MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 38561

< Previous12...66676869707172737475767778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_014205	ACG	2	6	1577670	1577675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297527625
38502	NC_014205	TTC	2	6	1577719	1577724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297527625
38503	NC_014205	CTC	2	6	1577742	1577747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297527625
38504	NC_014205	TGA	2	6	1577789	1577794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297527625
38505	NC_014205	AT	3	6	1577818	1577823	50 %	50 %	0 %	0 %	297527625
38506	NC_014205	CAA	2	6	1577848	1577853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297527625
38507	NC_014205	ACC	2	6	1577885	1577890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297527625
38508	NC_014205	TAACA	2	10	1577966	1577975	60 %	20 %	0 %	20 %	297527625
38509	NC_014205	TTAAT	2	10	1577986	1577995	40 %	60 %	0 %	0 %	297527625
38510	NC_014205	AAT	2	6	1578162	1578167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297527625
38511	NC_014205	CTA	2	6	1578171	1578176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297527625
38512	NC_014205	TTA	2	6	1578205	1578210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297527625
38513	NC_014205	TAA	2	6	1578218	1578223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297527625
38514	NC_014205	TAT	2	6	1578238	1578243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297527625
38515	NC_014205	TTC	2	6	1578275	1578280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297527625
38516	NC_014205	ATC	2	6	1578308	1578313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297527625
38517	NC_014205	TTA	2	6	1578327	1578332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297527625
38518	NC_014205	TTTC	2	8	1578360	1578367	0 %	75 %	0 %	25 %	297527626
38519	NC_014205	AAC	2	6	1578477	1578482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297527626
38520	NC_014205	ATC	2	6	1578486	1578491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297527626
38521	NC_014205	TTTTA	2	10	1578519	1578528	20 %	80 %	0 %	0 %	297527626
38522	NC_014205	ATA	2	6	1578563	1578568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297527626
38523	NC_014205	T	6	6	1578609	1578614	0 %	100 %	0 %	0 %	297527626
38524	NC_014205	AT	4	8	1578673	1578680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38525	NC_014205	AT	3	6	1578727	1578732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38526	NC_014205	TA	3	6	1578782	1578787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38527	NC_014205	TTAA	2	8	1578802	1578809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38528	NC_014205	TGG	2	6	1578854	1578859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38529	NC_014205	CCGG	2	8	1578861	1578868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38530	NC_014205	T	6	6	1578952	1578957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38531	NC_014205	ATTG	2	8	1579003	1579010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38532	NC_014205	ATT	2	6	1579028	1579033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38533	NC_014205	GAGG	2	8	1579106	1579113	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38534	NC_014205	TCT	2	6	1579124	1579129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38535	NC_014205	TGC	2	6	1579186	1579191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38536	NC_014205	TATGT	2	10	1579246	1579255	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38537	NC_014205	CCAC	2	8	1579295	1579302	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38538	NC_014205	ATC	2	6	1579438	1579443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38539	NC_014205	GTT	2	6	1579455	1579460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38540	NC_014205	TTC	2	6	1579588	1579593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38541	NC_014205	CTA	2	6	1579644	1579649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297527627
38542	NC_014205	ATT	2	6	1579651	1579656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297527627
38543	NC_014205	TTA	2	6	1579674	1579679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297527627
38544	NC_014205	TCA	2	6	1579700	1579705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297527627
38545	NC_014205	ATA	2	6	1579706	1579711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297527627
38546	NC_014205	CTT	2	6	1579724	1579729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297527627
38547	NC_014205	ATA	2	6	1579743	1579748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297527627
38548	NC_014205	AT	3	6	1579778	1579783	50 %	50 %	0 %	0 %	297527627
38549	NC_014205	TGGCT	2	10	1579800	1579809	0 %	40 %	40 %	20 %	297527627
38550	NC_014205	ATA	3	9	1579839	1579847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297527627
38551	NC_014205	ATG	2	6	1579910	1579915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297527627
38552	NC_014205	T	6	6	1579921	1579926	0 %	100 %	0 %	0 %	297527627
38553	NC_014205	GAG	2	6	1579927	1579932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297527627
38554	NC_014205	CAT	2	6	1580016	1580021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297527627
38555	NC_014205	T	6	6	1580046	1580051	0 %	100 %	0 %	0 %	297527627
38556	NC_014205	T	6	6	1580102	1580107	0 %	100 %	0 %	0 %	297527627
38557	NC_014205	TA	3	6	1580157	1580162	50 %	50 %	0 %	0 %	297527627
38558	NC_014205	ATT	2	6	1580240	1580245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297527627
38559	NC_014205	CCAT	2	8	1580249	1580256	25 %	25 %	0 %	50 %	297527627
38560	NC_014205	AAT	2	6	1580261	1580266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297527627
38561	NC_014205	ATT	2	6	1580342	1580347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...66676869707172737475767778Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.