MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 43752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014220	GTG	2	6	272142	272147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616463
5002	NC_014220	ACGG	2	8	272168	272175	25 %	0 %	50 %	25 %	297616463
5003	NC_014220	GGA	2	6	272186	272191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616463
5004	NC_014220	TATG	2	8	272360	272367	25 %	50 %	25 %	0 %	297616463
5005	NC_014220	GGT	2	6	272384	272389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616463
5006	NC_014220	GTG	2	6	272509	272514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616463
5007	NC_014220	GGTCA	2	10	272601	272610	20 %	20 %	40 %	20 %	297616463
5008	NC_014220	AGA	2	6	272813	272818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616463
5009	NC_014220	TGAGG	2	10	272960	272969	20 %	20 %	60 %	0 %	297616463
5010	NC_014220	TGG	2	6	273016	273021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616463
5011	NC_014220	TGG	2	6	273091	273096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616463
5012	NC_014220	GGT	2	6	273174	273179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616463
5013	NC_014220	TGCTT	2	10	273188	273197	0 %	60 %	20 %	20 %	297616463
5014	NC_014220	AT	3	6	273322	273327	50 %	50 %	0 %	0 %	297616463
5015	NC_014220	GAG	2	6	273460	273465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616463
5016	NC_014220	AAG	2	6	273551	273556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616463
5017	NC_014220	GGA	2	6	273660	273665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616463
5018	NC_014220	CAG	2	6	273712	273717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616463
5019	NC_014220	GGAGC	2	10	274040	274049	20 %	0 %	60 %	20 %	297616464
5020	NC_014220	GGACCA	2	12	274174	274185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616464
5021	NC_014220	GGAA	2	8	274235	274242	50 %	0 %	50 %	0 %	297616464
5022	NC_014220	TCC	2	6	274314	274319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616464
5023	NC_014220	AGG	2	6	274332	274337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616464
5024	NC_014220	GGAT	2	8	274356	274363	25 %	25 %	50 %	0 %	297616464
5025	NC_014220	CCG	2	6	274426	274431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616464
5026	NC_014220	AAG	2	6	274558	274563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616464
5027	NC_014220	TG	3	6	274627	274632	0 %	50 %	50 %	0 %	297616464
5028	NC_014220	CAC	2	6	274645	274650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616464
5029	NC_014220	TCTCT	2	10	274655	274664	0 %	60 %	0 %	40 %	297616464
5030	NC_014220	TCC	2	6	274727	274732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_014220	TC	3	6	274759	274764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_014220	TA	3	6	274768	274773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_014220	GATGAA	2	12	275063	275074	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014220	AGG	2	6	275078	275083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014220	TCGT	2	8	275299	275306	0 %	50 %	25 %	25 %	297616465
5036	NC_014220	TGC	2	6	275346	275351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616465
5037	NC_014220	AGGAC	2	10	275391	275400	40 %	0 %	40 %	20 %	297616465
5038	NC_014220	TTA	2	6	275408	275413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616465
5039	NC_014220	GCT	2	6	275464	275469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616465
5040	NC_014220	TTC	2	6	275483	275488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616465
5041	NC_014220	CGG	3	9	275495	275503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616465
5042	NC_014220	AGC	2	6	275566	275571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616465
5043	NC_014220	GGC	2	6	275613	275618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616465
5044	NC_014220	TCG	2	6	275702	275707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616465
5045	NC_014220	AGG	2	6	275724	275729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616465
5046	NC_014220	GGT	3	9	275784	275792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616465
5047	NC_014220	GGAG	2	8	275907	275914	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014220	AGG	2	6	275995	276000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_014220	TGT	2	6	276069	276074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616466
5050	NC_014220	GGA	2	6	276212	276217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616466
5051	NC_014220	TGA	2	6	276250	276255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616466
5052	NC_014220	GGT	2	6	276256	276261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616466
5053	NC_014220	AAAG	2	8	276451	276458	75 %	0 %	25 %	0 %	297616466
5054	NC_014220	GGCG	2	8	276472	276479	0 %	0 %	75 %	25 %	297616466
5055	NC_014220	GTTCC	2	10	276482	276491	0 %	40 %	20 %	40 %	297616466
5056	NC_014220	CGA	2	6	276544	276549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616466
5057	NC_014220	GGT	2	6	276568	276573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616466
5058	NC_014220	CAA	3	9	276634	276642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616466
5059	NC_014220	CTG	2	6	276713	276718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616466
5060	NC_014220	GAT	2	6	276740	276745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616466
5061	NC_014220	CAA	2	6	276769	276774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616466
5062	NC_014220	GGT	3	9	276916	276924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616466
5063	NC_014220	GAA	2	6	276926	276931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616466
5064	NC_014220	AGC	2	6	277236	277241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616466
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5066	NC_014220	CAGT	2	8	277407	277414	25 %	25 %	25 %	25 %	297616467
5067	NC_014220	TGG	2	6	277583	277588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616468
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5071	NC_014220	GTT	2	6	277796	277801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616469
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5074	NC_014220	GAT	2	6	278045	278050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616469
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5077	NC_014220	G	6	6	278298	278303	0 %	0 %	100 %	0 %	297616469
5078	NC_014220	AAC	2	6	278329	278334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616469
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5081	NC_014220	CGC	2	6	278525	278530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616469
5082	NC_014220	CGG	2	6	278539	278544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616469
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5085	NC_014220	TGA	2	6	278717	278722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616469
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5087	NC_014220	TGG	2	6	278908	278913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616470
5088	NC_014220	ACA	2	6	278914	278919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616470
5089	NC_014220	CAG	2	6	278920	278925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616470
5090	NC_014220	GGA	2	6	278978	278983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616470
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5092	NC_014220	ACT	2	6	279289	279294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616470
5093	NC_014220	GGTG	2	8	279317	279324	0 %	25 %	75 %	0 %	297616470
5094	NC_014220	TGC	2	6	279341	279346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616470
5095	NC_014220	T	6	6	279431	279436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_014220	TTCGGG	2	12	279535	279546	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5097	NC_014220	TGA	2	6	279573	279578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616471
5098	NC_014220	GGA	2	6	279638	279643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616471
5099	NC_014220	GAG	2	6	279674	279679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616471
5100	NC_014220	AGC	2	6	279735	279740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616471
5101	NC_014220	GCC	2	6	279869	279874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616471
5102	NC_014220	GGC	2	6	279910	279915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616471
5103	NC_014220	AG	3	6	279917	279922	50 %	0 %	50 %	0 %	297616471
5104	NC_014220	GCGG	2	8	279978	279985	0 %	0 %	75 %	25 %	297616471
5105	NC_014220	GACCGT	2	12	280006	280017	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616471
5106	NC_014220	GCCA	2	8	280024	280031	25 %	0 %	25 %	50 %	297616471
5107	NC_014220	AT	3	6	280070	280075	50 %	50 %	0 %	0 %	297616471
5108	NC_014220	T	6	6	280123	280128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_014220	CAC	2	6	280175	280180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_014220	GGA	2	6	280203	280208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_014220	GCTC	2	8	280219	280226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_014220	CTC	2	6	280232	280237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_014220	AAGG	2	8	280311	280318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014220	CCT	2	6	280357	280362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_014220	GT	3	6	280398	280403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014220	TCGC	2	8	280423	280430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_014220	CAC	2	6	280494	280499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_014220	AATCA	2	10	280540	280549	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5119	NC_014220	ATC	2	6	280568	280573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_014220	TG	3	6	280594	280599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014220	TG	3	6	280626	280631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014220	TC	3	6	280653	280658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_014220	GAG	2	6	280693	280698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_014220	A	6	6	280742	280747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_014220	GAG	2	6	280800	280805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_014220	TGG	2	6	280842	280847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616472
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5129	NC_014220	TA	3	6	281072	281077	50 %	50 %	0 %	0 %	297616472
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5132	NC_014220	ACC	2	6	281288	281293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616472
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5135	NC_014220	ACTG	2	8	281510	281517	25 %	25 %	25 %	25 %	297616472
5136	NC_014220	AAAG	2	8	281525	281532	75 %	0 %	25 %	0 %	297616472
5137	NC_014220	ATA	2	6	281552	281557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616472
5138	NC_014220	CAT	2	6	281711	281716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616473
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5148	NC_014220	TCC	2	6	282139	282144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5149	NC_014220	TTG	2	6	282299	282304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616474
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5151	NC_014220	T	6	6	282352	282357	0 %	100 %	0 %	0 %	297616474
5152	NC_014220	TTA	2	6	282479	282484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616474
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5154	NC_014220	GTT	2	6	282592	282597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616474
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5167	NC_014220	TA	3	6	283348	283353	50 %	50 %	0 %	0 %	297616474
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5176	NC_014220	AGGTG	2	10	283708	283717	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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5183	NC_014220	AGT	2	6	284011	284016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616475
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5231	NC_014220	T	6	6	286666	286671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5251	NC_014220	TA	3	6	287659	287664	50 %	50 %	0 %	0 %	297616476
5252	NC_014220	AAG	2	6	287689	287694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616476
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5495	NC_014220	AGT	2	6	300691	300696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616488
5496	NC_014220	GGC	2	6	300718	300723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616488
5497	NC_014220	AGTA	2	8	300738	300745	50 %	25 %	25 %	0 %	297616488
5498	NC_014220	TGC	2	6	300756	300761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616488
5499	NC_014220	GGC	2	6	300894	300899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616488
5500	NC_014220	ACT	2	6	301032	301037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616488

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