MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 25790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014205	CTT	2	6	58	63	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014205	ATA	2	6	100	105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
3	NC_014205	ATA	2	6	112	117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
4	NC_014205	GAA	3	9	129	137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526029
5	NC_014205	ATT	2	6	366	371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526029
6	NC_014205	ACA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526029
7	NC_014205	TTG	2	6	530	535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526029
8	NC_014205	ACT	2	6	551	556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526029
9	NC_014205	GAT	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
10	NC_014205	TAT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526029
11	NC_014205	TAG	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
12	NC_014205	AGT	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
13	NC_014205	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526029
14	NC_014205	ATG	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
15	NC_014205	AAC	2	6	737	742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526029
16	NC_014205	ATA	2	6	805	810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
17	NC_014205	GCA	2	6	820	825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526029
18	NC_014205	AGA	2	6	853	858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526029
19	NC_014205	GAG	2	6	955	960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526029
20	NC_014205	TAG	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526029
21	NC_014205	TAC	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526029
22	NC_014205	AGA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526029
23	NC_014205	ATA	2	6	1138	1143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
24	NC_014205	TAA	2	6	1166	1171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526029
25	NC_014205	ATA	2	6	1278	1283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526030
26	NC_014205	TGA	2	6	1289	1294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526030
27	NC_014205	AAT	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526030
28	NC_014205	AAC	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526030
29	NC_014205	GAA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526030
30	NC_014205	TAA	2	6	1549	1554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526030
31	NC_014205	CAA	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526030
32	NC_014205	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526030
33	NC_014205	CCG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014205	CGC	2	6	1889	1894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014205	TTC	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014205	GAC	2	6	2120	2125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014205	TAT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014205	TAT	2	6	2224	2229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526031
39	NC_014205	TTC	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526031
40	NC_014205	TAA	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526031
41	NC_014205	CAT	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526031
42	NC_014205	TAA	2	6	2556	2561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526031
43	NC_014205	AGG	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526031
44	NC_014205	TTG	2	6	2754	2759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526031
45	NC_014205	GAT	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526031
46	NC_014205	TCA	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526031
47	NC_014205	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526031
48	NC_014205	TTC	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526031
49	NC_014205	CGC	2	6	3231	3236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297526031
50	NC_014205	TCC	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526031
51	NC_014205	CTT	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526031
52	NC_014205	TTG	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526031
53	NC_014205	CAG	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526031
54	NC_014205	AGA	2	6	3504	3509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526031
55	NC_014205	CAG	2	6	3518	3523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526031
56	NC_014205	TGT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526031
57	NC_014205	CTC	2	6	3642	3647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526031
58	NC_014205	ATC	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526031
59	NC_014205	TAG	2	6	3698	3703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526031
60	NC_014205	TTC	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526031
61	NC_014205	GTT	2	6	3884	3889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526031
62	NC_014205	ACC	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014205	ATC	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526032
64	NC_014205	AAT	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526032
65	NC_014205	TCT	2	6	4167	4172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526032
66	NC_014205	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526032
67	NC_014205	CTC	2	6	4408	4413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014205	CCT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014205	TGA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014205	GTT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014205	ATA	2	6	4802	4807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526033
72	NC_014205	ATG	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526033
73	NC_014205	ATG	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526033
74	NC_014205	ATT	2	6	5268	5273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526033
75	NC_014205	GTG	2	6	5345	5350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297526033
76	NC_014205	TAG	2	6	5363	5368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526033
77	NC_014205	GAA	2	6	5464	5469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526033
78	NC_014205	AAG	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526033
79	NC_014205	CCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526033
80	NC_014205	AGC	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526033
81	NC_014205	ATC	2	6	5762	5767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526033
82	NC_014205	TTA	2	6	5954	5959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526034
83	NC_014205	TCA	2	6	5977	5982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526034
84	NC_014205	TCT	2	6	6024	6029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526034
85	NC_014205	TAT	2	6	6115	6120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526034
86	NC_014205	CTT	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526034
87	NC_014205	AGA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526034
88	NC_014205	TAT	2	6	6142	6147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526034
89	NC_014205	TGA	2	6	6214	6219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526034
90	NC_014205	TCC	2	6	6244	6249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526034
91	NC_014205	CTA	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526034
92	NC_014205	ATA	2	6	6374	6379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526034
93	NC_014205	TAT	2	6	6458	6463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526034
94	NC_014205	TCC	2	6	6560	6565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526034
95	NC_014205	TAC	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526034
96	NC_014205	TAC	2	6	6908	6913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526034
97	NC_014205	TCC	3	9	6917	6925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526034
98	NC_014205	TAA	2	6	7017	7022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014205	GTG	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014205	ACA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526035
101	NC_014205	ATT	2	6	7096	7101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526035
102	NC_014205	GAA	2	6	7105	7110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526035
103	NC_014205	CGA	2	6	7201	7206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526035
104	NC_014205	TTA	2	6	7260	7265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526035
105	NC_014205	GAA	2	6	7360	7365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526035
106	NC_014205	GTA	2	6	7421	7426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526035
107	NC_014205	TAA	2	6	7480	7485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526035
108	NC_014205	GAA	2	6	7505	7510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526035
109	NC_014205	TTA	2	6	7521	7526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526035
110	NC_014205	CTG	2	6	7571	7576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526035
111	NC_014205	GAA	2	6	7613	7618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526035
112	NC_014205	GTA	2	6	7687	7692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526036
113	NC_014205	TAA	2	6	7788	7793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526036
114	NC_014205	GAA	2	6	7822	7827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526036
115	NC_014205	GTT	2	6	7836	7841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526036
116	NC_014205	GAA	2	6	7842	7847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526036
117	NC_014205	CAA	2	6	7877	7882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526036
118	NC_014205	AAG	2	6	7919	7924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526036
119	NC_014205	TAG	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526036
120	NC_014205	ATC	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526036
121	NC_014205	AAT	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526036
122	NC_014205	TCA	2	6	8055	8060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526036
123	NC_014205	AAT	2	6	8112	8117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526036
124	NC_014205	TCT	2	6	8131	8136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526036
125	NC_014205	AAC	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526036
126	NC_014205	GAT	2	6	8176	8181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526036
127	NC_014205	GCC	2	6	8187	8192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297526036
128	NC_014205	AAT	2	6	8214	8219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526036
129	NC_014205	TCA	2	6	8240	8245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526036
130	NC_014205	AAC	2	6	8322	8327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526036
131	NC_014205	AGA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526036
132	NC_014205	ATT	2	6	8362	8367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526036
133	NC_014205	CTA	2	6	8394	8399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526036
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262	NC_014205	AGG	2	6	15605	15610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526043
263	NC_014205	ATT	2	6	15661	15666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526043
264	NC_014205	AAT	2	6	15756	15761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526043
265	NC_014205	GAA	2	6	15765	15770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526043
266	NC_014205	ATA	2	6	15780	15785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526043
267	NC_014205	AAT	2	6	15786	15791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526043
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270	NC_014205	AAT	3	9	16067	16075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526043
271	NC_014205	GAG	2	6	16117	16122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526043
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275	NC_014205	GTA	2	6	16623	16628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526044
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292	NC_014205	ACT	2	6	17158	17163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526045
293	NC_014205	ATA	2	6	17191	17196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526045
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296	NC_014205	ATC	2	6	17377	17382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_014205	CAT	2	6	17397	17402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_014205	CAA	2	6	17433	17438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_014205	TAT	2	6	17448	17453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526046
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383	NC_014205	CCA	2	6	22302	22307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297526052
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385	NC_014205	TTC	2	6	22371	22376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526052
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