MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014220	TG	3	6	80894	80899	0 %	50 %	50 %	0 %	297616282
1502	NC_014220	AAG	2	6	80990	80995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616282
1503	NC_014220	CGA	2	6	81097	81102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616282
1504	NC_014220	ATGGG	2	10	81145	81154	20 %	20 %	60 %	0 %	297616282
1505	NC_014220	AAC	2	6	81207	81212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_014220	A	6	6	81214	81219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014220	TGG	3	9	81256	81264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014220	TTC	2	6	81343	81348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_014220	TTG	2	6	81420	81425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014220	AAT	2	6	81531	81536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014220	TAAAA	2	10	81562	81571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014220	AGA	2	6	81622	81627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014220	CAG	2	6	81708	81713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616283
1514	NC_014220	GA	3	6	81716	81721	50 %	0 %	50 %	0 %	297616283
1515	NC_014220	AAG	2	6	81742	81747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616283
1516	NC_014220	CGAC	2	8	81766	81773	25 %	0 %	25 %	50 %	297616283
1517	NC_014220	AGA	2	6	81804	81809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616283
1518	NC_014220	GAA	2	6	81839	81844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_014220	A	6	6	81843	81848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014220	ACACAG	2	12	81861	81872	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_014220	CCG	2	6	81897	81902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_014220	GA	3	6	81908	81913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014220	AG	3	6	81964	81969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014220	A	6	6	82061	82066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014220	TGA	2	6	82083	82088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616284
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1529	NC_014220	T	6	6	82276	82281	0 %	100 %	0 %	0 %	297616284
1530	NC_014220	GTT	2	6	82314	82319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616284
1531	NC_014220	TTG	2	6	82340	82345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616284
1532	NC_014220	T	6	6	82381	82386	0 %	100 %	0 %	0 %	297616284
1533	NC_014220	ATTTT	2	10	82455	82464	20 %	80 %	0 %	0 %	297616284
1534	NC_014220	TAT	2	6	82469	82474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616284
1535	NC_014220	TAG	2	6	82484	82489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616284
1536	NC_014220	TTA	2	6	82498	82503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616284
1537	NC_014220	AGATA	2	10	82632	82641	60 %	20 %	20 %	0 %	297616285
1538	NC_014220	AGA	2	6	82692	82697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616285
1539	NC_014220	GAA	2	6	82714	82719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616285
1540	NC_014220	A	6	6	82737	82742	100 %	0 %	0 %	0 %	297616285
1541	NC_014220	TGA	2	6	82772	82777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616285
1542	NC_014220	TAG	3	9	82869	82877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616285
1543	NC_014220	GTT	2	6	82908	82913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616285
1544	NC_014220	ATA	2	6	82961	82966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616285
1545	NC_014220	TTG	2	6	82971	82976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616285
1546	NC_014220	ATT	2	6	83010	83015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616285
1547	NC_014220	GAA	2	6	83025	83030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616285
1548	NC_014220	AATA	2	8	83149	83156	75 %	25 %	0 %	0 %	297616285
1549	NC_014220	TA	3	6	83155	83160	50 %	50 %	0 %	0 %	297616285
1550	NC_014220	ATA	2	6	83183	83188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616285
1551	NC_014220	TTC	2	6	83309	83314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616286
1552	NC_014220	TAC	2	6	83321	83326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616286
1553	NC_014220	ATC	2	6	83402	83407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616286
1554	NC_014220	CTT	2	6	83446	83451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616286
1555	NC_014220	ACA	2	6	83454	83459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616286
1556	NC_014220	GCTCCT	2	12	83533	83544	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	297616286
1557	NC_014220	TTC	2	6	83675	83680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616286
1558	NC_014220	CTC	2	6	83708	83713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616286
1559	NC_014220	T	6	6	83762	83767	0 %	100 %	0 %	0 %	297616286
1560	NC_014220	GGT	2	6	83830	83835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616286
1561	NC_014220	AGA	2	6	83923	83928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616286
1562	NC_014220	CTC	2	6	83971	83976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616286
1563	NC_014220	CT	3	6	83986	83991	0 %	50 %	0 %	50 %	297616286
1564	NC_014220	CGG	2	6	84029	84034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616286
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1566	NC_014220	T	6	6	84061	84066	0 %	100 %	0 %	0 %	297616286
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1568	NC_014220	T	6	6	84076	84081	0 %	100 %	0 %	0 %	297616286
1569	NC_014220	GC	3	6	84204	84209	0 %	0 %	50 %	50 %	297616286
1570	NC_014220	TCAG	2	8	84255	84262	25 %	25 %	25 %	25 %	297616286
1571	NC_014220	TCT	2	6	84354	84359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616286
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1575	NC_014220	GGC	2	6	84620	84625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616286
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1577	NC_014220	CGT	2	6	84676	84681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616286
1578	NC_014220	TC	3	6	84725	84730	0 %	50 %	0 %	50 %	297616286
1579	NC_014220	TCT	2	6	84759	84764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616286
1580	NC_014220	TCT	3	9	84774	84782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616286
1581	NC_014220	TCC	2	6	84810	84815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616286
1582	NC_014220	AG	3	6	84840	84845	50 %	0 %	50 %	0 %	297616286
1583	NC_014220	TCT	2	6	84861	84866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616286
1584	NC_014220	ATA	2	6	84912	84917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616286
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1587	NC_014220	TACT	2	8	85010	85017	25 %	50 %	0 %	25 %	297616287
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1589	NC_014220	ACT	2	6	85143	85148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616287
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1592	NC_014220	CAA	2	6	85303	85308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616287
1593	NC_014220	TTA	2	6	85374	85379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616287
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1595	NC_014220	CAC	2	6	85471	85476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616287
1596	NC_014220	CAA	2	6	85516	85521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616287
1597	NC_014220	TAC	2	6	85549	85554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616288
1598	NC_014220	GTT	2	6	85568	85573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616288
1599	NC_014220	ACA	2	6	85637	85642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616288
1600	NC_014220	CGAAAT	2	12	85651	85662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	297616288
1601	NC_014220	CAT	2	6	85687	85692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616288
1602	NC_014220	CCT	2	6	85730	85735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616288
1603	NC_014220	A	6	6	85753	85758	100 %	0 %	0 %	0 %	297616288
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1607	NC_014220	ATA	2	6	85874	85879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616288
1608	NC_014220	CAC	2	6	85988	85993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_014220	AT	3	6	86031	86036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014220	GAAA	2	8	86040	86047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014220	A	6	6	86090	86095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_014220	CCA	2	6	86103	86108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_014220	GGC	2	6	86118	86123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616289
1614	NC_014220	TTC	2	6	86133	86138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616289
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1617	NC_014220	TCT	2	6	86200	86205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616289
1618	NC_014220	TTC	2	6	86221	86226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616289
1619	NC_014220	TCTG	2	8	86299	86306	0 %	50 %	25 %	25 %	297616289
1620	NC_014220	T	6	6	86387	86392	0 %	100 %	0 %	0 %	297616289
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1625	NC_014220	TTC	2	6	86549	86554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616290
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1627	NC_014220	TTCCG	2	10	86666	86675	0 %	40 %	20 %	40 %	297616290
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1997	NC_014220	GAA	2	6	107152	107157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616306
1998	NC_014220	A	6	6	107217	107222	100 %	0 %	0 %	0 %	297616306
1999	NC_014220	CCA	2	6	107273	107278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616306
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