MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 38561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014205	TA	3	6	142222	142227	50 %	50 %	0 %	0 %	297526182
3502	NC_014205	CTC	2	6	142237	142242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526182
3503	NC_014205	TCT	2	6	142323	142328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526182
3504	NC_014205	TTC	2	6	142368	142373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526182
3505	NC_014205	TTGCTA	2	12	142385	142396	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297526182
3506	NC_014205	TA	3	6	142395	142400	50 %	50 %	0 %	0 %	297526182
3507	NC_014205	TAA	2	6	142408	142413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526182
3508	NC_014205	CATA	2	8	142435	142442	50 %	25 %	0 %	25 %	297526182
3509	NC_014205	TAG	2	6	142501	142506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526182
3510	NC_014205	AG	3	6	142538	142543	50 %	0 %	50 %	0 %	297526182
3511	NC_014205	TAT	2	6	142564	142569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526182
3512	NC_014205	CCT	2	6	142678	142683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526182
3513	NC_014205	TGC	2	6	142741	142746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526182
3514	NC_014205	TGT	2	6	142792	142797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526182
3515	NC_014205	ATA	2	6	142874	142879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526182
3516	NC_014205	TAC	2	6	142921	142926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526182
3517	NC_014205	AT	4	8	142933	142940	50 %	50 %	0 %	0 %	297526182
3518	NC_014205	CAT	2	6	143094	143099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526182
3519	NC_014205	TCA	2	6	143105	143110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526182
3520	NC_014205	AG	3	6	143138	143143	50 %	0 %	50 %	0 %	297526182
3521	NC_014205	GAG	2	6	143267	143272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526182
3522	NC_014205	TTCT	2	8	143303	143310	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_014205	AG	3	6	143325	143330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_014205	AGA	2	6	143336	143341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_014205	TA	3	6	143383	143388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014205	AGA	2	6	143400	143405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526183
3527	NC_014205	GATC	2	8	143472	143479	25 %	25 %	25 %	25 %	297526183
3528	NC_014205	AAT	2	6	143576	143581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526183
3529	NC_014205	AT	3	6	143605	143610	50 %	50 %	0 %	0 %	297526183
3530	NC_014205	CTA	2	6	143618	143623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526183
3531	NC_014205	CG	3	6	143642	143647	0 %	0 %	50 %	50 %	297526183
3532	NC_014205	TTA	2	6	143675	143680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526183
3533	NC_014205	TTCT	2	8	143681	143688	0 %	75 %	0 %	25 %	297526183
3534	NC_014205	TATC	2	8	143726	143733	25 %	50 %	0 %	25 %	297526183
3535	NC_014205	GTT	2	6	143772	143777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526183
3536	NC_014205	CTA	2	6	143796	143801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526183
3537	NC_014205	GTT	2	6	143814	143819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526183
3538	NC_014205	TGA	2	6	143859	143864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526183
3539	NC_014205	AGG	2	6	143867	143872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526183
3540	NC_014205	AGC	2	6	143905	143910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526183
3541	NC_014205	TTC	2	6	144025	144030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526183
3542	NC_014205	TC	4	8	144029	144036	0 %	50 %	0 %	50 %	297526183
3543	NC_014205	GCC	2	6	144059	144064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297526183
3544	NC_014205	TCA	2	6	144086	144091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526183
3545	NC_014205	TCA	2	6	144116	144121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526183
3546	NC_014205	TCC	2	6	144139	144144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526183
3547	NC_014205	TAT	2	6	144192	144197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526183
3548	NC_014205	AAT	2	6	144253	144258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526183
3549	NC_014205	TCA	2	6	144272	144277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526183
3550	NC_014205	T	6	6	144281	144286	0 %	100 %	0 %	0 %	297526183
3551	NC_014205	TA	3	6	144291	144296	50 %	50 %	0 %	0 %	297526183
3552	NC_014205	AT	3	6	144368	144373	50 %	50 %	0 %	0 %	297526183
3553	NC_014205	CTC	2	6	144466	144471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526183
3554	NC_014205	TTA	2	6	144528	144533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526183
3555	NC_014205	TC	3	6	144609	144614	0 %	50 %	0 %	50 %	297526183
3556	NC_014205	T	6	6	144755	144760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014205	ATTT	2	8	144761	144768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014205	T	7	7	144766	144772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_014205	GTTTA	2	10	144848	144857	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014205	TATG	2	8	144870	144877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014205	TAA	2	6	144884	144889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_014205	AAAT	2	8	144890	144897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014205	AAT	2	6	144915	144920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_014205	GAA	2	6	144939	144944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_014205	AT	3	6	144993	144998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_014205	AAT	2	6	144999	145004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_014205	TA	3	6	145014	145019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_014205	CAT	2	6	145100	145105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_014205	T	6	6	145107	145112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_014205	TTC	2	6	145164	145169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_014205	TAT	2	6	145192	145197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526184
3572	NC_014205	CTT	2	6	145206	145211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526184
3573	NC_014205	GTG	2	6	145278	145283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297526184
3574	NC_014205	AGG	2	6	145364	145369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526184
3575	NC_014205	GCTG	2	8	145475	145482	0 %	25 %	50 %	25 %	297526184
3576	NC_014205	CTA	2	6	145488	145493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526184
3577	NC_014205	TTG	2	6	145521	145526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526184
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3581	NC_014205	GTA	2	6	145739	145744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526184
3582	NC_014205	TA	3	6	145775	145780	50 %	50 %	0 %	0 %	297526184
3583	NC_014205	GAGG	2	8	145792	145799	25 %	0 %	75 %	0 %	297526184
3584	NC_014205	A	6	6	145843	145848	100 %	0 %	0 %	0 %	297526184
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3587	NC_014205	ACT	2	6	145957	145962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526184
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3589	NC_014205	TCC	2	6	146073	146078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_014205	GA	3	6	146119	146124	50 %	0 %	50 %	0 %	297526185
3591	NC_014205	TA	3	6	146169	146174	50 %	50 %	0 %	0 %	297526185
3592	NC_014205	ATA	2	6	146200	146205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526185
3593	NC_014205	CTT	2	6	146217	146222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526185
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3595	NC_014205	AT	3	6	146231	146236	50 %	50 %	0 %	0 %	297526185
3596	NC_014205	TATTTA	2	12	146316	146327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526185
3597	NC_014205	TA	3	6	146326	146331	50 %	50 %	0 %	0 %	297526185
3598	NC_014205	GAGCC	2	10	146333	146342	20 %	0 %	40 %	40 %	297526185
3599	NC_014205	TTA	2	6	146370	146375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526185
3600	NC_014205	CTT	2	6	146419	146424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526185
3601	NC_014205	CAT	2	6	146439	146444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526185
3602	NC_014205	T	6	6	146554	146559	0 %	100 %	0 %	0 %	297526185
3603	NC_014205	GA	3	6	146581	146586	50 %	0 %	50 %	0 %	297526185
3604	NC_014205	T	7	7	146591	146597	0 %	100 %	0 %	0 %	297526185
3605	NC_014205	AAG	2	6	146653	146658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526185
3606	NC_014205	ATT	2	6	146692	146697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526185
3607	NC_014205	ATG	2	6	146713	146718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526185
3608	NC_014205	TCT	2	6	146831	146836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526185
3609	NC_014205	TC	4	8	146891	146898	0 %	50 %	0 %	50 %	297526185
3610	NC_014205	CTTC	2	8	146904	146911	0 %	50 %	0 %	50 %	297526185
3611	NC_014205	TAC	2	6	146922	146927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526185
3612	NC_014205	CTT	2	6	146930	146935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526185
3613	NC_014205	ATT	2	6	146960	146965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526185
3614	NC_014205	TAG	2	6	146983	146988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526185
3615	NC_014205	AGGG	2	8	147032	147039	25 %	0 %	75 %	0 %	297526185
3616	NC_014205	AT	3	6	147046	147051	50 %	50 %	0 %	0 %	297526185
3617	NC_014205	CTT	2	6	147099	147104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526185
3618	NC_014205	TTC	2	6	147298	147303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526185
3619	NC_014205	TA	3	6	147315	147320	50 %	50 %	0 %	0 %	297526185
3620	NC_014205	CTAATA	2	12	147345	147356	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297526185
3621	NC_014205	TTGC	2	8	147437	147444	0 %	50 %	25 %	25 %	297526185
3622	NC_014205	TAA	2	6	147469	147474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526185
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3624	NC_014205	CTCTAA	2	12	147504	147515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526185
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