MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014220	GTA	2	6	164797	164802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616361
3002	NC_014220	GC	3	6	164870	164875	0 %	0 %	50 %	50 %	297616361
3003	NC_014220	GAA	2	6	164987	164992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616361
3004	NC_014220	TTC	2	6	165071	165076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616361
3005	NC_014220	TCT	2	6	165088	165093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616362
3006	NC_014220	CAC	2	6	165129	165134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616362
3007	NC_014220	CCG	2	6	165151	165156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616362
3008	NC_014220	GCC	2	6	165276	165281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616362
3009	NC_014220	AAAAGC	2	12	165324	165335	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297616362
3010	NC_014220	ATG	2	6	165387	165392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616362
3011	NC_014220	CAT	2	6	165530	165535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616362
3012	NC_014220	GCC	2	6	165570	165575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616362
3013	NC_014220	GAA	2	6	165584	165589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616362
3014	NC_014220	CCA	2	6	165595	165600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616362
3015	NC_014220	TTCAGC	2	12	165645	165656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297616362
3016	NC_014220	AGA	2	6	165662	165667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616362
3017	NC_014220	AGC	2	6	165858	165863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616362
3018	NC_014220	CGG	2	6	165874	165879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616362
3019	NC_014220	AGC	2	6	165930	165935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616362
3020	NC_014220	GCC	2	6	165987	165992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616362
3021	NC_014220	CTT	2	6	166030	166035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616362
3022	NC_014220	AGC	2	6	166038	166043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616362
3023	NC_014220	TGG	2	6	166051	166056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616362
3024	NC_014220	GCC	2	6	166077	166082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616362
3025	NC_014220	GAA	2	6	166173	166178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616362
3026	NC_014220	CAG	2	6	166232	166237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616362
3027	NC_014220	CCTG	2	8	166257	166264	0 %	25 %	25 %	50 %	297616362
3028	NC_014220	GGCG	2	8	166312	166319	0 %	0 %	75 %	25 %	297616362
3029	NC_014220	AGT	2	6	166352	166357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616362
3030	NC_014220	A	7	7	166458	166464	100 %	0 %	0 %	0 %	297616362
3031	NC_014220	TACC	2	8	166552	166559	25 %	25 %	0 %	50 %	297616362
3032	NC_014220	CCA	2	6	166651	166656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616362
3033	NC_014220	AGGA	2	8	166708	166715	50 %	0 %	50 %	0 %	297616362
3034	NC_014220	C	6	6	166771	166776	0 %	0 %	0 %	100 %	297616362
3035	NC_014220	ACC	2	6	166812	166817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616362
3036	NC_014220	TAGC	2	8	166902	166909	25 %	25 %	25 %	25 %	297616362
3037	NC_014220	ACCGGT	2	12	166948	166959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616362
3038	NC_014220	CAC	2	6	167062	167067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_014220	TACATA	2	12	167078	167089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3040	NC_014220	G	6	6	167141	167146	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014220	GAA	2	6	167210	167215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_014220	TTCGAT	2	12	167244	167255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297616363
3043	NC_014220	GGTAGG	2	12	167271	167282	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	297616363
3044	NC_014220	TCT	2	6	167296	167301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616363
3045	NC_014220	CAG	2	6	167337	167342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616363
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3047	NC_014220	TTC	2	6	167363	167368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616363
3048	NC_014220	CTG	2	6	167369	167374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616363
3049	NC_014220	AGT	2	6	167408	167413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616363
3050	NC_014220	CTC	2	6	167460	167465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_014220	CCTG	2	8	167475	167482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_014220	ATT	3	9	167490	167498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014220	A	6	6	167528	167533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_014220	TAG	2	6	167544	167549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_014220	ATG	2	6	167611	167616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_014220	TCG	2	6	167631	167636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_014220	ACC	2	6	167658	167663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_014220	GGT	2	6	167670	167675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_014220	CA	3	6	167681	167686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_014220	AGAA	2	8	167738	167745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_014220	CAT	2	6	167895	167900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616364
3062	NC_014220	TG	3	6	167937	167942	0 %	50 %	50 %	0 %	297616364
3063	NC_014220	AGG	2	6	167994	167999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616364
3064	NC_014220	GAC	2	6	168028	168033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616364
3065	NC_014220	GCG	2	6	168082	168087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616364
3066	NC_014220	TGG	2	6	168215	168220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616364
3067	NC_014220	GGC	2	6	168237	168242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616364
3068	NC_014220	TAT	2	6	168276	168281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616364
3069	NC_014220	CAG	2	6	168289	168294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616364
3070	NC_014220	GCCT	2	8	168424	168431	0 %	25 %	25 %	50 %	297616364
3071	NC_014220	T	6	6	168517	168522	0 %	100 %	0 %	0 %	297616364
3072	NC_014220	TAA	2	6	168540	168545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616364
3073	NC_014220	ACC	2	6	168575	168580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616364
3074	NC_014220	CGG	2	6	168657	168662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616364
3075	NC_014220	GCATCG	2	12	168752	168763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616364
3076	NC_014220	TTTA	2	8	168828	168835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_014220	A	6	6	168845	168850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014220	GCTT	2	8	168960	168967	0 %	50 %	25 %	25 %	297616365
3079	NC_014220	GGC	2	6	169059	169064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616365
3080	NC_014220	CATCCT	2	12	169088	169099	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	297616365
3081	NC_014220	CAT	2	6	169145	169150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616365
3082	NC_014220	GGGC	2	8	169265	169272	0 %	0 %	75 %	25 %	297616365
3083	NC_014220	GTG	2	6	169290	169295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616365
3084	NC_014220	TTG	2	6	169360	169365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616365
3085	NC_014220	CGG	2	6	169398	169403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616365
3086	NC_014220	CAG	2	6	169527	169532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616365
3087	NC_014220	ATG	2	6	169539	169544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616365
3088	NC_014220	GAT	2	6	169646	169651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616365
3089	NC_014220	CGC	2	6	169766	169771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616365
3090	NC_014220	GAT	2	6	169782	169787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616365
3091	NC_014220	AG	3	6	169838	169843	50 %	0 %	50 %	0 %	297616365
3092	NC_014220	GCC	2	6	169884	169889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616365
3093	NC_014220	AAG	2	6	170027	170032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616366
3094	NC_014220	GCAA	2	8	170039	170046	50 %	0 %	25 %	25 %	297616366
3095	NC_014220	AAGA	2	8	170102	170109	75 %	0 %	25 %	0 %	297616366
3096	NC_014220	TTC	2	6	170217	170222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616366
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3098	NC_014220	CCCA	2	8	170273	170280	25 %	0 %	0 %	75 %	297616366
3099	NC_014220	TCA	2	6	170283	170288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616366
3100	NC_014220	CGG	2	6	170327	170332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616366
3101	NC_014220	ACT	2	6	170460	170465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616366
3102	NC_014220	TCC	2	6	170523	170528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616366
3103	NC_014220	GCC	2	6	170558	170563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616366
3104	NC_014220	CGC	3	9	170572	170580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616366
3105	NC_014220	CTAC	2	8	170658	170665	25 %	25 %	0 %	50 %	297616366
3106	NC_014220	TGA	2	6	170673	170678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616366
3107	NC_014220	CAT	2	6	170752	170757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616366
3108	NC_014220	TGG	2	6	170763	170768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616366
3109	NC_014220	GGC	2	6	170789	170794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616366
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3111	NC_014220	GCT	2	6	170962	170967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616366
3112	NC_014220	TGC	2	6	171020	171025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616366
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3114	NC_014220	GCT	2	6	171086	171091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616366
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3118	NC_014220	GGC	2	6	171420	171425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616366
3119	NC_014220	CCG	2	6	171440	171445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616366
3120	NC_014220	GAG	2	6	171447	171452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616366
3121	NC_014220	TCGC	2	8	171527	171534	0 %	25 %	25 %	50 %	297616366
3122	NC_014220	GCCATG	2	12	171536	171547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616366
3123	NC_014220	TGG	2	6	171570	171575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616366
3124	NC_014220	TGTCC	2	10	171591	171600	0 %	40 %	20 %	40 %	297616366
3125	NC_014220	TGGCAG	2	12	171639	171650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297616366
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3135	NC_014220	AGGA	2	8	172336	172343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_014220	CCG	2	6	172397	172402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3137	NC_014220	ATG	2	6	172467	172472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3234	NC_014220	GAT	2	6	177521	177526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616370
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3236	NC_014220	TTTCG	2	10	177607	177616	0 %	60 %	20 %	20 %	297616370
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3368	NC_014220	TCA	2	6	183903	183908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616375
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3372	NC_014220	A	6	6	184087	184092	100 %	0 %	0 %	0 %	297616375
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3484	NC_014220	GAGC	2	8	190613	190620	25 %	0 %	50 %	25 %	297616381
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3489	NC_014220	AAT	2	6	190777	190782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_014220	AGG	2	6	190789	190794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_014220	TGC	2	6	190804	190809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616382
3492	NC_014220	TTGATA	2	12	190813	190824	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297616382
3493	NC_014220	AAT	2	6	190908	190913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616382
3494	NC_014220	CT	3	6	191134	191139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3495	NC_014220	GCC	2	6	191196	191201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3496	NC_014220	TTA	2	6	191294	191299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_014220	CGG	2	6	191394	191399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616383
3498	NC_014220	TTC	2	6	191534	191539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616383
3499	NC_014220	GGC	2	6	191547	191552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616383
3500	NC_014220	GGC	2	6	191611	191616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616383

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