MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014220	T	6	6	53665	53670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014220	TAA	2	6	53698	53703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014220	GGGA	2	8	53709	53716	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014220	GTG	2	6	53735	53740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014220	AACGT	2	10	53805	53814	40 %	20 %	20 %	20 %	297616258
1007	NC_014220	TTA	2	6	53816	53821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616258
1008	NC_014220	TC	3	6	53882	53887	0 %	50 %	0 %	50 %	297616258
1009	NC_014220	AG	3	6	53951	53956	50 %	0 %	50 %	0 %	297616258
1010	NC_014220	GGA	2	6	53980	53985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616258
1011	NC_014220	TTTC	2	8	53989	53996	0 %	75 %	0 %	25 %	297616258
1012	NC_014220	CGTT	2	8	54086	54093	0 %	50 %	25 %	25 %	297616258
1013	NC_014220	TTA	2	6	54130	54135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616258
1014	NC_014220	ACC	2	6	54210	54215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616258
1015	NC_014220	GT	3	6	54228	54233	0 %	50 %	50 %	0 %	297616258
1016	NC_014220	GTG	2	6	54236	54241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616258
1017	NC_014220	GCA	2	6	54395	54400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616258
1018	NC_014220	ATT	2	6	54501	54506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616258
1019	NC_014220	CTT	2	6	54540	54545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616258
1020	NC_014220	AAC	2	6	54570	54575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616258
1021	NC_014220	TGGGC	2	10	54603	54612	0 %	20 %	60 %	20 %	297616258
1022	NC_014220	GCG	2	6	54626	54631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616258
1023	NC_014220	ACG	2	6	54699	54704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616258
1024	NC_014220	GAT	2	6	54848	54853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616258
1025	NC_014220	TCC	2	6	54937	54942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616258
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1028	NC_014220	GC	3	6	54983	54988	0 %	0 %	50 %	50 %	297616258
1029	NC_014220	TGG	2	6	55014	55019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616258
1030	NC_014220	CGC	2	6	55027	55032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616258
1031	NC_014220	TGG	2	6	55038	55043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616258
1032	NC_014220	GTG	2	6	55236	55241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014220	TA	3	6	55359	55364	50 %	50 %	0 %	0 %	297616259
1034	NC_014220	GATG	2	8	55372	55379	25 %	25 %	50 %	0 %	297616259
1035	NC_014220	GCT	3	9	55444	55452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616259
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1038	NC_014220	TAG	2	6	55521	55526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616259
1039	NC_014220	CGGG	2	8	55612	55619	0 %	0 %	75 %	25 %	297616259
1040	NC_014220	TCT	2	6	55651	55656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616259
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1042	NC_014220	G	6	6	55728	55733	0 %	0 %	100 %	0 %	297616259
1043	NC_014220	AG	4	8	55753	55760	50 %	0 %	50 %	0 %	297616259
1044	NC_014220	GA	3	6	55786	55791	50 %	0 %	50 %	0 %	297616259
1045	NC_014220	CGGAT	2	10	55821	55830	20 %	20 %	40 %	20 %	297616259
1046	NC_014220	AGA	2	6	55858	55863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616259
1047	NC_014220	CGT	2	6	55904	55909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616259
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1049	NC_014220	GAGAAA	2	12	55937	55948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616259
1050	NC_014220	GAT	2	6	55965	55970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014220	TGG	2	6	55972	55977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616260
1052	NC_014220	AGA	2	6	56093	56098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616260
1053	NC_014220	CTG	2	6	56127	56132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616260
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1055	NC_014220	CCA	2	6	56230	56235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616260
1056	NC_014220	CCT	2	6	56246	56251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616260
1057	NC_014220	GAGAA	2	10	56254	56263	60 %	0 %	40 %	0 %	297616260
1058	NC_014220	CGG	2	6	56274	56279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616260
1059	NC_014220	AGA	2	6	56327	56332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616260
1060	NC_014220	GA	4	8	56428	56435	50 %	0 %	50 %	0 %	297616260
1061	NC_014220	GT	3	6	56437	56442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014220	GAA	2	6	56458	56463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616261
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1065	NC_014220	TCC	2	6	56564	56569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616261
1066	NC_014220	GCG	2	6	56589	56594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616261
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1089	NC_014220	AGGC	2	8	57644	57651	25 %	0 %	50 %	25 %	297616262
1090	NC_014220	GGA	2	6	57652	57657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616262
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1096	NC_014220	T	6	6	57934	57939	0 %	100 %	0 %	0 %	297616262
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1099	NC_014220	ATGA	2	8	58110	58117	50 %	25 %	25 %	0 %	297616262
1100	NC_014220	CTT	2	6	58125	58130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616263
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1110	NC_014220	CGC	2	6	58470	58475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616264
1111	NC_014220	GCAG	2	8	58519	58526	25 %	0 %	50 %	25 %	297616264
1112	NC_014220	GTA	2	6	58568	58573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616264
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1133	NC_014220	G	6	6	59632	59637	0 %	0 %	100 %	0 %	297616265
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1252	NC_014220	T	6	6	66331	66336	0 %	100 %	0 %	0 %	297616272
1253	NC_014220	GAC	2	6	66402	66407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616272
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