GCTGG	2	10	12391	12400	0 %	20 %	60 %	20 %	297616224
11	NC_014220	AAGTA	2	10	14663	14672	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014220	CTCGA	2	10	15891	15900	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014220	ACCTC	2	10	16782	16791	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_014220	CGAGA	2	10	17804	17813	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014220	AGCAA	2	10	20798	20807	60 %	0 %	20 %	20 %	297616231
16	NC_014220	TAGCT	2	10	22414	22423	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014220	CCAGG	2	10	22891	22900	20 %	0 %	40 %	40 %	297616233
18	NC_014220	TGACG	2	10	28160	28169	20 %	20 %	40 %	20 %	297616237
19	NC_014220	CAGTT	2	10	28377	28386	20 %	40 %	20 %	20 %	297616237
20	NC_014220	TAAAC	2	10	31376	31385	60 %	20 %	0 %	20 %	297616238
21	NC_014220	GTGAA	2	10	34396	34405	40 %	20 %	40 %	0 %	297616241
22	NC_014220	GGCAA	2	10	36669	36678	40 %	0 %	40 %	20 %	297616243
23	NC_014220	CTGAG	2	10	39117	39126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014220	CTATC	2	10	39951	39960	20 %	40 %	0 %	40 %	297616247
25	NC_014220	GCTTC	2	10	40480	40489	0 %	40 %	20 %	40 %	297616247
26	NC_014220	AGTTC	2	10	40870	40879	20 %	40 %	20 %	20 %	297616247
27	NC_014220	CCTCA	2	10	41959	41968	20 %	20 %	0 %	60 %	297616249
28	NC_014220	GTGGG	2	10	43456	43465	0 %	20 %	80 %	0 %	297616252
29	NC_014220	TCGTG	2	10	48209	48218	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014220	GGGAG	2	10	49525	49534	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014220	ACTCA	2	10	49582	49591	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014220	TTGAG	2	10	49663	49672	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014220	GACAG	2	10	51930	51939	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014220	AACGT	2	10	53805	53814	40 %	20 %	20 %	20 %	297616258
35	NC_014220	TGGGC	2	10	54603	54612	0 %	20 %	60 %	20 %	297616258
36	NC_014220	CGGAT	2	10	55821	55830	20 %	20 %	40 %	20 %	297616259
37	NC_014220	GAGAA	2	10	56254	56263	60 %	0 %	40 %	0 %	297616260
38	NC_014220	TTTTA	2	10	57773	57782	20 %	80 %	0 %	0 %	297616262
39	NC_014220	GTGCT	2	10	57917	57926	0 %	40 %	40 %	20 %	297616262
40	NC_014220	GTTTT	2	10	59488	59497	0 %	80 %	20 %	0 %	297616265
41	NC_014220	GTTTG	2	10	61225	61234	0 %	60 %	40 %	0 %	297616267
42	NC_014220	CCTTA	2	10	63137	63146	20 %	40 %	0 %	40 %	297616268
43	NC_014220	GGGCA	2	10	64866	64875	20 %	0 %	60 %	20 %	297616270
44	NC_014220	AAACA	2	10	65543	65552	80 %	0 %	0 %	20 %	297616271
45	NC_014220	ACATA	2	10	65934	65943	60 %	20 %	0 %	20 %	297616271
46	NC_014220	GGGAT	2	10	66672	66681	20 %	20 %	60 %	0 %	297616273
47	NC_014220	CGGTT	2	10	71775	71784	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014220	AAAGA	2	10	80459	80468	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014220	ATGGG	2	10	81145	81154	20 %	20 %	60 %	0 %	297616282
50	NC_014220	TAAAA	2	10	81562	81571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014220	ATTTT	2	10	82455	82464	20 %	80 %	0 %	0 %	297616284
52	NC_014220	AGATA	2	10	82632	82641	60 %	20 %	20 %	0 %	297616285
53	NC_014220	TTCCG	2	10	86666	86675	0 %	40 %	20 %	40 %	297616290
54	NC_014220	ATTAT	2	10	86814	86823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014220	TTTAC	2	10	90435	90444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014220	CAAGG	2	10	90770	90779	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014220	TGGTT	2	10	93547	93556	0 %	60 %	40 %	0 %	297616294
58	NC_014220	GTTAT	2	10	95570	95579	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014220	TTTAT	2	10	95662	95671	20 %	80 %	0 %	0 %	297616296
60	NC_014220	ATGGC	2	10	96021	96030	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014220	TCCGT	2	10	96458	96467	0 %	40 %	20 %	40 %	297616297
62	NC_014220	TTCGA	2	10	98448	98457	20 %	40 %	20 %	20 %	297616299
63	NC_014220	TTTGG	2	10	98497	98506	0 %	60 %	40 %	0 %	297616299
64	NC_014220	ACCTG	2	10	99479	99488	20 %	20 %	20 %	40 %	297616299
65	NC_014220	ACGGG	2	10	100461	100470	20 %	0 %	60 %	20 %	297616300
66	NC_014220	GACCA	2	10	101498	101507	40 %	0 %	20 %	40 %	297616301
67	NC_014220	GGCAG	2	10	105131	105140	20 %	0 %	60 %	20 %	297616304
68	NC_014220	GGCGG	2	10	106303	106312	0 %	0 %	80 %	20 %	297616305
69	NC_014220	TGGCT	2	10	112806	112815	0 %	40 %	40 %	20 %	297616312
70	NC_014220	AGGGC	2	10	113188	113197	20 %	0 %	60 %	20 %	297616312
71	NC_014220	GGGTT	2	10	113289	113298	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014220	GTTGG	2	10	118830	118839	0 %	40 %	60 %	0 %	297616316
73	NC_014220	GTGAG	2	10	120511	120520	20 %	20 %	60 %	0 %	297616317
74	NC_014220	GTTGG	2	10	124304	124313	0 %	40 %	60 %	0 %	297616326
75	NC_014220	TCCGG	2	10	124361	124370	0 %	20 %	40 %	40 %	297616326
76	NC_014220	TCTTT	2	10	125317	125326	0 %	80 %	0 %	20 %	297616326
77	NC_014220	CTGAC	2	10	130268	130277	20 %	20 %	20 %	40 %	297616331
78	NC_014220	CAGGG	2	10	131603	131612	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014220	CCGGG	2	10	133902	133911	0 %	0 %	60 %	40 %	297616332
80	NC_014220	TCGGG	2	10	135661	135670	0 %	20 %	60 %	20 %	297616333
81	NC_014220	GAGGG	2	10	135840	135849	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014220	CGCAT	2	10	139030	139039	20 %	20 %	20 %	40 %	297616336
83	NC_014220	CATAT	2	10	140250	140259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014220	CGGAG	2	10	140592	140601	20 %	0 %	60 %	20 %	297616337
85	NC_014220	GCAGA	2	10	146240	146249	40 %	0 %	40 %	20 %	297616345
86	NC_014220	TGTTT	2	10	146662	146671	0 %	80 %	20 %	0 %	297616345
87	NC_014220	TCGAT	2	10	147518	147527	20 %	40 %	20 %	20 %	297616346
88	NC_014220	CAGGA	2	10	151727	151736	40 %	0 %	40 %	20 %	297616350
89	NC_014220	GATCC	2	10	152681	152690	20 %	20 %	20 %	40 %	297616351
90	NC_014220	GAATT	2	10	153542	153551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014220	CAAGA	2	10	153910	153919	60 %	0 %	20 %	20 %	297616352
92	NC_014220	CGGTA	2	10	155859	155868	20 %	20 %	40 %	20 %	297616354
93	NC_014220	GGCAA	2	10	156114	156123	40 %	0 %	40 %	20 %	297616354
94	NC_014220	CAGAC	2	10	158646	158655	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014220	TGAGT	2	10	158813	158822	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014220	CCCCT	2	10	160759	160768	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
97	NC_014220	TGTCC	2	10	171591	171600	0 %	40 %	20 %	40 %	297616366
98	NC_014220	ATCGG	2	10	173429	173438	20 %	20 %	40 %	20 %	297616367
99	NC_014220	AAAAG	2	10	174932	174941	80 %	0 %	20 %	0 %	297616368
100	NC_014220	TGCGC	2	10	176831	176840	0 %	20 %	40 %	40 %	297616370
101	NC_014220	GCTGA	2	10	177314	177323	20 %	20 %	40 %	20 %	297616370
102	NC_014220	TTTCG	2	10	177607	177616	0 %	60 %	20 %	20 %	297616370
103	NC_014220	AAAAG	2	10	180434	180443	80 %	0 %	20 %	0 %	297616373
104	NC_014220	CAGGC	2	10	187480	187489	20 %	0 %	40 %	40 %	297616378
105	NC_014220	CTTGA	2	10	188467	188476	20 %	40 %	20 %	20 %	297616379
106	NC_014220	ATATC	2	10	188594	188603	40 %	40 %	0 %	20 %	297616379
107	NC_014220	AAACC	2	10	189303	189312	60 %	0 %	0 %	40 %	297616380
108	NC_014220	CACGT	2	10	191782	191791	20 %	20 %	20 %	40 %	297616383
109	NC_014220	ATACC	2	10	192107	192116	40 %	20 %	0 %	40 %	297616384
110	NC_014220	GCCGT	2	10	198745	198754	0 %	20 %	40 %	40 %	297616394
111	NC_014220	GCAGA	2	10	200632	200641	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014220	ACACA	2	10	204018	204027	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014220	GAGTG	2	10	205794	205803	20 %	20 %	60 %	0 %	297616401
114	NC_014220	TTGCT	2	10	206381	206390	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014220	GTCCT	2	10	207266	207275	0 %	40 %	20 %	40 %	297616403
116	NC_014220	GTCCT	2	10	208357	208366	0 %	40 %	20 %	40 %	297616403
117	NC_014220	TCGAG	2	10	209080	209089	20 %	20 %	40 %	20 %	297616404
118	NC_014220	AGGAA	2	10	209442	209451	60 %	0 %	40 %	0 %	297616404
119	NC_014220	GCTGG	2	10	212535	212544	0 %	20 %	60 %	20 %	297616405
120	NC_014220	GCAGA	2	10	215057	215066	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014220	TAAAG	2	10	215142	215151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014220	CTTCG	2	10	218199	218208	0 %	40 %	20 %	40 %	297616412
123	NC_014220	TATGA	2	10	219098	219107	40 %	40 %	20 %	0 %	297616413
124	NC_014220	TCATC	2	10	219241	219250	20 %	40 %	0 %	40 %	297616413
125	NC_014220	TTCAG	2	10	219266	219275	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014220	ACCAA	2	10	220508	220517	60 %	0 %	0 %	40 %	297616415
127	NC_014220	CGAAT	2	10	221848	221857	40 %	20 %	20 %	20 %	297616417
128	NC_014220	CGAAA	2	10	221924	221933	60 %	0 %	20 %	20 %	297616417
129	NC_014220	ACCGT	2	10	227762	227771	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014220	CCCTA	2	10	229388	229397	20 %	20 %	0 %	60 %	297616422
131	NC_014220	CAGAA	2	10	229562	229571	60 %	0 %	20 %	20 %	297616422
132	NC_014220	TATTC	2	10	231831	231840	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014220	CCAGG	2	10	233657	233666	20 %	0 %	40 %	40 %	297616427
134	NC_014220	CACCG	2	10	234086	234095	20 %	0 %	20 %	60 %	297616427
135	NC_014220	CACAT	2	10	234278	234287	40 %	20 %	0 %	40 %	297616427
136	NC_014220	GGCCA	2	10	236384	236393	20 %	0 %	40 %	40 %	297616429
137	NC_014220	AGGCC	2	10	236470	236479	20 %	0 %	40 %	40 %	297616429
138	NC_014220	CCCCG	2	10	238086	238095	0 %	0 %	20 %	80 %	297616429
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194	NC_014220	GTGTT	2	10	315967	315976	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_014220	CTGTT	2	10	633368	633377	0 %	60 %	20 %	20 %	297616797
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