MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014220	CGG	2	6	25153	25158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616235
502	NC_014220	CAGC	2	8	25177	25184	25 %	0 %	25 %	50 %	297616235
503	NC_014220	CG	4	8	25234	25241	0 %	0 %	50 %	50 %	297616235
504	NC_014220	CCA	2	6	25367	25372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616235
505	NC_014220	CG	3	6	25510	25515	0 %	0 %	50 %	50 %	297616235
506	NC_014220	TTC	2	6	25622	25627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616235
507	NC_014220	CAG	2	6	25630	25635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616235
508	NC_014220	CG	4	8	25639	25646	0 %	0 %	50 %	50 %	297616235
509	NC_014220	CTT	2	6	25732	25737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616235
510	NC_014220	T	6	6	25786	25791	0 %	100 %	0 %	0 %	297616235
511	NC_014220	AGCA	2	8	25811	25818	50 %	0 %	25 %	25 %	297616235
512	NC_014220	AGAACC	2	12	25833	25844	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	297616235
513	NC_014220	GACC	2	8	25849	25856	25 %	0 %	25 %	50 %	297616235
514	NC_014220	TTC	2	6	25857	25862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616235
515	NC_014220	CAC	2	6	25871	25876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_014220	GGA	2	6	26016	26021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014220	GGC	2	6	26031	26036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_014220	AAG	2	6	26257	26262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014220	GAG	2	6	26292	26297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014220	CT	4	8	26375	26382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_014220	T	6	6	26418	26423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014220	TG	3	6	26473	26478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014220	TG	3	6	26484	26489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014220	ATG	2	6	26536	26541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014220	G	6	6	26616	26621	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014220	CAA	2	6	26630	26635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014220	AGG	2	6	26657	26662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014220	GCGA	2	8	26829	26836	25 %	0 %	50 %	25 %	297616236
529	NC_014220	GGT	2	6	26944	26949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616236
530	NC_014220	CGC	2	6	27130	27135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616236
531	NC_014220	TAC	2	6	27210	27215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616236
532	NC_014220	GA	3	6	27396	27401	50 %	0 %	50 %	0 %	297616236
533	NC_014220	GGCC	2	8	27404	27411	0 %	0 %	50 %	50 %	297616236
534	NC_014220	TAG	2	6	27421	27426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616236
535	NC_014220	CAG	2	6	27429	27434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616236
536	NC_014220	AG	3	6	27433	27438	50 %	0 %	50 %	0 %	297616236
537	NC_014220	CAG	2	6	27439	27444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616236
538	NC_014220	ATG	2	6	27466	27471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616236
539	NC_014220	TGT	2	6	27504	27509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014220	AGGA	2	8	27524	27531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014220	ATT	2	6	27610	27615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014220	T	8	8	27635	27642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014220	GA	4	8	27658	27665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014220	A	7	7	27696	27702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014220	A	6	6	27763	27768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014220	CCTG	2	8	27836	27843	0 %	25 %	25 %	50 %	297616237
547	NC_014220	T	6	6	27933	27938	0 %	100 %	0 %	0 %	297616237
548	NC_014220	TCC	2	6	27944	27949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616237
549	NC_014220	ACT	2	6	27958	27963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616237
550	NC_014220	CAT	2	6	27968	27973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616237
551	NC_014220	GCC	2	6	27975	27980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616237
552	NC_014220	ACCC	2	8	28021	28028	25 %	0 %	0 %	75 %	297616237
553	NC_014220	ACC	2	6	28077	28082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616237
554	NC_014220	TGACG	2	10	28160	28169	20 %	20 %	40 %	20 %	297616237
555	NC_014220	TGC	2	6	28222	28227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616237
556	NC_014220	ATC	2	6	28276	28281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616237
557	NC_014220	TCG	2	6	28345	28350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616237
558	NC_014220	CAGTT	2	10	28377	28386	20 %	40 %	20 %	20 %	297616237
559	NC_014220	CGA	2	6	28496	28501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616237
560	NC_014220	TCC	2	6	28730	28735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616238
561	NC_014220	CGG	2	6	28811	28816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616238
562	NC_014220	GTT	2	6	28825	28830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616238
563	NC_014220	AGA	2	6	28856	28861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616238
564	NC_014220	GTA	2	6	28921	28926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616238
565	NC_014220	G	7	7	28935	28941	0 %	0 %	100 %	0 %	297616238
566	NC_014220	CGG	2	6	28959	28964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616238
567	NC_014220	GTT	2	6	29019	29024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616238
568	NC_014220	T	6	6	29046	29051	0 %	100 %	0 %	0 %	297616238
569	NC_014220	GA	3	6	29074	29079	50 %	0 %	50 %	0 %	297616238
570	NC_014220	CAGC	2	8	29112	29119	25 %	0 %	25 %	50 %	297616238
571	NC_014220	TTC	2	6	29156	29161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616238
572	NC_014220	AGC	2	6	29407	29412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616238
573	NC_014220	CTC	2	6	29494	29499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616238
574	NC_014220	AC	3	6	29542	29547	50 %	0 %	0 %	50 %	297616238
575	NC_014220	CAC	2	6	29560	29565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616238
576	NC_014220	AGA	2	6	29569	29574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616238
577	NC_014220	GTA	2	6	29662	29667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616238
578	NC_014220	CTT	3	9	29731	29739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616238
579	NC_014220	GAA	2	6	29772	29777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616238
580	NC_014220	GAA	2	6	29801	29806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616238
581	NC_014220	ATT	2	6	29822	29827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616238
582	NC_014220	TAA	2	6	29867	29872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616238
583	NC_014220	GTCA	2	8	29902	29909	25 %	25 %	25 %	25 %	297616238
584	NC_014220	GAT	2	6	30037	30042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616238
585	NC_014220	GCG	2	6	30089	30094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616238
586	NC_014220	TCA	2	6	30135	30140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616238
587	NC_014220	CAA	2	6	30177	30182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616238
588	NC_014220	TCG	2	6	30191	30196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616238
589	NC_014220	AAC	2	6	30219	30224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616238
590	NC_014220	CATA	2	8	30256	30263	50 %	25 %	0 %	25 %	297616238
591	NC_014220	T	6	6	30286	30291	0 %	100 %	0 %	0 %	297616238
592	NC_014220	CTTT	2	8	30447	30454	0 %	75 %	0 %	25 %	297616238
593	NC_014220	CTT	2	6	30483	30488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616238
594	NC_014220	CGA	2	6	30613	30618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616238
595	NC_014220	AG	4	8	30715	30722	50 %	0 %	50 %	0 %	297616238
596	NC_014220	AGA	2	6	30727	30732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616238
597	NC_014220	GC	3	6	30741	30746	0 %	0 %	50 %	50 %	297616238
598	NC_014220	TCA	2	6	30815	30820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616238
599	NC_014220	AGC	2	6	30822	30827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616238
600	NC_014220	CAG	2	6	30841	30846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616238
601	NC_014220	TAG	2	6	30872	30877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616238
602	NC_014220	CTT	2	6	30915	30920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616238
603	NC_014220	CGGC	2	8	30926	30933	0 %	0 %	50 %	50 %	297616238
604	NC_014220	AAC	2	6	30935	30940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616238
605	NC_014220	GGC	2	6	31015	31020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616238
606	NC_014220	AAT	2	6	31029	31034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616238
607	NC_014220	AAT	2	6	31147	31152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616238
608	NC_014220	GGTC	2	8	31170	31177	0 %	25 %	50 %	25 %	297616238
609	NC_014220	CAT	2	6	31231	31236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616238
610	NC_014220	CTT	2	6	31284	31289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616238
611	NC_014220	GCA	2	6	31353	31358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616238
612	NC_014220	TAAAC	2	10	31376	31385	60 %	20 %	0 %	20 %	297616238
613	NC_014220	TTC	2	6	31490	31495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616238
614	NC_014220	AG	3	6	31502	31507	50 %	0 %	50 %	0 %	297616238
615	NC_014220	GCT	2	6	31517	31522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616238
616	NC_014220	AAG	2	6	31616	31621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616238
617	NC_014220	CAG	2	6	31654	31659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616238
618	NC_014220	CTT	2	6	31695	31700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616238
619	NC_014220	AAT	2	6	31720	31725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616238
620	NC_014220	TCT	2	6	31958	31963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616238
621	NC_014220	TCG	2	6	31973	31978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616238
622	NC_014220	AGCG	2	8	32017	32024	25 %	0 %	50 %	25 %	297616238
623	NC_014220	AGA	2	6	32067	32072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616238
624	NC_014220	GTC	2	6	32107	32112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616238
625	NC_014220	ACT	2	6	32132	32137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616238
626	NC_014220	TTG	2	6	32140	32145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616238
627	NC_014220	TTA	2	6	32183	32188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616238
628	NC_014220	T	7	7	32325	32331	0 %	100 %	0 %	0 %	297616239
629	NC_014220	ACA	2	6	32400	32405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616239
630	NC_014220	TTTA	2	8	32445	32452	25 %	75 %	0 %	0 %	297616239
631	NC_014220	TCT	2	6	32458	32463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616239
632	NC_014220	CTT	2	6	32474	32479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616239
633	NC_014220	CCT	2	6	32497	32502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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641	NC_014220	CTT	2	6	33393	33398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_014220	GA	3	6	33437	33442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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742	NC_014220	GAT	2	6	38825	38830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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747	NC_014220	AG	3	6	38955	38960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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749	NC_014220	GAA	2	6	39162	39167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
750	NC_014220	AGG	2	6	39186	39191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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753	NC_014220	TGGA	2	8	39260	39267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
754	NC_014220	ATTA	2	8	39320	39327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
755	NC_014220	A	6	6	39331	39336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
756	NC_014220	TTC	2	6	39383	39388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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