MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_014220	GATG	2	8	136716	136723	25 %	25 %	50 %	0 %	297616334
2503	NC_014220	CTG	2	6	136792	136797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616334
2504	NC_014220	CTG	2	6	136981	136986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616334
2505	NC_014220	CAA	2	6	136998	137003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616334
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2507	NC_014220	GGA	2	6	137019	137024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616334
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2511	NC_014220	TTCC	2	8	137143	137150	0 %	50 %	0 %	50 %	297616334
2512	NC_014220	TGC	2	6	137216	137221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616334
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2521	NC_014220	AGG	2	6	137697	137702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_014220	TAG	2	6	137759	137764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616335
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2533	NC_014220	GAG	2	6	138403	138408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2554	NC_014220	AGCCGG	2	12	140102	140113	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297616336
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2611	NC_014220	CATCGA	2	12	142816	142827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297616340
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2620	NC_014220	AGGG	2	8	143472	143479	25 %	0 %	75 %	0 %	297616341
2621	NC_014220	GCC	2	6	143529	143534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616341
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2623	NC_014220	GTG	2	6	143670	143675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616341
2624	NC_014220	AGG	2	6	143684	143689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616341
2625	NC_014220	TTC	2	6	143697	143702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616341
2626	NC_014220	AAG	2	6	143709	143714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616341
2627	NC_014220	TCGC	2	8	143908	143915	0 %	25 %	25 %	50 %	297616341
2628	NC_014220	GAT	2	6	143960	143965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616341
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2630	NC_014220	CCTTGA	2	12	144052	144063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297616341
2631	NC_014220	TAC	3	9	144136	144144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616342
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2634	NC_014220	GAAA	2	8	144169	144176	75 %	0 %	25 %	0 %	297616342
2635	NC_014220	A	6	6	144174	144179	100 %	0 %	0 %	0 %	297616342
2636	NC_014220	CCA	2	6	144322	144327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616342
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2640	NC_014220	G	7	7	144446	144452	0 %	0 %	100 %	0 %	297616342
2641	NC_014220	GAA	2	6	144479	144484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616342
2642	NC_014220	AGC	2	6	144643	144648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616342
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2644	NC_014220	CCG	2	6	144705	144710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616342
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2646	NC_014220	GAA	2	6	144929	144934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616342
2647	NC_014220	GAT	2	6	144966	144971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616343
2648	NC_014220	GAA	2	6	145032	145037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616343
2649	NC_014220	ACG	2	6	145070	145075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616343
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2655	NC_014220	CGGA	2	8	145508	145515	25 %	0 %	50 %	25 %	297616343
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2659	NC_014220	GATA	2	8	145791	145798	50 %	25 %	25 %	0 %	297616343
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2664	NC_014220	CAA	4	12	145962	145973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616344
2665	NC_014220	ATA	2	6	146023	146028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616344
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2672	NC_014220	GAA	2	6	146265	146270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616345
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2684	NC_014220	GTA	2	6	146843	146848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616345
2685	NC_014220	GGC	2	6	146876	146881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616345
2686	NC_014220	CGGT	2	8	146892	146899	0 %	25 %	50 %	25 %	297616345
2687	NC_014220	ATC	2	6	146921	146926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616345
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2689	NC_014220	CAC	2	6	147025	147030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616345
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2692	NC_014220	GTT	2	6	147172	147177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2697	NC_014220	GGA	2	6	147413	147418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616346
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2700	NC_014220	TGA	2	6	147502	147507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616346
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2722	NC_014220	TTA	2	6	148810	148815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2723	NC_014220	TGG	2	6	148955	148960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2728	NC_014220	GA	3	6	149300	149305	50 %	0 %	50 %	0 %	297616347
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2731	NC_014220	G	6	6	149511	149516	0 %	0 %	100 %	0 %	297616347
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2745	NC_014220	CCT	2	6	150186	150191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616348
2746	NC_014220	CGG	2	6	150194	150199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616348
2747	NC_014220	ATTC	2	8	150230	150237	25 %	50 %	0 %	25 %	297616348
2748	NC_014220	TGG	2	6	150262	150267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616348
2749	NC_014220	ATC	2	6	150273	150278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616348
2750	NC_014220	TTG	2	6	150309	150314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616348
2751	NC_014220	CGA	2	6	150485	150490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616348
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2753	NC_014220	GCTG	2	8	150744	150751	0 %	25 %	50 %	25 %	297616349
2754	NC_014220	TG	3	6	150762	150767	0 %	50 %	50 %	0 %	297616349
2755	NC_014220	GACC	2	8	150807	150814	25 %	0 %	25 %	50 %	297616349
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2763	NC_014220	GA	3	6	151257	151262	50 %	0 %	50 %	0 %	297616349
2764	NC_014220	ACC	2	6	151345	151350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616349
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2766	NC_014220	ACG	2	6	151460	151465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616349
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2769	NC_014220	CAGGA	2	10	151727	151736	40 %	0 %	40 %	20 %	297616350
2770	NC_014220	GACC	2	8	151762	151769	25 %	0 %	25 %	50 %	297616350
2771	NC_014220	CGG	2	6	151779	151784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616350
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2776	NC_014220	AGT	2	6	152005	152010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616350
2777	NC_014220	TCG	2	6	152061	152066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616350
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2782	NC_014220	CAT	2	6	152541	152546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616351
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2800	NC_014220	GAATT	2	10	153542	153551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2801	NC_014220	TCA	2	6	153553	153558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2802	NC_014220	CGC	2	6	153570	153575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2803	NC_014220	TAT	2	6	153612	153617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2804	NC_014220	AT	3	6	153616	153621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2805	NC_014220	AAG	2	6	153675	153680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2806	NC_014220	TGA	2	6	153690	153695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2808	NC_014220	CAAGA	2	10	153910	153919	60 %	0 %	20 %	20 %	297616352
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2817	NC_014220	TGA	2	6	154223	154228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616352
2818	NC_014220	TCA	2	6	154232	154237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616352
2819	NC_014220	TCA	2	6	154295	154300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616352
2820	NC_014220	CCGC	2	8	154412	154419	0 %	0 %	25 %	75 %	297616352
2821	NC_014220	GAGG	2	8	154505	154512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2822	NC_014220	AGTG	2	8	154531	154538	25 %	25 %	50 %	0 %	297616353
2823	NC_014220	TCA	2	6	154650	154655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616353
2824	NC_014220	GCG	2	6	154676	154681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616353
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2827	NC_014220	GC	3	6	154766	154771	0 %	0 %	50 %	50 %	297616353
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2837	NC_014220	GCTC	2	8	155549	155556	0 %	25 %	25 %	50 %	297616354
2838	NC_014220	ACT	2	6	155624	155629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616354
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2840	NC_014220	AGGA	2	8	155845	155852	50 %	0 %	50 %	0 %	297616354
2841	NC_014220	CGGTA	2	10	155859	155868	20 %	20 %	40 %	20 %	297616354
2842	NC_014220	TGGT	2	8	155880	155887	0 %	50 %	50 %	0 %	297616354
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2845	NC_014220	GGCAA	2	10	156114	156123	40 %	0 %	40 %	20 %	297616354
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2847	NC_014220	CTC	2	6	156169	156174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616354
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2851	NC_014220	TTC	2	6	156444	156449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616354
2852	NC_014220	TA	3	6	156472	156477	50 %	50 %	0 %	0 %	297616354
2853	NC_014220	GGAACG	2	12	156489	156500	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	297616354
2854	NC_014220	T	7	7	156546	156552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2855	NC_014220	AAG	2	6	156567	156572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2856	NC_014220	AAG	2	6	156635	156640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616355
2857	NC_014220	GGA	2	6	156654	156659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616355
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2859	NC_014220	GAC	3	9	156841	156849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616355
2860	NC_014220	ATA	2	6	156997	157002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616355
2861	NC_014220	CGGC	2	8	157040	157047	0 %	0 %	50 %	50 %	297616355
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2863	NC_014220	CCA	2	6	157120	157125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616356
2864	NC_014220	GGA	2	6	157187	157192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616356
2865	NC_014220	ATC	2	6	157415	157420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616356
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2990	NC_014220	AGC	2	6	164023	164028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2991	NC_014220	GCT	2	6	164124	164129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616361
2992	NC_014220	CGAC	2	8	164130	164137	25 %	0 %	25 %	50 %	297616361
2993	NC_014220	ACC	2	6	164201	164206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616361
2994	NC_014220	CGAC	2	8	164295	164302	25 %	0 %	25 %	50 %	297616361
2995	NC_014220	TCA	2	6	164334	164339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616361
2996	NC_014220	CCA	2	6	164415	164420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616361
2997	NC_014220	GCT	2	6	164429	164434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616361
2998	NC_014220	TCT	2	6	164496	164501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616361
2999	NC_014220	CTC	2	6	164638	164643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616361
3000	NC_014220	GCCA	2	8	164777	164784	25 %	0 %	25 %	50 %	297616361

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