MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014220	GAA	2	6	191677	191682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616383
3502	NC_014220	AGC	3	9	191748	191756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616383
3503	NC_014220	CACGT	2	10	191782	191791	20 %	20 %	20 %	40 %	297616383
3504	NC_014220	CCA	2	6	191797	191802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616383
3505	NC_014220	TCA	2	6	191820	191825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616383
3506	NC_014220	CGGTGT	2	12	191841	191852	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	297616383
3507	NC_014220	CCT	2	6	191928	191933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_014220	GCG	2	6	191961	191966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_014220	TGG	2	6	192013	192018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014220	TGG	2	6	192033	192038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616384
3511	NC_014220	AAAT	2	8	192041	192048	75 %	25 %	0 %	0 %	297616384
3512	NC_014220	CCG	2	6	192097	192102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616384
3513	NC_014220	ATACC	2	10	192107	192116	40 %	20 %	0 %	40 %	297616384
3514	NC_014220	GCT	2	6	192124	192129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616384
3515	NC_014220	AAT	2	6	192228	192233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616384
3516	NC_014220	AGG	2	6	192246	192251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616384
3517	NC_014220	GAA	2	6	192284	192289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616385
3518	NC_014220	GGGA	2	8	192339	192346	25 %	0 %	75 %	0 %	297616385
3519	NC_014220	AAG	2	6	192390	192395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616385
3520	NC_014220	GAG	2	6	192464	192469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616385
3521	NC_014220	AGG	2	6	192483	192488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616385
3522	NC_014220	TGG	2	6	192504	192509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616385
3523	NC_014220	AG	3	6	192781	192786	50 %	0 %	50 %	0 %	297616385
3524	NC_014220	GCAT	2	8	192885	192892	25 %	25 %	25 %	25 %	297616385
3525	NC_014220	TAC	2	6	192926	192931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616385
3526	NC_014220	TGG	2	6	193010	193015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616385
3527	NC_014220	CAA	2	6	193069	193074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616385
3528	NC_014220	GGC	2	6	193111	193116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616385
3529	NC_014220	GA	3	6	193132	193137	50 %	0 %	50 %	0 %	297616385
3530	NC_014220	GGC	2	6	193238	193243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616385
3531	NC_014220	TGG	2	6	193281	193286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616385
3532	NC_014220	GCG	2	6	193450	193455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616386
3533	NC_014220	CTT	2	6	193517	193522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616386
3534	NC_014220	GAA	2	6	193579	193584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616386
3535	NC_014220	CCGG	2	8	193598	193605	0 %	0 %	50 %	50 %	297616386
3536	NC_014220	AAG	2	6	193651	193656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616386
3537	NC_014220	A	6	6	193671	193676	100 %	0 %	0 %	0 %	297616386
3538	NC_014220	TGG	2	6	193703	193708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616386
3539	NC_014220	CGG	2	6	193730	193735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616386
3540	NC_014220	CGT	2	6	193742	193747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616386
3541	NC_014220	A	6	6	193764	193769	100 %	0 %	0 %	0 %	297616386
3542	NC_014220	GGA	2	6	193776	193781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616386
3543	NC_014220	TAC	2	6	193855	193860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616386
3544	NC_014220	GAG	2	6	193861	193866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616386
3545	NC_014220	CCG	2	6	193901	193906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616386
3546	NC_014220	GGA	2	6	193923	193928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616386
3547	NC_014220	AAG	2	6	193936	193941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616386
3548	NC_014220	ATT	2	6	194008	194013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014220	AGG	2	6	194074	194079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_014220	GCTT	2	8	194081	194088	0 %	50 %	25 %	25 %	297616387
3551	NC_014220	GGA	2	6	194150	194155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616387
3552	NC_014220	ATC	3	9	194157	194165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616387
3553	NC_014220	AAC	2	6	194172	194177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616387
3554	NC_014220	CGT	2	6	194243	194248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616387
3555	NC_014220	GAT	2	6	194271	194276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616387
3556	NC_014220	TCG	2	6	194313	194318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616388
3557	NC_014220	CTA	2	6	194446	194451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616388
3558	NC_014220	GCC	2	6	194624	194629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616388
3559	NC_014220	GTT	2	6	194744	194749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014220	AGG	2	6	194971	194976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014220	AG	3	6	195044	195049	50 %	0 %	50 %	0 %	297616389
3562	NC_014220	GAA	3	9	195197	195205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616389
3563	NC_014220	GAG	2	6	195312	195317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616390
3564	NC_014220	TAG	2	6	195340	195345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616390
3565	NC_014220	AT	3	6	195364	195369	50 %	50 %	0 %	0 %	297616390
3566	NC_014220	TCA	2	6	195469	195474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616390
3567	NC_014220	GGC	2	6	195569	195574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616390
3568	NC_014220	AGGCTC	2	12	195577	195588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616390
3569	NC_014220	AAG	2	6	195615	195620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616390
3570	NC_014220	TGT	2	6	195749	195754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616391
3571	NC_014220	GAA	2	6	195828	195833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616391
3572	NC_014220	TG	3	6	195926	195931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014220	CAT	2	6	195934	195939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_014220	ATG	2	6	196051	196056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_014220	TTC	2	6	196072	196077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_014220	CTT	2	6	196082	196087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_014220	TTCT	2	8	196147	196154	0 %	75 %	0 %	25 %	297616392
3578	NC_014220	TAT	2	6	196224	196229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616392
3579	NC_014220	TC	4	8	196242	196249	0 %	50 %	0 %	50 %	297616392
3580	NC_014220	GCT	2	6	196304	196309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616392
3581	NC_014220	GCC	2	6	196325	196330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616392
3582	NC_014220	ATGA	2	8	196348	196355	50 %	25 %	25 %	0 %	297616392
3583	NC_014220	CCGTTC	2	12	196366	196377	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	297616392
3584	NC_014220	GCC	2	6	196391	196396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616392
3585	NC_014220	TCG	2	6	196410	196415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616392
3586	NC_014220	TCA	2	6	196478	196483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616392
3587	NC_014220	GGT	2	6	196500	196505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616392
3588	NC_014220	TTC	2	6	196510	196515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616392
3589	NC_014220	TGA	2	6	196596	196601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616392
3590	NC_014220	ACC	2	6	196637	196642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616392
3591	NC_014220	GAC	2	6	196651	196656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616392
3592	NC_014220	TGA	2	6	196689	196694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616392
3593	NC_014220	AAT	2	6	196768	196773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616392
3594	NC_014220	CG	3	6	196787	196792	0 %	0 %	50 %	50 %	297616392
3595	NC_014220	CA	3	6	196795	196800	50 %	0 %	0 %	50 %	297616392
3596	NC_014220	ACT	2	6	196817	196822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616392
3597	NC_014220	ATC	2	6	196865	196870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616392
3598	NC_014220	CAC	2	6	196903	196908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616392
3599	NC_014220	CCT	2	6	196916	196921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_014220	ACC	3	9	196998	197006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616393
3601	NC_014220	TCT	2	6	197007	197012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616393
3602	NC_014220	CTC	2	6	197030	197035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616393
3603	NC_014220	AGT	2	6	197210	197215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616393
3604	NC_014220	GTT	2	6	197252	197257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616393
3605	NC_014220	GAA	2	6	197345	197350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616393
3606	NC_014220	GAT	2	6	197363	197368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616393
3607	NC_014220	A	7	7	197558	197564	100 %	0 %	0 %	0 %	297616393
3608	NC_014220	TTC	2	6	197608	197613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616393
3609	NC_014220	CTCG	2	8	197676	197683	0 %	25 %	25 %	50 %	297616393
3610	NC_014220	TTTC	2	8	197698	197705	0 %	75 %	0 %	25 %	297616393
3611	NC_014220	CTGC	2	8	197755	197762	0 %	25 %	25 %	50 %	297616393
3612	NC_014220	GCC	2	6	197802	197807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616393
3613	NC_014220	TCT	2	6	197821	197826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616393
3614	NC_014220	TCC	2	6	197954	197959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616393
3615	NC_014220	ACT	2	6	197976	197981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616393
3616	NC_014220	GTG	2	6	198024	198029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616393
3617	NC_014220	GCA	2	6	198058	198063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616393
3618	NC_014220	CGA	2	6	198109	198114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616393
3619	NC_014220	ACC	2	6	198132	198137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616393
3620	NC_014220	CCA	2	6	198154	198159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616393
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3622	NC_014220	TTG	2	6	198309	198314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616393
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3875	NC_014220	CCGC	2	8	210861	210868	0 %	0 %	25 %	75 %	297616404
3876	NC_014220	CCA	2	6	210889	210894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616404
3877	NC_014220	TCC	2	6	210931	210936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616404
3878	NC_014220	A	7	7	210944	210950	100 %	0 %	0 %	0 %	297616404
3879	NC_014220	GTT	2	6	211013	211018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616404
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3881	NC_014220	GCG	2	6	211111	211116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3882	NC_014220	TG	3	6	211238	211243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3883	NC_014220	AAC	2	6	211270	211275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616405
3884	NC_014220	CAG	2	6	211277	211282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616405
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3887	NC_014220	CTT	2	6	211484	211489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616405
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3890	NC_014220	TGG	2	6	211553	211558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616405
3891	NC_014220	TCA	2	6	211613	211618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616405
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3900	NC_014220	CCGG	2	8	211908	211915	0 %	0 %	50 %	50 %	297616405
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3904	NC_014220	CAC	2	6	212211	212216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616405
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3906	NC_014220	GCGG	2	8	212295	212302	0 %	0 %	75 %	25 %	297616405
3907	NC_014220	TGG	2	6	212345	212350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616405
3908	NC_014220	CG	3	6	212375	212380	0 %	0 %	50 %	50 %	297616405
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3912	NC_014220	GCG	2	6	212561	212566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616405
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3946	NC_014220	AT	3	6	214121	214126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3953	NC_014220	ACA	2	6	214581	214586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3954	NC_014220	CGA	2	6	214588	214593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3955	NC_014220	CTT	2	6	214627	214632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3957	NC_014220	T	6	6	214781	214786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3960	NC_014220	CAAT	2	8	215133	215140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3961	NC_014220	TAAAG	2	10	215142	215151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3962	NC_014220	AGC	2	6	215236	215241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616407
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3977	NC_014220	TGC	2	6	215720	215725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616408
3978	NC_014220	TGT	2	6	215937	215942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3979	NC_014220	TAT	2	6	216095	216100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616409
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3984	NC_014220	ATTC	2	8	216356	216363	25 %	50 %	0 %	25 %	297616410
3985	NC_014220	TTGG	2	8	216420	216427	0 %	50 %	50 %	0 %	297616410
3986	NC_014220	AAG	2	6	216435	216440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616410
3987	NC_014220	GATG	2	8	216603	216610	25 %	25 %	50 %	0 %	297616410
3988	NC_014220	ATT	2	6	216618	216623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616410
3989	NC_014220	TG	3	6	216707	216712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_014220	ATA	2	6	216751	216756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_014220	GTG	2	6	216777	216782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3992	NC_014220	CA	3	6	216820	216825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3993	NC_014220	GT	3	6	216839	216844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_014220	A	6	6	216895	216900	100 %	0 %	0 %	0 %	297616411
3995	NC_014220	ATG	2	6	216925	216930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616411
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3999	NC_014220	AGC	2	6	217110	217115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616411
4000	NC_014220	TTTG	2	8	217156	217163	0 %	75 %	25 %	0 %	297616411

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