MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 38561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014205	CT	3	6	163409	163414	0 %	50 %	0 %	50 %	297526206
4002	NC_014205	CAA	2	6	163424	163429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526206
4003	NC_014205	ACTT	2	8	163469	163476	25 %	50 %	0 %	25 %	297526206
4004	NC_014205	AT	3	6	163516	163521	50 %	50 %	0 %	0 %	297526206
4005	NC_014205	AGCC	2	8	163536	163543	25 %	0 %	25 %	50 %	297526206
4006	NC_014205	ATAG	2	8	163561	163568	50 %	25 %	25 %	0 %	297526206
4007	NC_014205	TAA	2	6	163577	163582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526206
4008	NC_014205	ATG	2	6	163586	163591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526206
4009	NC_014205	CAGG	2	8	163606	163613	25 %	0 %	50 %	25 %	297526206
4010	NC_014205	AT	3	6	163618	163623	50 %	50 %	0 %	0 %	297526206
4011	NC_014205	GAG	2	6	163626	163631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526206
4012	NC_014205	CAATC	2	10	163644	163653	40 %	20 %	0 %	40 %	297526206
4013	NC_014205	CAT	2	6	163780	163785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_014205	T	6	6	163812	163817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014205	TTAT	2	8	163839	163846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014205	AT	3	6	163863	163868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_014205	TGG	2	6	163873	163878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014205	GTT	2	6	163928	163933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526207
4019	NC_014205	GCT	2	6	163954	163959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526207
4020	NC_014205	TGA	2	6	163977	163982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526207
4021	NC_014205	AGCCT	2	10	164004	164013	20 %	20 %	20 %	40 %	297526207
4022	NC_014205	TGT	3	9	164077	164085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526207
4023	NC_014205	GGA	2	6	164109	164114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526207
4024	NC_014205	TGT	2	6	164122	164127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526207
4025	NC_014205	TGG	2	6	164155	164160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297526207
4026	NC_014205	GTT	2	6	164240	164245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526207
4027	NC_014205	TAA	2	6	164400	164405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526207
4028	NC_014205	AT	3	6	164517	164522	50 %	50 %	0 %	0 %	297526207
4029	NC_014205	TC	4	8	164540	164547	0 %	50 %	0 %	50 %	297526207
4030	NC_014205	CTC	2	6	164701	164706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526207
4031	NC_014205	TCC	2	6	164722	164727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526207
4032	NC_014205	TGA	2	6	164845	164850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526207
4033	NC_014205	CTA	2	6	164911	164916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526207
4034	NC_014205	AAT	2	6	164966	164971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526207
4035	NC_014205	GGT	2	6	165058	165063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297526207
4036	NC_014205	TAG	2	6	165074	165079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526207
4037	NC_014205	TAT	2	6	165092	165097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526208
4038	NC_014205	TCA	2	6	165174	165179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526208
4039	NC_014205	GCC	2	6	165195	165200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297526208
4040	NC_014205	TA	3	6	165292	165297	50 %	50 %	0 %	0 %	297526208
4041	NC_014205	TCAC	2	8	165333	165340	25 %	25 %	0 %	50 %	297526208
4042	NC_014205	ATC	2	6	165377	165382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526208
4043	NC_014205	TGC	2	6	165452	165457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526208
4044	NC_014205	AGG	2	6	165473	165478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526208
4045	NC_014205	ATA	2	6	165528	165533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526208
4046	NC_014205	AC	3	6	165560	165565	50 %	0 %	0 %	50 %	297526208
4047	NC_014205	ATT	2	6	165620	165625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526208
4048	NC_014205	CTG	2	6	165679	165684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526208
4049	NC_014205	CAA	2	6	165688	165693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526208
4050	NC_014205	ACC	2	6	165734	165739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297526208
4051	NC_014205	ACAA	2	8	165763	165770	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_014205	A	6	6	165769	165774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_014205	AATA	2	8	165799	165806	75 %	25 %	0 %	0 %	297526209
4054	NC_014205	GAG	2	6	165814	165819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526209
4055	NC_014205	AGC	2	6	165823	165828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526209
4056	NC_014205	AGC	2	6	165832	165837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526209
4057	NC_014205	TAG	2	6	165861	165866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526209
4058	NC_014205	ACC	2	6	166007	166012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297526209
4059	NC_014205	GA	3	6	166037	166042	50 %	0 %	50 %	0 %	297526209
4060	NC_014205	ACA	2	6	166053	166058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526209
4061	NC_014205	TAT	2	6	166145	166150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526209
4062	NC_014205	GGGA	2	8	166161	166168	25 %	0 %	75 %	0 %	297526209
4063	NC_014205	GCT	2	6	166241	166246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526209
4064	NC_014205	TAT	2	6	166268	166273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526209
4065	NC_014205	TAC	2	6	166312	166317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526209
4066	NC_014205	GAA	2	6	166362	166367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526209
4067	NC_014205	TAATGC	2	12	166375	166386	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297526209
4068	NC_014205	TAC	2	6	166397	166402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526209
4069	NC_014205	ACT	2	6	166404	166409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526209
4070	NC_014205	TAT	2	6	166433	166438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526209
4071	NC_014205	AT	3	6	166437	166442	50 %	50 %	0 %	0 %	297526209
4072	NC_014205	GTC	2	6	166456	166461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526209
4073	NC_014205	TC	3	6	166460	166465	0 %	50 %	0 %	50 %	297526209
4074	NC_014205	GTG	2	6	166470	166475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297526209
4075	NC_014205	GGGTTG	2	12	166638	166649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297526209
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4081	NC_014205	TAA	2	6	166918	166923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526209
4082	NC_014205	AT	3	6	166989	166994	50 %	50 %	0 %	0 %	297526209
4083	NC_014205	CAA	2	6	167040	167045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526209
4084	NC_014205	TAC	2	6	167146	167151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526209
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4087	NC_014205	TAG	2	6	167217	167222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526209
4088	NC_014205	AT	3	6	167224	167229	50 %	50 %	0 %	0 %	297526209
4089	NC_014205	G	6	6	167233	167238	0 %	0 %	100 %	0 %	297526209
4090	NC_014205	CT	3	6	167271	167276	0 %	50 %	0 %	50 %	297526209
4091	NC_014205	GTC	2	6	167320	167325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526209
4092	NC_014205	CT	3	6	167343	167348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_014205	AAT	2	6	167380	167385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014205	GGAT	2	8	167399	167406	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014205	TA	3	6	167533	167538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_014205	TGG	2	6	167578	167583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_014205	TTCT	2	8	167635	167642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_014205	TGT	2	6	167644	167649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014205	ATTTT	2	10	167675	167684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_014205	TTC	2	6	167685	167690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_014205	AT	4	8	167698	167705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014205	GTT	2	6	167818	167823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014205	TG	3	6	167824	167829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_014205	TA	3	6	167856	167861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014205	TAAT	2	8	167875	167882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_014205	TGGA	2	8	167893	167900	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014205	AAT	2	6	167938	167943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014205	AAT	2	6	167969	167974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014205	CTC	2	6	167984	167989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_014205	TA	3	6	168017	168022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_014205	CT	3	6	168047	168052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_014205	TATT	2	8	168082	168089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014205	T	6	6	168126	168131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014205	TCT	2	6	168151	168156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_014205	CAG	2	6	168160	168165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_014205	AATT	2	8	168187	168194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014205	GAT	2	6	168216	168221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014205	TAT	2	6	168290	168295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014205	AGG	2	6	168330	168335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014205	TAT	3	9	168343	168351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526210
4121	NC_014205	AGG	2	6	168368	168373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526210
4122	NC_014205	TA	3	6	168387	168392	50 %	50 %	0 %	0 %	297526210
4123	NC_014205	TTA	2	6	168397	168402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526210
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4125	NC_014205	TGTTT	2	10	168481	168490	0 %	80 %	20 %	0 %	297526210
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4127	NC_014205	TATT	2	8	168581	168588	25 %	75 %	0 %	0 %	297526210
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4253	NC_014205	TCA	2	6	173307	173312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526214
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4257	NC_014205	AGA	2	6	173429	173434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526214
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4274	NC_014205	AT	4	8	174051	174058	50 %	50 %	0 %	0 %	297526214
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